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root/group/branches/mmeineke/xyz2pov/src/AtomTypes
Revision: 60
Committed: Thu Aug 1 21:12:33 2002 UTC (22 years, 1 month ago) by mmeineke
File size: 7409 byte(s)
Log Message: 
A pair of utilities to turn an xyz file into a sequence of povray rendered images.

File Contents

# User Rev Content
1 mmeineke 60 #Type Base Number Mass vdWR covR Red Green Blue
2     # X is a fall-back element type that should always exist
3     X X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
4     # The elements:
5     H H 1 1.008 1.20 0.32 250 235 215
6     He He 2 4.003 1.40 0.93 255 192 203
7     Li Li 3 6.941 1.82 1.23 178 34 34
8     Be Be 4 9.0122 1.3725 0.90 34 139 34
9     B B 5 10.811 0.795 0.82 0 255 0
10     C C 6 12.011 1.70 0.77 112 128 144
11     N N 7 14.007 1.55 0.75 0 191 255
12     O O 8 15.999 1.52 0.73 255 0 0
13     F F 9 18.998 1.47 0.72 218 165 32
14     Ne Ne 10 20.18 1.54 0.71 255 105 180
15     Na Na 11 22.99 2.27 1.54 0 0 255
16     Mg Mg 12 24.312 1.73 1.36 34 139 34
17     Al Al 13 26.982 1.7 1.18 190 190 190
18     Si Si 14 28.086 2.10 1.11 218 165 32
19     P P 15 30.974 1.80 1.06 255 165 0
20     S S 16 32.06 1.80 1.02 255 255 0
21     Cl Cl 17 35.453 1.75 0.99 0 255 0
22     Ar Ar 18 39.948 1.88 0.98 255 192 203
23     K K 19 39.098 2.75 2.03 255 20 147
24     Ca Ca 20 40.078 2.45 1.74 128 128 128
25     Sc Sc 21 44.956 1.37 1.44 190 190 190
26     Ti Ti 22 47.9 1.37 1.32 190 190 190
27     V V 23 50.941 1.37 1.22 190 190 190
28     Cr Cr 24 51.996 1.37 1.18 190 190 190
29     Mn Mn 25 54.938 1.37 1.17 190 190 190
30     Fe Fe 26 55.847 1.456 1.17 255 165 0
31     Co Co 27 58.933 0.88 1.16 165 42 42
32     Ni Ni 28 58.71 0.69 1.15 165 42 42
33     Cu Cu 29 63.54 0.72 1.17 165 42 42
34     Zn Zn 30 65.37 0.74 1.25 165 42 42
35     Ga Ga 31 69.72 1.37 1.26 165 42 42
36     Ge Ge 32 72.59 1.95 1.22 85 107 47
37     As As 33 74.9216 1.85 1.20 253 245 230
38     Se Se 34 78.96 1.90 1.16 152 251 152
39     Br Br 35 79.904 1.85 1.14 165 42 42
40     Kr Kr 36 83.80 2.02 1.12 50 205 50
41     Rb Rb 37 85.47 1.58 2.16 165 42 42
42     Sr Sr 38 87.62 2.151 1.91 190 190 190
43     Y Y 39 88.9059 1.801 1.62 190 190 190
44     Zr Zr 40 91.224 1.602 1.45 190 190 190
45     Nb Nb 41 92.9064 1.468 1.34 190 190 190
46     Mo Mo 42 95.94 1.526 1.30 255 127 80
47     Tc Tc 43 98.0 1.360 1.27 190 190 190
48     Ru Ru 44 101.07 1.339 1.25 190 190 190
49     Rh Rh 45 102.906 1.345 1.25 190 190 190
50     Pd Pd 46 106.42 1.376 1.28 190 190 190
51     Ag Ag 47 107.87 1.27 1.34 19 190 190
52     Cd Cd 48 112.41 1.424 1.48 255 140 0
53     In In 49 114.82 1.663 1.44 190 190 190
54     Sn Sn 50 118.71 2.10 1.41 190 190 190
55     Sb Sb 51 121.75 2.05 1.40 190 190 190
56     Te Te 52 127.60 2.06 1.36 190 190 190
57     I I 53 129.905 1.98 1.33 160 32 240
58     Xe Xe 54 131.29 2.00 1.31 255 105 180
59     Cs Cs 55 132.905 1.84 2.35 165 42 42
60     Ba Ba 56 137.33 2.243 1.98 190 190 190
61     La La 57 138.906 1.877 1.69 190 190 190
62     Lu Lu 71 174.967 2.17 1.60 190 190 190
63     Hf Hf 72 178.49 1.580 1.44 190 190 190
64     Ta Ta 73 180.948 1.467 1.34 190 190 190
65     W W 74 183.85 1.534 1.30 64 224 208
66     Re Re 75 186.207 1.375 1.28 190 190 190
67     Os Os 76 190.2 1.353 1.26 190 190 190
68     Ir Ir 77 192.22 1.357 1.27 190 90 190
69     Pt Pt 78 195.08 1.75 1.30 190 190 190
70     Au Au 79 196.967 1.66 1.34 255 215 0
