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root/OpenMD/trunk/src/applications/staticProps/StaticPropsCmd.c
(Generate patch)

Comparing trunk/src/applications/staticProps/StaticPropsCmd.c (file contents):
Revision 507 by gezelter, Fri Apr 15 22:04:00 2005 UTC vs.
Revision 544 by tim, Fri May 27 04:41:34 2005 UTC

# Line 1 | Line 1
1   /*
2    File autogenerated by gengetopt version 2.11
3    generated with the following command:
4 <  /home/maul/gezelter/tim/bin/gengetopt -F StaticPropsCmd
4 >  /home/maul/gezelter/tim/bin/gengetopt -i StaticProps.ggo -F StaticPropsCmd
5  
6    The developers of gengetopt consider the fixed text that goes in all
7    gengetopt output files to be in the public domain:
# Line 33 | Line 33 | cmdline_parser_print_help (void)
33   {
34    cmdline_parser_print_version ();
35    printf("\n"
36 <         "Usage: %s [OPTIONS]...\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
36 >  "Usage: %s [OPTIONS]...\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
37    printf("\n");
38    printf("  -h, --help                      Print help and exit\n");
39    printf("  -V, --version                   Print version and exit\n");
# Line 43 | Line 43 | cmdline_parser_print_help (void)
43    printf("  -r, --nrbins=INT                number of bins for distance  (default=`100')\n");
44    printf("  -a, --nanglebins=INT            number of bins for cos(angle)  (default=\n                                    `50')\n");
45    printf("  -l, --length=DOUBLE             maximum length (Defaults to 1/2 smallest \n                                    length of first frame)\n");
46 <  printf("      --sele1=selection script    select first stuntdouble set\n");
47 <  printf("      --sele2=selection script    select second stuntdouble set\n");
46 >  printf("      --sele1=selection script    select the first stuntdouble set\n");
47 >  printf("      --sele2=selection script    select the second stuntdouble set\n");
48 >  printf("      --sele3=selection script    select the third stuntdouble set\n");
49    printf("      --refsele=selection script  select reference (use and only use with \n                                    --gxyz)\n");
50 +  printf("      --molname=STRING            molecule name\n");
51 +  printf("      --begin=INT                 begin interanl index\n");
52 +  printf("      --end=INT                   end internal index\n");
53    printf("\n");
54    printf(" Group: staticProps  an option of this group is required\n");
55    printf("      --gofr                      g(r)\n");
# Line 53 | Line 57 | cmdline_parser_print_help (void)
57    printf("      --r_omega                   g(r, cos(omega))\n");
58    printf("      --theta_omega               g(cos(theta), cos(omega))\n");
59    printf("      --gxyz                      g(x, y, z)\n");
60 +  printf("      --p2                        p2 order parameter (--sele1 and --sele2 must \n                                    be specified)\n");
61 +  printf("      --scd                       scd order parameter(either --sele1, --sele2, \n                                    --sele3 are specified or --molname, \n                                    --begin, --end are specified)\n");
62   }
63  
64  
# Line 88 | Line 94 | cmdline_parser (int argc, char * const *argv, struct g
94    args_info->length_given = 0 ;
95    args_info->sele1_given = 0 ;
96    args_info->sele2_given = 0 ;
97 +  args_info->sele3_given = 0 ;
98    args_info->refsele_given = 0 ;
99 +  args_info->molname_given = 0 ;
100 +  args_info->begin_given = 0 ;
101 +  args_info->end_given = 0 ;
102    args_info->gofr_given = 0 ;
103    args_info->r_theta_given = 0 ;
104    args_info->r_omega_given = 0 ;
105    args_info->theta_omega_given = 0 ;
106    args_info->gxyz_given = 0 ;
107 < #define clear_args() {                          \
108 <    args_info->input_arg = NULL;                \
109 <    args_info->output_arg = NULL;               \
110 <    args_info->step_arg = 1 ;                   \
111 <    args_info->nrbins_arg = 100 ;               \
112 <    args_info->nanglebins_arg = 50 ;            \
113 <    args_info->sele1_arg = NULL;                \
114 <    args_info->sele2_arg = NULL;                \
115 <    args_info->refsele_arg = NULL;              \
116 <  }
107 >  args_info->p2_given = 0 ;
108 >  args_info->scd_given = 0 ;
109 > #define clear_args() { \
110 >  args_info->input_arg = NULL; \
111 >  args_info->output_arg = NULL; \
112 >  args_info->step_arg = 1 ;\
113 >  args_info->nrbins_arg = 100 ;\
114 >  args_info->nanglebins_arg = 50 ;\
115 >  args_info->sele1_arg = NULL; \
116 >  args_info->sele2_arg = NULL; \
117 >  args_info->sele3_arg = NULL; \
118 >  args_info->refsele_arg = NULL; \
119 >  args_info->molname_arg = NULL; \
120 > }
121  
122    clear_args();
123  
# Line 128 | Line 142 | cmdline_parser (int argc, char * const *argv, struct g
142          { "length",     1, NULL, 'l' },
143          { "sele1",      1, NULL, 0 },
144          { "sele2",      1, NULL, 0 },
145 +        { "sele3",      1, NULL, 0 },
146          { "refsele",    1, NULL, 0 },
147 +        { "molname",    1, NULL, 0 },
148 +        { "begin",      1, NULL, 0 },
149 +        { "end",        1, NULL, 0 },
150          { "gofr",       0, NULL, 0 },
151          { "r_theta",    0, NULL, 0 },
152          { "r_omega",    0, NULL, 0 },
153          { "theta_omega",        0, NULL, 0 },
154          { "gxyz",       0, NULL, 0 },
155 +        { "p2", 0, NULL, 0 },
156 +        { "scd",        0, NULL, 0 },
157          { NULL, 0, NULL, 0 }
158        };
159  
# Line 222 | Line 242 | cmdline_parser (int argc, char * const *argv, struct g
242  
243  
244          case 0: /* Long option with no short option */
245 <          /* select first stuntdouble set.  */
245 >          /* select the first stuntdouble set.  */
246            if (strcmp (long_options[option_index].name, "sele1") == 0)
247 <            {
248 <              if (args_info->sele1_given)
249 <                {
250 <                  fprintf (stderr, "%s: `--sele1' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
251 <                  clear_args ();
252 <                  exit (EXIT_FAILURE);
253 <                }
254 <              args_info->sele1_given = 1;
255 <              args_info->sele1_arg = gengetopt_strdup (optarg);
256 <              break;
257 <            }
247 >          {
248 >            if (args_info->sele1_given)
249 >              {
250 >                fprintf (stderr, "%s: `--sele1' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
251 >                clear_args ();
252 >                exit (EXIT_FAILURE);
253 >              }
254 >            args_info->sele1_given = 1;
255 >            args_info->sele1_arg = gengetopt_strdup (optarg);
256 >            break;
257 >          }
258            
259 <          /* select second stuntdouble set.  */
259 >          /* select the second stuntdouble set.  */
260            else if (strcmp (long_options[option_index].name, "sele2") == 0)
261 <            {
262 <              if (args_info->sele2_given)
263 <                {
264 <                  fprintf (stderr, "%s: `--sele2' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
265 <                  clear_args ();
266 <                  exit (EXIT_FAILURE);
267 <                }
268 <              args_info->sele2_given = 1;
269 <              args_info->sele2_arg = gengetopt_strdup (optarg);
270 <              break;
271 <            }
261 >          {
262 >            if (args_info->sele2_given)
263 >              {
264 >                fprintf (stderr, "%s: `--sele2' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
265 >                clear_args ();
266 >                exit (EXIT_FAILURE);
267 >              }
268 >            args_info->sele2_given = 1;
269 >            args_info->sele2_arg = gengetopt_strdup (optarg);
270 >            break;
271 >          }
272            
273 +          /* select the third stuntdouble set.  */
274 +          else if (strcmp (long_options[option_index].name, "sele3") == 0)
275 +          {
276 +            if (args_info->sele3_given)
277 +              {
278 +                fprintf (stderr, "%s: `--sele3' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
279 +                clear_args ();
280 +                exit (EXIT_FAILURE);
281 +              }
282 +            args_info->sele3_given = 1;
283 +            args_info->sele3_arg = gengetopt_strdup (optarg);
284 +            break;
285 +          }
286 +          
287            /* select reference (use and only use with --gxyz).  */
288            else if (strcmp (long_options[option_index].name, "refsele") == 0)
289 <            {
290 <              if (args_info->refsele_given)
291 <                {
292 <                  fprintf (stderr, "%s: `--refsele' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
293 <                  clear_args ();
