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root/group/trunk/OOPSE/forceFields/DUFF.frc
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE/forceFields/DUFF.frc (file contents):
Revision 566 by mmeineke, Wed Jun 25 21:11:42 2003 UTC vs.
Revision 963 by chrisfen, Mon Jan 19 18:51:39 2004 UTC

# Line 1 | Line 1
1 < ! This is the forcefield file for the TraPPE force field.
2 < ! the sections are divided into AtomTypes, BondTypes, BendTypes,
1 > ! This is the forcefield file for the Dipolar Unified-atom Force Field (DUFF).
2 > !
3 > ! The sections are divided into AtomTypes, BondTypes, BendTypes,
4   ! and TorsionTypes.
5 + !
6 + ! Many parameters (but not all) are derived from the TRAPPE force field
7 + ! of Siepmann's group.
8  
9   #AtomTypes
10 < !Atom           isDipole        isSSD   mass            LJ epsilon ( kcal/mol)          LJ sigma (Angstroms)    Dipole Moment (Debye)   w0      v0 (kcal/mol)
10 > !Atom           isDipole        isSSD   mass            LJ epsilon ( kcal/mol)          LJ sigma (Angstroms)    Dipole Moment (Debye)   w0      v0 (kcal/mol)   v0p (kcal/mol)  rl (Angstroms)  ru (Angstroms)  rlp (Angstroms) rup (Angstroms)
11  
12   CH4             0               0       16.05           0.279                           3.73
13   CH3             0               0       15.04           0.185                           3.75
14   CH2             0               0       14.03           0.0866                          3.95
15   CH              0               0       13.02           0.0189                          4.68
16 < SSD             1               1       18.03           0.152                           3.051                   2.35    0.07715 3.7284
16 > SSD             1               1       18.015          0.152                           3.035                   2.42    0.07715 3.9     3.9     2.4     3.8     2.75    3.35
17   HEAD            1               0       196             0.185                           5.75                    20.6
18 < TB1             0               0       57.375          0.0866                          4.0
19 < TE1             0               0       65.0            0.185                           4.0
20 < TB2             0               0       57.375          0.0866                          6.0
21 < TE2             0               0       65.0            0.185                           6.0
22 < TB3             0               0       57.375          0.0866                          8.0
23 < TE3             0               0       65.0            0.185                           8.0
18 > TB1             0               0       14.03           0.0866                          4.0
19 > TE1             0               0       15.04           0.185                           4.0
20 > TB2             0               0       21.05           0.25                            6.0
21 > TE2             0               0       22.56           0.5                             6.0
22 > TB3             0               0       28.06           0.5                             8.0
23 > TE3             0               0       30.08           0.75                            8.0
24  
25   #BondTypes
26   !Atom1  Atom2   type            distance        k0 (kcal/mol)
27  
28 < HEAD    CH3     harmonic        2.75            260
29 < HEAD    CH2     harmonic        2.75            260
30 < HEAD    CH      harmonic        2.75            260
31 < HEAD    TB1     harmonic        2.76            260
32 < HEAD    TB2     harmonic        3.20            260
33 < HEAD    TB3     harmonic        3.63            260
34 < CH3     CH3     harmonic        1.526           260
35 < CH3     CH2     harmonic        1.526           260
36 < CH3     CH      harmonic        1.526           260
37 < CH2     CH2     harmonic        1.526           260
38 < CH2     CH      harmonic        1.526           260
39 < CH      CH      harmonic        1.526           260
40 < TB1     TB1     harmonic        1.526           260
41 < TB2     TB2     harmonic        2.34            260
42 < TB3     TB3     harmonic        3.12            260
43 < TB1     TE1     harmonic        1.526           260
44 < TB2     TE2     harmonic        2.34            260
45 < TB3     TE3     harmonic        3.12            260
28 > HEAD    CH3     fixed           2.75            260
29 > HEAD    CH2     fixed           2.75            260
30 > HEAD    CH      fixed           2.75            260
31 > HEAD    TB1     fixed           2.76            260
32 > HEAD    TB2     fixed           3.20            260
33 > HEAD    TB3     fixed           3.63            260
34 > CH3     CH3     fixed           1.526           260
35 > CH3     CH2     fixed           1.526           260
36 > CH3     CH      fixed           1.526           260
37 > CH2     CH2     fixed           1.526           260
38 > CH2     CH      fixed           1.526           260
39 > CH      CH      fixed           1.526           260
40 > TB1     TB1     fixed           1.526           260
41 > TB2     TB2     fixed           2.34            260
42 > TB3     TB3     fixed           3.12            260
43 > TB1     TE1     fixed           1.526           260
44 > TB2     TE2     fixed           2.34            260
45 > TB3     TE3     fixed           3.12            260
46  
47  
48  
49   #BendTypes
50 < !Atom1  Atom2   Atom3   type            k1      k2      k3      theta_0 ( k1 -> kcal/mol/degrees^2; theta_0 ->degrees )
51 < !V_bend = k1 * ( th - th0 )^2 + k2 * ( th - th0 ) + k3
50 > !Atom1  Atom2   Atom3   type            k1      k2      k3      theta_0
51 > !
52 > ! Units require ( k1 -> kcal/mol/degrees^2; theta_0 ->degrees )
53 > ! consistent with the functional form:
54 > !
55 > !      V_bend = k1 * ( th - th0 )^2 + k2 * ( th - th0 ) + k3
56  
57  
58   GHOST   HEAD    CH2     quadratic       0.00176972      0.0     0.0     129.783

Diff Legend

– Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines