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root/group/trunk/OOPSE-4/src/applications/staticProps/StaticPropsCmd.c
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE-4/src/applications/staticProps/StaticPropsCmd.c (file contents):
Revision 2204 by gezelter, Fri Apr 15 22:04:00 2005 UTC vs.
Revision 2539 by tim, Mon Jan 9 22:14:32 2006 UTC

# Line 1 | Line 1
1   /*
2    File autogenerated by gengetopt version 2.11
3    generated with the following command:
4 <  /home/maul/gezelter/tim/bin/gengetopt -F StaticPropsCmd
4 >  /home/maul/gezelter/tim/program/gengetopt-2.11/src/gengetopt -F StaticPropsCmd
5  
6    The developers of gengetopt consider the fixed text that goes in all
7    gengetopt output files to be in the public domain:
# Line 33 | Line 33 | cmdline_parser_print_help (void)
33   {
34    cmdline_parser_print_version ();
35    printf("\n"
36 <         "Usage: %s [OPTIONS]...\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
36 >  "Usage: %s [OPTIONS]...\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
37    printf("\n");
38    printf("  -h, --help                      Print help and exit\n");
39    printf("  -V, --version                   Print version and exit\n");
# Line 43 | Line 43 | cmdline_parser_print_help (void)
43    printf("  -r, --nrbins=INT                number of bins for distance  (default=`100')\n");
44    printf("  -a, --nanglebins=INT            number of bins for cos(angle)  (default=\n                                    `50')\n");
45    printf("  -l, --length=DOUBLE             maximum length (Defaults to 1/2 smallest \n                                    length of first frame)\n");
46 <  printf("      --sele1=selection script    select first stuntdouble set\n");
47 <  printf("      --sele2=selection script    select second stuntdouble set\n");
46 >  printf("      --sele1=selection script    select the first stuntdouble set\n");
47 >  printf("      --sele2=selection script    select the second stuntdouble set\n");
48 >  printf("      --sele3=selection script    select the third stuntdouble set\n");
49    printf("      --refsele=selection script  select reference (use and only use with \n                                    --gxyz)\n");
50 +  printf("      --molname=STRING            molecule name\n");
51 +  printf("      --begin=INT                 begin interanl index\n");
52 +  printf("      --end=INT                   end internal index\n");
53    printf("\n");
54    printf(" Group: staticProps  an option of this group is required\n");
55    printf("      --gofr                      g(r)\n");
# Line 53 | Line 57 | cmdline_parser_print_help (void)
57    printf("      --r_omega                   g(r, cos(omega))\n");
58    printf("      --theta_omega               g(cos(theta), cos(omega))\n");
59    printf("      --gxyz                      g(x, y, z)\n");
60 +  printf("      --p2                        p2 order parameter (--sele1 and --sele2 must \n                                    be specified)\n");
61 +  printf("      --scd                       scd order parameter(either --sele1, --sele2, \n                                    --sele3 are specified or --molname, \n                                    --begin, --end are specified)\n");
62 +  printf("      --density                   density plot (--sele1 must be specified)\n");
63 +  printf("      --slab_density              slab density (--sele1 must be specified)\n");
64   }
65  
66  
# Line 88 | Line 96 | cmdline_parser (int argc, char * const *argv, struct g
96    args_info->length_given = 0 ;
97    args_info->sele1_given = 0 ;
98    args_info->sele2_given = 0 ;
99 +  args_info->sele3_given = 0 ;
100    args_info->refsele_given = 0 ;
101 +  args_info->molname_given = 0 ;
102 +  args_info->begin_given = 0 ;
103 +  args_info->end_given = 0 ;
104    args_info->gofr_given = 0 ;
105    args_info->r_theta_given = 0 ;
106    args_info->r_omega_given = 0 ;
107    args_info->theta_omega_given = 0 ;
108    args_info->gxyz_given = 0 ;
109 < #define clear_args() {                          \
110 <    args_info->input_arg = NULL;                \
111 <    args_info->output_arg = NULL;               \
112 <    args_info->step_arg = 1 ;                   \
113 <    args_info->nrbins_arg = 100 ;               \
114 <    args_info->nanglebins_arg = 50 ;            \
115 <    args_info->sele1_arg = NULL;                \
116 <    args_info->sele2_arg = NULL;                \
117 <    args_info->refsele_arg = NULL;              \
118 <  }
109 >  args_info->p2_given = 0 ;
110 >  args_info->scd_given = 0 ;
111 >  args_info->density_given = 0 ;
112 >  args_info->slab_density_given = 0 ;
113 > #define clear_args() { \
114 >  args_info->input_arg = NULL; \
115 >  args_info->output_arg = NULL; \
116 >  args_info->step_arg = 1 ;\
117 >  args_info->nrbins_arg = 100 ;\
118 >  args_info->nanglebins_arg = 50 ;\
119 >  args_info->sele1_arg = NULL; \
120 >  args_info->sele2_arg = NULL; \
121 >  args_info->sele3_arg = NULL; \
122 >  args_info->refsele_arg = NULL; \
123 >  args_info->molname_arg = NULL; \
124 > }
125  
126    clear_args();
127  
# Line 128 | Line 146 | cmdline_parser (int argc, char * const *argv, struct g
146          { "length",     1, NULL, 'l' },
147          { "sele1",      1, NULL, 0 },
148          { "sele2",      1, NULL, 0 },
149 +        { "sele3",      1, NULL, 0 },
150          { "refsele",    1, NULL, 0 },
151 +        { "molname",    1, NULL, 0 },
152 +        { "begin",      1, NULL, 0 },
153 +        { "end",        1, NULL, 0 },
154          { "gofr",       0, NULL, 0 },
155          { "r_theta",    0, NULL, 0 },
156          { "r_omega",    0, NULL, 0 },
157          { "theta_omega",        0, NULL, 0 },
158          { "gxyz",       0, NULL, 0 },
159 +        { "p2", 0, NULL, 0 },
160 +        { "scd",        0, NULL, 0 },
161 +        { "density",    0, NULL, 0 },
162 +        { "slab_density",       0, NULL, 0 },
163          { NULL, 0, NULL, 0 }
164        };
165  
# Line 222 | Line 248 | cmdline_parser (int argc, char * const *argv, struct g
248  
249  
250          case 0: /* Long option with no short option */
251 <          /* select first stuntdouble set.  */
251 >          /* select the first stuntdouble set.  */
252            if (strcmp (long_options[option_index].name, "sele1") == 0)
253 <            {
254 <              if (args_info->sele1_given)
255 <                {
256 <                  fprintf (stderr, "%s: `--sele1' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
257 <                  clear_args ();
258 <                  exit (EXIT_FAILURE);
259 <                }
260 <              args_info->sele1_given = 1;
261 <              args_info->sele1_arg = gengetopt_strdup (optarg);
262 <              break;
263 <            }
253 >          {
254 >            if (args_info->sele1_given)
255 >              {
256 >                fprintf (stderr, "%s: `--sele1' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
257 >                clear_args ();
258 >                exit (EXIT_FAILURE);
259 >              }
260 >            args_info->sele1_given = 1;
261 >            args_info->sele1_arg = gengetopt_strdup (optarg);
262 >            break;
263 >          }
264            
265 <          /* select second stuntdouble set.  */
265 >          /* select the second stuntdouble set.  */
266            else if (strcmp (long_options[option_index].name, "sele2") == 0)
267 <            {
268 <              if (args_info->sele2_given)
269 <                {
270 <                  fprintf (stderr, "%s: `--sele2' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
271 <                  clear_args ();
272 <                  exit (EXIT_FAILURE);
273 <                }
274 <              args_info->sele2_given = 1;
275 <              args_info->sele2_arg = gengetopt_strdup (optarg);
276 <              break;
277 <            }
267 >          {
268 >            if (args_info->sele2_given)
269 >              {
270 >                fprintf (stderr, "%s: `--sele2' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
271 >                clear_args ();
272 >                exit (EXIT_FAILURE);
273 >              }
274 >            args_info->sele2_given = 1;
275 >            args_info->sele2_arg = gengetopt_strdup (optarg);
276 >            break;
277 >          }
278            
279 +          /* select the third stuntdouble set.  */
280 +          else if (strcmp (long_options[option_index].name, "sele3") == 0)
281 +          {
282 +            if (args_info->sele3_given)
283 +              {
284 +                fprintf (stderr, "%s: `--sele3' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
285 +                clear_args ();
286 +                exit (EXIT_FAILURE);
287 +              }
288 +            args_info->sele3_given = 1;
289 +            args_info->sele3_arg = gengetopt_strdup (optarg);
290 +            break;
291 +          }
292 +          
293            /* select reference (use and only use with --gxyz).  */
294            else if (strcmp (long_options[option_index].name, "refsele") == 0)
295 <            {
296 <              if (args_info->refsele_given)
297 <                {
298 <                  fprintf (stderr, "%s: `--refsele' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
299 <                  clear_args ();
300 <                  exit (EXIT_FAILURE);
301 <                }
302 <              args_info->refsele_given = 1;
303 <              args_info->refsele_arg = gengetopt_strdup (optarg);
304 <              break;
305 <            }
295 >          {
296 >            if (args_info->refsele_given)
297 >              {
298 >                fprintf (stderr, "%s: `--refsele' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
299 >                clear_args ();
300 >                exit (EXIT_FAILURE);
301 >              }
302 >            args_info->refsele_given = 1;
303 >            args_info->refsele_arg = gengetopt_strdup (optarg);
304 >            break;
305 >          }
306 >          
307 >          /* molecule name.  */
308 >          else if (strcmp (long_options[option_index].name, "molname") == 0)
309 >          {
310 >            if (args_info->molname_given)
311 >              {
312 >                fprintf (stderr, "%s: `--molname' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
313 >                clear_args ();
314 >                exit (EXIT_FAILURE);
315 >              }
316 >            args_info->molname_given = 1;
317 >            args_info->molname_arg = gengetopt_strdup (optarg);
318 >            break;
319 >          }
320 >          
321 >          /* begin interanl index.  */
322 >          else if (strcmp (long_options[option_index].name, "begin") == 0)
323 >          {
324 >            if (args_info->begin_given)
325 >              {
326 >                fprintf (stderr, "%s: `--begin' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
327 >                clear_args ();
328 >                exit (EXIT_FAILURE);
329 >              }
330 >            args_info->begin_given = 1;
331 >            args_info->begin_arg = strtol (optarg,&stop_char,0);
332 >            break;
333 >          }
334 >          
335 >          /* end internal index.  */
336 >          else if (strcmp (long_options[option_index].name, "end") == 0)
337 >          {
338 >            if (args_info->end_given)
339 >              {
340 >                fprintf (stderr, "%s: `--end' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
341 >                clear_args ();
342 >                exit (EXIT_FAILURE);
343 >              }
344 >            args_info->end_given = 1;
345 >            args_info->end_arg = strtol (optarg,&stop_char,0);
346 >            break;
347 >          }
348            
349            /* g(r).  */
350            else if (strcmp (long_options[option_index].name, "gofr") == 0)
351 <            {
352 <              if (args_info->gofr_given)
353 <                {
354 <                  fprintf (stderr, "%s: `--gofr' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
355 <                  clear_args ();
356 <                  exit (EXIT_FAILURE);
357 <                }
358 <              args_info->gofr_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
351 >          {
352 >            if (args_info->gofr_given)
353 >              {
354 >                fprintf (stderr, "%s: `--gofr' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
355 >                clear_args ();
356 >                exit (EXIT_FAILURE);
357 >              }
358 >            args_info->gofr_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
359            
360 <              break;
361 <            }
360 >            break;
361 >          }
362            
363            /* g(r, cos(theta)).  */
364            else if (strcmp (long_options[option_index].name, "r_theta") == 0)
365 <            {
366 <              if (args_info->r_theta_given)
367 <                {
368 <                  fprintf (stderr, "%s: `--r_theta' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
369 <                  clear_args ();
370 <                  exit (EXIT_FAILURE);
371 <                }
372 <              args_info->r_theta_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
365 >          {
366 >            if (args_info->r_theta_given)
367 >              {
368 >                fprintf (stderr, "%s: `--r_theta' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
369 >                clear_args ();
370 >                exit (EXIT_FAILURE);
371 >              }
372 >            args_info->r_theta_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
373            
374 <              break;
375 <            }
374 >            break;
375 >          }
376            
377            /* g(r, cos(omega)).  */
378            else if (strcmp (long_options[option_index].name, "r_omega") == 0)
379 <            {
380 <              if (args_info->r_omega_given)
381 <                {
382 <                  fprintf (stderr, "%s: `--r_omega' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
383 <                  clear_args ();
384 <                  exit (EXIT_FAILURE);
385 <                }
386 <              args_info->r_omega_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
379 >          {
380 >            if (args_info->r_omega_given)
381 >              {
382 >                fprintf (stderr, "%s: `--r_omega' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
383 >                clear_args ();
384 >                exit (EXIT_FAILURE);
385 >              }
386 >            args_info->r_omega_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
387            
388 <              break;
389 <            }
388 >            break;
389 >          }
390            
391            /* g(cos(theta), cos(omega)).  */
392            else if (strcmp (long_options[option_index].name, "theta_omega") == 0)
393 <            {
394 <              if (args_info->theta_omega_given)
395 <                {
396 <                  fprintf (stderr, "%s: `--theta_omega' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
397 <                  clear_args ();
398 <                  exit (EXIT_FAILURE);
399 <                }
400 <              args_info->theta_omega_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
393 >          {
394 >            if (args_info->theta_omega_given)
395 >              {
396 >                fprintf (stderr, "%s: `--theta_omega' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
397 >                clear_args ();
398 >                exit (EXIT_FAILURE);
399 >              }
400 >            args_info->theta_omega_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
401            
402 <              break;
403 <            }
402 >            break;
403 >          }
404            
405            /* g(x, y, z).  */
406            else if (strcmp (long_options[option_index].name, "gxyz") == 0)
407 <            {
408 <              if (args_info->gxyz_given)
409 <                {
410 <                  fprintf (stderr, "%s: `--gxyz' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
411 <                  clear_args ();
412 <                  exit (EXIT_FAILURE);
413 <                }
414 <              args_info->gxyz_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
407 >          {
408 >            if (args_info->gxyz_given)
409 >              {
410 >                fprintf (stderr, "%s: `--gxyz' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
411 >                clear_args ();
412 >                exit (EXIT_FAILURE);
413 >              }
414 >            args_info->gxyz_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
415            
416 <              break;
417 <            }
416 >            break;
417 >          }
418            
419 +          /* p2 order parameter (--sele1 and --sele2 must be specified).  */
420 +          else if (strcmp (long_options[option_index].name, "p2") == 0)
421 +          {
422 +            if (args_info->p2_given)
423 +              {
424 +                fprintf (stderr, "%s: `--p2' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
425 +                clear_args ();
426 +                exit (EXIT_FAILURE);
427 +              }
428 +            args_info->p2_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
429 +          
430 +            break;
431 +          }
432 +          
433 +          /* scd order parameter(either --sele1, --sele2, --sele3 are specified or --molname, --begin, --end are specified).  */
434 +          else if (strcmp (long_options[option_index].name, "scd") == 0)
435 +          {
436 +            if (args_info->scd_given)
437 +              {
438 +                fprintf (stderr, "%s: `--scd' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
439 +                clear_args ();
440 +                exit (EXIT_FAILURE);
441 +              }
442 +            args_info->scd_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
443 +          
444 +            break;
445 +          }
446 +          
447 +          /* density plot (--sele1 must be specified).  */
448 +          else if (strcmp (long_options[option_index].name, "density") == 0)
449 +          {
450 +            if (args_info->density_given)
451 +              {
452 +                fprintf (stderr, "%s: `--density' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
453 +                clear_args ();
454 +                exit (EXIT_FAILURE);
455 +              }
456 +            args_info->density_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
457 +          
458 +            break;
459 +          }
460 +          
461 +          /* slab density (--sele1 must be specified).  */
462 +          else if (strcmp (long_options[option_index].name, "slab_density") == 0)
463 +          {
464 +            if (args_info->slab_density_given)
465 +              {
466 +                fprintf (stderr, "%s: `--slab_density' option given more than once\n", CMDLINE_PARSER_PACKAGE);
467 +                clear_args ();
468 +                exit (EXIT_FAILURE);
469 +              }
470 +            args_info->slab_density_given = 1; staticProps_group_counter += 1;
471 +          
472 +            break;
473 +          }
474 +          
475  
476          case '?':       /* Invalid option.  */
477            /* `getopt_long' already printed an error message.  */

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