294 <                  exit (EXIT_FAILURE);
295 <                }
296 <              args_info->refsele_given = 1;
297 <              args_info->refsele_arg = gengetopt_strdup (optarg);
298 <              break;
299 <            }
289 >          {
290 >            if (args_info->refsele_given)
291 >              {
292 >                fprintf (stderr, "%s: `--refsele' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
293 >                clear_args ();
294 >                exit (EXIT_FAILURE);
295 >              }
296 >            args_info->refsele_given = 1;
297 >            args_info->refsele_arg = gengetopt_strdup (optarg);
298 >            break;
299 >          }
300 >          
301 >          /* molecule name.  */
302 >          else if (strcmp (long_options[option_index].name, "molname") == 0)
303 >          {
304 >            if (args_info->molname_given)
305 >              {
306 >                fprintf (stderr, "%s: `--molname' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
307 >                clear_args ();
308 >                exit (EXIT_FAILURE);
309 >              }
310 >            args_info->molname_given = 1;
311 >            args_info->molname_arg = gengetopt_strdup (optarg);
312 >            break;
313 >          }
314 >          
315 >          /* begin interanl index.  */
316 >          else if (strcmp (long_options[option_index].name, "begin") == 0)
317 >          {
318 >            if (args_info->begin_given)
319 >              {
320 >                fprintf (stderr, "%s: `--begin' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
321 >                clear_args ();
322 >                exit (EXIT_FAILURE);
323 >              }
324 >            args_info->begin_given = 1;
325 >            args_info->begin_arg = strtol (optarg,&stop_char,0);
326 >            break;
327 >          }
328            
329 +          /* end internal index.  */
330 +          else if (strcmp (long_options[option_index].name, "end") == 0)
331 +          {
332 +            if (args_info->end_given)
333 +              {
334 +                fprintf (stderr, "%s: `--end' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
335 +                clear_args ();
336 +                exit (EXIT_FAILURE);
337 +              }
338 +            args_info->end_given = 1;
339 +            args_info->end_arg = strtol (optarg,&stop_char,0);
340 +            break;
341 +          }
342 +          
343            /* g(r).  */
344            else if (strcmp (long_options[option_index].name, "gofr") == 0)
345 <            {
346 <              if (args_info->gofr_given)
347 <                {
348 <                  fprintf (stderr, "%s: `--gofr' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
349 <                  clear_args ();
350 <                  exit (EXIT_FAILURE);
351 <                }
352 <              args_info->gofr_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
345 >          {
346 >            if (args_info->gofr_given)
347 >              {
348 >                fprintf (stderr, "%s: `--gofr' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
349 >                clear_args ();
350 >                exit (EXIT_FAILURE);
351 >              }
352 >            args_info->gofr_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
353            
354 <              break;
355 <            }
354 >            break;
355 >          }
356            
357            /* g(r, cos(theta)).  */
358            else if (strcmp (long_options[option_index].name, "r_theta") == 0)
359 <            {
360 <              if (args_info->r_theta_given)
361 <                {
362 <                  fprintf (stderr, "%s: `--r_theta' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
363 <                  clear_args ();
364 <                  exit (EXIT_FAILURE);
365 <                }
366 <              args_info->r_theta_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
359 >          {
360 >            if (args_info->r_theta_given)
361 >              {
362 >                fprintf (stderr, "%s: `--r_theta' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
363 >                clear_args ();
364 >                exit (EXIT_FAILURE);
365 >              }
366 >            args_info->r_theta_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
367            
368 <              break;
369 <            }
368 >            break;
369 >          }
370            
371            /* g(r, cos(omega)).  */