71     Hg Hg 80 200.59 1.55 1.49 190 190 190
72     Tl Tl 81 204.383 1.96 1.48 190 190 190
73     Pb Pb 82 207.2 2.02 1.47 190 190 190
74     Bi Bi 83 208.98 2.15 1.46 255 181 197
75     # Derived types
76     LP X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
77     PD X 0 0.0 0.0 0.0 0 0 0
78     DM X 0 0.0 0.0 0.0 0 0 0
79     1 H 1 1.008 1.20 0.32 250 235 215
80     H3 H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
81     HALI H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
82     HARO H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
83     HC H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
84     HHBN H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
85     HN H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
86     HO H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
87     HS H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
88     HE He 2 4.003 1.40 0.93 255 192 203
89     3 Li 3 6.941 1.82 1.23 178 34 34
90     LI Li 3 6.941 1.82 1.23 178 34 34
91     5 B 5 10.811 0.795 0.82 0 255 0
92     6 C 6 12.011 1.70 0.77 112 128 144
93     C1 C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
94     C2 C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
95     C3 C 6 12.011 1.65 0.77 112 128 144
96     CA C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
97     CAR C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
98     CARO C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
99     CB C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
100     CH2AL C 6 14.027 1.65 0.77 112 128 144
101     CH2OL C 6 14.027 1.65 0.77 112 128 144
102     CH3AL C 6 15.035 1.77 0.77 112 128 144
103     CHAL C 6 13.019 1.67 0.77 112 128 144
104     CHAR C 6 13.019 1.58 0.77 112 128 144
105     CHOL C 6 13.019 1.67 0.77 112 128 144
106     CSP C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
107     CSP2 C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
108     CSP3 C 6 12.011 1.65 0.77 112 128 144
109     CT C 6 15.035 1.77 0.77 112 128 144
110     7 N 7 14.007 1.55 0.75 0 191 255
111     N1 N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
112     N2 N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
113     N3 N 7 14.007 1.5 0.75 0 191 255
114     N3+ N 7 14.007 1.5 0.75 0 191 255
115     NAM N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
116     NAR N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
117     NARO N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
118     NPL3 N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
119     NSP N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
120     NSP2 N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
121     NSP3 N 7 14.007 1.5 0.75 0 191 255
122     NSP3+ N 7 14.007 1.5 0.75 0 191 255
123     8 O 8 15.999 1.52 0.73 255 0 0
124     O2 O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
125     O3 O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
126     OH O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
127     OSP2 O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
128     OSP3 O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
129     OSP3- O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
130     9 F 9 18.998 1.47 0.72 218 165 32
131     NE Ne 10 20.18 1.54 0.71 255 105 180
132     11 Na 11 22.99 2.27 1.54 0 0 255
133     NA Na 11 22.99 2.27 1.54 0 0 255
134     12 Mg 12 24.312 1.73 1.36 34 139 34
