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root/group/branches/mmeineke/xyz2pov/src/AtomTypes
Revision: 60
Committed: Thu Aug 1 21:12:33 2002 UTC (21 years, 11 months ago) by mmeineke
File size: 7409 byte(s)
Log Message: 
A pair of utilities to turn an xyz file into a sequence of povray rendered images.

File Contents

# Content
1 #Type Base Number Mass vdWR covR Red Green Blue
2 # X is a fall-back element type that should always exist
3 X X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
4 # The elements:
5 H H 1 1.008 1.20 0.32 250 235 215
6 He He 2 4.003 1.40 0.93 255 192 203
7 Li Li 3 6.941 1.82 1.23 178 34 34
8 Be Be 4 9.0122 1.3725 0.90 34 139 34
9 B B 5 10.811 0.795 0.82 0 255 0
10 C C 6 12.011 1.70 0.77 112 128 144
11 N N 7 14.007 1.55 0.75 0 191 255
12 O O 8 15.999 1.52 0.73 255 0 0
13 F F 9 18.998 1.47 0.72 218 165 32
14 Ne Ne 10 20.18 1.54 0.71 255 105 180
15 Na Na 11 22.99 2.27 1.54 0 0 255
16 Mg Mg 12 24.312 1.73 1.36 34 139 34
17 Al Al 13 26.982 1.7 1.18 190 190 190
18 Si Si 14 28.086 2.10 1.11 218 165 32
19 P P 15 30.974 1.80 1.06 255 165 0
20 S S 16 32.06 1.80 1.02 255 255 0
21 Cl Cl 17 35.453 1.75 0.99 0 255 0
22 Ar Ar 18 39.948 1.88 0.98 255 192 203
23 K K 19 39.098 2.75 2.03 255 20 147
24 Ca Ca 20 40.078 2.45 1.74 128 128 128
25 Sc Sc 21 44.956 1.37 1.44 190 190 190
26 Ti Ti 22 47.9 1.37 1.32 190 190 190
27 V V 23 50.941 1.37 1.22 190 190 190
28 Cr Cr 24 51.996 1.37 1.18 190 190 190
29 Mn Mn 25 54.938 1.37 1.17 190 190 190
30 Fe Fe 26 55.847 1.456 1.17 255 165 0
31 Co Co 27 58.933 0.88 1.16 165 42 42
32 Ni Ni 28 58.71 0.69 1.15 165 42 42
33 Cu Cu 29 63.54 0.72 1.17 165 42 42
34 Zn Zn 30 65.37 0.74 1.25 165 42 42
35 Ga Ga 31 69.72 1.37 1.26 165 42 42
36 Ge Ge 32 72.59 1.95 1.22 85 107 47
37 As As 33 74.9216 1.85 1.20 253 245 230
38 Se Se 34 78.96 1.90 1.16 152 251 152
39 Br Br 35 79.904 1.85 1.14 165 42 42
40 Kr Kr 36 83.80 2.02 1.12 50 205 50
41 Rb Rb 37 85.47 1.58 2.16 165 42 42
42 Sr Sr 38 87.62 2.151 1.91 190 190 190
43 Y Y 39 88.9059 1.801 1.62 190 190 190
44 Zr Zr 40 91.224 1.602 1.45 190 190 190
45 Nb Nb 41 92.9064 1.468 1.34 190 190 190
46 Mo Mo 42 95.94 1.526 1.30 255 127 80
47 Tc Tc 43 98.0 1.360 1.27 190 190 190
48 Ru Ru 44 101.07 1.339 1.25 190 190 190
49 Rh Rh 45 102.906 1.345 1.25 190 190 190
50 Pd Pd 46 106.42 1.376 1.28 190 190 190
51 Ag Ag 47 107.87 1.27 1.34 19 190 190
52 Cd Cd 48 112.41 1.424 1.48 255 140 0
53 In In 49 114.82 1.663 1.44 190 190 190
54 Sn Sn 50 118.71 2.10 1.41 190 190 190
55 Sb Sb 51 121.75 2.05 1.40 190 190 190
56 Te Te 52 127.60 2.06 1.36 190 190 190
57 I I 53 129.905 1.98 1.33 160 32 240
58 Xe Xe 54 131.29 2.00 1.31 255 105 180
59 Cs Cs 55 132.905 1.84 2.35 165 42 42
60 Ba Ba 56 137.33 2.243 1.98 190 190 190
61 La La 57 138.906 1.877 1.69 190 190 190
62 Lu Lu 71 174.967 2.17 1.60 190 190 190
63 Hf Hf 72 178.49 1.580 1.44 190 190 190
64 Ta Ta 73 180.948 1.467 1.34 190 190 190
65 W W 74 183.85 1.534 1.30 64 224 208
66 Re Re 75 186.207 1.375 1.28 190 190 190
67 Os Os 76 190.2 1.353 1.26 190 190 190
68 Ir Ir 77 192.22 1.357 1.27 190 90 190
69 Pt Pt 78 195.08 1.75 1.30 190 190 190
