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root/group/trunk/OOPSE-2.0/make/Makefile.in
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE-2.0/make/Makefile.in (file contents):
Revision 1508 by gezelter, Wed Sep 29 17:56:08 2004 UTC vs.
Revision 2101 by chrisfen, Thu Mar 10 15:10:24 2005 UTC

# Line 33 | Line 33
33   #  $<      - Current dependency
34   #
35   #---------------------------------------------------------------------------
36 + IS_UNIX=1
37  
38 < Packages = \
39 <        utils \
40 <        math \
41 <        types \
42 <        primitives \
43 <        visitors \
44 <        UseTheForce/DarkSide \
45 <        UseTheForce \
46 <        brains \
47 <        io \
48 <        integrators \
49 <        minimizers \
50 <        constraints \
51 <        profiling \
52 <        restraints \
53 <        applications \
38 > #packages containing libraries
39 > PackageLibs = \
40 >        utils \
41 >        visitors \
42 >        math \
43 >        types \
44 >        primitives \
45 >        UseTheForce/DarkSide \
46 >        UseTheForce \
47 >        brains \
48 >        io \
49 >        integrators\
50 >        constraints \
51 >        minimizers \
52 >        selection \
53 >        restraints \
54  
55 + #packages containing applications
56 + Applications = \
57 +        applications/oopse \
58 +        applications/dump2Xyz \
59 +        applications/simpleBuilder\
60 +        applications/staticProps \
61 +        applications/dynamicProps \
62 +
63 + Samples = \
64 +        samples/argon \
65 +        samples/water/dimer \
66 +        samples/water/spce \
67 +        samples/water/ssd \
68 +        samples/water/ssde \
69 +        samples/water/tip3p_ice \
70 +        samples/water/tip4p \
71 +        samples/lipid \
72 +        samples/alkane \
73 +        samples/minimizer \
74 +        samples/metals \
75 +        samples/zcons \
76 +
77 + IncludeDirs = \
78 +        @MPI_INC_DIR@
79 +
80 + LibraryDirs = \
81 +        @MPI_LIB_DIR@
82 +
83 + Libraries = \
84 +        @MPI_LIB@ \
85 +        @MPI_F90_LIB@
86 +
87 + OopseHome       = @OOPSE_HOME@
88 + ForceParamDir   = $(OopseHome)/share/forceFields
89 + SampleSimDir    = $(OopseHome)/share/samples
90 + InstallBinDir   = $(OopseHome)/bin
91 + DocDir          = $(OopseHome)/doc
92 + FrcDeclare      = -DFRC_PATH="$(ForceParamDir)"
93 + F90Declare      = -D__FORTRAN90
94 + ParallelDeclare = -DIS_MPI
95 + UseMPI          = @USE_MPI@
96 + ModuleCase      = @F90_MODULE_NAMES@
97 + ModSuffix       = @MOD@
98 + LinkOptions = \
99 +        @F90LIBS@
100 +
101 + ParallelLinkOptions = \
102 +        @F90LIBS@
103 +
104 +
105   #---------------------------------------------------------------------------
106   #
107   #  Directories
108   #
109   #---------------------------------------------------------------------------
110  
60 – srcdir = @srcdir@
111   SourceDir         = $(DEV_ROOT)/src
112   TargetDir         = $(DEV_ROOT)/obj
113   ParallelTargetDir = $(DEV_ROOT)/MPIobj
# Line 66 | Line 116 | CurrentDir        = $(CURDIR)
116   BinDir            = $(DEV_ROOT)/bin
117   DocsDir           = $(DEV_ROOT)/docs
118   CurrentDir        = $(CURDIR)
119 + CombinedStaticLib = $(LibDir)/libOOPSE.a
120 + CombinedParallelStaticLib = $(LibDir)/libOOPSE_MPI.a
121  
122   ifdef Source
123 < Package                  = $(subst $(SourceDir)/,,$(CurrentDir))
123 > #get the relative path of current package to source directory
124 > # /home/maul/gezelter/src/code/src/UseTheForce/Darkside --> UseTheForce/Darkside
125 > #Package          = $(shell echo $(CurrentDir) | sed -e 's/^.*\/src\/\(.*\)/\1/g')
126 > #use shell script to get the absolute path and then rip it off from $(CurrentDir)
127 > #Package          = $(subst $(shell cd $(SourceDir); pwd)/,,$(CurrentDir))
128 > # REMINDER: We are now using the Package line in each subdir makefile.
