| 94 | 
  | 
         * @param simParams  | 
| 95 | 
  | 
         * @note | 
| 96 | 
  | 
         */ | 
| 97 | 
< | 
        SimInfo(std::vector<std::pair<MoleculeStamp*, int> >& molStampPairs, ForceField* ff, Globals* simParams); | 
| 97 | 
> | 
        SimInfo(MakeStamps* stamps, std::vector<std::pair<MoleculeStamp*, int> >& molStampPairs, ForceField* ff, Globals* simParams); | 
| 98 | 
  | 
        virtual ~SimInfo(); | 
| 99 | 
  | 
 | 
| 100 | 
  | 
        /** | 
| 323 | 
  | 
         | 
| 324 | 
  | 
        void setStatFileName(const std::string& fileName) { | 
| 325 | 
  | 
            statFileName_ = fileName; | 
| 326 | 
+ | 
        } | 
| 327 | 
+ | 
         | 
| 328 | 
+ | 
        std::string getRestFileName() { | 
| 329 | 
+ | 
          return restFileName_; | 
| 330 | 
+ | 
        } | 
| 331 | 
+ | 
         | 
| 332 | 
+ | 
        void setRestFileName(const std::string& fileName) { | 
| 333 | 
+ | 
          restFileName_ = fileName; | 
| 334 | 
  | 
        } | 
| 335 | 
  | 
 | 
| 336 | 
  | 
        /**  | 
| 440 | 
  | 
         */ | 
| 441 | 
  | 
        void addMoleculeStamp(MoleculeStamp* molStamp, int nmol); | 
| 442 | 
  | 
 | 
| 443 | 
+ | 
        MakeStamps* stamps_; | 
| 444 | 
  | 
        ForceField* forceField_;       | 
| 445 | 
  | 
        Globals* simParams_; | 
| 446 | 
  | 
 | 
| 503 | 
  | 
        std::string finalConfigFileName_; | 
| 504 | 
  | 
        std::string dumpFileName_; | 
| 505 | 
  | 
        std::string statFileName_; | 
| 506 | 
< | 
 | 
| 506 | 
> | 
        std::string restFileName_; | 
| 507 | 
> | 
         | 
| 508 | 
  | 
        double rcut_;       /**< cutoff radius*/ | 
| 509 | 
  | 
        double rsw_;        /**< radius of switching function*/ | 
| 510 | 
  | 
 |