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root/group/trunk/OOPSE-4/src/UseTheForce/doForces.F90
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE-4/src/UseTheForce/doForces.F90 (file contents):
Revision 2375 by gezelter, Mon Oct 17 19:12:45 2005 UTC vs.
Revision 2540 by chuckv, Mon Jan 9 22:22:35 2006 UTC

# Line 45 | Line 45
45  
46   !! @author Charles F. Vardeman II
47   !! @author Matthew Meineke
48 < !! @version $Id: doForces.F90,v 1.59 2005-10-17 19:12:34 gezelter Exp $, $Date: 2005-10-17 19:12:34 $, $Name: not supported by cvs2svn $, $Revision: 1.59 $
48 > !! @version $Id: doForces.F90,v 1.75 2006-01-09 22:22:35 chuckv Exp $, $Date: 2006-01-09 22:22:35 $, $Name: not supported by cvs2svn $, $Revision: 1.75 $
49  
50  
51   module doForces
# Line 58 | Line 58 | module doForces
58    use lj
59    use sticky
60    use electrostatic_module
61  use reaction_field_module
61    use gayberne
62    use shapes
63    use vector_class
64    use eam
65 +  use suttonchen
66    use status
67   #ifdef IS_MPI
68    use mpiSimulation
# Line 87 | Line 87 | module doForces
87    logical, save :: haveInteractionHash = .false.
88    logical, save :: haveGtypeCutoffMap = .false.
89    logical, save :: haveDefaultCutoffs = .false.
90 <  logical, save :: haveRlist = .false.
90 >  logical, save :: haveSkinThickness = .false.
91 >  logical, save :: haveElectrostaticSummationMethod = .false.
92 >  logical, save :: haveCutoffPolicy = .false.
93 >  logical, save :: VisitCutoffsAfterComputing = .false.
94  
95    logical, save :: FF_uses_DirectionalAtoms
96    logical, save :: FF_uses_Dipoles
97    logical, save :: FF_uses_GayBerne
98    logical, save :: FF_uses_EAM
99 +  logical, save :: FF_uses_SC
100 +  logical, save :: FF_uses_MEAM
101 +
102  
103    logical, save :: SIM_uses_DirectionalAtoms
104    logical, save :: SIM_uses_EAM
105 +  logical, save :: SIM_uses_SC
106 +  logical, save :: SIM_uses_MEAM
107    logical, save :: SIM_requires_postpair_calc
108    logical, save :: SIM_requires_prepair_calc
109    logical, save :: SIM_uses_PBC
110  
111    integer, save :: electrostaticSummationMethod
112 +  integer, save :: cutoffPolicy = TRADITIONAL_CUTOFF_POLICY
113  
114 +  real(kind=dp), save :: defaultRcut, defaultRsw, largestRcut
115 +  real(kind=dp), save :: skinThickness
116 +  logical, save :: defaultDoShift
117 +
118    public :: init_FF
119 <  public :: setDefaultCutoffs
119 >  public :: setCutoffs
120 >  public :: cWasLame
121 >  public :: setElectrostaticMethod
122 >  public :: setCutoffPolicy
123 >  public :: setSkinThickness
124    public :: do_force_loop
108  public :: createInteractionHash
109  public :: createGtypeCutoffMap
110  public :: getStickyCut
111  public :: getStickyPowerCut
112  public :: getGayBerneCut
113  public :: getEAMCut
114  public :: getShapeCut
125  
126   #ifdef PROFILE
127    public :: getforcetime
# Line 139 | Line 149 | module doForces
149    end type gtypeCutoffs
150    type(gtypeCutoffs), dimension(:,:), allocatable :: gtypeCutoffMap
151  
142  integer, save :: cutoffPolicy = TRADITIONAL_CUTOFF_POLICY
143  real(kind=dp),save :: defaultRcut, defaultRsw, defaultRlist
144  real(kind=dp),save :: listSkin
145  
152   contains
153  
154 <  subroutine createInteractionHash(status)
154 >  subroutine createInteractionHash()
155      integer :: nAtypes
150    integer, intent(out) :: status
156      integer :: i
157      integer :: j
158      integer :: iHash
# Line 159 | Line 164 | contains
164      logical :: i_is_GB
165      logical :: i_is_EAM
166      logical :: i_is_Shape
167 +    logical :: i_is_SC
168 +    logical :: i_is_MEAM
169      logical :: j_is_LJ
170      logical :: j_is_Elect
171      logical :: j_is_Sticky
# Line 166 | Line 173 | contains
173      logical :: j_is_GB
174      logical :: j_is_EAM
175      logical :: j_is_Shape
176 +    logical :: j_is_SC
177 +    logical :: j_is_MEAM
178      real(kind=dp) :: myRcut
179  
171    status = 0  
172
180      if (.not. associated(atypes)) then
181 <       call handleError("atype", "atypes was not present before call of createInteractionHash!")
175 <       status = -1
181 >       call handleError("doForces", "atypes was not present before call of createInteractionHash!")
182         return
183      endif
184      
185      nAtypes = getSize(atypes)
186      
187      if (nAtypes == 0) then
188 <       status = -1
188 >       call handleError("doForces", "nAtypes was zero during call of createInteractionHash!")