129 > # This avoids the strange path problem and the subshell
130 >
131   PackageList              = $(Package)
132   PackageSourceDir         = $(SourceDir)/$(Package)
133   PackageTargetDir         = $(TargetDir)
134   PackageParallelTargetDir = $(ParallelTargetDir)
135   JavaMainClass            = $(subst /,.,$(Package)).$(Main)
136   else
137 < PackageList              = $(Packages) $(JavaPackages)
137 > PackageList              = $(PackageLibs) $(JavaPackages) $(Applications)
138   endif
139  
140 < PackageListLoop  = $(patsubst %,$(SourceDir)/%/.loop,$(PackageList))
140 > PackageListLoop          = $(patsubst %,$(SourceDir)/%/.loop,$(PackageList))
141  
142 < JRE              = $(JAVA_HOME)/jre/lib/rt.jar
142 > JRE                      = $(JAVA_HOME)/jre/lib/rt.jar
143  
144   ifdef IS_UNIX
145   X = :
# Line 108 | Line 167 | SourceFiles            = $(JavaFiles:%.java=  $(Packag
167                                        $(YaccFiles) $(CorbaFiles), \
168                                        $(Source))
169   ManifestFile           = $(PackageSourceDir)/Manifest
111 – SourceFiles            = $(JavaFiles:%.java=  $(PackageSourceDir)/%.java)\
112 –                         $(CppFiles:%.cpp=    $(PackageSourceDir)/%.cpp)\
113 –                         $(CFiles:%.c=        $(PackageSourceDir)/%.c)\
114 –                         $(FortranFiles:%.f=  $(PackageSourceDir)/%.f)\
115 –                         $(F90Files:%.F90=    $(PackageSourceDir)/%.F90)\
116 –                         $(LexFiles:%.l=      $(PackageSourceDir)/%.l)\
117 –                         $(YaccFiles:%.y=     $(PackageSourceDir)/%.y)\
170  
171 + SourceFiles            = $(JavaFiles)\
172 +                         $(CppFiles)\
173 +                         $(CFiles)\
174 +                         $(FortranFiles)\
175 +                         $(F90Files)\
176 +                         $(LexFiles)\
177 +                         $(YaccFiles)
178  
179   # Target
180   JavaClassFiles         = $(JavaFiles:%.java=  $(PackageTargetDir)/%.class)
# Line 125 | Line 184 | ObjectFiles            = $(CFiles:%.c=        $(Packag
184   JniClassFiles          = $(JniSource:%.java=  $(PackageTargetDir)/%.class)
185   JniHeaders             = $(JniSource:%.java=  $(PackageSourceDir)/%.h)
186   ObjectFiles            = $(CFiles:%.c=        $(PackageTargetDir)/%.o)\
187 <                         $(CppFiles:%.cpp=    $(PackageTargetDir)/%.o)\
187 >                         $(CppFiles:%.cpp=    $(PackageTargetDir)/%.o)\
188                           $(FortranFiles:%.f=  $(PackageTargetDir)/%.o)\
189                           $(F90Files:%.F90=    $(PackageTargetDir)/%.o)\
190                           $(LexFiles:%.l=      $(PackageTargetDir)/%.o)\
# Line 158 | Line 217 | ifneq  "$(words $(ObjectFiles) $(ParallelObjectFiles))
217   ifneq  "$(words $(ObjectFiles) $(ParallelObjectFiles))" "0"
218    DependencyFile    = $(PackageSourceDir)/Makedepend
219    ifneq "$(Main)" ""
220 <    Executable        = $(BinDir)/$(Main)
220 >    Executable             = $(BinDir)/$(Main)
221      ParallelExecutable     = $(BinDir)/$(Main)_MPI
222    else
223 <    SharedLibrary     = $(LibDir)/lib$(subst /,,$(Package)).so
224 <    StaticLibrary     = $(LibDir)/lib$(subst /,,$(Package)).a
225 <    ParallelSharedLibrary  = $(LibDir)/lib$(subst /,,$(Package))_MPI.so
226 <    ParallelStaticLibrary  = $(LibDir)/lib$(subst /,,$(Package))_MPI.a
223 >    SharedLibrary          = $(LibDir)/lib$(subst /,,$(patsubst %,oopse_%,$(Package)))_UP.so
