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root/OpenMD/trunk/src/selection/SelectionEvaluator.cpp
(Generate patch)

Comparing trunk/src/selection/SelectionEvaluator.cpp (file contents):
Revision 283 by tim, Thu Feb 3 23:14:05 2005 UTC vs.
Revision 415 by tim, Wed Mar 9 18:46:16 2005 UTC

# Line 49 | Line 49 | namespace oopse {
49   namespace oopse {
50  
51  
52 < SelectionEvaluator::SelectionEvaluator(SimInfo* si, const std::string& script) : info(si), finder(info){
52 > SelectionEvaluator::SelectionEvaluator(SimInfo* si)
53 >    : info(si), nameFinder(info), distanceFinder(info), indexFinder(info), isLoaded_(false){
54 >    
55 >    nStuntDouble = info->getNGlobalAtoms() + info->getNRigidBodies();
56   }            
57  
58   bool SelectionEvaluator::loadScript(const std::string& filename, const std::string& script) {
59 +    clearDefinitionsAndLoadPredefined();
60      this->filename = filename;
61      this->script = script;
62      if (! compiler.compile(filename, script)) {
63          error = true;
64          errorMessage = compiler.getErrorMessage();
65 +        std::cerr << "SelectionCompiler Error: " << errorMessage << std::endl;
66          return false;
67      }
68  
# Line 65 | Line 70 | bool SelectionEvaluator::loadScript(const std::string&
70      aatoken = compiler.getAatokenCompiled();
71      linenumbers = compiler.getLineNumbers();
72      lineIndices = compiler.getLineIndices();
73 +
74 +    std::vector<std::vector<Token> >::const_iterator i;  
75 +
76 +    isDynamic_ = false;
77 +    for (i = aatoken.begin(); i != aatoken.end(); ++i) {
78 +        if (containDynamicToken(*i)) {
79 +            isDynamic_ = true;
80 +            break;
81 +        }
82 +    }
83 +
84 +    isLoaded_ = true;
85      return true;
86   }
87  
88   void SelectionEvaluator::clearState() {
89 <    for (int i = scriptLevelMax; --i >= 0; )
90 <        stack[i].clear();
91 <    scriptLevel = 0;
89 >    //for (int i = scriptLevelMax; --i >= 0; )
90 >    //    stack[i].clear();
91 >    //scriptLevel = 0;
92      error = false;
93      errorMessage = "";
94   }
# Line 87 | Line 104 | bool SelectionEvaluator::loadScriptFileInternal(const
104   }
105  
106   bool SelectionEvaluator::loadScriptFileInternal(const  std::string & filename) {
107 <    return true; /**@todo */
108 < }
107 >  std::ifstream ifs(filename.c_str());
108 >    if (!ifs.is_open()) {
109 >        return false;
110 >    }
111  
112 < void SelectionEvaluator::instructionDispatchLoop(){
112 >    const int bufferSize = 65535;
113 >    char buffer[bufferSize];
114 >    std::string script;
115 >    while(ifs.getline(buffer, bufferSize)) {
116 >        script += buffer;
117 >    }
118 >    return loadScript(filename, script);
119 > }
120  
121 + void SelectionEvaluator::instructionDispatchLoop(BitSet& bs){
122 +    
123      while ( pc < aatoken.size()) {
124          statement = aatoken[pc++];
125          statementLength = statement.size();
# Line 101 | Line 129 | void SelectionEvaluator::instructionDispatchLoop(){
129                  define();
130              break;
131              case Token::select:
132 <                select();
132 >                select(bs);
133              break;
134              default:
135                  unrecognizedCommand(token);
136              return;
137          }
138      }
139 +
140   }
141  
142    BitSet SelectionEvaluator::expression(const std::vector<Token>& code, int pcStart) {
143      BitSet bs;
144      std::stack<BitSet> stack;
145      
146 <    for (int pc = pcStart; ; ++pc) {
146 >    for (int pc = pcStart; pc < code.size(); ++pc) {
147        Token instruction = code[pc];
148  
149        switch (instruction.tok) {
# Line 154 | Line 183 | void SelectionEvaluator::instructionDispatchLoop(){
183        case Token::name:
184          stack.push(nameInstruction(boost::any_cast<std::string>(instruction.value)));
185          break;
186 +      case Token::index:
187 +        stack.push(indexInstruction(instruction.value));
188          break;
189        case Token::identifier:
190          stack.push(lookupValue(boost::any_cast<std::string>(instruction.value)));
# Line 184 | Line 215 | BitSet SelectionEvaluator::comparatorInstruction(const
215      float comparisonValue = boost::any_cast<float>(instruction.value);
216      float propertyValue;
217      BitSet bs(nStuntDouble);
218 +    bs.clearAll();
219      
220      SimInfo::MoleculeIterator mi;
221      Molecule* mol;
# Line 250 | Line 282 | void SelectionEvaluator::withinInstruction(const Token
282   }
283  
284   void SelectionEvaluator::withinInstruction(const Token& instruction, BitSet& bs){
285 <
