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root/OpenMD/trunk/src/io/DumpReader.cpp
(Generate patch)

Comparing trunk/src/io/DumpReader.cpp (file contents):
Revision 246 by gezelter, Wed Jan 12 22:41:40 2005 UTC vs.
Revision 274 by tim, Tue Jan 25 21:59:18 2005 UTC

# Line 80 | Line 80 | DumpReader::DumpReader(SimInfo* info, const std::strin
80          inFile_ = fopen(filename_.c_str(), "r");
81  
82          if (inFile_ == NULL) {
83 <            sprintf(painCave.errMsg, "Cannot open file: %s\n", filename_.c_str());
83 >            sprintf(painCave.errMsg, "DumpReader: Cannot open file: %s\n", filename_.c_str());
84              painCave.isFatal = 1;
85              simError();
86          }
# Line 108 | Line 108 | DumpReader::~DumpReader() {
108          error = fclose(inFile_);
109  
110          if (error) {
111 <            sprintf(painCave.errMsg, "Error closing %s\n", filename_.c_str());
111 >            sprintf(painCave.errMsg, "DumpReader Error: Error closing %s\n", filename_.c_str());
112              painCave.isFatal = 1;            
113              simError();
114          }
# Line 155 | Line 155 | void DumpReader::scanFile(void) {
155  
156          if (feof(inFile_)) {
157              sprintf(painCave.errMsg,
158 <                    "File \"%s\" ended unexpectedly at line %d\n",
158 >                    "DumpReader Error: File \"%s\" ended unexpectedly at line %d\n",
159                      filename_.c_str(),
160                      lineNum);
161              painCave.isFatal = 1;
# Line 172 | Line 172 | void DumpReader::scanFile(void) {
172  
173              if (feof(inFile_)) {
174                  sprintf(painCave.errMsg,
175 <                        "File \"%s\" ended unexpectedly at line %d\n",
175 >                        "DumpReader Error: File \"%s\" ended unexpectedly at line %d\n",
176                          filename_.c_str(),
177                          lineNum);
178                  painCave.isFatal = 1;
# Line 185 | Line 185 | void DumpReader::scanFile(void) {
185  
186                  if (feof(inFile_)) {
187                      sprintf(painCave.errMsg,
188 <                            "File \"%s\" ended unexpectedly at line %d,"
188 >                            "DumpReader Error: File \"%s\" ended unexpectedly at line %d,"
189                                  " with atom %d\n", filename_.c_str(),
190                              lineNum,
191                              j);
# Line 254 | Line 254 | void DumpReader::readSet(int whichFrame) {
254                      "does not match the meta-data file's nIntegrable, %d.\n",
255                  filename_.c_str(),
256                  nTotObjs,
257 <                info_->getNIntegrableObjects());
257 >                info_->getNGlobalIntegrableObjects());
258  
259          painCave.isFatal = 1;
260          simError();
# Line 265 | Line 265 | void DumpReader::readSet(int whichFrame) {
265      eof_test = fgets(read_buffer, sizeof(read_buffer), inFile_);
266  
267      if (eof_test == NULL) {
268 <        sprintf(painCave.errMsg, "error in reading commment in %s\n",
268 >        sprintf(painCave.errMsg, "DumpReader Error: error in reading commment in %s\n",
269                  filename_.c_str());
270          painCave.isFatal = 1;
271          simError();
# Line 284 | Line 284 | void DumpReader::readSet(int whichFrame) {
284  
285              if (eof_test == NULL) {
286                  sprintf(painCave.errMsg,
287 <                        "error in reading file %s\n"
287 >                        "DumpReader Error: error in reading file %s\n"
288                              "natoms  = %d; index = %d\n"
289                              "error reading the line from the file.\n",
290                          filename_.c_str(),
# Line 324 | Line 324 | void DumpReader::readSet(int whichFrame) {
324          eof_test = fgets(read_buffer, sizeof(read_buffer), inFile_);
325  
326          if (eof_test == NULL) {
327 <            sprintf(painCave.errMsg, "Error reading 1st line of %s \n ",
327 >            sprintf(painCave.errMsg, "DumpReader Error: Error reading 1st line of %s \n ",
328                      filename_.c_str());
329              painCave.isFatal = 1;
330              simError();
# Line 353 | Line 353 | void DumpReader::readSet(int whichFrame) {
353          eof_test = fgets(read_buffer, sizeof(read_buffer), inFile_);
354  
