| 78 | 
  | 
#include "applications/staticProps/TetrahedralityParam.hpp" | 
| 79 | 
  | 
#include "applications/staticProps/TetrahedralityParamZ.hpp" | 
| 80 | 
  | 
#include "applications/staticProps/RNEMDStats.hpp" | 
| 81 | 
+ | 
#include "applications/staticProps/NitrileFrequencyMap.hpp" | 
| 82 | 
+ | 
#include "applications/staticProps/MultipoleSum.hpp" | 
| 83 | 
  | 
 | 
| 84 | 
  | 
using namespace OpenMD; | 
| 85 | 
  | 
 | 
| 244 | 
  | 
      painCave.isFatal = 1; | 
| 245 | 
  | 
      simError(); | 
| 246 | 
  | 
    } | 
| 247 | 
+ | 
  } else if (args_info.multipole_given){ | 
| 248 | 
+ | 
    if (args_info.rcut_given) { | 
| 249 | 
+ | 
      analyser = new MultipoleSum(info, dumpFileName, sele1,  | 
| 250 | 
+ | 
                                        args_info.rcut_arg); | 
| 251 | 
+ | 
    } else { | 
| 252 | 
+ | 
      sprintf( painCave.errMsg, | 
| 253 | 
+ | 
               "A cutoff radius (rcut) must be specified when calculating Multipole Sums"); | 
| 254 | 
+ | 
      painCave.severity = OPENMD_ERROR; | 
| 255 | 
+ | 
      painCave.isFatal = 1; | 
| 256 | 
+ | 
      simError(); | 
| 257 | 
+ | 
    } | 
| 258 | 
  | 
     | 
| 259 | 
  | 
  } else if (args_info.tet_param_given) { | 
| 260 | 
  | 
    if (args_info.rcut_given) {    | 
| 280 | 
  | 
      painCave.isFatal = 1; | 
| 281 | 
  | 
      simError(); | 
| 282 | 
  | 
    } | 
| 283 | 
< | 
  } else if (args_info.bor_given){ | 
| 283 | 
> | 
  } else if (args_info.ior_given){ | 
| 284 | 
  | 
    if (args_info.rcut_given) { | 
| 285 | 
< | 
      analyser = new BOPofR(info, dumpFileName, sele1, args_info.rcut_arg, | 
| 285 | 
> | 
      analyser = new IcosahedralOfR(info, dumpFileName, sele1,  | 
| 286 | 
> | 
                                    args_info.rcut_arg, | 
| 287 | 
> | 
                                    args_info.nbins_arg, maxLen); | 
| 288 | 
> | 
    } else { | 
| 289 | 
> | 
      sprintf( painCave.errMsg, | 
| 290 | 
> | 
               "A cutoff radius (rcut) must be specified when calculating Bond Order Parameters"); | 
| 291 | 
> | 
      painCave.severity = OPENMD_ERROR; | 
| 292 | 
> | 
      painCave.isFatal = 1; | 
| 293 | 
> | 
      simError(); | 
| 294 | 
> | 
    } | 
| 295 | 
> | 
  } else if (args_info.for_given){ | 
| 296 | 
> | 
    if (args_info.rcut_given) { | 
| 297 | 
> | 
      analyser = new FCCOfR(info, dumpFileName, sele1, args_info.rcut_arg, | 
| 298 | 
  | 
                            args_info.nbins_arg, maxLen); | 
| 299 | 
  | 
    } else { | 
| 300 | 
  | 
      sprintf( painCave.errMsg, | 
| 336 | 
  | 
    analyser = new RNEMDZ(info, dumpFileName, sele1, args_info.nbins_arg); | 
| 337 | 
  | 
  } else if (args_info.rnemdr_given) { | 
| 338 | 
  | 
    analyser = new RNEMDR(info, dumpFileName, sele1, args_info.nbins_arg); | 
| 339 | 
+ | 
  } else if (args_info.rnemdrt_given) { | 
| 340 | 
+ | 
    analyser = new RNEMDRTheta(info, dumpFileName, sele1, | 
| 341 | 
+ | 
                               args_info.nbins_arg, args_info.nanglebins_arg); | 
| 342 | 
+ | 
  } else if (args_info.nitrile_given) { | 
| 343 | 
+ | 
    analyser = new NitrileFrequencyMap(info, dumpFileName, sele1, | 
| 344 | 
+ | 
                                       args_info.nbins_arg); | 
| 345 | 
  | 
  } else if (args_info.p_angle_given) { | 
| 346 | 
< | 
    analyser = new pAngle(info, dumpFileName, sele1, args_info.nbins_arg); | 
| 346 | 
> | 
    if (args_info.sele1_given) {      | 
| 347 | 
> | 
      if (args_info.sele2_given)  | 
| 348 | 
> | 
        analyser  = new pAngle(info, dumpFileName, sele1, sele2, | 
| 349 | 
> | 
                               args_info.nbins_arg); | 
| 350 | 
> | 
      else  | 
| 351 | 
> | 
        if (args_info.seleoffset_given) { | 
| 352 | 
> | 
          if (args_info.seleoffset2_given) { | 
| 353 | 
> | 
            analyser  = new pAngle(info, dumpFileName, sele1,  | 
| 354 | 
> | 
                                   args_info.seleoffset_arg,  | 
| 355 | 
> | 
                                   args_info.seleoffset2_arg,  | 
| 356 | 
> | 
                                   args_info.nbins_arg); | 
| 357 | 
> | 
          } else { | 
| 358 | 
> | 
            analyser  = new pAngle(info, dumpFileName, sele1,  | 
| 359 | 
> | 
                                   args_info.seleoffset_arg,  | 
| 360 | 
> | 
                                   args_info.nbins_arg); | 
| 361 | 
> | 
          } | 
| 362 | 
> | 
        } else  | 
| 363 | 
> | 
          analyser  = new pAngle(info, dumpFileName, sele1,  | 
| 364 | 
> | 
                                 args_info.nbins_arg); | 
| 365 | 
> | 
    } else { | 
| 366 | 
> | 
      sprintf( painCave.errMsg, | 
| 367 | 
> | 
               "At least one selection script (--sele1) must be specified when " | 
| 368 | 
> | 
               "calculating P(angle) distributions"); | 
| 369 | 
> | 
      painCave.severity = OPENMD_ERROR; | 
| 370 | 
> | 
      painCave.isFatal = 1; | 
| 371 | 
> | 
      simError(); | 
| 372 | 
> | 
    } | 
| 373 | 
  | 
#if defined(HAVE_FFTW_H) || defined(HAVE_DFFTW_H) || defined(HAVE_FFTW3_H) | 
| 374 | 
  | 
  }else if (args_info.hxy_given) { | 
| 375 | 
  | 
    analyser = new Hxy(info, dumpFileName, sele1, args_info.nbins_x_arg,  |