285 >    
286      boost::any withinSpec = instruction.value;
287 +    float distance;
288      if (withinSpec.type() == typeid(float)){
289 <        //
290 <        return;
289 >        distance = boost::any_cast<float>(withinSpec);
290 >    } else if (withinSpec.type() == typeid(int)) {
291 >        distance = boost::any_cast<int>(withinSpec);    
292 >    } else {
293 >        evalError("casting error in withinInstruction");
294 >        bs.clearAll();
295      }
296      
297 <    evalError("Unrecognized within parameter");
297 >    bs = distanceFinder.find(bs, distance);            
298   }
299  
300   void SelectionEvaluator::define() {
# Line 265 | Line 302 | void SelectionEvaluator::define() {
302  
303      std::string variable = boost::any_cast<std::string>(statement[1].value);
304  
305 <    variables.insert(std::make_pair(variable, expression(statement, 2)));
305 >    variables.insert(VariablesType::value_type(variable, expression(statement, 2)));
306   }
307  
308  
# Line 284 | Line 321 | void SelectionEvaluator::predefine(const std::string&
321              int tok = statement[1].tok;
322              if (tok == Token::identifier || (tok & Token::predefinedset) == Token::predefinedset) {
323                  std::string variable = boost::any_cast<std::string>(statement[1].value);
324 <                variables.insert(std::make_pair(variable, statement));
324 >                variables.insert(VariablesType::value_type(variable, statement));
325  
326              } else {
327                  evalError("invalid variable name:" + script);
# Line 301 | Line 338 | void SelectionEvaluator::predefine(const std::string&
338  
339   }
340  
341 < void SelectionEvaluator::select(){
342 <    //viewer.setSelectionSet(expression(statement, 1));
341 > void SelectionEvaluator::select(BitSet& bs){
342 >    bs = expression(statement, 1);
343   }
344  
345   BitSet SelectionEvaluator::lookupValue(const std::string& variable){
346  
347 +    BitSet bs(nStuntDouble);
348      std::map<std::string, boost::any>::iterator i = variables.find(variable);
349 <
349 >    
350      if (i != variables.end()) {
351          if (i->second.type() == typeid(BitSet)) {
352              return boost::any_cast<BitSet>(i->second);
353          } else if (i->second.type() ==  typeid(std::vector<Token>)){
354 <            BitSet bs = expression(boost::any_cast<std::vector<Token> >(i->second), 2);
354 >            bs = expression(boost::any_cast<std::vector<Token> >(i->second), 2);
355              i->second =  bs; /**@todo fixme */
356              return bs;
357          }
358      } else {
359          unrecognizedIdentifier(variable);
360      }
361 +
362 +    return bs;
363   }
364  
365   BitSet SelectionEvaluator::nameInstruction(const std::string& name){
326 –    BitSet bs(nStuntDouble);
366      
367 <    bool hasError = finder.match(name, bs);
368 <    
330 <    return bs;    
367 >    return nameFinder.match(name);
368 >
369   }    
370  
371 + bool SelectionEvaluator::containDynamicToken(const std::vector<Token>& tokens){
372 +    std::vector<Token>::const_iterator i;
373 +    for (i = tokens.begin(); i != tokens.end(); ++i) {
374 +        if (i->tok & Token::dynamic) {
375 +            return true;
376 +        }
377 +    }
378  
379 +    return false;
380 + }    
381 +
382 + void SelectionEvaluator::clearDefinitionsAndLoadPredefined() {
383 +    variables.clear();
384 +    //load predefine
385 +    //predefine();
386   }
387 +
388 + BitSet SelectionEvaluator::evaluate() {
389 +    BitSet bs(nStuntDouble);
390 +    if (isLoaded_) {
391 +        pc = 0;
392 +        instructionDispatchLoop(bs);
393 +    }
394 +
395 +    return bs;
396 + }
397 +
398 + BitSet SelectionEvaluator::indexInstruction(const boost::any& value) {
399 +    BitSet bs(nStuntDouble);
400 +
401 +    if (value.type() == typeid(int)) {
402 +        int index = boost::any_cast<int>(value);
403 +        if (index < 0 || index >= bs.size()) {
404 +            invalidIndex(index);
405 +        } else {
406 +            bs = indexFinder.find(index);
407 +        }
408 +    } else if (value.type() == typeid(std::pair<int, int>)) {
409 +        std::pair<int, int> indexRange= boost::any_cast<std::pair<int, int> >(value);
410 +        assert(indexRange.first <= indexRange.second);
411 +        if (indexRange.first < 0 || indexRange.second >= bs.size()) {
412 +            invalidIndexRange(indexRange);
413 +        }else {
414 +            bs = indexFinder.find(indexRange.first, indexRange.second);
415 +        }
416 +    }
417 +
418 +    return bs;
419 + }
420 +
421 + }

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