70 Au Au 79 196.967 1.66 1.34 255 215 0
71 Hg Hg 80 200.59 1.55 1.49 190 190 190
72 Tl Tl 81 204.383 1.96 1.48 190 190 190
73 Pb Pb 82 207.2 2.02 1.47 190 190 190
74 Bi Bi 83 208.98 2.15 1.46 255 181 197
75 # Derived types
76 LP X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
77 PD X 0 0.0 0.0 0.0 0 0 0
78 DM X 0 0.0 0.0 0.0 0 0 0
79 1 H 1 1.008 1.20 0.32 250 235 215
80 H3 H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
81 HALI H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
82 HARO H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
83 HC H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
84 HHBN H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
85 HN H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
86 HO H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
87 HS H 1 1.008 1.25 0.32 250 235 215
88 HE He 2 4.003 1.40 0.93 255 192 203
89 3 Li 3 6.941 1.82 1.23 178 34 34
90 LI Li 3 6.941 1.82 1.23 178 34 34
91 5 B 5 10.811 0.795 0.82 0 255 0
92 6 C 6 12.011 1.70 0.77 112 128 144
93 C1 C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
94 C2 C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
95 C3 C 6 12.011 1.65 0.77 112 128 144
96 CA C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
97 CAR C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
98 CARO C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
99 CB C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
100 CH2AL C 6 14.027 1.65 0.77 112 128 144
101 CH2OL C 6 14.027 1.65 0.77 112 128 144
102 CH3AL C 6 15.035 1.77 0.77 112 128 144
103 CHAL C 6 13.019 1.67 0.77 112 128 144
104 CHAR C 6 13.019 1.58 0.77 112 128 144
105 CHOL C 6 13.019 1.67 0.77 112 128 144
106 CSP C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
107 CSP2 C 6 12.011 1.5 0.77 112 128 144
108 CSP3 C 6 12.011 1.65 0.77 112 128 144
109 CT C 6 15.035 1.77 0.77 112 128 144
110 7 N 7 14.007 1.55 0.75 0 191 255
111 N1 N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
112 N2 N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
113 N3 N 7 14.007 1.5 0.75 0 191 255
114 N3+ N 7 14.007 1.5 0.75 0 191 255
115 NAM N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
116 NAR N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
117 NARO N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
118 NPL3 N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
119 NSP N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
120 NSP2 N 7 14.007 1.35 0.75 0 191 255
121 NSP3 N 7 14.007 1.5 0.75 0 191 255
122 NSP3+ N 7 14.007 1.5 0.75 0 191 255
123 8 O 8 15.999 1.52 0.73 255 0 0
124 O2 O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
125 O3 O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
126 OH O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
127 OSP2 O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
128 OSP3 O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
129 OSP3- O 8 15.999 1.35 0.73 255 0 0
130 9 F 9 18.998 1.47 0.72 218 165 32
131 NE Ne 10 20.18 1.54 0.71 255 105 180
132 11 Na 11 22.99 2.27 1.54 0 0 255
133 NA Na 11 22.99 2.27 1.54 0 0 255
134 12 Mg 12 24.312 1.73 1.36 34 139 34