224 >    StaticLibrary          = $(LibDir)/lib$(subst /,,$(patsubst %,oopse_%,$(Package)))_UP.a
225 >    ParallelSharedLibrary  = $(LibDir)/lib$(subst /,,$(patsubst %,oopse_%,$(Package)))_MPI.so
226 >    ParallelStaticLibrary  = $(LibDir)/lib$(subst /,,$(patsubst %,oopse_%,$(Package)))_MPI.a
227    endif
228   endif
229 +
230   #
231   # Misc
232   #
# Line 174 | Line 234 | LocalLibs        = $(subst /,,$(Packages))
234   JavaPackageNames = $(subst /,.,$(JavaPackages))
235   IncludePath      = -I$(SourceDir) $(IncludeDirs:%=-I%)
236   LibDirs          = -L$(LibDir)    $(LibraryDirs:%=-L%)
237 < LocalLibs        = $(subst /,,$(Packages))
238 < LibList          = $(LocalLibs:%=-l%) $(Libraries:%=-l%)
237 > LocalLibs        = $(subst /,,$(patsubst %, oopse_%_UP, $(PackageLibs)))
238 > ParallelLocalLibs= $(subst /,,$(patsubst %, oopse_%_MPI, $(PackageLibs)))
239 > LibList          = $(LocalLibs:%=-l%) $(Libraries)
240 > LibNames         = $(LocalLibs:%=$(LibDir)/lib%.a)
241 > ParallelLibList  = $(ParallelLocalLibs:%=-l%) $(Libraries)
242 > ParallelLibNames = $(ParallelLocalLibs:%=$(LibDir)/lib%.a)
243  
244  
245   #---------------------------------------------------------------------------
# Line 184 | Line 248 | Move                   = mv
248   #
249   #---------------------------------------------------------------------------
250   Print                  = @echo
251 < Move                   = mv
251 > Move                   = mv -f
252   Copy                   = cp
253   CCompiler              = @CC@
254   CppCompiler            = @CXX@
255   Linker                 = @CXX@
256   MakeDepend             = makedepend
257 < Install                = @INSTALL@
257 > INSTALL                = @INSTALL@
258   InstallProgram         = @INSTALL_PROGRAM@
259   InstallData            = @INSTALL_DATA@
260 < MakeDir                = @MKINSTALLDIRS@
260 > MkDir                  = @MKINSTALLDIRS@
261   Delete                 = rm -fr
262   StaticArchiver         = @AR@
263   DynamicArchiver        = @CC@
# Line 211 | Line 275 | Lex                    = @LEX@
275   List                   = cat
276   Yacc                   = @YACC@
277   Lex                    = @LEX@
278 + Ranlib                 = @RANLIB@
279 + Doxygen                = @DOXYGEN@
280  
281 <
216 < MakeOptions            = -k -s
281 > MakeOptions            = -k
282   MakeDependOptions      =
283   StaticArchiverOptions  = rc
284   DynamicArchiverOptions = -shared
# Line 221 | Line 286 | FortranOptions         =
286   JniOptions             =
287   RmiOptions             = -d $(TargetDir) -classpath $(ClassPath) \
288                           -sourcepath $(SourceDir)
289 + COptions               = $(FrcDeclare) @CFLAGS@
290 + CParallelOptions       = $(FrcDeclare) $(ParallelDeclare) @CFLAGS@
291 + CppOptions             = $(FrcDeclare) @CXXFLAGS@ @OOPSE_TEMPLATE_FLAGS@
292 + CppParallelOptions     = $(FrcDeclare) $(ParallelDeclare) @CXXFLAGS@ @OOPSE_TEMPLATE_FLAGS@
293   FortranOptions         =
294 < F90Options             =  -I$(SourceDir) -module $(TargetDir)
294 > F90Options             =  @PREPFLAG@ @F90FLAGS@ @MODDIRFLAG@$(SourceDir) @MODDIRFLAG@$(TargetDir)
295 > F90ParallelOptions     =  @PREPFLAG@ @F90FLAGS@ @MODDIRFLAG@$(SourceDir) @MODDIRFLAG@$(ParallelTargetDir)  @PREPDEFFLAG@$(ParallelDeclare)
296   JavaCompilerOptions    = -d $(TargetDir) -classpath $(ClassPath) \
297                           -sourcepath $(SourceDir) -deprecation
298   JavaRunOptions         = -classpath $(ClassPath)
# Line 248 | Line 318 | Space                  = $(Empty) $(Empty)
318  