372            else if (strcmp (long_options[option_index].name, "r_omega") == 0)
373 <            {
374 <              if (args_info->r_omega_given)
375 <                {
376 <                  fprintf (stderr, "%s: `--r_omega' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
377 <                  clear_args ();
378 <                  exit (EXIT_FAILURE);
379 <                }
380 <              args_info->r_omega_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
373 >          {
374 >            if (args_info->r_omega_given)
375 >              {
376 >                fprintf (stderr, "%s: `--r_omega' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
377 >                clear_args ();
378 >                exit (EXIT_FAILURE);
379 >              }
380 >            args_info->r_omega_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
381            
382 <              break;
383 <            }
382 >            break;
383 >          }
384            
385            /* g(cos(theta), cos(omega)).  */
386            else if (strcmp (long_options[option_index].name, "theta_omega") == 0)
387 <            {
388 <              if (args_info->theta_omega_given)
389 <                {
390 <                  fprintf (stderr, "%s: `--theta_omega' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
391 <                  clear_args ();
392 <                  exit (EXIT_FAILURE);
393 <                }
394 <              args_info->theta_omega_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
387 >          {
388 >            if (args_info->theta_omega_given)
389 >              {
390 >                fprintf (stderr, "%s: `--theta_omega' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
391 >                clear_args ();
392 >                exit (EXIT_FAILURE);
393 >              }
394 >            args_info->theta_omega_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
395            
396 <              break;
397 <            }
396 >            break;
397 >          }
398            
399            /* g(x, y, z).  */
400            else if (strcmp (long_options[option_index].name, "gxyz") == 0)
401 <            {
402 <              if (args_info->gxyz_given)
403 <                {
404 <                  fprintf (stderr, "%s: `--gxyz' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
405 <                  clear_args ();
406 <                  exit (EXIT_FAILURE);
407 <                }
408 <              args_info->gxyz_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
401 >          {
402 >            if (args_info->gxyz_given)
403 >              {
404 >                fprintf (stderr, "%s: `--gxyz' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
405 >                clear_args ();
406 >                exit (EXIT_FAILURE);
407 >              }
408 >            args_info->gxyz_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
409            
410 <              break;
411 <            }
410 >            break;
411 >          }
412            
413 +          /* p2 order parameter (--sele1 and --sele2 must be specified).  */
414 +          else if (strcmp (long_options[option_index].name, "p2") == 0)
415 +          {
416 +            if (args_info->p2_given)
417 +              {
418 +                fprintf (stderr, "%s: `--p2' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
419 +                clear_args ();
420 +                exit (EXIT_FAILURE);
421 +              }
422 +            args_info->p2_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
423 +          
424 +            break;
425 +          }
426 +          
427 +          /* scd order parameter(either --sele1, --sele2, --sele3 are specified or --molname, --begin, --end are specified).  */
428 +          else if (strcmp (long_options[option_index].name, "scd") == 0)
429 +          {
430 +            if (args_info->scd_given)
431 +              {
432 +                fprintf (stderr, "%s: `--scd' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
433 +                clear_args ();
434 +                exit (EXIT_FAILURE);
435 +              }
436 +            args_info->scd_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
437 +          
438 +            break;
439 +          }
440 +          
441  
442          case '?':       /* Invalid option.  */
443            /* `getopt_long' already printed an error message.  */

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