ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/group/trunk/OOPSE-3.0/src/selection/SelectionEvaluator.cpp
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE-3.0/src/selection/SelectionEvaluator.cpp (file contents):
Revision 1961 by tim, Tue Feb 1 06:55:00 2005 UTC vs.
Revision 2102 by tim, Thu Mar 10 16:14:07 2005 UTC

# Line 39 | Line 39
39   * such damages.
40   */
41  
42 + #include <stack>
43   #include "selection/SelectionEvaluator.hpp"
44 + #include "primitives/Atom.hpp"
45 + #include "primitives/DirectionalAtom.hpp"
46 + #include "primitives/RigidBody.hpp"
47 + #include "primitives/Molecule.hpp"
48 +
49   namespace oopse {
50  
51  
52 + SelectionEvaluator::SelectionEvaluator(SimInfo* si)
53 +    : info(si), nameFinder(info), distanceFinder(info), indexFinder(info), isLoaded_(false){
54 +    
55 +    nStuntDouble = info->getNGlobalAtoms() + info->getNRigidBodies();
56 + }            
57 +
58 + bool SelectionEvaluator::loadScript(const std::string& filename, const std::string& script) {
59 +    clearDefinitionsAndLoadPredefined();
60 +    this->filename = filename;
61 +    this->script = script;
62 +    if (! compiler.compile(filename, script)) {
63 +        error = true;
64 +        errorMessage = compiler.getErrorMessage();
65 +        std::cerr << "SelectionCompiler Error: " << errorMessage << std::endl;
66 +        return false;
67 +    }
68 +
69 +    pc = 0;
70 +    aatoken = compiler.getAatokenCompiled();
71 +    linenumbers = compiler.getLineNumbers();
72 +    lineIndices = compiler.getLineIndices();
73 +
74 +    std::vector<std::vector<Token> >::const_iterator i;  
75 +
76 +    isDynamic_ = false;
77 +    for (i = aatoken.begin(); i != aatoken.end(); ++i) {
78 +        if (containDynamicToken(*i)) {
79 +            isDynamic_ = true;
80 +            break;
81 +        }
82 +    }
83 +
84 +    isLoaded_ = true;
85 +    return true;
86   }
87 +
88 + void SelectionEvaluator::clearState() {
89 +    error = false;
90 +    errorMessage = "";
91 + }
92 +
93 + bool SelectionEvaluator::loadScriptString(const std::string& script) {
94 +    clearState();
95 +    return loadScript("", script);
96 + }
97 +
98 + bool SelectionEvaluator::loadScriptFile(const std::string& filename) {
99 +    clearState();
100 +    return loadScriptFileInternal(filename);
101 + }
102 +
103 + bool SelectionEvaluator::loadScriptFileInternal(const  std::string & filename) {
104 +  std::ifstream ifs(filename.c_str());
105 +    if (!ifs.is_open()) {
106 +        return false;
107 +    }
108 +
109 +    const int bufferSize = 65535;
110 +    char buffer[bufferSize];
111 +    std::string script;
112 +    while(ifs.getline(buffer, bufferSize)) {
113 +        script += buffer;
114 +    }
115 +    return loadScript(filename, script);
116 + }
117 +
118 + void SelectionEvaluator::instructionDispatchLoop(BitSet& bs){
119 +    
120 +    while ( pc < aatoken.size()) {
121 +        statement = aatoken[pc++];
122 +        statementLength = statement.size();
123 +        Token token = statement[0];
124 +        switch (token.tok) {
125 +            case Token::define:
126 +                define();
127 +            break;
128 +            case Token::select:
129 +                select(bs);
130 +            break;
131 +            default:
132 +                unrecognizedCommand(token);
133 +            return;
134 +        }
135 +    }
136 +
137 + }
138 +
139 +  BitSet SelectionEvaluator::expression(const std::vector<Token>& code, int pcStart) {
140 +    BitSet bs;
141 +    std::stack<BitSet> stack;
142 +    
143 +    for (int pc = pcStart; pc < code.size(); ++pc) {
144 +      Token instruction = code[pc];
145 +
146 +      switch (instruction.tok) {
147 +      case Token::expressionBegin:
148 +        break;
149 +      case Token::expressionEnd:
150 +        break;
151 +      case Token::all:
152 +        bs = BitSet(nStuntDouble);
153 +        bs.setAll();
154 +        stack.push(bs);            
155 +        break;
156 +      case Token::none:
157 +        bs = BitSet(nStuntDouble);
158 +        stack.push(bs);            
159 +        break;
160 +      case Token::opOr:
161 +        bs = stack.top();
162 +        stack.pop();
163 +        stack.top() |= bs;
164 +        break;
165 +      case Token::opAnd:
166 +        bs = stack.top();
167 +        stack.pop();
168 +        stack.top() &= bs;