135 MG Mg 12 24.312 1.73 1.36 34 139 34
136 13 Al 13 26.982 1.7 1.18 190 190 190
137 AL Al 13 26.982 1.7 1.18 190 190 190
138 14 Si 14 28.086 2.10 1.11 218 165 32
139 SI Si 14 28.086 2.10 1.11 218 165 32
140 15 P 15 30.974 1.80 1.06 255 165 0
141 P(C) P 15 30.974 1.75 1.06 255 165 0
142 P(N) P 15 30.974 1.75 1.06 255 165 0
143 P(O) P 15 30.974 1.75 1.06 255 165 0
144 P(S) P 15 30.974 1.75 1.06 255 165 0
145 16 S 16 32.06 1.80 1.02 255 255 0
146 S2 S 16 32.06 1.85 1.02 255 255 0
147 S3 S 16 32.06 1.85 1.02 255 255 0
148 SDIV S 16 32.06 1.85 1.02 255 255 0
149 STET S 16 32.06 1.85 1.02 255 255 0
150 STRI S 16 32.06 1.85 1.02 255 255 0
151 Sh S 16 32.06 1.85 1.02 25 255 0
152 17 Cl 17 35.453 1.75 0.99 0 255 0
153 CL Cl 17 35.453 1.75 0.99 0 255 0
154 AR Ar 18 39.948 1.88 0.98 255 192 203
155 HV Ar 18 399.48 1.91 0.0 255 192 203
156 LT Ar 18 39.948 1.91 0.0 255 192 203
157 DZ Ar 18 39.948 1.91 0.0 255 192 203
158 19 K 19 39.098 2.75 2.03 255 20 147
159 20 Ca 20 40.078 2.45 1.74 128 128 128
160 21 Sc 21 44.956 1.37 1.44 190 190 190
161 SC Sc 21 44.956 1.37 1.44 190 190 190
162 22 Ti 22 47.9 1.37 1.32 190 190 190
163 TI Ti 22 47.9 1.37 1.32 190 190 190
164 23 V 23 50.941 1.37 1.22 190 190 190
165 24 Cr 24 51.996 1.37 1.18 190 190 190
166 CR Cr 24 51.996 1.37 1.18 190 190 190
167 25 Mn 25 54.938 1.37 1.17 190 190 190
168 MN Mn 25 54.938 1.37 1.17 190 190 190
169 26 Fe 26 55.847 1.456 1.17 255 165 0
170 FE Fe 26 55.847 1.456 1.17 255 165 0
171 27 Co 27 58.933 0.88 1.16 165 42 42
172 CO Co 27 58.933 0.88 1.16 165 42 42
173 28 Ni 28 58.71 0.69 1.15 165 42 42
174 NI Ni 28 58.71 0.69 1.15 165 42 42
175 29 Cu 29 63.54 0.72 1.17 165 42 42
176 CU Cu 29 63.54 0.72 1.17 165 42 42
177 30 Zn 30 65.37 0.74 1.25 165 42 42
178 ZN Zn 30 65.37 0.74 1.25 165 42 42
179 31 Ga 31 69.72 1.37 1.26 165 42 42
180 GA Ga 31 69.72 1.37 1.26 165 42 42
181 GE Ge 32 72.59 1.95 1.22 85 107 47
182 35 Br 35 79.904 1.85 1.14 165 42 42
183 BR Br 35 79.904 1.85 1.14 165 42 42
184 37 Rb 37 85.47 1.58 2.16 165 42 42
185 RB Rb 37 85.47 1.58 2.16 165 42 42
186 MO Mo 42 95.94 1.526 1.30 255 127 80
187 47 Ag 47 107.87 1.27 1.34 190 190 190
188 AG Ag 47 107.87 1.27 1.34 190 190 190
189 53 I 53 129.905 1.98 1.33 160 32 240
190 55 Cs 55 132.905 1.84 2.35 165 42 42
191 CS Cs 55 132.905 1.84 2.35 165 42 42
192 79 Au 79 196.967 1.66 1.34 255 215 0
193 AU Au 79 196.967 1.66 1.34 255 215 0
194 # Some oddball types derived from X
195 XX X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
196 + X 0 0.0 1.0 1.38 255 20 147
197 ++ X 0 0.0 1.0 0.9 255 20 147
198 - X 0 0.0 1.0 2.0 255 20 147
199 -- X 0 0.0 1.0 2.0 255 20 147
200 DUMMY X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
201 RESERV X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
202 BOGUS X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
203 DU X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
204 Tv X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
205 TV X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
206 BQ X 0 0.0 1.0 0.0 255 20 147
207 GB X 0 760.09 1.0 0.0 255 20 147
208 GBDP X 0 760.09 10.0 0.0 255 20 147