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root/group/trunk/OOPSE-3.0/src/selection/SelectionEvaluator.cpp
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE-3.0/src/selection/SelectionEvaluator.cpp (file contents):
Revision 1961 by tim, Tue Feb 1 06:55:00 2005 UTC vs.
Revision 2097 by tim, Wed Mar 9 17:30:29 2005 UTC

# Line 39 | Line 39
39   * such damages.
40   */
41  
42 + #include <stack>
43   #include "selection/SelectionEvaluator.hpp"
44 + #include "primitives/Atom.hpp"
45 + #include "primitives/DirectionalAtom.hpp"
46 + #include "primitives/RigidBody.hpp"
47 + #include "primitives/Molecule.hpp"
48 +
49   namespace oopse {
50  
51  
52 + SelectionEvaluator::SelectionEvaluator(SimInfo* si)
53 +    : info(si), nameFinder(info), distanceFinder(info), indexFinder(info), isLoaded_(false){
54 +    
55 +    nStuntDouble = info->getNGlobalAtoms() + info->getNRigidBodies();
56 + }            
57 +
58 + bool SelectionEvaluator::loadScript(const std::string& filename, const std::string& script) {
59 +    clearDefinitionsAndLoadPredefined();
60 +    this->filename = filename;
61 +    this->script = script;
62 +    if (! compiler.compile(filename, script)) {
63 +        error = true;
64 +        errorMessage = compiler.getErrorMessage();
65 +        std::cerr << "SelectionCompiler Error: " << errorMessage << std::endl;
66 +        return false;
67 +    }
68 +
69 +    pc = 0;
70 +    aatoken = compiler.getAatokenCompiled();
71 +    linenumbers = compiler.getLineNumbers();
72 +    lineIndices = compiler.getLineIndices();
73 +
74 +    std::vector<std::vector<Token> >::const_iterator i;  
75 +
76 +    isDynamic_ = false;
77 +    for (i = aatoken.begin(); i != aatoken.end(); ++i) {
78 +        if (containDynamicToken(*i)) {
79 +            isDynamic_ = true;
80 +            break;
81 +        }
82 +    }
83 +
84 +    isLoaded_ = true;
85 +    return true;
86   }
87 +
88 + void SelectionEvaluator::clearState() {
89 +    //for (int i = scriptLevelMax; --i >= 0; )
90 +    //    stack[i].clear();
91 +    //scriptLevel = 0;
92 +    error = false;
93 +    errorMessage = "";
94 + }
95 +
96 + bool SelectionEvaluator::loadScriptString(const std::string& script) {
97 +    clearState();
98 +    return loadScript("", script);
99 + }
100 +
101 + bool SelectionEvaluator::loadScriptFile(const std::string& filename) {
102 +    clearState();
103 +    return loadScriptFileInternal(filename);
104 + }
105 +
106 + bool SelectionEvaluator::loadScriptFileInternal(const  std::string & filename) {
107 +  std::ifstream ifs(filename.c_str());
108 +    if (!ifs.is_open()) {
109 +        return false;
110 +    }
111 +
112 +    const int bufferSize = 65535;
113 +    char buffer[bufferSize];
114 +    std::string script;
115 +    while(ifs.getline(buffer, bufferSize)) {
116 +        script += buffer;
117 +    }
118 +    return loadScript(filename, script);
119 + }
120 +
121 + void SelectionEvaluator::instructionDispatchLoop(BitSet& bs){
122 +    
123 +    while ( pc < aatoken.size()) {
124 +        statement = aatoken[pc++];
125 +        statementLength = statement.size();
126 +        Token token = statement[0];
127 +        switch (token.tok) {
128 +            case Token::define:
129 +                define();
130 +            break;
131 +            case Token::select:
132 +                select(bs);
133 +            break;
134 +            default:
135 +                unrecognizedCommand(token);
136 +            return;
137 +        }
138 +    }
139 +
140 + }
141 +
142 +  BitSet SelectionEvaluator::expression(const std::vector<Token>& code, int pcStart) {
143 +    BitSet bs;
144 +    std::stack<BitSet> stack;
145 +    
146 +    for (int pc = pcStart; pc < code.size(); ++pc) {
147 +      Token instruction = code[pc];
148 +
149 +      switch (instruction.tok) {
150 +      case Token::expressionBegin:
151 +        break;
152 +      case Token::expressionEnd:
153 +        break;
154 +      case Token::all:
155 +        bs = BitSet(nStuntDouble);
156 +        bs.setAll();
157 +        stack.push(bs);            
158 +        break;
159 +      case Token::none:
160 +        bs = BitSet(nStuntDouble);
161 +        stack.push(bs);            
162 +        break;
163 +      case Token::opOr:
164 +        bs = stack.top();
165 +        stack.pop();
166 +        stack.top() |= bs;
167 +        break;
168 +      case Token::opAnd:
169 +        bs = stack.top();
170 +        stack.pop();
171 +        stack.top() &= bs;
172 +        break;
173 +      case Token::opNot:
174 +        stack.top().flip();
175 +        break;
176 +      case Token::within:
177 +
178 +        withinInstruction(instruction, stack.top());
179 +        break;
180 +      //case Token::selected:
181 +      //  stack.push(getSelectionSet());
182 +      //  break;
183 +      case Token::name:
184 +        stack.push(nameInstruction(boost::any_cast<std::string>(instruction.value)));
185 +        break;
186 +      case Token::index:
187 +        stack.push(indexInstruction(instruction.value));
188 +        break;
189 +      case Token::identifier:
190 +        stack.push(lookupValue(boost::any_cast<std::string>(instruction.value)));
191 +        break;
192 +      case Token::opLT:
193 +      case Token::opLE:
194 +      case Token::opGE:
195 +      case Token::opGT:
196 +      case Token::opEQ:
197 +      case Token::opNE:
198 +        stack.push(comparatorInstruction(instruction));
199 +        break;
200 +      default:
201 +        unrecognizedExpression();
202 +      }
203 +    }
204 +    if (stack.size() != 1)
205 +      evalError("atom expression compiler error - stack over/underflow");
206 +          
207 +    return stack.top();
208 +  }
209 +
210 +
211 +
212 + BitSet SelectionEvaluator::comparatorInstruction(const Token& instruction) {
213 +    int comparator = instruction.tok;
214 +    int property = instruction.intValue;
215 +    float comparisonValue = boost::any_cast<float>(instruction.value);
216 +    float propertyValue;
217 +    BitSet bs(nStuntDouble);
218 +    bs.clearAll();
219 +    
220 +    SimInfo::MoleculeIterator mi;
221 +    Molecule* mol;
222 +    Molecule::AtomIterator ai;
223 +    Atom* atom;
224 +    Molecule::RigidBodyIterator rbIter;
225 +    RigidBody* rb;
226 +    
227 +    for (mol = info->beginMolecule(mi); mol != NULL; mol = info->nextMolecule(mi)) {
228 +
229 +        for(atom = mol->beginAtom(ai); atom != NULL; atom = mol->nextAtom(ai)) {
230 +            compareProperty(atom, bs, property, comparator, comparisonValue);
231 +        }
232 +        
233 +        //change the positions of atoms which belong to the rigidbodies
234 +        for (rb = mol->beginRigidBody(rbIter); rb != NULL; rb = mol->nextRigidBody(rbIter)) {
235 +            compareProperty(rb, bs, property, comparator, comparisonValue);
236 +        }        
237 +    }
238 +
239 +    return bs;
240 + }
241 +
242 + void SelectionEvaluator::compareProperty(StuntDouble* sd, BitSet& bs, int property, int comparator, float comparisonValue) {
243 +        double propertyValue;
244 +        switch (property) {
245 +        case Token::mass:
246 +            propertyValue = sd->getMass();
247 +            break;
248 +        case Token::charge:
249 +            return;
250 +            //break;
251 +        case Token::dipole:
252 +            return;
253 +            //break;
254 +        default:
255 +            unrecognizedAtomProperty(property);
256 +        }
257 +        
258 +        bool match = false;
259 +        switch (comparator) {
260 +            case Token::opLT:
261 +                match = propertyValue < comparisonValue;
262 +                break;
263 +            case Token::opLE:
264 +                match = propertyValue <= comparisonValue;
265 +                break;
266 +            case Token::opGE:
267 +                match = propertyValue >= comparisonValue;
268 +                break;
269 +            case Token::opGT:
270 +                match = propertyValue > comparisonValue;
271 +                break;
272 +            case Token::opEQ:
273 +                match = propertyValue == comparisonValue;
274 +                break;
275 +            case Token::opNE:
276 +                match = propertyValue != comparisonValue;
277 +                break;
278 +        }
279 +        if (match)
280 +            bs.setBitOn(sd->getGlobalIndex());
281 +
282 + }
283 +
284 + void SelectionEvaluator::withinInstruction(const Token& instruction, BitSet& bs){
285 +    
286 +    boost::any withinSpec = instruction.value;
287 +    float distance;
288 +    if (withinSpec.type() == typeid(float)){
289 +        distance = boost::any_cast<float>(withinSpec);
290 +    } else if (withinSpec.type() == typeid(int)) {
291 +        distance = boost::any_cast<int>(withinSpec);    
292 +    } else {