355          if (eof_test == NULL) {
356 <            sprintf(painCave.errMsg, "error in reading commment in %s\n",
356 >            sprintf(painCave.errMsg, "DumpReader Error: error in reading commment in %s\n",
357                      filename_.c_str());
358              painCave.isFatal = 1;
359              simError();
# Line 376 | Line 376 | void DumpReader::readSet(int whichFrame) {
376                  mol = info_->getMoleculeByGlobalIndex(i);
377  
378                  if (mol == NULL) {
379 <                    sprintf(painCave.errMsg, "Molecule not found on node %d!", worldRank);
379 >                    sprintf(painCave.errMsg, "DumpReader Error: Molecule not found on node %d!", worldRank);
380                          painCave.isFatal = 1;
381                      simError();
382                  }
# Line 388 | Line 388 | void DumpReader::readSet(int whichFrame) {
388  
389                      if (eof_test == NULL) {
390                          sprintf(painCave.errMsg,
391 <                                "error in reading file %s\n"
391 >                                "DumpReader Error: error in reading file %s\n"
392                                      "natoms  = %d; index = %d\n"
393                                      "error reading the line from the file.\n",
394                                  filename_.c_str(),
# Line 412 | Line 412 | void DumpReader::readSet(int whichFrame) {
412  
413                      if (eof_test == NULL) {
414                          sprintf(painCave.errMsg,
415 <                                "error in reading file %s\n"
415 >                                "DumpReader Error: error in reading file %s\n"
416                                      "natoms  = %d; index = %d\n"
417                                      "error reading the line from the file.\n",
418                                  filename_.c_str(),
# Line 443 | Line 443 | void DumpReader::readSet(int whichFrame) {
443                  
444                  mol = info_->getMoleculeByGlobalIndex(i);
445                  if (mol == NULL) {
446 <                    sprintf(painCave.errMsg, "Molecule not found on node %d!", worldRank);
446 >                    sprintf(painCave.errMsg, "DumpReader Error: Molecule not found on node %d!", worldRank);
447                      painCave.isFatal = 1;
448                      simError();
449                  }
# Line 485 | Line 485 | void DumpReader::parseDumpLine(char *line, StuntDouble
485  
486      if (nTokens < 14) {
487              sprintf(painCave.errMsg,
488 <                    "Not enough Tokens.\n");
488 >                    "DumpReader Error: Not enough Tokens.\n");
489              painCave.isFatal = 1;
490              simError();
491      }
# Line 493 | Line 493 | void DumpReader::parseDumpLine(char *line, StuntDouble
493      std::string name = tokenizer.nextToken();
494  
495      if (name != integrableObject->getType()) {
496 <        
496 >
497 >            sprintf(painCave.errMsg,
498 >                    "DumpReader Error: Atom type [%s] in %s does not match Atom Type [%s] in .md file.\n",
499 >                    name.c_str(), filename_.c_str(), integrableObject->getType().c_str());
500 >            painCave.isFatal = 1;
501 >            simError();        
502      }
503  
504      pos[0] = tokenizer.nextTokenAsDouble();
# Line 517 | Line 522 | void DumpReader::parseDumpLine(char *line, StuntDouble
522          if (qlen < oopse::epsilon) { //check quaternion is not equal to 0
523              
524              sprintf(painCave.errMsg,
525 <                    "initial quaternion error (q0^2 + q1^2 + q2^2 + q3^2 ~ 0).\n");
525 >                    "DumpReader Error: initial quaternion error (q0^2 + q1^2 + q2^2 + q3^2 ~ 0).\n");
526              painCave.isFatal = 1;
527              simError();
528              
# Line 551 | Line 556 | void DumpReader::parseCommentLine(char* line, Snapshot
556      //comment line should at least contain 10 tokens: current time(1 token) and  h-matrix(9 tokens)
557      if (nTokens < 10) {
558              sprintf(painCave.errMsg,
559 <                    "Not enough tokens in comment line: %s", line);
559 >                    "DumpReader Error: Not enough tokens in comment line: %s", line);
560              painCave.isFatal = 1;
561              simError();  
562      }

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