319   #---------------------------------------------------------------------------
320   #
321 + #  Install
322 + #
323 + #---------------------------------------------------------------------------
324 +
325 + ifneq "$(words $(SampleFiles))" "0"
326 +  MySample                 = $(subst $(shell cd $(DEV_ROOT)/samples; pwd)/,,$(CurrentDir))
327 +  MyInstallDir             = $(SampleSimDir)/$(MySample)
328 +  InstallFiles             = $(SampleFiles)
329 +  InstallCommand           = $(InstallData)
330 + endif
331 +
332 + ifneq "$(words $(Main))" "0"
333 +  MyInstallDir             = $(InstallBinDir)
334 +  ifeq "$(UseMPI)" "yes"
335 +    InstallFiles             = $(Executable) $(ParallelExecutable)
336 +  else
337 +    InstallFiles             = $(Executable)
338 +  endif
339 +  InstallCommand           = $(InstallProgram)
340 + endif
341 +
342 + ifneq "$(words $(ForcefieldFiles))" "0"
343 +  MyInstallDir             = $(ForceParamDir)
344 +  InstallFiles             = $(ForcefieldFiles)
345 +  InstallCommand           = $(InstallData)
346 + endif
347 +
348 + ifneq "$(words $(InstallFiles))" "0"
349 +  InstallList            =
350 + else
351 +  InstallList            = $(patsubst %,$(DEV_ROOT)/%,$(Samples)) $(DEV_ROOT)/forceFields $(patsubst %, $(SourceDir)/%,$(Applications))
352 + endif
353 +
354 + InstallListLoop          = $(patsubst %,$(SourceDir)/%/.install,$(PackageList))  $(patsubst %,%/.install,$(InstallList))
355 +
356 +
357 +
358 + #---------------------------------------------------------------------------
359 + #
360   # Rules
361   #
362   #---------------------------------------------------------------------------
# Line 258 | Line 367 | $(PackageTargetDir) :
367  
368   # Create target directory
369   $(PackageTargetDir) :
370 <        $(MakeDir) $@
370 >        $(MkDir) $@
371  
372 + $(BinDir) :
373 +        $(MkDir) $@
374 +
375   # .c -> .o
376 < $(PackageTargetDir)/%.o : $(PackageSourceDir)/%.c
376 > $(PackageTargetDir)/%.o : %.c
377          $(Print) $@
378 <        $(Print) $(CCompiler) $(COptions) -c $(IncludePath) $< -o $@
267 <        @$(CCompiler) $(COptions) -c $(IncludePath) $< -o $@
378 >        $(CCompiler) $(COptions) -c $(IncludePath) $< -o $@
379  
380 < %.o : $(PackageSourceDir)/%.c
380 > $(PackageParallelTargetDir)/%.o : %.c
381 >        $(Print) $@
382 >        $(CCompiler) $(CParallelOptions) -c $(IncludePath) $< -o $@
383 >
384 > ifeq "$(UseMPI)" "yes"
385 > %.o : %.c
386          $(MAKE) $(MakeOptions) $(PackageTargetDir)/$@
387 +        $(MAKE) $(MakeOptions) $(PackageParallelTargetDir)/$@
388 + else
389 + %.o : %.c
390 +        $(MAKE) $(MakeOptions) $(PackageTargetDir)/$@
391 + endif
392  
393   # .cpp -> .o
394 < $(PackageTargetDir)/%.o : $(PackageSourceDir)/%.cpp
274 <        $(Print) $@
275 <        $(Print) $(CppCompiler) $(CppOptions) -c $(IncludePath) $< -o $@
394 > $(PackageTargetDir)/%.o : %.cpp
395          $(CppCompiler) $(CppOptions) -c $(IncludePath) $< -o $@
396  
397 < %.o : $(PackageSourceDir)/%.cpp
397 > $(PackageParallelTargetDir)/%.o : %.cpp
398 >        $(CppCompiler) $(CppParallelOptions) -c $(IncludePath) $< -o $@
399 >
400 > ifeq "$(UseMPI)" "yes"
401 > %.o : %.cpp
402          $(MAKE) $(MakeOptions) $(PackageTargetDir)/$@
403 +        $(MAKE) $(MakeOptions) $(PackageParallelTargetDir)/$@
404 + else
405 + %.o : %.cpp
406 +        $(MAKE) $(MakeOptions) $(PackageTargetDir)/$@
407 + endif
408  
409   # .f -> .o
410 < $(PackageTargetDir)/%.o : $(PackageSourceDir)/%.f
411 <        $(Print) $@
284 <        $(Print) $(FortranCompiler) $(FortranOptions) -c $< -o $@
