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root/group/trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile.in
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile.in (file contents):
Revision 887 by mmeineke, Fri Dec 19 17:25:00 2003 UTC vs.
Revision 1224 by gezelter, Wed Jun 2 18:27:52 2004 UTC

# Line 49 | Line 49 | MODDIRFLAG=@MODDIRFLAG@
49   # MODDIRFLAG
50   MODDIRFLAG=@MODDIRFLAG@
51  
52 – # MPI F90 Module path
53 – MPI_F90_MODS=@MPI_F90_MODS@
54 –
52   # Compiler dependent Fortran module
53   FLIBS_EXTRA = @F90LIBS@
54  
# Line 127 | Line 124 | MPI_INCLUDES= -I$(MPI_INC) $(MODDIRFLAG)$(MPI_F90_MODS
124   # include paths starting with "." are all relative to the SUBDIRS!!!
125  
126   INCLUDES= -I.. -I../../libBASS $(SPRNG_INC)
127 < MPI_INCLUDES= -I$(MPI_INC) $(MODDIRFLAG)$(MPI_F90_MODS)
127 > MPI_INCLUDES= -I$(MPI_INC)
128   F90_INCLUDES= -I/usr/local/include
129  
130   CFLAGS=$(CFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARE) $(MPI_INCLUDES) $(FUNCWRAP)
# Line 166 | Line 163 | C_FILES = \
163  
164   C_FILES = \
165          $(DIR)/mpiForceField.c \
166 +        $(DIR)/MatVec3.c \
167          $(DIR)/fInfo.c
168  
169   CXX_FILES = \
170 <        $(DIR)/Atom.cpp \
170 >        $(DIR)/Atom.cpp \
171 >        $(DIR)/AtomVisitor.cpp \
172          $(DIR)/Bend.cpp \
173          $(DIR)/BendExtensions.cpp \
174          $(DIR)/Bond.cpp \
175          $(DIR)/BondExtensions.cpp \
176 +        $(DIR)/CGFamilyMinimizer.cpp \
177 +        $(DIR)/CompositeVisitor.cpp \
178          $(DIR)/DirectionalAtom.cpp \
179 <        $(DIR)/DumpWriter.cpp \
179 >        $(DIR)/DUFF.cpp \
180          $(DIR)/DumpReader.cpp \
181 +        $(DIR)/DumpWriter.cpp \
182 +        $(DIR)/EAM_FF.cpp \
183          $(DIR)/Exclude.cpp \
184 +        $(DIR)/ForceFields.cpp \
185 +        $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
186 +        $(DIR)/GenericData.cpp \
187 +        $(DIR)/GhostBend.cpp \
188          $(DIR)/InitializeFromFile.cpp \
182 –        $(DIR)/LJFF.cpp \
183 –        $(DIR)/EAM_FF.cpp \
184 –        $(DIR)/SimInfo.cpp \
185 –        $(DIR)/SimSetup.cpp \
186 –        $(DIR)/StatWriter.cpp \
189          $(DIR)/Integrator.cpp \
190 <        $(DIR)/Thermo.cpp \
191 <        $(DIR)/GhostBend.cpp \
190 <        $(DIR)/Torsion.cpp \
191 <        $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
192 <        $(DIR)/DUFF.cpp \
193 <        $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
194 <        $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
195 <        $(DIR)/ForceFields.cpp \
196 <        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
190 >        $(DIR)/LJFF.cpp \
191 >        $(DIR)/mdProfile.cpp \
192          $(DIR)/Molecule.cpp \
193 +        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
194 +        $(DIR)/NPT.cpp \
195          $(DIR)/NPTf.cpp \
196          $(DIR)/NPTi.cpp \
197          $(DIR)/NPTxyz.cpp \
198          $(DIR)/NVT.cpp \
199 +        $(DIR)/OOPSEMinimizer.cpp \
200 +        $(DIR)/OtherVisitor.cpp \
201 +        $(DIR)/PRCG.cpp \
202 +        $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
203 +        $(DIR)/Restraints.cpp \
204 +        $(DIR)/RigidBody.cpp \
205 +        $(DIR)/RigidBodyVisitor.cpp \
206 +        $(DIR)/SDMinimizer.cpp \
207 +        $(DIR)/SimInfo.cpp \
208 +        $(DIR)/SimSetup.cpp \
209          $(DIR)/SimState.cpp \
210 +        $(DIR)/SkipList.cpp \
211 +        $(DIR)/StatWriter.cpp \
212 +        $(DIR)/StreamTokenizer.cpp \
213 +        $(DIR)/StuntDouble.cpp \
214 +        $(DIR)/Thermo.cpp \
215 +        $(DIR)/Torsion.cpp \
216 +        $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
217 +        $(DIR)/Utility.cpp \
218 +        $(DIR)/WATER.cpp \
219 +        $(DIR)/ZConsReader.cpp \