189         return
190      end if
191  
# Line 205 | Line 211 | contains
211         call getElementProperty(atypes, i, "is_GayBerne", i_is_GB)
212         call getElementProperty(atypes, i, "is_EAM", i_is_EAM)
213         call getElementProperty(atypes, i, "is_Shape", i_is_Shape)
214 +       call getElementProperty(atypes, i, "is_SC", i_is_SC)
215 +       call getElementProperty(atypes, i, "is_MEAM", i_is_MEAM)
216  
217         do j = i, nAtypes
218  
# Line 218 | Line 226 | contains
226            call getElementProperty(atypes, j, "is_GayBerne", j_is_GB)
227            call getElementProperty(atypes, j, "is_EAM", j_is_EAM)
228            call getElementProperty(atypes, j, "is_Shape", j_is_Shape)
229 +          call getElementProperty(atypes, j, "is_SC", j_is_SC)
230 +          call getElementProperty(atypes, j, "is_MEAM", j_is_MEAM)
231  
232            if (i_is_LJ .and. j_is_LJ) then
233               iHash = ior(iHash, LJ_PAIR)            
# Line 239 | Line 249 | contains
249               iHash = ior(iHash, EAM_PAIR)
250            endif
251  
252 +          if (i_is_SC .and. j_is_SC) then
253 +             iHash = ior(iHash, SC_PAIR)
254 +          endif
255 +
256            if (i_is_GB .and. j_is_GB) iHash = ior(iHash, GAYBERNE_PAIR)
257            if (i_is_GB .and. j_is_LJ) iHash = ior(iHash, GAYBERNE_LJ)
258            if (i_is_LJ .and. j_is_GB) iHash = ior(iHash, GAYBERNE_LJ)
# Line 258 | Line 272 | contains
272      haveInteractionHash = .true.
273    end subroutine createInteractionHash
274  
275 <  subroutine createGtypeCutoffMap(stat)
275 >  subroutine createGtypeCutoffMap()
276  
263    integer, intent(out), optional :: stat
277      logical :: i_is_LJ
278      logical :: i_is_Elect
279      logical :: i_is_Sticky
# Line 268 | Line 281 | contains
281      logical :: i_is_GB
282      logical :: i_is_EAM
283      logical :: i_is_Shape
284 +    logical :: i_is_SC
285      logical :: GtypeFound
286  
287      integer :: myStatus, nAtypes,  i, j, istart, iend, jstart, jend
# Line 275 | Line 289 | contains
289      integer :: nGroupsInRow
290      integer :: nGroupsInCol
291      integer :: nGroupTypesRow,nGroupTypesCol
292 <    real(kind=dp):: thisSigma, bigSigma, thisRcut, tradRcut, tol, skin
292 >    real(kind=dp):: thisSigma, bigSigma, thisRcut, tradRcut, tol
293      real(kind=dp) :: biggestAtypeCutoff
294  
281    stat = 0
295      if (.not. haveInteractionHash) then
296 <       call createInteractionHash(myStatus)      
284 <       if (myStatus .ne. 0) then
285 <          write(default_error, *) 'createInteractionHash failed in doForces!'
286 <          stat = -1
287 <          return
288 <       endif
296 >       call createInteractionHash()      
297      endif
298   #ifdef IS_MPI
299      nGroupsInRow = getNgroupsInRow(plan_group_row)
# Line 303 | Line 311 | contains
311            call getElementProperty(atypes, i, "is_GayBerne", i_is_GB)
312            call getElementProperty(atypes, i, "is_EAM", i_is_EAM)
313            call getElementProperty(atypes, i, "is_Shape", i_is_Shape)
314 <          
314 >          call getElementProperty(atypes, i, "is_SC", i_is_SC)
315  
316            if (haveDefaultCutoffs) then
317               atypeMaxCutoff(i) = defaultRcut
# Line 336 | Line 344 | contains
344                  thisRcut = getShapeCut(i)
345                  if (thisRCut .gt. atypeMaxCutoff(i)) atypeMaxCutoff(i) = thisRCut
346               endif
347 +             if (i_is_SC) then
348 +                thisRcut = getSCCut(i)
349 +                if (thisRCut .gt. atypeMaxCutoff(i)) atypeMaxCutoff(i) = thisRCut
350 +             endif
351            endif
352 <          
341 <          
352 >                    
353            if (atypeMaxCutoff(i).gt.biggestAtypeCutoff) then
354               biggestAtypeCutoff = atypeMaxCutoff(i)
355            endif
356  
357         endif
358      enddo
348  
349
359      
360      istart = 1
361      jstart = 1
# Line 390 | Line 399 | contains
399         allocate(groupToGtypeCol(jend))
400      end if
401  
402 <    if(.not.associated(groupToGtypeCol)) then
403 <       allocate(groupToGtypeCol(jend))
402 >    if(.not.associated(groupMaxCutoffCol)) then
403 >       allocate(groupMaxCutoffCol(jend))
404      else
405 <       deallocate(groupToGtypeCol)
406 <       allocate(groupToGtypeCol(jend))
405 >       deallocate(groupMaxCutoffCol)
406 >       allocate(groupMaxCutoffCol(jend))
407      end if
408      if(.not.associated(gtypeMaxCutoffCol)) then
409         allocate(gtypeMaxCutoffCol(jend))
# Line 417 | Line 426 | contains
426      
427      tol = 1.0d-6
428      nGroupTypesRow = 0
429 <
429 >    nGroupTypesCol = 0
430      do i = istart, iend      
431         n_in_i = groupStartRow(i+1) - groupStartRow(i)
432         groupMaxCutoffRow(i) = 0.0_dp
# Line 432 | Line 441 | contains
441               groupMaxCutoffRow(i)=atypeMaxCutoff(me_i)
442            endif          
443         enddo
435
444         if (nGroupTypesRow.eq.0) then
445            nGroupTypesRow = nGroupTypesRow + 1
446            gtypeMaxCutoffRow(nGroupTypesRow) = groupMaxCutoffRow(i)
# Line 495 | Line 503 | contains
503      groupMaxCutoffCol => groupMaxCutoffRow
504   #endif
505  
498
499
500
501
506      !! allocate the gtypeCutoffMap here.