135     MG Mg 12 24.312 1.73 1.36 34 139 34
136     13 Al 13 26.982 1.7 1.18 190 190 190
137     AL Al 13 26.982 1.7 1.18 190 190 190
138     14 Si 14 28.086 2.10 1.11 218 165 32
139     SI Si 14 28.086 2.10 1.11 218 165 32
140     15 P 15 30.974 1.80 1.06 255 165 0
141     P(C) P 15 30.974 1.75 1.06 255 165 0
142     P(N) P 15 30.974 1.75 1.06 255 165 0
143     P(O) P 15 30.974 1.75 1.06 255 165 0
144     P(S) P 15 30.974 1.75 1.06 255 165 0
145     16 S 16 32.06 1.80 1.02 255 255 0
146     S2 S 16 32.06 1.85 1.02 255 255 0
147     S3 S 16 32.06 1.85 1.02 255 255 0
148     SDIV S 16 32.06 1.85 1.02 255 255 0
149     STET S 16 32.06 1.85 1.02 255 255 0
150     STRI S 16 32.06 1.85 1.02 255 255 0
151     Sh S 16 32.06 1.85 1.02 25 255 0
152     17 Cl 17 35.453 1.75 0.99 0 255 0
153     CL Cl 17 35.453 1.75 0.99 0 255 0
154     AR Ar 18 39.948 1.88 0.98 255 192 203
155     HV Ar 18 399.48 1.91 0.0 255 192 203
156     LT Ar 18 39.948 1.91 0.0 255 192 203
157     DZ Ar 18 39.948 1.91 0.0 255 192 203
158     19 K 19 39.098 2.75 2.03 255 20 147
159     20 Ca 20 40.078 2.45 1.74 128 128 128
160     21 Sc 21 44.956 1.37 1.44 190 190 190
161     SC Sc 21 44.956 1.37 1.44 190 190 190
162     22 Ti 22 47.9 1.37 1.32 190 190 190
163     TI Ti 22 47.9 1.37 1.32 190 190 190
164     23 V 23 50.941 1.37 1.22 190 190 190
165     24 Cr 24 51.996 1.37 1.18 190 190 190
166     CR Cr 24 51.996 1.37 1.18 190 190 190
167     25 Mn 25 54.938 1.37 1.17 190 190 190
168     MN Mn 25 54.938 1.37 1.17 190 190 190
169     26 Fe 26 55.847 1.456 1.17 255 165 0
170     FE Fe 26 55.847 1.456 1.17 255 165 0
171     27 Co 27 58.933 0.88 1.16 165 42 42
172     CO Co 27 58.933 0.88 1.16 165 42 42
173     28 Ni 28 58.71 0.69 1.15 165 42 42
174     NI Ni 28 58.71 0.69 1.15 165 42 42
175     29 Cu 29 63.54 0.72 1.17 165 42 42
176     CU Cu 29 63.54 0.72 1.17 165 42 42
177     30 Zn 30 65.37 0.74 1.25 165 42 42
178     ZN Zn 30 65.37 0.74 1.25 165 42 42
179     31 Ga 31 69.72 1.37 1.26 165 42 42
180     GA Ga 31 69.72 1.37 1.26 165 42 42
181     GE Ge 32 72.59 1.95 1.22 85 107 47
182     35 Br 35 79.904 1.85 1.14 165 42 42
183     BR Br 35 79.904 1.85 1.14 165 42 42
184     37 Rb 37 85.47 1.58 2.16 165 42 42
185     RB Rb 37 85.47 1.58 2.16 165 42 42
186     MO Mo 42 95.94 1.526 1.30 255 127 80
187     47 Ag 47 107.87 1.27 1.34 190 190 190
188     AG Ag 47 107.87 1.27 1.34 190 190 190
189     53 I 53 129.905 1.98 1.33 160 32 240
190     55 Cs 55 132.905 1.84 2.35 165 42 42
191     CS Cs 55 132.905 1.84 2.35 165 42 42
192     79 Au 79 196.967 1.66 1.34 255 215 0
193     AU Au 79 196.967 1.66 1.34 255 215 0
194     # Some oddball types derived from X
195     XX X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
196     + X 0 0.0 1.0 1.38 255 20 147
197     ++ X 0 0.0 1.0 0.9 255 20 147
198     - X 0 0.0 1.0 2.0 255 20 147
199     -- X 0 0.0 1.0 2.0 255 20 147
200     DUMMY X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
201     RESERV X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
202     BOGUS X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
203     DU X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
204     Tv X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
205     TV X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
206     BQ X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
207     GB X 0 760.09 1.0 0.0 255 20 147
208     GBDP X 0 760.09 10.0 0.0 255 20 147