220          $(DIR)/ZConstraint.cpp \
221 <        $(DIR)/ZConsWriter.cpp \
222 <        $(DIR)/mdProfile.cpp \
206 <        $(DIR)/GenericData.cpp
221 >        $(DIR)/ZconsVisitor.cpp \
222 >        $(DIR)/ZConsWriter.cpp
223  
224   F90_FILES= \
225 <        $(DIR)/definitions_module.F90 \
226 <        $(DIR)/status_module.F90 \
211 <        $(DIR)/atype_module.F90 \
225 >        $(DIR)/atype_module.F90 \
226 >        $(DIR)/calc_charge_charge.F90 \
227          $(DIR)/calc_dipole_dipole.F90 \
213 –        $(DIR)/calc_reaction_field.F90 \
214 –        $(DIR)/calc_LJ_FF.F90 \
228          $(DIR)/calc_eam.F90 \
229 +        $(DIR)/calc_gb.F90 \
230 +        $(DIR)/calc_LJ_FF.F90 \
231 +        $(DIR)/calc_reaction_field.F90 \
232          $(DIR)/calc_sticky_pair.F90 \
233 +        $(DIR)/definitions_module.F90 \
234          $(DIR)/do_Forces.F90 \
218 –        $(DIR)/vector_class.F90 \
219 –        $(DIR)/simulation_module.F90 \
220 –        $(DIR)/wrappers.F90 \
221 –        $(DIR)/neighborLists.F90 \
222 –        $(DIR)/calc_gb.F90 \
235          $(DIR)/force_globals.F90 \
236          $(DIR)/mpiSimulation_module.F90 \
237 +        $(DIR)/neighborLists.F90 \
238          $(DIR)/notifyCutoffs.F90 \
239 <        $(DIR)/oopseMPI_module.F90
239 >        $(DIR)/oopseMPI_module.F90 \
240 >        $(DIR)/simulation_module.F90 \
241 >        $(DIR)/status_module.F90 \
242 >        $(DIR)/switch_module.F90 \
243 >        $(DIR)/timing.F90 \
244 >        $(DIR)/vector_class.F90 \
245 >        $(DIR)/wrappers.F90
246  
247   DIR:=.
248   C_SRCS   :=     $(C_FILES)
# Line 340 | Line 359 | obj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
359          obj/vector_class$(O) \
360          obj/force_globals$(O) \
361          obj/atype_module$(O) \
362 +        obj/switch_module$(O) \
363          obj/neighborLists$(O)
364  
365   obj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
366          obj/definitions_module$(O) \
367          obj/atype_module$(O) \
368 +        obj/switch_module$(O) \
369          obj/simulation_module$(O) \
370          obj/vector_class$(O) \
371          obj/force_globals$(O)
# Line 354 | Line 375 | obj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90
375          obj/vector_class$(O) \
376          obj/atype_module$(O) \
377          obj/simulation_module$(O) \
378 +        obj/status_module$(O) \
379          obj/force_globals$(O)
380  
381   obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
# Line 361 | Line 383 | obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
383          obj/atype_module$(O) \
384          obj/simulation_module$(O) \
385          obj/force_globals$(O) \
386 +        obj/status_module$(O) \
387          obj/vector_class$(O)
388  
389 + obj/calc_charge_charge$(O): ./calc_charge_charge.F90 \
390 +        obj/definitions_module$(O) \
391 +        obj/atype_module$(O) \
392 +        obj/simulation_module$(O) \
393 +        obj/force_globals$(O) \
394 +        obj/status_module$(O) \
395 +        obj/vector_class$(O)
396 +
397   obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
398          obj/definitions_module$(O) \
399          obj/atype_module$(O) \
400 +        obj/switch_module$(O) \
401          obj/simulation_module$(O) \
402          obj/neighborLists$(O) \
403          obj/calc_LJ_FF$(O) \
# Line 374 | Line 406 | obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
406          obj/calc_reaction_field$(O) \
407          obj/calc_gb$(O) \
408          obj/force_globals$(O) \
409 +        obj/status_module$(O) \
410          obj/vector_class$(O)
411  
412   obj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
# Line 383 | Line 416 | obj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
416          obj/calc_eam$(O) \
417          obj/calc_dipole_dipole$(O) \
418          obj/calc_reaction_field$(O) \
419 +        obj/switch_module$(O) \
420          obj/do_Forces$(O)
421  
422   obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
# Line 394 | Line 428 | obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
428          obj/do_Forces$(O) \
429          obj/notifyCutoffs$(O)
430  
431 + obj/timing$(O): ./timing.F90 \
432 +        obj/do_Forces$(O)
433  
434  
435  
400 –
401 –
436   #MPI dependencies:
437  
438   MPIobj/definitions_module$(O): ./definitions_module.F90
# Line 452 | Line 486 | MPIobj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90
486          MPIobj/force_globals$(O) \
487          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
488          MPIobj/atype_module$(O) \
489 +        MPIobj/switch_module$(O) \
490          MPIobj/neighborLists$(O)
491  
492   MPIobj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
493          MPIobj/definitions_module$(O) \
494          MPIobj/atype_module$(O) \
495 +        MPIobj/switch_module$(O) \
496          MPIobj/simulation_module$(O) \
497          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
498          MPIobj/atype_module$(O) \
# Line 470 | Line 506 | MPIobj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.
506          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
507          MPIobj/vector_class$(O) \
508          MPIobj/atype_module$(O) \
509 +        MPIobj/status_module$(O) \
510          MPIobj/force_globals$(O)
511  
512   MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
# Line 478 | Line 515 | MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F9
515          MPIobj/simulation_module$(O) \
516          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
517          MPIobj/force_globals$(O) \
518 +        MPIobj/status_module$(O) \
519          MPIobj/vector_class$(O)
520  
521 + MPIobj/calc_charge_charge$(O): ./calc_charge_charge.F90 \
522 +        MPIobj/definitions_module$(O) \
523 +        MPIobj/atype_module$(O) \
524 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
525 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
526 +        MPIobj/force_globals$(O) \
527 +        MPIobj/status_module$(O) \
528 +        MPIobj/vector_class$(O)
529 +
530   MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
531          MPIobj/definitions_module$(O) \
532          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
533          MPIobj/atype_module$(O) \
534 +        MPIobj/switch_module$(O) \
535          MPIobj/simulation_module$(O) \
536          MPIobj/neighborLists$(O) \
537          MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
# Line 492 | Line 540 | MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
540          MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
541          MPIobj/calc_gb$(O) \
542          MPIobj/force_globals$(O) \
543 +        MPIobj/status_module$(O) \
544          MPIobj/vector_class$(O)
545  
546   MPIobj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
# Line 501 | Line 550 | MPIobj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
550          MPIobj/calc_eam$(O) \
551          MPIobj/calc_dipole_dipole$(O) \
552          MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
553 +        MPIobj/switch_module$(O) \
554          MPIobj/do_Forces$(O)
555  
556   MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
# Line 513 | Line 563 | MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
563          MPIobj/do_Forces$(O) \
564          MPIobj/notifyCutoffs$(O)  
565  
566 + MPIobj/timing$(O): ./timing.F90 \
567 +        MPIobj/do_Forces$(O) \
568 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O)

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