507      allocate(gtypeCutoffMap(nGroupTypesRow,nGroupTypesCol))
508      !! then we do a double loop over all the group TYPES to find the cutoff
509      !! map between groups of two types
510      tradRcut = max(maxval(gtypeMaxCutoffRow),maxval(gtypeMaxCutoffCol))
511  
512 <    do i = 1, nGroupTypesRow
512 >    do i = 1, nGroupTypesRow      
513         do j = 1, nGroupTypesCol
514        
515            select case(cutoffPolicy)
# Line 520 | Line 524 | contains
524               return
525            end select
526            gtypeCutoffMap(i,j)%rcut = thisRcut
527 +          
528 +          if (thisRcut.gt.largestRcut) largestRcut = thisRcut
529 +
530            gtypeCutoffMap(i,j)%rcutsq = thisRcut*thisRcut
524          skin = defaultRlist - defaultRcut
525          listSkin = skin ! set neighbor list skin thickness
526          gtypeCutoffMap(i,j)%rlistsq = (thisRcut + skin)**2
531  
532 +          if (.not.haveSkinThickness) then
533 +             skinThickness = 1.0_dp
534 +          endif
535 +
536 +          gtypeCutoffMap(i,j)%rlistsq = (thisRcut + skinThickness)**2
537 +
538            ! sanity check
539  
540            if (haveDefaultCutoffs) then
# Line 534 | Line 544 | contains
544            endif
545         enddo
546      enddo
547 +
548      if(allocated(gtypeMaxCutoffRow)) deallocate(gtypeMaxCutoffRow)
549      if(allocated(groupMaxCutoffRow)) deallocate(groupMaxCutoffRow)
550      if(allocated(atypeMaxCutoff)) deallocate(atypeMaxCutoff)
# Line 547 | Line 558 | contains
558      haveGtypeCutoffMap = .true.
559     end subroutine createGtypeCutoffMap
560  
561 <   subroutine setDefaultCutoffs(defRcut, defRsw, defRlist, cutPolicy)
551 <     real(kind=dp),intent(in) :: defRcut, defRsw, defRlist
552 <     integer, intent(in) :: cutPolicy
561 >   subroutine setCutoffs(defRcut, defRsw)
562  
563 +     real(kind=dp),intent(in) :: defRcut, defRsw
564 +     character(len = statusMsgSize) :: errMsg
565 +     integer :: localError
566 +
567       defaultRcut = defRcut
568       defaultRsw = defRsw
569 <     defaultRlist = defRlist
570 <     cutoffPolicy = cutPolicy
569 >    
570 >     defaultDoShift = .false.
571 >     if (abs(defaultRcut-defaultRsw) .lt. 0.0001) then
572 >        
573 >        write(errMsg, *) &
574 >             'cutoffRadius and switchingRadius are set to the same', newline &
575 >             // tab, 'value.  OOPSE will use shifted ', newline &
576 >             // tab, 'potentials instead of switching functions.'
577 >        
578 >        call handleInfo("setCutoffs", errMsg)
579 >        
580 >        defaultDoShift = .true.
581 >        
582 >     endif
583  
584 +     localError = 0
585 +     call setLJDefaultCutoff( defaultRcut, defaultDoShift )
586 +     call setElectrostaticCutoffRadius( defaultRcut, defaultRsw )
587 +     call setCutoffEAM( defaultRcut, localError)
588 +     if (localError /= 0) then
589 +       write(errMsg, *) 'An error has occured in setting the EAM cutoff'
590 +       call handleError("setCutoffs", errMsg)
591 +     end if
592 +     call set_switch(GROUP_SWITCH, defaultRsw, defaultRcut)
593 +
594       haveDefaultCutoffs = .true.
595 <   end subroutine setDefaultCutoffs
595 >     haveGtypeCutoffMap = .false.
596 >   end subroutine setCutoffs
597  
598 +   subroutine cWasLame()
599 +    
600 +     VisitCutoffsAfterComputing = .true.
601 +     return
602 +    
603 +   end subroutine cWasLame
604 +  
605     subroutine setCutoffPolicy(cutPolicy)
606 <
606 >    
607       integer, intent(in) :: cutPolicy
608 +    
609       cutoffPolicy = cutPolicy
610 <     call createGtypeCutoffMap()
610 >     haveCutoffPolicy = .true.
611 >     haveGtypeCutoffMap = .false.
612 >    
613     end subroutine setCutoffPolicy
614 +  
615 +   subroutine setElectrostaticMethod( thisESM )
616 +
617 +     integer, intent(in) :: thisESM
618 +
619 +     electrostaticSummationMethod = thisESM
620 +     haveElectrostaticSummationMethod = .true.
621      
622 +   end subroutine setElectrostaticMethod
623 +
624 +   subroutine setSkinThickness( thisSkin )
625      
626 <  subroutine setSimVariables()
627 <    SIM_uses_DirectionalAtoms = SimUsesDirectionalAtoms()
628 <    SIM_uses_EAM = SimUsesEAM()
629 <    SIM_requires_postpair_calc = SimRequiresPostpairCalc()
630 <    SIM_requires_prepair_calc = SimRequiresPrepairCalc()
631 <    SIM_uses_PBC = SimUsesPBC()
626 >     real(kind=dp), intent(in) :: thisSkin
627 >    
628 >     skinThickness = thisSkin
629 >     haveSkinThickness = .true.    
630 >     haveGtypeCutoffMap = .false.
631 >    
632 >   end subroutine setSkinThickness
633 >      
634 >   subroutine setSimVariables()
635 >     SIM_uses_DirectionalAtoms = SimUsesDirectionalAtoms()
636 >     SIM_uses_EAM = SimUsesEAM()
637 >     SIM_requires_postpair_calc = SimRequiresPostpairCalc()
638 >     SIM_requires_prepair_calc = SimRequiresPrepairCalc()
639 >     SIM_uses_PBC = SimUsesPBC()
640 >     SIM_uses_SC = SimUsesSC()
641 >    
642 >     haveSIMvariables = .true.