285 <        @$(FortranCompiler) $(FortranOptions) -c $< -o $@
410 > $(PackageTargetDir)/%.o : %.f
411 >        $(FortranCompiler) $(FortranOptions) -c $< -o $@
412  
413 < %.o : $(PackageSourceDir)/%.f
413 > $(PackageParallelTargetDir)/%.o : %.f
414 >        $(FortranCompiler) $(FortranParallelOptions) -c $< -o $@
415 >
416 > ifeq "$(UseMPI)" "yes"
417 > %.o : %.f
418          $(MAKE) $(MakeOptions) $(PackageTargetDir)/$@
419 +        $(MAKE) $(MakeOptions) $(PackageParallelTargetDir)/$@
420 + else
421 + %.o : %.f
422 +        $(MAKE) $(MakeOptions) $(PackageTargetDir)/$@
423 + endif
424  
425   # .F90 -> .o
426 < $(PackageTargetDir)/%.o : $(PackageSourceDir)/%.F90
427 <        $(Print) $@
428 <        $(Print) $(F90Compiler) $(F90Options) -c $< -o $@
429 <        @$(F90Compiler) $(F90Options) -c $< -o $@
426 > $(PackageTargetDir)/%.o : %.F90
427 >        $(F90Compiler) $(F90Options) $(IncludePath) -c $< -o $@
428 >        if test -n "`ls *.$(ModSuffix)`"; then \
429 >          $(Move) `ls *.$(ModSuffix)` $(PackageTargetDir);\
430 >        fi
431  
432 < %.o : $(PackageSourceDir)/%.F90
432 > $(PackageParallelTargetDir)/%.o : %.F90
433 >        $(F90Compiler) $(F90ParallelOptions) $(IncludePath) -c $< -o $@
434 >        if test -n "`ls *.$(ModSuffix)`"; then \
435 >          $(Move) "`ls *.$(ModSuffix)`" $(PackageParallelTargetDir);\
436 >        fi
437 >
438 > ifeq "$(UseMPI)" "yes"
439 > %.o : %.F90
440          $(MAKE) $(MakeOptions) $(PackageTargetDir)/$@
441 +        if test -n "`ls *.$(ModSuffix)`"; then\
442 +          $(Move) "`ls *.$(ModSuffix)`" $(PackageTargetDir);\
443 +        fi
444  
445 +        $(MAKE) $(MakeOptions) $(PackageParallelTargetDir)/$@
446 +        if test -n "`ls *.$(ModSuffix)`"; then\
447 +          $(Move) "`ls *.$(ModSuffix)`" $(PackageTargetDir);\
448 +        fi
449 +
450 + else
451 + %.o : %.F90
452 +        $(MAKE) $(MakeOptions) $(PackageTargetDir)/$@
453 +        if test -n "`ls *.$(ModSuffix)`"; then\
454 +          $(Move) "`ls *.$(ModSuffix)`" $(PackageTargetDir);\
455 +        fi
456 + endif
457 +
458 +
459   # .java -> .class
460   $(PackageTargetDir)/%.class : $(PackageSourceDir)/%.java
461 <        $(Print) $@
302 <        $(Print) $(JavaCompiler) $(JavaCompilerOptions) $<
303 <        @$(JavaCompiler) $(JavaCompilerOptions) $<
461 >        $(JavaCompiler) $(JavaCompilerOptions) $<
462  
463   %.class : $(PackageSourceDir)/%.java
464          @$(MAKE) $(MakeOptions) $(PackageTargetDir)/$@
465  
466   # .class -> .h
467   $(PackageSourceDir)/%.h : $(PackageTargetDir)/%.class
310 –        $(Print) $@
311 –        $(Print) $(JniCompiler) $(JniOptions) $(JavaPackageName).$*
468          $(JniCompiler) $(JniOptions) $(JavaPackageName).$*
469  
470   %.h : %.class
471          $(MAKE) $(MakeOptions) $(PackageSourceDir)/$@
472  
473   #.y -> .h
474 < $(PackageSourceDir)/%.h : $(PackageSourceDir)/%.y
475 <        $(Print) $@
320 <        $(Print) @$(Yacc) -d $?
321 <        @$(Yacc) -d  $?
474 > %.h : %.y
475 >        $(Yacc) -d  $?
476          @$(Move) y.tab.h $*.h
477          @$(Delete) y.tab.c
478  
479   #.y -> .c
480 < $(PackageSourceDir)/%.c : $(PackageSourceDir)/%.y
481 <        $(Print) $@
328 <        $(Print) $(Yacc) -d $?
329 <        @$(Yacc) -d  $?
480 > %.c : %.y
481 >        $(Yacc) -d  $?
482          @$(Move) y.tab.c $*.c
483          @$(Delete) y.tab.h
484  
485   # .l -> .c
486 < $(PackageSourceDir)/%.c : $(PackageSourceDir)/%.l
486 > %.c : %.l
487          $(Print) $@
488          $(Print) $(Lex) -o$@ $?
489          @$(Lex) -o$@ $?
490  
491   # .o -> .a
340 – $(LibDir)/%.a : $(ObjectFiles)
341 –        $(Print) $@
342 –        $(Print) $(StaticArchiver) $(StaticArchiverOptions) $@ $(ObjectFiles)
343 –        @$(StaticArchiver) $(StaticArchiverOptions) $@ $(ObjectFiles)
492  
493 < %.a : $(ObjectFiles)
494 <        $(MAKE) $(MakeOptions) $(LibDir)/$@
493 > $(LibDir)/%_UP.a : $(ObjectFiles)
494 >        $(StaticArchiver) $(StaticArchiverOptions) $@ $(ObjectFiles)
495 >        @touch $(LibDir)/.stamp_UP
496  
497 < $(LibDir)/%_MPI.a : $(ParallelObjectFiles)
498 <        $(Print) $@
499 <        $(Print) $(StaticArchiver) $(StaticArchiverOptions) $@ $(ParallelObjectFiles)
351 <        @$(StaticArchiver) $(StaticArchiverOptions) $@ $(ParallelObjectFiles)
497 > $(LibDir)/%_MPI.a: $(ParallelObjectFiles)
498 >        $(StaticArchiver) $(StaticArchiverOptions) $@ $(ParallelObjectFiles)
499 >        @touch $(LibDir)/.stamp_MPI
500  
501 + %_UP.a : $(ObjectFiles)
502 +        $(MAKE) $(MakeOptions) $(LibDir)/$@
503 +
504   %_MPI.a : $(ParallelObjectFiles)
505          $(MAKE) $(MakeOptions) $(LibDir)/$@
506  
507   # .o -> .so
508 < $(LibDir)/%.so : $(ObjectFiles)
358 <        $(Print) $@    
359 <        $(Print) $(DynamicArchiver) $(ObjectFiles) $(DynamicArchiverOptions) -o $@
508 > $(LibDir)/%_UP.so : $(ObjectFiles)
509          $(DynamicArchiver) $(ObjectFiles) $(DynamicArchiverOptions) -o $@
510  
362 – %.so : $(ObjectFiles)
363 –        $(MAKE) $(MakeOptions) $(LibDir)/$@
364 –
511   $(LibDir)/%_MPI.so : $(ParallelObjectFiles)
366 –        $(Print) $@    
367 –        $(Print) $(DynamicArchiver) $(ParallelObjectFiles) $(DynamicArchiverOptions) -o $@
512          $(DynamicArchiver) $(ParallelObjectFiles) $(DynamicArchiverOptions) -o $@
513  
514 + %_UP.so : $(ObjectFiles)
515 +        $(MAKE) $(MakeOptions) $(LibDir)/$@
516 +
517   %_MPI.so : $(ParallelObjectFiles)
518          $(MAKE) $(MakeOptions) $(LibDir)/$@
519  
520   # .class -> .jar
521   $(LibDir)/%.jar : $(JavaClassFiles) $(OtherTargetFiles)
522          $(Print) $@
376 –        $(Print) $(JavaArchiver) -cf $@ $(JavaClassFilesRel) $(OtherTargetFiles)
523          @cd $(TargetDir); $(JavaArchiver) -cf $@ \
524          $(JavaClassFilesRel) $(OtherTargetFiles)
525  
# Line 403 | Line 549 | $(PackageTargetDir)/%_Skel.class : $(PackageTargetDir)
549   %_Skel.class : %.class
550          $(MAKE) $(MakeOptions) $(PackageTargetDir)/$@
551  
552 + document :
553 +        $(Print) Generate Documentation for OOPSE-2.0
554 +        @cd $(DEV_ROOT)/src    
555 +        $(Doxygen) $(DEV_ROOT)/make/Doxyfile
556 +
557 + #GUN make funtions to merge the libraries
558 + find_objs = $(shell $(StaticArchiver) -t $(1))
559 + extract_objs = $(shell $(StaticArchiver) -x $(1) $(call find_objs, $(1)))
560 + create_archive = $(shell  $(StaticArchiver) $(StaticArchiverOptions) $(2) $(call find_objs, $(1)))
561 + remove_objs = $(shell $(Delete) $(call find_objs, $(1)))
562 + do_create = $(call extract_objs,$(1))$(call create_archive,$(1),$(2))$(call remove_objs,$(1))  
563 +
564 + $(CombinedStaticLib) : $(LibDir)/.stamp_UP
565 +        $(Print) create $@      
566 +        $(foreach thisLib,$(LibNames),$(call do_create,$(thisLib),$@))
567 +        $(Ranlib) $(CombinedStaticLib)
568 +
569 + $(CombinedParallelStaticLib) : $(LibDir)/.stamp_MPI
570 +        $(Print) create $@
571 +        $(foreach thisLib,$(ParallelLibNames), $(call do_create, $(thisLib), $@))
572 +        $(Ranlib) $(CombinedParallelStaticLib)
573 +
574   # Executable
575 < $(Executable) : $(ObjectFiles)
576 <        $(Print) $@
409 <        $(Linker) $(LinkOptions) $(LibDirs) $(LibList) $(ObjectFiles) -o $@
575 > $(Executable) : $(CombinedStaticLib) $(ObjectFiles) $(BinDir)
576 >        $(Linker) $(ObjectFiles) $(CombinedStaticLib) $(LinkOptions) $(LibDirs) $(Libraries) -o $@
577  
578 < $(ParallelExecutable) : $(ParallelObjectFiles)
579 <        $(Print) $@
413 <        $(Linker) $(LinkOptions) $(LibDirs) $(LibList) $(ParallelObjectFiles) -o $@
578 > $(ParallelExecutable) : $(CombinedParallelStaticLib) $(ParallelObjectFiles) $(BinDir)
579 >        $(Linker) $(ParallelObjectFiles) $(CombinedParallelStaticLib) $(ParallelLinkOptions) $(LibDirs) $(Libraries) -o $@
580  
581   # Anything else is just copied from source to target
582   $(PackageTargetDir)/% : $(PackageSourceDir)/%
# Line 423 | Line 589 | _buildall : \
589  
590   _all : _buildall
591  
592 + _buildall :
593 + ifeq "$(UseMPI)" "yes"
594 + _buildall : \
595 +        $(DependencyFile) \
596 +        $(PackageTargetDir) \
597 +        $(ObjectFiles) \
598 +        $(ParallelObjectFiles) \
599 +        $(JavaClassFiles) \
600 +        $(RmiStubFiles) \
601 +        $(RmiSkeletonFiles) \
602 +        $(OtherTargetFiles) \
603 +        $(StaticLibrary) \
604 +        $(ParallelStaticLibrary) \
605 +        $(JarFile) \
606 +        $(Executable) \
607 +        $(ParallelExecutable)
608 + else
609   _buildall : \
610          $(DependencyFile) \
611          $(PackageTargetDir) \
# Line 431 | Line 614 | _buildall : \
614          $(RmiStubFiles) \
615          $(RmiSkeletonFiles) \
616          $(OtherTargetFiles) \
434 –        $(SharedLibrary) \
617          $(StaticLibrary) \
618          $(JarFile) \
619 <        $(Executable)
619 >        $(Executable)
620 > endif
621  
622  
623   # make clean
# Line 442 | Line 625 | _cleanall :
625          $(Print) Done clean.    
626  
627   _cleanall :
628 <        $(Delete) $(PackageTargetDir)/* \
629 <                  $(JarFile) \
630 <                  $(SharedLibrary) \
631 <                  $(StaticLibrary) \
632 <                  $(Executable) \
633 <                  $(DependencyFile)
628 >        $(Delete) \
629 >                $(ObjectFiles) \
630 >                $(ParallelObjectFiles) \
631 >                $(JarFile) \
632 >                $(SharedLibrary) \
633 >                $(StaticLibrary) \
634 >                $(ParallelSharedLibrary) \
635 >                $(ParallelStaticLibrary) \
636 >                $(CombinedStaticLib) \
637 >                $(CombinedParallelStaticLib)
638  
639 + # make distclean
640 + distclean : $(PackageListLoop)
641 +        $(Print) Done clean.    
642  
643 + _distcleanall : _cleanall
644 +        $(Delete) $(Executable) \
645 +                  $(ParallelExecutable) \
646 +                  $(DependencyFile)
647 +
648   # make depend
649   depend : $(PackageListLoop)
650          $(Print) Done dependencies.