169 +        break;
170 +      case Token::opNot:
171 +        stack.top().flip();
172 +        break;
173 +      case Token::within:
174 +
175 +        withinInstruction(instruction, stack.top());
176 +        break;
177 +      //case Token::selected:
178 +      //  stack.push(getSelectionSet());
179 +      //  break;
180 +      case Token::name:
181 +        stack.push(nameInstruction(boost::any_cast<std::string>(instruction.value)));
182 +        break;
183 +      case Token::index:
184 +        stack.push(indexInstruction(instruction.value));
185 +        break;
186 +      case Token::identifier:
187 +        stack.push(lookupValue(boost::any_cast<std::string>(instruction.value)));
188 +        break;
189 +      case Token::opLT:
190 +      case Token::opLE:
191 +      case Token::opGE:
192 +      case Token::opGT:
193 +      case Token::opEQ:
194 +      case Token::opNE:
195 +        stack.push(comparatorInstruction(instruction));
196 +        break;
197 +      default:
198 +        unrecognizedExpression();
199 +      }
200 +    }
201 +    if (stack.size() != 1)
202 +      evalError("atom expression compiler error - stack over/underflow");
203 +          
204 +    return stack.top();
205 +  }
206 +
207 +
208 +
209 + BitSet SelectionEvaluator::comparatorInstruction(const Token& instruction) {
210 +    int comparator = instruction.tok;
211 +    int property = instruction.intValue;
212 +    float comparisonValue = boost::any_cast<float>(instruction.value);
213 +    float propertyValue;
214 +    BitSet bs(nStuntDouble);
215 +    bs.clearAll();
216 +    
217 +    SimInfo::MoleculeIterator mi;
218 +    Molecule* mol;
219 +    Molecule::AtomIterator ai;
220 +    Atom* atom;
221 +    Molecule::RigidBodyIterator rbIter;
222 +    RigidBody* rb;
223 +    
224 +    for (mol = info->beginMolecule(mi); mol != NULL; mol = info->nextMolecule(mi)) {
225 +
226 +        for(atom = mol->beginAtom(ai); atom != NULL; atom = mol->nextAtom(ai)) {
227 +            compareProperty(atom, bs, property, comparator, comparisonValue);
228 +        }
229 +        
230 +        for (rb = mol->beginRigidBody(rbIter); rb != NULL; rb = mol->nextRigidBody(rbIter)) {
231 +            compareProperty(rb, bs, property, comparator, comparisonValue);
232 +        }        
233 +    }
234 +
235 +    return bs;
236 + }
237 +
238 + void SelectionEvaluator::compareProperty(StuntDouble* sd, BitSet& bs, int property, int comparator, float comparisonValue) {
239 +        double propertyValue;
240 +        switch (property) {
241 +        case Token::mass:
242 +            propertyValue = sd->getMass();
243 +            break;
244 +        case Token::charge:
245 +            return;
246 +            //break;
247 +        case Token::dipole:
248 +            return;
249 +            //break;
250 +        default:
251 +            unrecognizedAtomProperty(property);
252 +        }
253 +        
254 +        bool match = false;
255 +        switch (comparator) {
256 +            case Token::opLT:
257 +                match = propertyValue < comparisonValue;
258 +                break;
259 +            case Token::opLE:
260 +                match = propertyValue <= comparisonValue;
261 +                break;
262 +            case Token::opGE:
263 +                match = propertyValue >= comparisonValue;
264 +                break;
265 +            case Token::opGT:
266 +                match = propertyValue > comparisonValue;
267 +                break;
268 +            case Token::opEQ:
269 +                match = propertyValue == comparisonValue;
270 +                break;
271 +            case Token::opNE:
272 +                match = propertyValue != comparisonValue;
273 +                break;
274 +        }
275 +        if (match)
276 +            bs.setBitOn(sd->getGlobalIndex());
277 +
278 + }
279 +
280 + void SelectionEvaluator::withinInstruction(const Token& instruction, BitSet& bs){
281 +    
282 +    boost::any withinSpec = instruction.value;
283 +    float distance;
284 +    if (withinSpec.type() == typeid(float)){
285 +        distance = boost::any_cast<float>(withinSpec);
286 +    } else if (withinSpec.type() == typeid(int)) {
287 +        distance = boost::any_cast<int>(withinSpec);    
288 +    } else {
289 +        evalError("casting error in withinInstruction");
290 +        bs.clearAll();