643 >    
644 >     return
645 >   end subroutine setSimVariables
646  
577    haveSIMvariables = .true.
578
579    return
580  end subroutine setSimVariables
581
647    subroutine doReadyCheck(error)
648      integer, intent(out) :: error
649  
# Line 587 | Line 652 | contains
652      error = 0
653  
654      if (.not. haveInteractionHash) then      
655 <       myStatus = 0      
591 <       call createInteractionHash(myStatus)      
592 <       if (myStatus .ne. 0) then
593 <          write(default_error, *) 'createInteractionHash failed in doForces!'
594 <          error = -1
595 <          return
596 <       endif
655 >       call createInteractionHash()      
656      endif
657  
658      if (.not. haveGtypeCutoffMap) then        
659 <       myStatus = 0      
601 <       call createGtypeCutoffMap(myStatus)      
602 <       if (myStatus .ne. 0) then
603 <          write(default_error, *) 'createGtypeCutoffMap failed in doForces!'
604 <          error = -1
605 <          return
606 <       endif
659 >       call createGtypeCutoffMap()      
660      endif
661  
662 +
663 +    if (VisitCutoffsAfterComputing) then
664 +       call set_switch(GROUP_SWITCH, largestRcut, largestRcut)      
665 +    endif
666 +
667 +
668      if (.not. haveSIMvariables) then
669         call setSimVariables()
670      endif
# Line 639 | Line 698 | contains
698    end subroutine doReadyCheck
699  
700  
701 <  subroutine init_FF(thisESM, thisStat)
701 >  subroutine init_FF(thisStat)
702  
644    integer, intent(in) :: thisESM
703      integer, intent(out) :: thisStat  
704      integer :: my_status, nMatches
705      integer, pointer :: MatchList(:) => null()
648    real(kind=dp) :: rcut, rrf, rt, dielect
706  
707      !! assume things are copacetic, unless they aren't
708      thisStat = 0
709  
653    electrostaticSummationMethod = thisESM
654
710      !! init_FF is called *after* all of the atom types have been
711      !! defined in atype_module using the new_atype subroutine.
712      !!
# Line 662 | Line 717 | contains
717      FF_uses_Dipoles = .false.
718      FF_uses_GayBerne = .false.
719      FF_uses_EAM = .false.
720 +    FF_uses_SC = .false.
721  
722      call getMatchingElementList(atypes, "is_Directional", .true., &
723           nMatches, MatchList)
# Line 678 | Line 734 | contains
734      call getMatchingElementList(atypes, "is_EAM", .true., nMatches, MatchList)
735      if (nMatches .gt. 0) FF_uses_EAM = .true.
736  
737 +    call getMatchingElementList(atypes, "is_SC", .true., nMatches, MatchList)
738 +    if (nMatches .gt. 0) FF_uses_SC = .true.
739  
682    haveSaneForceField = .true.
740  
741 <    !! check to make sure the reaction field setting makes sense
685 <
686 <    if (FF_uses_Dipoles) then
687 <       if (electrostaticSummationMethod == REACTION_FIELD) then
688 <          dielect = getDielect()
689 <          call initialize_rf(dielect)
690 <       endif
691 <    else
692 <       if (electrostaticSummationMethod == REACTION_FIELD) then
693 <          write(default_error,*) 'Using Reaction Field with no dipoles?  Huh?'
694 <          thisStat = -1
695 <          haveSaneForceField = .false.
696 <          return
697 <       endif
698 <    endif
741 >    haveSaneForceField = .true.
742  
743      if (FF_uses_EAM) then
744         call init_EAM_FF(my_status)
# Line 761 | Line 804 | contains
804      integer :: nlist
805      real( kind = DP ) :: ratmsq, rgrpsq, rgrp, vpair, vij
806      real( kind = DP ) :: sw, dswdr, swderiv, mf
807 +    real( kind = DP ) :: rVal
808      real(kind=dp),dimension(3) :: d_atm, d_grp, fpair, fij
809      real(kind=dp) :: rfpot, mu_i, virial
810 +    real(kind=dp):: rCut
811      integer :: me_i, me_j, n_in_i, n_in_j
812      logical :: is_dp_i
813      integer :: neighborListSize
# Line 771 | Line 816 | contains
816      integer :: propPack_i, propPack_j
817      integer :: loopStart, loopEnd, loop
818      integer :: iHash
819 +    integer :: i1
820    
821  
822      !! initialize local variables  
# Line 835 | Line 881 | contains
881         ! (but only on the first time through):
882         if (loop .eq. loopStart) then
883   #ifdef IS_MPI
884 <          call checkNeighborList(nGroupsInRow, q_group_row, listSkin, &
884 >          call checkNeighborList(nGroupsInRow, q_group_row, skinThickness, &
885                 update_nlist)
886   #else
887 <          call checkNeighborList(nGroups, q_group, listSkin, &
887 >          call checkNeighborList(nGroups, q_group, skinThickness, &
888                 update_nlist)
889   #endif
890         endif
# Line 918 | Line 964 | contains
964  
965                     list(nlist) = j
966                  endif
967 +
968  
969 <                if (loop .eq. PAIR_LOOP) then
970 <                   vij = 0.0d0
924 <                   fij(1:3) = 0.0d0
925 <                endif
969 >                
970 >                if (rgrpsq < gtypeCutoffMap(groupToGtypeRow(i),groupToGtypeCol(j))%rCutsq) then
971  
972 <                call get_switch(rgrpsq, sw, dswdr, rgrp, group_switch, &
973 <                     in_switching_region)
974 <
975 <                n_in_j = groupStartCol(j+1) - groupStartCol(j)
976 <
977 <                do ia = groupStartRow(i), groupStartRow(i+1)-1
978 <
979 <                   atom1 = groupListRow(ia)
980 <
981 <                   inner: do jb = groupStartCol(j), groupStartCol(j+1)-1
982 <
983 <                      atom2 = groupListCol(jb)
984 <
985 <                      if (skipThisPair(atom1, atom2)) cycle inner
986 <
987 <                      if ((n_in_i .eq. 1).and.(n_in_j .eq. 1)) then
988 <                         d_atm(1:3) = d_grp(1:3)
989 <                         ratmsq = rgrpsq
990 <                      else
991 < #ifdef IS_MPI
992 <                         call get_interatomic_vector(q_Row(:,atom1), &
993 <                              q_Col(:,atom2), d_atm, ratmsq)
972 >                   rCut = gtypeCutoffMap(groupToGtypeRow(i),groupToGtypeCol(j))%rCut
973 >                   if (loop .eq. PAIR_LOOP) then
974 >                      vij = 0.0d0
975 >                      fij(1:3) = 0.0d0
976 >                   endif
977 >                  
978 >                   call get_switch(rgrpsq, sw, dswdr, rgrp, &
979 >                        group_switch, in_switching_region)
980 >                  
981 >                   n_in_j = groupStartCol(j+1) - groupStartCol(j)
982 >                  
983 >                   do ia = groupStartRow(i), groupStartRow(i+1)-1
984 >                      
985 >                      atom1 = groupListRow(ia)
986 >                      
987 >                      inner: do jb = groupStartCol(j), groupStartCol(j+1)-1
988 >                        
989 >                         atom2 = groupListCol(jb)
990 >                        
991 >                         if (skipThisPair(atom1, atom2))  cycle inner
992 >                        
993 >                         if ((n_in_i .eq. 1).and.(n_in_j .eq. 1)) then
994 >                            d_atm(1:3) = d_grp(1:3)
995 >                            ratmsq = rgrpsq
996 >                         else
997 > #ifdef IS_MPI
998 >                            call get_interatomic_vector(q_Row(:,atom1), &
999 >                                 q_Col(:,atom2), d_atm, ratmsq)
1000   #else
1001 <                         call get_interatomic_vector(q(:,atom1), &
1002 <                              q(:,atom2), d_atm, ratmsq)
1001 >                            call get_interatomic_vector(q(:,atom1), &
1002 >                                 q(:,atom2), d_atm, ratmsq)
1003   #endif
1004 <                      endif
1005 <
1006 <                      if (loop .eq. PREPAIR_LOOP) then
1007 < #ifdef IS_MPI                      
1008 <                         call do_prepair(atom1, atom2, ratmsq, d_atm, sw, &
1009 <                              rgrpsq, d_grp, do_pot, do_stress, &
1010 <                              eFrame, A, f, t, pot_local)
1004 >                         endif
1005 >                        
1006 >                         if (loop .eq. PREPAIR_LOOP) then
1007 > #ifdef IS_MPI                      
1008 >                            call do_prepair(atom1, atom2, ratmsq, d_atm, sw, &
1009 >                                 rgrpsq, d_grp, rCut, do_pot, do_stress, &
1010 >                                 eFrame, A, f, t, pot_local)
1011   #else
1012 <                         call do_prepair(atom1, atom2, ratmsq, d_atm, sw, &
1013 <                              rgrpsq, d_grp, do_pot, do_stress, &
1014 <                              eFrame, A, f, t, pot)
1012 >                            call do_prepair(atom1, atom2, ratmsq, d_atm, sw, &
1013 >                                 rgrpsq, d_grp, rCut, do_pot, do_stress, &
1014 >                                 eFrame, A, f, t, pot)
1015   #endif                                              
1016 <                      else
1016 >                         else
1017   #ifdef IS_MPI                      
1018 <                         call do_pair(atom1, atom2, ratmsq, d_atm, sw, &
1019 <                              do_pot, &
1020 <                              eFrame, A, f, t, pot_local, vpair, fpair)
1018 >                            call do_pair(atom1, atom2, ratmsq, d_atm, sw, &
1019 >                                 do_pot, eFrame, A, f, t, pot_local, vpair, &
1020 >                                 fpair, d_grp, rgrp, rCut)
1021   #else
1022 <                         call do_pair(atom1, atom2, ratmsq, d_atm, sw, &
1023 <                              do_pot,  &
1024 <                              eFrame, A, f, t, pot, vpair, fpair)
1022 >                            call do_pair(atom1, atom2, ratmsq, d_atm, sw, &
1023 >                                 do_pot, eFrame, A, f, t, pot, vpair, fpair, &
1024 >                                 d_grp, rgrp, rCut)
1025   #endif
1026 +                            vij = vij + vpair
1027 +                            fij(1:3) = fij(1:3) + fpair(1:3)
1028 +                         endif
1029 +                      enddo inner
1030 +                   enddo
1031  
1032 <                         vij = vij + vpair
1033 <                         fij(1:3) = fij(1:3) + fpair(1:3)
1034 <                      endif
1035 <                   enddo inner
1036 <                enddo
1037 <
1038 <                if (loop .eq. PAIR_LOOP) then
1039 <                   if (in_switching_region) then
1040 <                      swderiv = vij*dswdr/rgrp
1041 <                      fij(1) = fij(1) + swderiv*d_grp(1)
986 <                      fij(2) = fij(2) + swderiv*d_grp(2)
987 <                      fij(3) = fij(3) + swderiv*d_grp(3)
988 <
989 <                      do ia=groupStartRow(i), groupStartRow(i+1)-1
990 <                         atom1=groupListRow(ia)
991 <                         mf = mfactRow(atom1)
1032 >                   if (loop .eq. PAIR_LOOP) then
1033 >                      if (in_switching_region) then
1034 >                         swderiv = vij*dswdr/rgrp
1035 >                         fij(1) = fij(1) + swderiv*d_grp(1)
1036 >                         fij(2) = fij(2) + swderiv*d_grp(2)
1037 >                         fij(3) = fij(3) + swderiv*d_grp(3)
1038 >                        
1039 >                         do ia=groupStartRow(i), groupStartRow(i+1)-1
1040 >                            atom1=groupListRow(ia)
1041 >                            mf = mfactRow(atom1)
1042   #ifdef IS_MPI
1043 <                         f_Row(1,atom1) = f_Row(1,atom1) + swderiv*d_grp(1)*mf
1044 <                         f_Row(2,atom1) = f_Row(2,atom1) + swderiv*d_grp(2)*mf
1045 <                         f_Row(3,atom1) = f_Row(3,atom1) + swderiv*d_grp(3)*mf
1043 >                            f_Row(1,atom1) = f_Row(1,atom1) + swderiv*d_grp(1)*mf
1044 >                            f_Row(2,atom1) = f_Row(2,atom1) + swderiv*d_grp(2)*mf
1045 >                            f_Row(3,atom1) = f_Row(3,atom1) + swderiv*d_grp(3)*mf
1046   #else
1047 <                         f(1,atom1) = f(1,atom1) + swderiv*d_grp(1)*mf
1048 <                         f(2,atom1) = f(2,atom1) + swderiv*d_grp(2)*mf
1049 <                         f(3,atom1) = f(3,atom1) + swderiv*d_grp(3)*mf
1047 >                            f(1,atom1) = f(1,atom1) + swderiv*d_grp(1)*mf
1048 >                            f(2,atom1) = f(2,atom1) + swderiv*d_grp(2)*mf
1049 >                            f(3,atom1) = f(3,atom1) + swderiv*d_grp(3)*mf
1050   #endif
1051 <                      enddo
1052 <
1053 <                      do jb=groupStartCol(j), groupStartCol(j+1)-1
1054 <                         atom2=groupListCol(jb)
1055 <                         mf = mfactCol(atom2)
1051 >                         enddo
1052 >                        
1053 >                         do jb=groupStartCol(j), groupStartCol(j+1)-1
1054 >                            atom2=groupListCol(jb)
1055 >                            mf = mfactCol(atom2)
1056   #ifdef IS_MPI
1057 <                         f_Col(1,atom2) = f_Col(1,atom2) - swderiv*d_grp(1)*mf
1058 <                         f_Col(2,atom2) = f_Col(2,atom2) - swderiv*d_grp(2)*mf
1059 <                         f_Col(3,atom2) = f_Col(3,atom2) - swderiv*d_grp(3)*mf
1057 >                            f_Col(1,atom2) = f_Col(1,atom2) - swderiv*d_grp(1)*mf
1058 >                            f_Col(2,atom2) = f_Col(2,atom2) - swderiv*d_grp(2)*mf
1059 >                            f_Col(3,atom2) = f_Col(3,atom2) - swderiv*d_grp(3)*mf
1060   #else
1061 <                         f(1,atom2) = f(1,atom2) - swderiv*d_grp(1)*mf
1062 <                         f(2,atom2) = f(2,atom2) - swderiv*d_grp(2)*mf
1063 <                         f(3,atom2) = f(3,atom2) - swderiv*d_grp(3)*mf
1061 >                            f(1,atom2) = f(1,atom2) - swderiv*d_grp(1)*mf
1062 >                            f(2,atom2) = f(2,atom2) - swderiv*d_grp(2)*mf
1063 >                            f(3,atom2) = f(3,atom2) - swderiv*d_grp(3)*mf
1064   #endif
1065 <                      enddo
1066 <                   endif
1065 >                         enddo
1066 >                      endif
1067  
1068 <                   if (do_stress) call add_stress_tensor(d_grp, fij)
1068 >                      if (do_stress) call add_stress_tensor(d_grp, fij)
1069 >                   endif
1070                  endif
1071 <             end if
1071 >             endif
1072            enddo
1073 <
1073 >          
1074         enddo outer
1075  
1076         if (update_nlist) then
# Line 1101 | Line 1152 | contains
1152      endif
1153   #endif
1154  
1155 <    if (FF_RequiresPostpairCalc() .and. SIM_requires_postpair_calc) then
1155 >    if (SIM_requires_postpair_calc) then
1156 >       do i = 1, nlocal            
1157 >          
1158 >          ! we loop only over the local atoms, so we don't need row and column
1159 >          ! lookups for the types
1160 >          
1161 >          me_i = atid(i)
1162 >          
1163 >          ! is the atom electrostatic?  See if it would have an
1164 >          ! electrostatic interaction with itself
1165 >          iHash = InteractionHash(me_i,me_i)
1166  