# Line 459 | Line 654 | $(DependencyFile) : $(DerivedSource)
654   $(DependencyFile) : $(DerivedSource)
655          $(Print) $@
656          @cd $(PackageSourceDir)
657 <        touch Make.temp
658 < ifdef $(CppFiles)
659 <        $(CppCompiler) $(IncludePath) -MM $(CppFiles)  > Make.temp
657 >
658 > ifneq "$(words $(CppFiles))" "0"
659 >        $(DEV_ROOT)/scripts/filepp  -I $(DEV_ROOT)/src -od '$$(TargetDir)/' -MM $(CppFiles)>> Make.cpptemp
660 >        @cat Make.cpptemp  >> $(DependencyFile)
661 >        $(Delete) Make.cpptemp
662 >
663 >  ifeq "$(UseMPI)" "yes"
664 >        $(DEV_ROOT)/scripts/filepp  -I $(DEV_ROOT)/src -od '$$(ParallelTargetDir)/' $(ParallelDeclare) -MM $(CppFiles)>> Make.cpptemp
665 >        @cat Make.cpptemp  >> $(DependencyFile)
666 >        @$(Delete) Make.cpptemp
667 >  endif
668 >
669   endif
670 < ifdef $(CFiles)
671 <        $(CCompiler)   $(IncludePath) -MM $(CFiles) $(DerivedCFiles)   >> Make.temp
670 >
671 > ifneq "$(words $(CFiles))" "0"
672 >        $(DEV_ROOT)/scripts/filepp  -I $(DEV_ROOT)/src -od '$$(TargetDir)/'  -MM $(CFiles) $(DerivedCFiles)  >> Make.ctemp
673 >        @cat Make.ctemp  >> $(DependencyFile)
674 >        $(Delete) Make.ctemp
675 >
676 >  ifeq "$(UseMPI)" "yes"
677 >        $(DEV_ROOT)/scripts/filepp  -I $(DEV_ROOT)/src -od '$$(ParallelTargetDir)/' $(ParallelDeclare) -MM $(CFiles) $(DerivedCFiles)  >> Make.ctemp
678 >        @cat Make.ctemp  >> $(DependencyFile)
679 >        @$(Delete) Make.ctemp
680 >  endif
681 >
682   endif
683 <        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/$$\(DEV_ROOT\)\/obj\/&/g' >> $(DependencyFile)
684 <        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/$$\(DEV_ROOT\)\/MPIobj\/&/g' >> $(DependencyFile)
685 <        echo $(F90Files)
686 < ifdef $(F90Files)
687 <        $(DEV_ROOT)/scripts/sfmakedepend  -I $(DEV_ROOT)/src -d '$$(DEV_ROOT)/obj' -f ./Make.ftemp -h *.F90
688 <        cat Make.ftemp >> $(DependencyFile)
683 >
684 > ifneq "$(words $(F90Files))" "0"
685 >        $(DEV_ROOT)/scripts/filepp  -I $(DEV_ROOT)/src -od '$$(TargetDir)/' $(F90Declare) -MM -mc $(ModuleCase) -ms $(ModSuffix) $(F90Files) > Make.ftemp
686 >        @cat Make.ftemp >> $(DependencyFile)
687 >        @$(Delete) Make.ftemp
688 >
689 >  ifeq "$(UseMPI)" "yes"
690 >        $(DEV_ROOT)/scripts/filepp  -I $(DEV_ROOT)/src -od '$$(ParallelTargetDir)/' $(ParallelDeclare) $(F90Declare) -MM -mc $(ModuleCase) -ms $(ModSuffix)  $(F90Files) >> Make.ftemp
691 >        @cat Make.ftemp >> $(DependencyFile)
692 >        @$(Delete) Make.ftemp
693 >  endif
694 >
695   endif
476 –        $(Delete) Make.temp Make.ftemp
696  
697   # make lib
698   lib    : $(PackageListLoop)
# Line 486 | Line 705 | jarsign : $(JarFile)
705   jarsign : $(JarFile)
706          $(JarSigner) -keystore GeoSoftKeystore $(JarFile) myself
707  
708 + #make install
709 + %.install :
710 +        @$(MAKE) $(MakeOptions) -C $(subst .install,,$@) _installall    
711 +
712 + install : $(InstallListLoop)
713 +        $(Print) Done Install
714 +
715 + _installall : _buildall _installdata
716 +
717 + $(MyInstallDir) :
718 +        $(MkDir) $@
719 +
720 + _installdata :  $(MyInstallDir)
721 +        $(Print) $(InstallFiles)
722 + ifneq "$(words $(InstallFiles))" "0"
723 +        $(InstallData) $(InstallFiles) $(MyInstallDir)
724 + endif      
725 +
726   # make statistics
727   _statisticsall :
728 <        @$(Print) $(SourceFiles) >> $(DEV_ROOT)/files.tmp
728 >        @$(Print) $(patsubst %,$(CurrentDir)/%,$(SourceFiles)) >> $(DEV_ROOT)/files.tmp
729  
730   statistics : $(PackageListLoop)
731          @$(List) $(DEV_ROOT)/files.tmp | xargs $(WordCount) $(WordCountOptions)
# Line 502 | Line 739 | pure : $(Executable).pure
739  
740   pure : $(Executable).pure
741  
742 + #make cvslog
743 + cvslog:
744 +        $(DEV_ROOT)/scripts/cvs2cl.pl
745 +
746   # Execute
747   _runexe :
748          $(Executable) $(RunParameters)

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