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root/group/trunk/OOPSE-3.0/forceFields/DUFF2.frc
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE-3.0/forceFields/DUFF2.frc (file contents):
Revision 2083 by gezelter, Tue Mar 8 21:05:18 2005 UTC vs.
Revision 2802 by gezelter, Tue Jun 6 17:43:28 2006 UTC

# Line 2 | Line 2
2   //
3   // The sections are divided into AtomTypes
4   //
5 < //any parameters (but not all) are derived from the TRAPPE force field
5 > // many parameters (but not all) are derived from the TRAPPE force field
6   // of Siepmann's group.
7 +
8 + begin Options
9 +      Name                   = "DUFF"
10 +      GayBerneMu             = 2.0
11 +      GayBerneNu             = 1.0
12 + end Options
13 +
14   begin AtomTypes    
15   //Name          mass     (amu)
16   CH4             16.05          
17   CH3             15.04          
18   CH2             14.03          
19 < CH              13.02          
19 > CH              13.02
20 > DIP             9.00764        
21   SSD             18.0153        
22   SSD1            18.0153
23   SSD_E           18.0153
24   SSD_RF          18.0153
25 + TAP             18.0153
26 + O_DIP3P         15.9994                
27   O_TIP3P         15.9994                
28   O_TIP4P         15.9994
29 + O_TIP4P-Ew      15.9994
30   O_TIP5P         15.9994
31 + O_TIP5P-E       15.9994
32   O_SPCE          15.9994
33   O_SPC           15.9994
34 + H_DIP3P         1.0079
35   H_TIP3P         1.0079
36   H_TIP4P         1.0079
37 + H_TIP4P-Ew      1.0079
38   H_TIP5P         1.0079
39   H_SPCE          1.0079
40   H_SPC           1.0079
41   EP_TIP4P        0.0
42 + EP_TIP4P-Ew     0.0
43   EP_TIP5P        0.0
44   HEAD            196            
45   TB1             14.03          
# Line 34 | Line 49 | He             4.002602        
49   TB3             28.06          
50   TE3             30.08  
51   H               1.00794        
52 < He              4.002602        
52 > He              4.002602
53   C               12.0107        
54   N               14.00674        
55   O               15.9994        
# Line 42 | Line 57 | Ar             39.948          
57   Ne              20.1797        
58   S               32.066          
59   Cl              35.4527        
60 + Cl-             35.4527
61 + Na+             22.98977
62   Ar              39.948          
63 + GBAr            39.948          
64   Br              79.904          
65 < Kr              83.80          
65 > Kr              83.80
66 > GBKr            83.80
67 > U               1.00
68 > GBPaper         48.0428
69 > GBlinear        48.0428
70 > GBC6H6          78.11184
71 > GBCH3OH         32.04186
72 > GBH2O           18.0153
73 > Pchg+           5.000  
74 > Pchg-           5.000  
75 > PDIP            10.000  
76 > DPD             72.06112
77   end AtomTypes
78  
79   begin DirectionalAtomTypes
80   //Name          I_xx    I_yy    I_zz    (All moments in (amu*Ang^2)
81 + H_DIP3P         0       0       0
82 + DIP             0.8202  0.8202  0
83   SSD             1.7696  0.6145  1.1550  
84   SSD1            1.7696  0.6145  1.1550  
85   SSD_E           1.7696  0.6145  1.1550  
86   SSD_RF          1.7696  0.6145  1.1550  
87 + TAP             1.7696  0.6145  1.1550
88   HEAD            1125    1125    250
89 + GBPaper         86.477  86.477  0
90 + GBlinear        86.477  86.477  0
91 + GBC6H6          88.781  88.781  177.561
92 + GBCH3OH         4.056   20.258  20.999
93 + GBH2O           1.777   0.581   1.196
94 + GBAr            1.777   0.581   1.196
95 + GBKr            1.777   0.581   1.196
96 + PDIP            10.0    10.0    0
97   end DirectionalAtomTypes                    
98 <                        
98 >
99 > begin GayBerneAtomTypes
100 > //Name          d       l       eps             eps_ratio       dw
101 > GBPaper         3.35    10.05   0.774729        0.2             1.0
102 > GBlinear        2.8104  9.993   0.774729        0.150814        1.0
103 > GBC6H6          4.65    2.03    0.540           3.67            0.6
104 > GBCH3OH         2.55    3.18    0.542           1.03            1.0
105 > GBAr            3.41    3.41    0.2381          1.0             1.0