1167 <       if (electrostaticSummationMethod == REACTION_FIELD) then
1107 <
1167 >          if ( iand(iHash, ELECTROSTATIC_PAIR).ne.0 ) then
1168   #ifdef IS_MPI
1169 <          call scatter(rf_Row,rf,plan_atom_row_3d)
1170 <          call scatter(rf_Col,rf_Temp,plan_atom_col_3d)
1111 <          do i = 1,nlocal
1112 <             rf(1:3,i) = rf(1:3,i) + rf_Temp(1:3,i)
1113 <          end do
1114 < #endif
1115 <
1116 <          do i = 1, nLocal
1117 <
1118 <             rfpot = 0.0_DP
1119 < #ifdef IS_MPI
1120 <             me_i = atid_row(i)
1169 >             call self_self(i, eFrame, pot_local(ELECTROSTATIC_POT), &
1170 >                  t, do_pot)
1171   #else
1172 <             me_i = atid(i)
1172 >             call self_self(i, eFrame, pot(ELECTROSTATIC_POT), &
1173 >                  t, do_pot)
1174   #endif
1175 <             iHash = InteractionHash(me_i,me_j)
1176 <            
1177 <             if ( iand(iHash, ELECTROSTATIC_PAIR).ne.0 ) then
1178 <
1179 <                mu_i = getDipoleMoment(me_i)
1180 <
1181 <                !! The reaction field needs to include a self contribution
1182 <                !! to the field:
1183 <                call accumulate_self_rf(i, mu_i, eFrame)
1184 <                !! Get the reaction field contribution to the
1185 <                !! potential and torques:
1186 <                call reaction_field_final(i, mu_i, eFrame, rfpot, t, do_pot)
1187 < #ifdef IS_MPI
1188 <                pot_local(ELECTROSTATIC_POT) = pot_local(ELECTROSTATIC_POT) + rfpot
1175 >          endif
1176 >  
1177 >          
1178 >          if (electrostaticSummationMethod.eq.REACTION_FIELD) then
1179 >            
1180 >             ! loop over the excludes to accumulate RF stuff we've
1181 >             ! left out of the normal pair loop
1182 >            
1183 >             do i1 = 1, nSkipsForAtom(i)
1184 >                j = skipsForAtom(i, i1)
1185 >                
1186 >                ! prevent overcounting of the skips
1187 >                if (i.lt.j) then
1188 >                   call get_interatomic_vector(q(:,i), &
1189 >                        q(:,j), d_atm, ratmsq)
1190 >                   rVal = dsqrt(ratmsq)
1191 >                   call get_switch(ratmsq, sw, dswdr, rVal, group_switch, &
1192 >                        in_switching_region)
1193 > #ifdef IS_MPI
1194 >                   call rf_self_excludes(i, j, sw, eFrame, d_atm, rVal, &
1195 >                        vpair, pot_local(ELECTROSTATIC_POT), f, t, do_pot)
1196   #else
1197 <                pot(ELECTROSTATIC_POT) = pot(ELECTROSTATIC_POT) + rfpot
1198 <
1197 >                   call rf_self_excludes(i, j, sw, eFrame, d_atm, rVal, &
1198 >                        vpair, pot(ELECTROSTATIC_POT), f, t, do_pot)
1199   #endif
1200 <             endif
1201 <          enddo
1202 <       endif
1200 >                endif
1201 >             enddo
1202 >          endif
1203 >       enddo
1204      endif
1205 <
1147 <
1205 >    
1206   #ifdef IS_MPI
1207 <
1207 >    
1208      if (do_pot) then
1209 <       pot(1:LR_POT_TYPES) = pot(1:LR_POT_TYPES) &
1210 <            + pot_local(1:LR_POT_TYPES)
1153 <       !! we assume the c code will do the allreduce to get the total potential
1154 <       !! we could do it right here if we needed to...
1209 >       call mpi_allreduce(pot_local, pot, LR_POT_TYPES,mpi_double_precision,mpi_sum, &
1210 >            mpi_comm_world,mpi_err)            
1211      endif
1212 <
1212 >    
1213      if (do_stress) then
1214         call mpi_allreduce(tau_Temp, tau, 9,mpi_double_precision,mpi_sum, &
1215              mpi_comm_world,mpi_err)
1216         call mpi_allreduce(virial_Temp, virial,1,mpi_double_precision,mpi_sum, &
1217              mpi_comm_world,mpi_err)
1218      endif
1219 <
1219 >    
1220   #else
1221 <
1221 >    
1222      if (do_stress) then
1223         tau = tau_Temp
1224         virial = virial_Temp
1225      endif
1226 <
1226 >    
1227   #endif
1228 <
1228 >    
1229    end subroutine do_force_loop
1230  
1231    subroutine do_pair(i, j, rijsq, d, sw, do_pot, &
1232 <       eFrame, A, f, t, pot, vpair, fpair)
1232 >       eFrame, A, f, t, pot, vpair, fpair, d_grp, r_grp, rCut)
1233  
1234      real( kind = dp ) :: vpair, sw
1235      real( kind = dp ), dimension(LR_POT_TYPES) :: pot
# Line 1187 | Line 1243 | contains
1243      logical, intent(inout) :: do_pot
1244      integer, intent(in) :: i, j
1245      real ( kind = dp ), intent(inout) :: rijsq
1246 <    real ( kind = dp )                :: r
1246 >    real ( kind = dp ), intent(inout) :: r_grp
1247      real ( kind = dp ), intent(inout) :: d(3)
1248 +    real ( kind = dp ), intent(inout) :: d_grp(3)
1249 +    real ( kind = dp ), intent(inout) :: rCut
1250 +    real ( kind = dp ) :: r
1251      integer :: me_i, me_j
1252  
1253      integer :: iHash
# Line 1206 | Line 1265 | contains
1265   #endif
1266  
1267      iHash = InteractionHash(me_i, me_j)
1268 <
1268 >    
1269      if ( iand(iHash, LJ_PAIR).ne.0 ) then
1270 <       call do_lj_pair(i, j, d, r, rijsq, sw, vpair, fpair, &
1270 >       call do_lj_pair(i, j, d, r, rijsq, rcut, sw, vpair, fpair, &
1271              pot(VDW_POT), f, do_pot)
1272      endif
1273 <
1273 >    
1274      if ( iand(iHash, ELECTROSTATIC_PAIR).ne.0 ) then
1275 <       call doElectrostaticPair(i, j, d, r, rijsq, sw, vpair, fpair, &
1275 >       call doElectrostaticPair(i, j, d, r, rijsq, rcut, sw, vpair, fpair, &
1276              pot(ELECTROSTATIC_POT), eFrame, f, t, do_pot)
1218
1219       if (electrostaticSummationMethod == REACTION_FIELD) then
1220
1221          ! CHECK ME (RF needs to know about all electrostatic types)
1222          call accumulate_rf(i, j, r, eFrame, sw)
1223          call rf_correct_forces(i, j, d, r, eFrame, sw, f, fpair)
1224       endif
1225
1277      endif
1278 <
1278 >    
1279      if ( iand(iHash, STICKY_PAIR).ne.0 ) then
1280         call do_sticky_pair(i, j, d, r, rijsq, sw, vpair, fpair, &
1281              pot(HB_POT), A, f, t, do_pot)
1282      endif
1283 <
1283 >    
1284      if ( iand(iHash, STICKYPOWER_PAIR).ne.0 ) then
1285         call do_sticky_power_pair(i, j, d, r, rijsq, sw, vpair, fpair, &
1286              pot(HB_POT), A, f, t, do_pot)
1287      endif
1288 <
1288 >    
1289      if ( iand(iHash, GAYBERNE_PAIR).ne.0 ) then
1290         call do_gb_pair(i, j, d, r, rijsq, sw, vpair, fpair, &
1291              pot(VDW_POT), A, f, t, do_pot)
1292      endif
1293      
1294      if ( iand(iHash, GAYBERNE_LJ).ne.0 ) then
1295 <       call do_gb_lj_pair(i, j, d, r, rijsq, sw, vpair, fpair, &
1295 >       call do_gb_lj_pair(i, j, d, r, rijsq, rcut, sw, vpair, fpair, &
1296              pot(VDW_POT), A, f, t, do_pot)
1297      endif
1298 <
1298 >    
1299      if ( iand(iHash, EAM_PAIR).ne.0 ) then      
1300         call do_eam_pair(i, j, d, r, rijsq, sw, vpair, fpair, &
1301              pot(METALLIC_POT), f, do_pot)
1302      endif
1303 <
1303 >    
1304      if ( iand(iHash, SHAPE_PAIR).ne.0 ) then      
1305         call do_shape_pair(i, j, d, r, rijsq, sw, vpair, fpair, &
1306              pot(VDW_POT), A, f, t, do_pot)
1307      endif
1308 <
1308 >    
1309      if ( iand(iHash, SHAPE_LJ).ne.0 ) then      
1310         call do_shape_pair(i, j, d, r, rijsq, sw, vpair, fpair, &
1311              pot(VDW_POT), A, f, t, do_pot)
1312 +    endif
1313 +
1314 +    if ( iand(iHash, SC_PAIR).ne.0 ) then      
1315 +       call do_SC_pair(i, j, d, r, rijsq, rcut, sw, vpair, fpair, &
1316 +            pot(METALLIC_POT), f, do_pot)
1317      endif
1318 +
1319      
1320 +    
1321    end subroutine do_pair
1322  
1323 <  subroutine do_prepair(i, j, rijsq, d, sw, rcijsq, dc, &
1323 >  subroutine do_prepair(i, j, rijsq, d, sw, rcijsq, dc, rCut, &
1324         do_pot, do_stress, eFrame, A, f, t, pot)
1325  
1326      real( kind = dp ) :: sw
# Line 1274 | Line 1332 | contains
1332  
1333      logical, intent(inout) :: do_pot, do_stress
1334      integer, intent(in) :: i, j
1335 <    real ( kind = dp ), intent(inout)    :: rijsq, rcijsq
1335 >    real ( kind = dp ), intent(inout)    :: rijsq, rcijsq, rCut
1336      real ( kind = dp )                :: r, rc
1337      real ( kind = dp ), intent(inout) :: d(3), dc(3)
1338  
# Line 1293 | Line 1351 | contains
1351      iHash = InteractionHash(me_i, me_j)
1352  
1353      if ( iand(iHash, EAM_PAIR).ne.0 ) then      
1354 <            call calc_EAM_prepair_rho(i, j, d, r, rijsq )
1354 >            call calc_EAM_prepair_rho(i, j, d, r, rijsq)
1355      endif
1356 +
1357 +    if ( iand(iHash, SC_PAIR).ne.0 ) then      
1358 +            call calc_SC_prepair_rho(i, j, d, r, rijsq, rcut )
1359 +    endif
1360      
1361    end subroutine do_prepair
1362  
# Line 1305 | Line 1367 | contains
1367  
1368      if (FF_uses_EAM .and. SIM_uses_EAM) then
1369         call calc_EAM_preforce_Frho(nlocal,pot(METALLIC_POT))
1370 +    endif
1371 +    if (FF_uses_SC .and. SIM_uses_SC) then
1372 +       call calc_SC_preforce_Frho(nlocal,pot(METALLIC_POT))
1373      endif
1374  
1375  
# Line 1390 | Line 1455 | contains
1455      pot_Col = 0.0_dp
1456      pot_Temp = 0.0_dp
1457  
1393    rf_Row = 0.0_dp
1394    rf_Col = 0.0_dp
1395    rf_Temp = 0.0_dp
1396
1458   #endif
1459  
1460      if (FF_uses_EAM .and. SIM_uses_EAM) then
1461         call clean_EAM()
1462      endif
1463  
1403    rf = 0.0_dp
1464      tau_Temp = 0.0_dp
1465      virial_Temp = 0.0_dp
1466    end subroutine zero_work_arrays
# Line 1494 | Line 1554 | contains
1554  
1555    function FF_RequiresPrepairCalc() result(doesit)
1556      logical :: doesit
1557 <    doesit = FF_uses_EAM
1557 >    doesit = FF_uses_EAM .or. FF_uses_SC &
1558 >         .or. FF_uses_MEAM
1559    end function FF_RequiresPrepairCalc
1560  
1500  function FF_RequiresPostpairCalc() result(doesit)
1501    logical :: doesit
1502    if (electrostaticSummationMethod == REACTION_FIELD) doesit = .true.
1503  end function FF_RequiresPostpairCalc
1504
1561   #ifdef PROFILE
1562    function getforcetime() result(totalforcetime)
1563      real(kind=dp) :: totalforcetime

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