293 +        evalError("casting error in withinInstruction");
294 +        bs.clearAll();
295 +    }
296 +    
297 +    bs = distanceFinder.find(bs, distance);            
298 + }
299 +
300 + void SelectionEvaluator::define() {
301 +    assert(statement.size() >= 3);
302 +
303 +    std::string variable = boost::any_cast<std::string>(statement[1].value);
304 +
305 +    variables.insert(VariablesType::value_type(variable, expression(statement, 2)));
306 + }
307 +
308 +
309 + /** @todo */
310 + void SelectionEvaluator::predefine(const std::string& script) {
311 +
312 +    if (compiler.compile("#predefine", script)) {
313 +        std::vector<std::vector<Token> > aatoken = compiler.getAatokenCompiled();
314 +        if (aatoken.size() != 1) {
315 +            evalError("predefinition does not have exactly 1 command:"
316 +                + script);
317 +            return;
318 +        }
319 +        std::vector<Token> statement = aatoken[0];
320 +        if (statement.size() > 2) {
321 +            int tok = statement[1].tok;
322 +            if (tok == Token::identifier || (tok & Token::predefinedset) == Token::predefinedset) {
323 +                std::string variable = boost::any_cast<std::string>(statement[1].value);
324 +                variables.insert(VariablesType::value_type(variable, statement));
325 +
326 +            } else {
327 +                evalError("invalid variable name:" + script);
328 +            }
329 +        }else {
330 +            evalError("bad predefinition length:" + script);
331 +        }
332 +
333 +        
334 +    } else {
335 +        evalError("predefined set compile error:" + script +
336 +          "\ncompile error:" + compiler.getErrorMessage());
337 +    }
338 +
339 + }
340 +
341 + void SelectionEvaluator::select(BitSet& bs){
342 +    bs = expression(statement, 1);
343 + }
344 +
345 + BitSet SelectionEvaluator::lookupValue(const std::string& variable){
346 +
347 +    BitSet bs(nStuntDouble);
348 +    std::map<std::string, boost::any>::iterator i = variables.find(variable);
349 +    
350 +    if (i != variables.end()) {
351 +        if (i->second.type() == typeid(BitSet)) {
352 +            return boost::any_cast<BitSet>(i->second);
353 +        } else if (i->second.type() ==  typeid(std::vector<Token>)){
354 +            bs = expression(boost::any_cast<std::vector<Token> >(i->second), 2);
355 +            i->second =  bs; /**@todo fixme */
356 +            return bs;
357 +        }
358 +    } else {
359 +        unrecognizedIdentifier(variable);
360 +    }
361 +
362 +    return bs;
363 + }
364 +
365 + BitSet SelectionEvaluator::nameInstruction(const std::string& name){
366 +    
367 +    return nameFinder.match(name);
368 +
369 + }    
370 +
371 + bool SelectionEvaluator::containDynamicToken(const std::vector<Token>& tokens){
372 +    std::vector<Token>::const_iterator i;
373 +    for (i = tokens.begin(); i != tokens.end(); ++i) {
374 +        if (i->tok & Token::dynamic) {
375 +            return true;
376 +        }
377 +    }
378 +
379 +    return false;
380 + }    
381 +
382 + void SelectionEvaluator::clearDefinitionsAndLoadPredefined() {
383 +    variables.clear();
384 +    //load predefine
385 +    //predefine();
386 + }
387 +
388 + BitSet SelectionEvaluator::evaluate() {
389 +    BitSet bs(nStuntDouble);
390 +    if (isLoaded_) {
391 +        pc = 0;
392 +        instructionDispatchLoop(bs);
393 +    }
394 +
395 +    return bs;
396 + }
397 +
398 + BitSet SelectionEvaluator::indexInstruction(const boost::any& value) {
399 +    BitSet bs(nStuntDouble);
400 +
401 +    if (value.type() == typeid(int)) {
402 +        int index = boost::any_cast<int>(value);
403 +        if (index < 0 || index >= bs.size()) {
404 +            invalidIndex(index);
405 +        } else {
406 +            indexFinder.find(index);
407 +        }
408 +    } else if (value.type() == typeid(std::pair<int, int>)) {
409 +        std::pair<int, int> indexRange= boost::any_cast<std::pair<int, int> >(value);
410 +        assert(indexRange.first <= indexRange.second);
411 +        if (indexRange.first < 0 || indexRange.second >= bs.size()) {
412 +            invalidIndexRange(indexRange);
413 +        }else {
414 +            indexFinder.find(indexRange.first, indexRange.second);
415 +        }
416 +    }
417 +
418 +    return bs;
419 + }
420 +
421 + }

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