291 +    }
292 +    
293 +    bs = distanceFinder.find(bs, distance);            
294 + }
295 +
296 + void SelectionEvaluator::define() {
297 +    assert(statement.size() >= 3);
298 +
299 +    std::string variable = boost::any_cast<std::string>(statement[1].value);
300 +
301 +    variables.insert(VariablesType::value_type(variable, expression(statement, 2)));
302 + }
303 +
304 +
305 + /** @todo */
306 + void SelectionEvaluator::predefine(const std::string& script) {
307 +
308 +    if (compiler.compile("#predefine", script)) {
309 +        std::vector<std::vector<Token> > aatoken = compiler.getAatokenCompiled();
310 +        if (aatoken.size() != 1) {
311 +            evalError("predefinition does not have exactly 1 command:"
312 +                + script);
313 +            return;
314 +        }
315 +        std::vector<Token> statement = aatoken[0];
316 +        if (statement.size() > 2) {
317 +            int tok = statement[1].tok;
318 +            if (tok == Token::identifier || (tok & Token::predefinedset) == Token::predefinedset) {
319 +                std::string variable = boost::any_cast<std::string>(statement[1].value);
320 +                variables.insert(VariablesType::value_type(variable, statement));
321 +
322 +            } else {
323 +                evalError("invalid variable name:" + script);
324 +            }
325 +        }else {
326 +            evalError("bad predefinition length:" + script);
327 +        }
328 +
329 +        
330 +    } else {
331 +        evalError("predefined set compile error:" + script +
332 +          "\ncompile error:" + compiler.getErrorMessage());
333 +    }
334 +
335 + }
336 +
337 + void SelectionEvaluator::select(BitSet& bs){
338 +    bs = expression(statement, 1);
339 + }
340 +
341 + BitSet SelectionEvaluator::lookupValue(const std::string& variable){
342 +
343 +    BitSet bs(nStuntDouble);
344 +    std::map<std::string, boost::any>::iterator i = variables.find(variable);
345 +    
346 +    if (i != variables.end()) {
347 +        if (i->second.type() == typeid(BitSet)) {
348 +            return boost::any_cast<BitSet>(i->second);
349 +        } else if (i->second.type() ==  typeid(std::vector<Token>)){
350 +            bs = expression(boost::any_cast<std::vector<Token> >(i->second), 2);
351 +            i->second =  bs; /**@todo fixme */
352 +            return bs;
353 +        }
354 +    } else {
355 +        unrecognizedIdentifier(variable);
356 +    }
357 +
358 +    return bs;
359 + }
360 +
361 + BitSet SelectionEvaluator::nameInstruction(const std::string& name){
362 +    
363 +    return nameFinder.match(name);
364 +
365 + }    
366 +
367 + bool SelectionEvaluator::containDynamicToken(const std::vector<Token>& tokens){
368 +    std::vector<Token>::const_iterator i;
369 +    for (i = tokens.begin(); i != tokens.end(); ++i) {
370 +        if (i->tok & Token::dynamic) {
371 +            return true;
372 +        }
373 +    }
374 +
375 +    return false;
376 + }    
377 +
378 + void SelectionEvaluator::clearDefinitionsAndLoadPredefined() {
379 +    variables.clear();
380 +    //load predefine
381 +    //predefine();
382 + }
383 +
384 + BitSet SelectionEvaluator::evaluate() {
385 +    BitSet bs(nStuntDouble);
386 +    if (isLoaded_) {
387 +        pc = 0;
388 +        instructionDispatchLoop(bs);
389 +    }
390 +
391 +    return bs;
392 + }
393 +
394 + BitSet SelectionEvaluator::indexInstruction(const boost::any& value) {
395 +    BitSet bs(nStuntDouble);
396 +
397 +    if (value.type() == typeid(int)) {
398 +        int index = boost::any_cast<int>(value);
399 +        if (index < 0 || index >= bs.size()) {
400 +            invalidIndex(index);
401 +        } else {
402 +            bs = indexFinder.find(index);
403 +        }
404 +    } else if (value.type() == typeid(std::pair<int, int>)) {
405 +        std::pair<int, int> indexRange= boost::any_cast<std::pair<int, int> >(value);
406 +        assert(indexRange.first <= indexRange.second);
407 +        if (indexRange.first < 0 || indexRange.second >= bs.size()) {
408 +            invalidIndexRange(indexRange);
409 +        }else {
410 +            bs = indexFinder.find(indexRange.first, indexRange.second);
411 +        }
412 +    }
413 +
414 +    return bs;
415 + }
416 +
417 + }

Diff Legend

– Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines