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root/group/trunk/OOPSE-4/forceFields/DUFF2.frc
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE-4/forceFields/DUFF2.frc (file contents):
Revision 2382 by kdaily, Tue Oct 18 18:36:14 2005 UTC vs.
Revision 2953 by chrisfen, Wed Jul 19 12:33:20 2006 UTC

# Line 2 | Line 2
2   //
3   // The sections are divided into AtomTypes
4   //
5 < //any parameters (but not all) are derived from the TRAPPE force field
5 > // many parameters (but not all) are derived from the TRAPPE force field
6   // of Siepmann's group.
7 +
8 + begin Options
9 +      Name                   = "DUFF"
10 +      GayBerneMu             = 2.0
11 +      GayBerneNu             = 1.0
12 + end Options
13 +
14   begin AtomTypes    
15   //Name          mass     (amu)
16   CH4             16.05          
17   CH3             15.04          
18   CH2             14.03          
19   CH              13.02
20 < DIP             9.00764        
20 > DIP             9.00764        
21   SSD             18.0153        
22 < SSD1            18.0153
23 < SSD_E           18.0153
24 < SSD_RF          18.0153
22 > SSD1            18.0153
23 > SSD_E           18.0153
24 > SSD_RF          18.0153
25   TAP             18.0153
26 + TRED            18.0153
27 + EP_TRED         0.0
28   O_DIP3P         15.9994                
29   O_TIP3P         15.9994                
30   O_TIP4P         15.9994
31 < O_TIP4P-Ew      15.9994
31 > O_TIP4P-Ew      15.9994
32   O_TIP5P         15.9994
33 + O_TIP5P-E       15.9994
34   O_SPCE          15.9994
35   O_SPC           15.9994
36   H_DIP3P         1.0079
37   H_TIP3P         1.0079
38   H_TIP4P         1.0079
39 < H_TIP4P-Ew      1.0079
39 > H_TIP4P-Ew      1.0079
40   H_TIP5P         1.0079
41   H_SPCE          1.0079
42   H_SPC           1.0079
43   EP_TIP4P        0.0
44 < EP_TIP4P-Ew     0.0
44 > EP_TIP4P-Ew     0.0
45   EP_TIP5P        0.0
46   HEAD            196            
47   TB1             14.03          
# Line 52 | Line 62 | Br             79.904          
62   Cl-             35.4527
63   Na+             22.98977
64   Ar              39.948          
65 + GBAr            39.948          
66   Br              79.904          
67   Kr              83.80
68 < U               1.00
69 < GB              48.0428
70 < linear          48.0428        
68 > GBKr            83.80
69 > U               1.00
70 > GBPaper         48.0428
71 > GBlinear        48.0428
72 > GBC6H6          78.11184
73 > GBCH3OH         32.04186
74 > GBH2O           18.0153
75 > Pchg+           5.000  
76 > Pchg-           5.000  
77 > PDIP            10.000  
78 > DPD             72.06112
79   end AtomTypes
80  
81   begin DirectionalAtomTypes
82   //Name          I_xx    I_yy    I_zz    (All moments in (amu*Ang^2)
83 < H_DIP3P         0       0       0
84 < DIP             0.8202  0.8202  0
83 > H_DIP3P         0       0       0
84 > DIP             0.8202  0.8202  0
85   SSD             1.7696  0.6145  1.1550  
86   SSD1            1.7696  0.6145  1.1550  
87   SSD_E           1.7696  0.6145  1.1550  
88   SSD_RF          1.7696  0.6145  1.1550  
89   TAP             1.7696  0.6145  1.1550
90 + TRED            1.7696  0.6145  1.1550
91   HEAD            1125    1125    250
92 < GB              86.477  86.477  0
93 < linear          86.477  86.477  0
92 > GBPaper         86.477  86.477  0
93 > GBlinear        86.477  86.477  0
94 > GBC6H6          88.781  88.781  177.561
95 > GBCH3OH         4.056   20.258  20.999
96 > GBH2O           1.777   0.581   1.196
97 > GBAr            1.777   0.581   1.196
98 > GBKr            1.777   0.581   1.196
99 > PDIP            10.0    10.0    0
100   end DirectionalAtomTypes                    
101  
102   begin GayBerneAtomTypes
103 < //Name  Sigma   12b_ratio       eps     eps_ratio       mu      nu            
104 < GBPaper         3.35    3       .774729         .2      2.0     1.0
105 < linear  2.8104  3.555721        .774729         .150814         2.0     1.0
103 > //Name          d       l           eps             eps_ratio   dw
104 > GBPaper         3.35    10.05   0.774729        0.2             1.0
105 > GBlinear        2.8104  9.993   0.774729        0.150814        1.0
106 > GBC6H6          4.65    2.03    0.540           3.67            0.6
107 > GBCH3OH         2.55    3.18    0.542           1.03            1.0
108 > GBAr            3.41    3.41    0.2381          1.0             1.0
109 > GBKr            3.83    3.83    0.3259          1.0             1.0
110   end GayBerneAtomTypes                  
111  
112   begin LennardJonesAtomTypes
113 < //Name  epsilon                 sigma  
114 < DIP             0.038025        3.12
115 < SSD             0.152           3.051                                  
113 > //Name          epsilon             sigma      
114 > DIP             0.038025        3.12
115 > SSD             0.152           3.051                                  
116   SSD1            0.152           3.016
117   SSD_E           0.152           3.035
118   SSD_RF          0.152           3.019
119 < TAP             0.152           2.9
119 > TAP             0.152           2.9
120 > TRED            0.2045          2.980
121   O_DIP3P         0.1521          3.15061
122   O_TIP3P         0.1521          3.15061
123   O_TIP4P         0.1550          3.15365
124 < O_TIP4P-Ew      0.16275         3.16435
124 > O_TIP4P-Ew      0.16275         3.16435
125   O_TIP5P         0.16            3.12  
126 + O_TIP5P-E       0.178           3.097  
127   O_SPCE          0.15532         3.16549
128   O_SPC           0.15532         3.16549
129   CH4             0.279           3.73
# Line 102 | Line 134 | TE2            0.5             6.0                                  
134   TB1             0.0866          4.0                              
135   TE1             0.185           4.0                                  
136   TB2             0.25            6.0                                  
137 < TE2             0.5             6.0                                  
138 < TB3             0.5             8.0                                  
139 < TE3             0.75            8.0    
137 > TE2             0.5             6.0                                  
138 > TB3             0.5             8.0                                  
139 > TE3             0.75            8.0    
140   H               0.017090056482  2.81
141   He              0.020269601874  2.28
142   C               0.101745452544  3.35
# Line 117 | Line 149 | Br             0.511111921764  3.54
149   Cl-             0.100           4.445
150   Na+             0.118           2.579
151   Ar              0.238068461226  3.41
152 < Br              0.511111921764  3.54
152 > Br              0.5111119214    3.54
153   Kr              0.32590340268   3.83
154   U               1.0             1.0
155 + Pchg+           0.1             3.0
156 + Pchg-           0.1             3.0
157 + PDIP            0.15            5.0
158 + DPD             1.194           4.70
159 + GBH2O           0.2             2.35
160   end LennardJonesAtomTypes
161  
162   begin ChargeAtomTypes
# Line 129 | Line 166 | H_TIP4P-Ew      0.52422
166   O_SPC           -0.82
167   H_TIP3P         0.417
168   H_TIP4P         0.520
169 < H_TIP4P-Ew      0.52422
169 > H_TIP4P-Ew      0.52422
170   H_TIP5P         0.241
171   H_SPCE          0.4238
172   H_SPC           0.42
# Line 139 | Line 176 | end ChargeAtomTypes
176   Cl              -1.0
177   Cl-             -1.0
178   Na+             1.0
179 + Pchg+           0.5
180 + Pchg-           -1.0
181 + EP_TRED         1.041
182 + TRED            -1.041
183   end ChargeAtomTypes
184  
185   begin MultipoleAtomTypes
# Line 173 | Line 214 | H_DIP3P d        0.0     0.0     0.0     1.91
214   // Quadrupole moments are given in units of 10^-26 esu cm^2 (also known as an
215   //                                                           esu centi-barn)
216   //
217 < H_DIP3P d        0.0     0.0     0.0     1.91
218 < DIP     d        0.0     0.0     0.0     1.91
219 < SSD_E   dq       0.0     0.0     0.0     2.42  -1.682  1.762  -0.08
220 < SSD_RF  dq       0.0     0.0     0.0     2.48  -1.682  1.762  -0.08
221 < SSD     dq       0.0     0.0     0.0     2.35  -1.682  1.762  -0.08
222 < SSD1    dq       0.0     0.0     0.0     2.35  -1.682  1.762  -0.08
223 < TAP     dq       0.0     0.0     0.0     2.12  -1.682  1.762  -0.08
217 > H_DIP3P d       0.0     0.0     0.0     1.91
218 > DIP     d       0.0     0.0     0.0     1.91
219 > SSD_E   dq      0.0     0.0     0.0     2.42    -1.682  1.762   -0.08
220 > SSD_RF  dq      0.0     0.0     0.0     2.48    -1.682  1.762   -0.08
221 > SSD     dq      0.0     0.0     0.0     2.35    -1.682  1.762   -0.08
222 > SSD1    dq      0.0     0.0     0.0     2.35    -1.682  1.762   -0.08
223 > TAP     dq      0.0     0.0     0.0     2.12    -1.682  1.762   -0.08
224 > //TRED    q       0.0     0.0     0.0     -1.682  1.762   -0.08
225 > PDIP    d       0.0     0.0     0.0     9.6064
226 > GBH2O   dq      0.0     0.0     0.0     1.772   -2.165  2.446   -0.281
227 > GBC6H6  q       0.0     0.0     0.0     4.584   4.584   -9.168
228   //HDP     s       0.0     0.0     0.0     20.6    4.63
229   end MultipoleAtomTypes
230  
231   begin StickyAtomTypes
232 < //name w0       v0 (kcal/mol)   v0p     rl (Ang)  ru    rlp     rup
232 > //name  w0      v0 (kcal/mol)   v0p     rl (Ang)  ru    rlp     rup
233   SSD_E   0.07715 3.90            3.90    2.40      3.80  2.75    3.35
234   SSD_RF  0.07715 3.90            3.90    2.40      3.80  2.75    3.35
235   SSD     0.07715 3.7284          3.7284  2.75      3.35  2.75    4.0
236   SSD1    0.07715 3.6613          3.6613  2.75      3.35  2.75    4.0
237 + TRED    0.07715 4.22            4.22    2.40      4.00  2.40    4.0
238   end StickyAtomTypes
239  
240   begin StickyPowerAtomTypes
241 < //name w0       v0 (kcal/mol)   v0p     rl (Ang)  ru    rlp     rup
242 < TAP     0.075   5.5             0.25    2.75      3.5   2.75    3.25
241 > //name  w0          v0 (kcal/mol)   v0p     rl (Ang)  ru        rlp         rup
242 > TAP     0.075   5.5                     0.25    2.75      3.5   2.75    3.25
243   end StickyPowerAtomTypes
244  
245   begin BondTypes
# Line 201 | Line 247 | begin BondTypes
247   //Atom1 Atom2   Fixed
248   //V_Fixed = 0
249  
250 < //Atom1 Atom2   Harmonic        b0      Kb (kcal/mol)
250 > //Atom1 Atom2   Harmonic        b0              Kb (kcal/mol)
251   //V_Harmonic = 0.5*Kb(b- bo)^2
252   //Harmonic Examples
253   HEAD    CH3     Harmonic                2.75            260
# Line 210 | Line 256 | CH3    CH3     Harmonic                1.526           260
256   HEAD    TB1     Harmonic                2.76            260
257   HEAD    TB2     Harmonic                3.20            260
258   HEAD    TB3     Harmonic                3.63            260
259 < CH3     CH3     Harmonic                1.526           260
260 < CH3     CH2     Harmonic                1.526           260
261 < CH3     CH      Harmonic                1.526           260
262 < CH2     CH2     Harmonic                1.526           260
263 < CH2     CH      Harmonic                1.526           260
264 < CH      CH      Harmonic                1.526           260
265 < TB1     TB1     Harmonic                1.526           260
266 < TB2     TB2     Harmonic                2.34            260
267 < TB3     TB3     Harmonic                3.12            260
268 < TB1     TE1     Harmonic                1.526           260
269 < TB2     TE2     Harmonic                2.34            260
270 < TB3     TE3     Harmonic                3.12            260
259 > CH3         CH3 Harmonic                1.526           260
260 > CH3         CH2 Harmonic                1.526           260
261 > CH3         CH  Harmonic                1.526           260
262 > CH2         CH2 Harmonic                1.526           260
263 > CH2         CH  Harmonic                1.526           260
264 > CH          CH  Harmonic                1.526           260
265 > TB1         TB1 Harmonic                1.526           260
266 > TB2         TB2 Harmonic                2.34            260
267 > TB3         TB3 Harmonic                3.12            260
268 > TB1         TE1 Harmonic                1.526           260
269 > TB2         TE2 Harmonic                2.34            260
270 > TB3         TE3 Harmonic                3.12            260
271  
272   //Atom1 Atom2   Cubic           b0      K3      K2      K1      K0
273   //V_Cubic = K3(b - b0)^3 + K2(b - b0)^2 + K1(b - b0) + K0

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