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root/group/trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile.in
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile.in (file contents):
Revision 1032 by tim, Fri Feb 6 19:05:07 2004 UTC vs.
Revision 1234 by tim, Fri Jun 4 03:15:31 2004 UTC

# Line 36 | Line 36 | SPRNG_INC=@SPRNG_INC@
36  
37   # SPRNG include path
38   SPRNG_INC=@SPRNG_INC@
39 +
40 + # Compile MPI code?
41 + USE_MPI=@USE_MPI@
42 +  
43 + # MPI include path
44 + MPI_INC_DIR=@MPI_INC_DIR@
45  
46 < # MPICH library path
47 < MPI_LIBDIR=@MPI_LIBDIR@
46 > # MPI include path
47 > MPI_F90_INC=@MPI_F90_INC@
48  
43 – # MPICH library
44 – MPI_LIB=@MPI_LIB@
45 –
46 – # MPICH include path
47 – MPI_INC=@MPI_INC@
48 –
49 – # MODDIRFLAG
50 – MODDIRFLAG=@MODDIRFLAG@
51 –
49   # Compiler dependent Fortran module
50   FLIBS_EXTRA = @F90LIBS@
51  
# Line 124 | Line 121 | MPI_INCLUDES= -I$(MPI_INC)
121   # include paths starting with "." are all relative to the SUBDIRS!!!
122  
123   INCLUDES= -I.. -I../../libBASS $(SPRNG_INC)
124 < MPI_INCLUDES= -I$(MPI_INC)
125 < F90_INCLUDES= -I/usr/local/include
124 > MPI_INCLUDES= -I$(MPI_INC_DIR)
125 > MPI_F90_INCLUDES= -I$(MPI_F90_INC)
126  
127 < CFLAGS=$(CFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARE) $(MPI_INCLUDES) $(FUNCWRAP)
128 < CXXFLAGS=$(CXXFLAGS_C) $(OOPSE_TEMPLATE_FLAGS) $(EXTRA_CC_FLAG) $(INCLUDES) $(DECLARE) $(FUNCWRAP)
127 > CFLAGS=$(CFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARE)
128 > CXXFLAGS=$(CXXFLAGS_C) $(OOPSE_TEMPLATE_FLAGS) $(EXTRA_CC_FLAG) $(INCLUDES) $(DECLARE)
129   FFLAGS=$(PREPFLAG) $(FFLAGS_C)
130 < F90FLAGS=$(PREPFLAG) $(F90FLAGS_C) $(F90_INCLUDES)
130 > F90FLAGS=$(PREPFLAG) $(F90FLAGS_C) -I../../libBASS
131   DEPFLAGS=$(CFLAGS_C) -I. -I../libBASS $(SPRNG_INC) $(MPI_INCLUDES)
132  
133   MPI_CFLAGS=$(CFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARE)
134   MPI_CXXFLAGS=$(CXXFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARE)
135 < MPI_F90FLAGS=$(F90FLAGS) $(PREPDEFFLAG)$(MPI_DECLARE) $(MPI_INCLUDES)
135 > MPI_F90FLAGS=$(F90FLAGS) $(MPI_F90_INCLUDES) $(PREPDEFFLAG)$(MPI_DECLARE)
136  
137   SRC_DIR := ..
138  
# Line 163 | Line 160 | C_FILES = \
160  
161   C_FILES = \
162          $(DIR)/mpiForceField.c \
163 +        $(DIR)/MatVec3.c \
164          $(DIR)/fInfo.c
165  
166   CXX_FILES = \
167 <        $(DIR)/Atom.cpp \
167 >        $(DIR)/Atom.cpp \
168 >        $(DIR)/AtomVisitor.cpp \
169          $(DIR)/Bend.cpp \
170          $(DIR)/BendExtensions.cpp \
171          $(DIR)/Bond.cpp \
172          $(DIR)/BondExtensions.cpp \
173 +        $(DIR)/CGFamilyMinimizer.cpp \
174 +        $(DIR)/CompositeVisitor.cpp \
175          $(DIR)/DirectionalAtom.cpp \
176 <        $(DIR)/DumpWriter.cpp \
176 >        $(DIR)/DUFF.cpp \
177          $(DIR)/DumpReader.cpp \
178 +        $(DIR)/DumpWriter.cpp \
179 +        $(DIR)/EAM_FF.cpp \
180          $(DIR)/Exclude.cpp \
181 +        $(DIR)/ForceFields.cpp \
182 +        $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
183 +        $(DIR)/GenericData.cpp \
184 +        $(DIR)/GhostBend.cpp \
185          $(DIR)/InitializeFromFile.cpp \
179 –        $(DIR)/LJFF.cpp \
180 –        $(DIR)/EAM_FF.cpp \
181 –        $(DIR)/WATER.cpp \
182 –        $(DIR)/SimInfo.cpp \
183 –        $(DIR)/SimSetup.cpp \
184 –        $(DIR)/StatWriter.cpp \
186          $(DIR)/Integrator.cpp \
187 <        $(DIR)/Thermo.cpp \
188 <        $(DIR)/GhostBend.cpp \
188 <        $(DIR)/Torsion.cpp \
189 <        $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
190 <        $(DIR)/DUFF.cpp \
191 <        $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
192 <        $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
193 <        $(DIR)/ForceFields.cpp \
187 >        $(DIR)/LJFF.cpp \
188 >        $(DIR)/mdProfile.cpp \
189          $(DIR)/Molecule.cpp \
190 +        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
191 +        $(DIR)/NPT.cpp \
192          $(DIR)/NPTf.cpp \
193          $(DIR)/NPTi.cpp \
194          $(DIR)/NPTxyz.cpp \
195          $(DIR)/NVT.cpp \
196 +        $(DIR)/OOPSEMinimizer.cpp \
197 +        $(DIR)/OtherVisitor.cpp \
198 +        $(DIR)/PRCG.cpp \
199 +        $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
200 +        $(DIR)/Restraints.cpp \
201 +        $(DIR)/RigidBody.cpp \
202 +        $(DIR)/RigidBodyVisitor.cpp \
203 +        $(DIR)/SDMinimizer.cpp \
204 +        $(DIR)/SimInfo.cpp \
205 +        $(DIR)/SimSetup.cpp \
206          $(DIR)/SimState.cpp \
207 <        $(DIR)/ZConstraint.cpp \
208 <        $(DIR)/ZConsWriter.cpp \
209 <        $(DIR)/mdProfile.cpp \
210 <        $(DIR)/GenericData.cpp \
211 <        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
212 <        $(DIR)/NLModel0.cpp \
213 <        $(DIR)/NLModel1.cpp \
207 <        $(DIR)/Constraint.cpp \
208 <        $(DIR)/SimpleBoundCons.cpp \
209 <        $(DIR)/LinearCons.cpp \
210 <        $(DIR)/NonlinearCons.cpp \
211 <        $(DIR)/ConstraintList.cpp \
212 <        $(DIR)/Minimizer1D.cpp \
213 <        $(DIR)/ConjugateMinimizer.cpp \
207 >        $(DIR)/SkipList.cpp \
208 >        $(DIR)/StatWriter.cpp \
209 >        $(DIR)/StreamTokenizer.cpp \
210 >        $(DIR)/StuntDouble.cpp \
211 >        $(DIR)/Thermo.cpp \
212 >        $(DIR)/Torsion.cpp \
213 >        $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
214          $(DIR)/Utility.cpp \
215 <        $(DIR)/OOPSEMinimizerBase.cpp
215 >        $(DIR)/WATER.cpp \
216 >        $(DIR)/ZConsReader.cpp \
217 >        $(DIR)/ZConstraint.cpp \
218 >        $(DIR)/ZconsVisitor.cpp \
219 >        $(DIR)/Restraints.cpp   \
220 >        $(DIR)/ConstraintManager.cpp \
221 >        $(DIR)/ConstraintAlgorithm.cpp \
222 >        $(DIR)/Shake.cpp \
223 >        $(DIR)/Rattle.cpp \
224 >        $(DIR)/ShakeMin.cpp \
225 >        $(DIR)/CallbackFunctor.cpp \
226 >        $(DIR)/ConstraintElement.cpp \
227 >        $(DIR)/ZConsWriter.cpp
228  
229   F90_FILES= \
230 <        $(DIR)/definitions_module.F90 \
219 <        $(DIR)/status_module.F90 \
220 <        $(DIR)/atype_module.F90 \
221 <        $(DIR)/calc_dipole_dipole.F90 \
230 >        $(DIR)/atype_module.F90 \
231          $(DIR)/calc_charge_charge.F90 \
232 <        $(DIR)/calc_reaction_field.F90 \
224 <        $(DIR)/calc_LJ_FF.F90 \
232 >        $(DIR)/calc_dipole_dipole.F90 \
233          $(DIR)/calc_eam.F90 \
234 +        $(DIR)/calc_gb.F90 \
235 +        $(DIR)/calc_LJ_FF.F90 \
236 +        $(DIR)/calc_reaction_field.F90 \
237          $(DIR)/calc_sticky_pair.F90 \
238 +        $(DIR)/definitions_module.F90 \
239          $(DIR)/do_Forces.F90 \
228 –        $(DIR)/vector_class.F90 \
229 –        $(DIR)/simulation_module.F90 \
230 –        $(DIR)/wrappers.F90 \
231 –        $(DIR)/neighborLists.F90 \
232 –        $(DIR)/calc_gb.F90 \
240          $(DIR)/force_globals.F90 \
241          $(DIR)/mpiSimulation_module.F90 \
242 +        $(DIR)/neighborLists.F90 \
243          $(DIR)/notifyCutoffs.F90 \
244 +        $(DIR)/oopseMPI_module.F90 \
245 +        $(DIR)/simulation_module.F90 \
246 +        $(DIR)/status_module.F90 \
247 +        $(DIR)/switch_module.F90 \
248          $(DIR)/timing.F90 \
249 <        $(DIR)/oopseMPI_module.F90
249 >        $(DIR)/vector_class.F90 \
250 >        $(DIR)/wrappers.F90
251  
252   DIR:=.
253   C_SRCS   :=     $(C_FILES)
# Line 260 | Line 273 | all: libmdtools.a libmdtools_MPI.a
273  
274   # Possible make targets:
275  
276 + ifeq ($(USE_MPI),yes)
277   all: libmdtools.a libmdtools_MPI.a
278 + else
279 + all: libmdtools.a
280 + endif
281  
282 +
283   libmdtools.a: $(OBJS)
284          $(RM) $@
285          $(AR) cr $@ $(OBJS)
# Line 351 | Line 369 | obj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
369          obj/vector_class$(O) \
370          obj/force_globals$(O) \
371          obj/atype_module$(O) \
372 +        obj/switch_module$(O) \
373          obj/neighborLists$(O)
374  
375   obj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
376          obj/definitions_module$(O) \
377          obj/atype_module$(O) \
378 +        obj/switch_module$(O) \
379          obj/simulation_module$(O) \
380          obj/vector_class$(O) \
381          obj/force_globals$(O)
# Line 365 | Line 385 | obj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90
385          obj/vector_class$(O) \
386          obj/atype_module$(O) \
387          obj/simulation_module$(O) \
388 +        obj/status_module$(O) \
389          obj/force_globals$(O)
390  
391   obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
# Line 372 | Line 393 | obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
393          obj/atype_module$(O) \
394          obj/simulation_module$(O) \
395          obj/force_globals$(O) \
396 +        obj/status_module$(O) \
397          obj/vector_class$(O)
398  
399   obj/calc_charge_charge$(O): ./calc_charge_charge.F90 \
# Line 379 | Line 401 | obj/calc_charge_charge$(O): ./calc_charge_charge.F90 \
401          obj/atype_module$(O) \
402          obj/simulation_module$(O) \
403          obj/force_globals$(O) \
404 +        obj/status_module$(O) \
405          obj/vector_class$(O)
406  
407   obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
408          obj/definitions_module$(O) \
409          obj/atype_module$(O) \
410 +        obj/switch_module$(O) \
411          obj/simulation_module$(O) \
412          obj/neighborLists$(O) \
413          obj/calc_LJ_FF$(O) \
# Line 392 | Line 416 | obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
416          obj/calc_reaction_field$(O) \
417          obj/calc_gb$(O) \
418          obj/force_globals$(O) \
419 +        obj/status_module$(O) \
420          obj/vector_class$(O)
421  
422   obj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
# Line 401 | Line 426 | obj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
426          obj/calc_eam$(O) \
427          obj/calc_dipole_dipole$(O) \
428          obj/calc_reaction_field$(O) \
429 +        obj/switch_module$(O) \
430          obj/do_Forces$(O)
431  
432   obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
# Line 470 | Line 496 | MPIobj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90
496          MPIobj/force_globals$(O) \
497          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
498          MPIobj/atype_module$(O) \
499 +        MPIobj/switch_module$(O) \
500          MPIobj/neighborLists$(O)
501  
502   MPIobj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
503          MPIobj/definitions_module$(O) \
504          MPIobj/atype_module$(O) \
505 +        MPIobj/switch_module$(O) \
506          MPIobj/simulation_module$(O) \
507          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
508          MPIobj/atype_module$(O) \
# Line 488 | Line 516 | MPIobj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.
516          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
517          MPIobj/vector_class$(O) \
518          MPIobj/atype_module$(O) \
519 +        MPIobj/status_module$(O) \
520          MPIobj/force_globals$(O)
521  
522   MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
# Line 496 | Line 525 | MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F9
525          MPIobj/simulation_module$(O) \
526          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
527          MPIobj/force_globals$(O) \
528 +        MPIobj/status_module$(O) \
529          MPIobj/vector_class$(O)
530  
531   MPIobj/calc_charge_charge$(O): ./calc_charge_charge.F90 \
# Line 504 | Line 534 | MPIobj/calc_charge_charge$(O): ./calc_charge_charge.F9
534          MPIobj/simulation_module$(O) \
535          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
536          MPIobj/force_globals$(O) \
537 +        MPIobj/status_module$(O) \
538          MPIobj/vector_class$(O)
539  
540   MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
541          MPIobj/definitions_module$(O) \
542          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
543          MPIobj/atype_module$(O) \
544 +        MPIobj/switch_module$(O) \
545          MPIobj/simulation_module$(O) \
546          MPIobj/neighborLists$(O) \
547          MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
# Line 518 | Line 550 | MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
550          MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
551          MPIobj/calc_gb$(O) \
552          MPIobj/force_globals$(O) \
553 +        MPIobj/status_module$(O) \
554          MPIobj/vector_class$(O)
555  
556   MPIobj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
# Line 527 | Line 560 | MPIobj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
560          MPIobj/calc_eam$(O) \
561          MPIobj/calc_dipole_dipole$(O) \
562          MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
563 +        MPIobj/switch_module$(O) \
564          MPIobj/do_Forces$(O)
565  
566   MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \

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