106 > GBKr            3.83    3.83    0.3259          1.0             1.0
107 > end GayBerneAtomTypes                  
108 >
109   begin LennardJonesAtomTypes
110 < //Name  epsilon                 sigma  
111 < SSD       0.152                 3.051                                  
112 < SSD1      0.152                 3.016
113 < SSD_E     0.152                 3.035
114 < SSD_RF    0.152                 3.019
115 < O_TIP3P   0.1521                3.15061
116 < O_TIP4P   0.1550                3.15365
117 < O_TIP5P   0.16                  3.12  
118 < O_SPCE    0.15532               3.16549
119 < O_SPC     0.15532               3.16549
120 < CH4       0.279                 3.73
121 < CH3       0.185                 3.75
122 < CH2       0.0866                3.95
123 < CH        0.0189                4.68
124 < HEAD      0.185                 .75                                    
125 < TB1       0.0866                4.0                              
126 < TE1       0.185                 4.0                                  
127 < TB2       0.25                  6.0                                  
128 < TE2       0.5                   6.0                                  
129 < TB3       0.5                   8.0                                  
130 < TE3       0.75                  8.0    
131 < H         0.017090056482        2.81
132 < He        0.020269601874        2.28
133 < C         0.101745452544        3.35
134 < N         0.074123151951        3.31
135 < O         0.122412497592        2.95
136 < F         0.104924997936        2.83
137 < Ne        0.09339914589         2.72
138 < S         0.36366050421         3.52
139 < Cl        0.344781953445        3.35
140 < Ar        0.238068461226        3.41
141 < Br        0.511111921764        3.54
142 < Kr        0.32590340268         3.83                  
110 > //Name          epsilon         sigma  
111 > DIP             0.038025        3.12
112 > SSD             0.152           3.051                                  
113 > SSD1            0.152           3.016
114 > SSD_E           0.152           3.035
115 > SSD_RF          0.152           3.019
116 > TAP             0.152           2.9
117 > O_DIP3P         0.1521          3.15061
118 > O_TIP3P         0.1521          3.15061
119 > O_TIP4P         0.1550          3.15365
120 > O_TIP4P-Ew      0.16275         3.16435
121 > O_TIP5P         0.16            3.12  
122 > O_TIP5P-E       0.178           3.097  
123 > O_SPCE          0.15532         3.16549
124 > O_SPC           0.15532         3.16549
125 > CH4             0.279           3.73
126 > CH3             0.185           3.75
127 > CH2             0.0866          3.95
128 > CH              0.0189          4.68
129 > HEAD            0.185           0.75                                    
130 > TB1             0.0866          4.0                              
131 > TE1             0.185           4.0                                  
132 > TB2             0.25            6.0                                  
133 > TE2             0.5             6.0                                  
134 > TB3             0.5             8.0                                  
135 > TE3             0.75            8.0    
136 > H               0.017090056482  2.81
137 > He              0.020269601874  2.28
138 > C               0.101745452544  3.35
139 > N               0.074123151951  3.31
140 > O               0.122412497592  2.95
141 > F               0.104924997936  2.83
142 > Ne              0.09339914589   2.72
143 > S               0.36366050421   3.52
144 > Cl              0.344781953445  3.35
145 > Cl-             0.100           4.445
146 > Na+             0.118           2.579
147 > Ar              0.238068461226  3.41
148 > Br              0.511111921764  3.54
149 > Kr              0.32590340268   3.83
150 > U               1.0             1.0
151 > Pchg+           0.1             3.0
152 > Pchg-           0.1             3.0
153 > PDIP            0.15            5.0
154 > DPD             1.194           4.70
155 > GBH2O           0.2             2.35
156   end LennardJonesAtomTypes
157  
158 < begin ElectrostaticAtomTypes
159 < //only support up tp quadrupole.
160 < //Below are possible format
161 < //name 0 charge
162 < //name 1 charge dipole [phi, theta, psi]
163 < //name 2 charge dipole Qxx Qyy Qzz [phi, theta, psi]
164 < //note: [phi, theta, psi] is optional, by default, they are [0, 0, 0]
165 < SSD_E           1       0.0     2.42
166 < SSD_RF          1       0.0     2.48
167 < SSD             1       0.0     2.35
168 < SSD1            1       0.0     2.35
169 < O_TIP3P         0       -0.834
170 < O_SPCE          0       -0.8476
171 < O_SPC           0       -0.82
172 < H_TIP3P         0       0.417
173 < H_TIP4P         0       0.520
174 < H_TIP5P         0       0.241
175 < H_SPCE          0       0.4238
176 < H_SPC           0       0.42
177 < EP_TIP4P        0       -1.040
115 < EP_TIP5P        0       -0.241
116 < HEAD            0       20.6
117 < Cl              0       -1.0
118 < end ElectrostaticAtomTypes
158 > begin ChargeAtomTypes
159 > // Name         charge
160 > O_TIP3P         -0.834
161 > O_SPCE          -0.8476
162 > O_SPC           -0.82
163 > H_TIP3P         0.417
164 > H_TIP4P         0.520
165 > H_TIP4P-Ew      0.52422
166 > H_TIP5P         0.241
167 > H_SPCE          0.4238
168 > H_SPC           0.42
169 > EP_TIP4P        -1.040
170 > EP_TIP4P-Ew     -1.04844
171 > EP_TIP5P        -0.241
172 > Cl              -1.0
173 > Cl-             -1.0
174 > Na+             1.0
175 > Pchg+           0.5
176 > Pchg-           -1.0
177 > end ChargeAtomTypes
178  
179 + begin MultipoleAtomTypes
180 + // OOPSE currently only supports charge-charge, charge-dipole,
181 + // dipole-dipole, and charge-quadrupole interactions.
182 + // Dipoles may be either traditional point-dipoles or split-dipoles.
183 + // possible formats for a multipolar atom type are:
184 + //
185 + // Point-dipoles:
186 + // name d phi theta psi dipole_moment
187 + //
188 + // Split-dipoles:
189 + // name s phi theta psi dipole_moment splitdipole_distance
190 + //
191 + // Point-Quadrupoles:
192 + // name q phi theta psi Qxx Qyy Qzz
193 + //
194 + // Atoms with both dipole and quadrupole moments:
195 + // name dq phi theta psi dipole_moment Qxx Qyy Qzz
196 + //
197 + // Atoms with both split dipoles and quadrupole moments:
198 + // name sq phi theta psi dipole_moment splitdipole_distance Qxx Qyy Qzz
199 + //
200 + // Euler angles are given in zxz convention in units of degrees.
201 + //
202 + // Charges are given in units of electrons.
203 + //
204 + // Dipoles are given in units of Debyes.
205 + //
206 + // Split dipole distances are given in units of Angstroms.
207 + //  
208 + // Quadrupole moments are given in units of 10^-26 esu cm^2 (also known as an
209 + //                                                           esu centi-barn)
210 + //
211 + H_DIP3P d        0.0     0.0     0.0     1.91
212 + DIP     d        0.0     0.0     0.0     1.91
213 + SSD_E   dq       0.0     0.0     0.0     2.42  -1.682  1.762  -0.08
214 + SSD_RF  dq       0.0     0.0     0.0     2.48  -1.682  1.762  -0.08
215 + SSD     dq       0.0     0.0     0.0     2.35  -1.682  1.762  -0.08
216 + SSD1    dq       0.0     0.0     0.0     2.35  -1.682  1.762  -0.08
217 + TAP     dq       0.0     0.0     0.0     2.12  -1.682  1.762  -0.08
218 + PDIP    d        0.0     0.0     0.0     9.6064
219 + GBH2O   dq      0.0     0.0     0.0     1.772   -2.165  2.446   -0.281
220 + GBC6H6  q       0.0     0.0     0.0     4.584   4.584   -9.168
221 + //HDP     s       0.0     0.0     0.0     20.6    4.63
222 + end MultipoleAtomTypes
223 +
224   begin StickyAtomTypes
225   //name w0       v0 (kcal/mol)   v0p     rl (Ang)  ru    rlp     rup
226   SSD_E   0.07715 3.90            3.90    2.40      3.80  2.75    3.35
# Line 125 | Line 229 | end StickyAtomTypes
229   SSD1    0.07715 3.6613          3.6613  2.75      3.35  2.75    4.0
230   end StickyAtomTypes
231  
232 + begin StickyPowerAtomTypes
233 + //name w0       v0 (kcal/mol)   v0p     rl (Ang)  ru    rlp     rup
234 + TAP     0.075   5.5             0.25    2.75      3.5   2.75    3.25
235 + end StickyPowerAtomTypes
236  
237   begin BondTypes
238  

Diff Legend

– Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines