ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/group/trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile.in
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile.in (file contents):
Revision 812 by mmeineke, Wed Oct 22 21:17:32 2003 UTC vs.
Revision 1237 by gezelter, Fri Jun 4 14:35:59 2004 UTC

# Line 36 | Line 36 | SPRNG_INC=@SPRNG_INC@
36  
37   # SPRNG include path
38   SPRNG_INC=@SPRNG_INC@
39 +
40 + # Compile MPI code?
41 + USE_MPI=@USE_MPI@
42 +  
43 + # MPI include path
44 + MPI_INC_DIR=@MPI_INC_DIR@
45  
46 < # MPICH library path
47 < MPI_LIBDIR=@MPI_LIBDIR@
46 > # MPI include path
47 > MPI_F90_INC=@MPI_F90_INC@
48  
43 – # MPICH library
44 – MPI_LIB=@MPI_LIB@
45 –
46 – # MPICH include path
47 – MPI_INC=@MPI_INC@
48 –
49 – # MPI F90 Module path
50 – MPI_F90_MODS=@MPI_F90_MODS@
51 –
49   # Compiler dependent Fortran module
50   FLIBS_EXTRA = @F90LIBS@
51  
# Line 95 | Line 92 | CXXFLAGS_C=@CXXFLAGS@
92   # C++ flags
93   CXXFLAGS_C=@CXXFLAGS@
94  
95 + # C++ template flags
96 + OOPSE_TEMPLATE_FLAGS=@OOPSE_TEMPLATE_FLAGS@
97 +
98 + # C++ namespace flags
99 + EXTRA_CC_FLAG=@EXTRA_CC_FLAG@
100 +
101   # Preprocessor flag for fortran
102   PREPFLAG=@PREPFLAG@
103  
# Line 118 | Line 121 | MPI_INCLUDES= -I$(MPI_INC) $(MPI_F90_MODS)
121   # include paths starting with "." are all relative to the SUBDIRS!!!
122  
123   INCLUDES= -I.. -I../../libBASS $(SPRNG_INC)
124 < MPI_INCLUDES= -I$(MPI_INC) $(MPI_F90_MODS)
124 > MPI_INCLUDES= -I$(MPI_INC_DIR)
125 > MPI_F90_INCLUDES= -I$(MPI_F90_INC)
126  
127 < CFLAGS=$(CFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARE) $(MPI_INCLUDES) $(FUNCWRAP)
128 < CXXFLAGS=$(CXXFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARE) $(FUNCWRAP)
127 > CFLAGS=$(CFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARE)
128 > CXXFLAGS=$(CXXFLAGS_C) $(OOPSE_TEMPLATE_FLAGS) $(EXTRA_CC_FLAG) $(INCLUDES) $(DECLARE)
129   FFLAGS=$(PREPFLAG) $(FFLAGS_C)
130 < F90FLAGS=$(PREPFLAG) $(F90FLAGS_C)
130 > F90FLAGS=$(PREPFLAG) $(F90FLAGS_C) -I../../libBASS
131   DEPFLAGS=$(CFLAGS_C) -I. -I../libBASS $(SPRNG_INC) $(MPI_INCLUDES)
132  
133   MPI_CFLAGS=$(CFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARE)
134   MPI_CXXFLAGS=$(CXXFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARE)
135 < MPI_F90FLAGS=$(F90FLAGS) $(PREPDEFFLAG)$(MPI_DECLARE) $(MPI_INCLUDES)
135 > MPI_F90FLAGS=$(F90FLAGS) $(MPI_F90_INCLUDES) $(PREPDEFFLAG)$(MPI_DECLARE)
136  
137 < SRC_DIR := $(PWD)
137 > SRC_DIR := ..
138  
139   # Then do the compile rules:
140  
# Line 156 | Line 160 | C_FILES = \
160  
161   C_FILES = \
162          $(DIR)/mpiForceField.c \
163 <        $(DIR)/fInfo.c
163 >        $(DIR)/MatVec3.c
164  
165   CXX_FILES = \
166 <        $(DIR)/Atom.cpp \
166 >        $(DIR)/Atom.cpp \
167 >        $(DIR)/AtomVisitor.cpp \
168          $(DIR)/Bend.cpp \
169          $(DIR)/BendExtensions.cpp \
170          $(DIR)/Bond.cpp \
171          $(DIR)/BondExtensions.cpp \
172 +        $(DIR)/CGFamilyMinimizer.cpp \
173 +        $(DIR)/CompositeVisitor.cpp \
174          $(DIR)/DirectionalAtom.cpp \
175 <        $(DIR)/DumpWriter.cpp \
175 >        $(DIR)/DUFF.cpp \
176          $(DIR)/DumpReader.cpp \
177 +        $(DIR)/DumpWriter.cpp \
178 +        $(DIR)/EAM_FF.cpp \
179          $(DIR)/Exclude.cpp \
180 +        $(DIR)/ForceFields.cpp \
181 +        $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
182 +        $(DIR)/GenericData.cpp \
183 +        $(DIR)/GhostBend.cpp \
184          $(DIR)/InitializeFromFile.cpp \
172 –        $(DIR)/LJFF.cpp \
173 –        $(DIR)/EAM_FF.cpp \
174 –        $(DIR)/SimInfo.cpp \
175 –        $(DIR)/SimSetup.cpp \
176 –        $(DIR)/StatWriter.cpp \
185          $(DIR)/Integrator.cpp \
186 <        $(DIR)/Thermo.cpp \
187 <        $(DIR)/GhostBend.cpp \
180 <        $(DIR)/Torsion.cpp \
181 <        $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
182 <        $(DIR)/DUFF.cpp \
183 <        $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
184 <        $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
185 <        $(DIR)/ForceFields.cpp \
186 <        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
186 >        $(DIR)/LJFF.cpp \
187 >        $(DIR)/mdProfile.cpp \
188          $(DIR)/Molecule.cpp \
189 +        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
190 +        $(DIR)/NPT.cpp \
191          $(DIR)/NPTf.cpp \
192          $(DIR)/NPTi.cpp \
193          $(DIR)/NPTxyz.cpp \
194          $(DIR)/NVT.cpp \
195 +        $(DIR)/OOPSEMinimizer.cpp \
196 +        $(DIR)/OtherVisitor.cpp \
197 +        $(DIR)/PRCG.cpp \
198 +        $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
199 +        $(DIR)/Restraints.cpp \
200 +        $(DIR)/RigidBody.cpp \
201 +        $(DIR)/RigidBodyVisitor.cpp \
202 +        $(DIR)/SDMinimizer.cpp \
203 +        $(DIR)/SimInfo.cpp \
204 +        $(DIR)/SimSetup.cpp \
205          $(DIR)/SimState.cpp \
206 +        $(DIR)/SkipList.cpp \
207 +        $(DIR)/StatWriter.cpp \
208 +        $(DIR)/StreamTokenizer.cpp \
209 +        $(DIR)/StuntDouble.cpp \
210 +        $(DIR)/Thermo.cpp \
211 +        $(DIR)/Torsion.cpp \
212 +        $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
213 +        $(DIR)/Utility.cpp \
214 +        $(DIR)/WATER.cpp \
215 +        $(DIR)/ZConsReader.cpp \
216          $(DIR)/ZConstraint.cpp \
217 <        $(DIR)/ZConsWriter.cpp \
218 <        $(DIR)/GenericData.cpp
217 >        $(DIR)/ZconsVisitor.cpp \
218 >        $(DIR)/Restraints.cpp   \
219 >        $(DIR)/ConstraintManager.cpp \
220 >        $(DIR)/ConstraintAlgorithm.cpp \
221 >        $(DIR)/Shake.cpp \
222 >        $(DIR)/Rattle.cpp \
223 >        $(DIR)/ShakeMin.cpp \
224 >        $(DIR)/CallbackFunctor.cpp \
225 >        $(DIR)/ConstraintElement.cpp \
226 >        $(DIR)/ZConsWriter.cpp
227  
228   F90_FILES= \
229 <        $(DIR)/definitions_module.F90 \
230 <        $(DIR)/status_module.F90 \
200 <        $(DIR)/atype_module.F90 \
229 >        $(DIR)/atype_module.F90 \
230 >        $(DIR)/calc_charge_charge.F90 \
231          $(DIR)/calc_dipole_dipole.F90 \
202 –        $(DIR)/calc_reaction_field.F90 \
203 –        $(DIR)/calc_LJ_FF.F90 \
232          $(DIR)/calc_eam.F90 \
233 +        $(DIR)/calc_gb.F90 \
234 +        $(DIR)/calc_LJ_FF.F90 \
235 +        $(DIR)/calc_reaction_field.F90 \
236          $(DIR)/calc_sticky_pair.F90 \
237 +        $(DIR)/definitions_module.F90 \
238          $(DIR)/do_Forces.F90 \
207 –        $(DIR)/vector_class.F90 \
208 –        $(DIR)/simulation_module.F90 \
209 –        $(DIR)/wrappers.F90 \
210 –        $(DIR)/neighborLists.F90 \
211 –        $(DIR)/calc_gb.F90 \
239          $(DIR)/force_globals.F90 \
240          $(DIR)/mpiSimulation_module.F90 \
241 <        $(DIR)/notifyCutoffs.F90
241 >        $(DIR)/neighborLists.F90 \
242 >        $(DIR)/notifyCutoffs.F90 \
243 >        $(DIR)/oopseMPI_module.F90 \
244 >        $(DIR)/simulation_module.F90 \
245 >        $(DIR)/status_module.F90 \
246 >        $(DIR)/switch_module.F90 \
247 >        $(DIR)/timing.F90 \
248 >        $(DIR)/vector_class.F90 \
249 >        $(DIR)/wrappers.F90
250  
251   DIR:=.
252   C_SRCS   :=     $(C_FILES)
# Line 237 | Line 272 | all: libmdtools.a libmdtools_MPI.a
272  
273   # Possible make targets:
274  
275 + ifeq ($(USE_MPI),yes)
276   all: libmdtools.a libmdtools_MPI.a
277 + else
278 + all: libmdtools.a
279 + endif
280 +
281  
282   libmdtools.a: $(OBJS)
283          $(RM) $@
# Line 328 | Line 368 | obj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
368          obj/vector_class$(O) \
369          obj/force_globals$(O) \
370          obj/atype_module$(O) \
371 +        obj/switch_module$(O) \
372          obj/neighborLists$(O)
373  
374   obj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
375          obj/definitions_module$(O) \
376          obj/atype_module$(O) \
377 +        obj/switch_module$(O) \
378          obj/simulation_module$(O) \
379          obj/vector_class$(O) \
380          obj/force_globals$(O)
# Line 342 | Line 384 | obj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90
384          obj/vector_class$(O) \
385          obj/atype_module$(O) \
386          obj/simulation_module$(O) \
387 +        obj/status_module$(O) \
388          obj/force_globals$(O)
389  
390   obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
# Line 349 | Line 392 | obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
392          obj/atype_module$(O) \
393          obj/simulation_module$(O) \
394          obj/force_globals$(O) \
395 +        obj/status_module$(O) \
396          obj/vector_class$(O)
397  
398 + obj/calc_charge_charge$(O): ./calc_charge_charge.F90 \
399 +        obj/definitions_module$(O) \
400 +        obj/atype_module$(O) \
401 +        obj/simulation_module$(O) \
402 +        obj/force_globals$(O) \
403 +        obj/status_module$(O) \
404 +        obj/vector_class$(O)
405 +
406   obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
407          obj/definitions_module$(O) \
408          obj/atype_module$(O) \
409 +        obj/switch_module$(O) \
410          obj/simulation_module$(O) \
411          obj/neighborLists$(O) \
412          obj/calc_LJ_FF$(O) \
# Line 362 | Line 415 | obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
415          obj/calc_reaction_field$(O) \
416          obj/calc_gb$(O) \
417          obj/force_globals$(O) \
418 +        obj/status_module$(O) \
419          obj/vector_class$(O)
420  
421   obj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
# Line 371 | Line 425 | obj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
425          obj/calc_eam$(O) \
426          obj/calc_dipole_dipole$(O) \
427          obj/calc_reaction_field$(O) \
428 +        obj/switch_module$(O) \
429          obj/do_Forces$(O)
430  
431   obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
# Line 382 | Line 437 | obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
437          obj/do_Forces$(O) \
438          obj/notifyCutoffs$(O)
439  
440 + obj/timing$(O): ./timing.F90 \
441 +        obj/do_Forces$(O)
442  
443  
444  
388 –
389 –
445   #MPI dependencies:
446  
447   MPIobj/definitions_module$(O): ./definitions_module.F90
# Line 395 | Line 450 | MPIobj/mpiSimulation_module$(O): ./mpiSimulation_modul
450  
451   MPIobj/status_module$(O): ./status_module.F90
452  
453 < MPIobj/mpiSimulation_module$(O): ./mpiSimulation_module.F90
453 > MPIobj/oopseMPI_module$(O): ./oopseMPI_module.F90
454  
455 + MPIobj/mpiSimulation_module$(O): ./mpiSimulation_module.F90 \
456 +        MPIobj/oopseMPI_module$(O)
457 +
458   MPIobj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
459          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
460          MPIobj/definitions_module$(O)
# Line 437 | Line 495 | MPIobj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90
495          MPIobj/force_globals$(O) \
496          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
497          MPIobj/atype_module$(O) \
498 +        MPIobj/switch_module$(O) \
499          MPIobj/neighborLists$(O)
500  
501   MPIobj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
502          MPIobj/definitions_module$(O) \
503          MPIobj/atype_module$(O) \
504 +        MPIobj/switch_module$(O) \
505          MPIobj/simulation_module$(O) \
506          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
507          MPIobj/atype_module$(O) \
# Line 455 | Line 515 | MPIobj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.
515          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
516          MPIobj/vector_class$(O) \
517          MPIobj/atype_module$(O) \
518 +        MPIobj/status_module$(O) \
519          MPIobj/force_globals$(O)
520  
521   MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
# Line 463 | Line 524 | MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F9
524          MPIobj/simulation_module$(O) \
525          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
526          MPIobj/force_globals$(O) \
527 +        MPIobj/status_module$(O) \
528          MPIobj/vector_class$(O)
529  
530 + MPIobj/calc_charge_charge$(O): ./calc_charge_charge.F90 \
531 +        MPIobj/definitions_module$(O) \
532 +        MPIobj/atype_module$(O) \
533 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
534 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
535 +        MPIobj/force_globals$(O) \
536 +        MPIobj/status_module$(O) \
537 +        MPIobj/vector_class$(O)
538 +
539   MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
540          MPIobj/definitions_module$(O) \
541          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
542          MPIobj/atype_module$(O) \
543 +        MPIobj/switch_module$(O) \
544          MPIobj/simulation_module$(O) \
545          MPIobj/neighborLists$(O) \
546          MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
# Line 477 | Line 549 | MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
549          MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
550          MPIobj/calc_gb$(O) \
551          MPIobj/force_globals$(O) \
552 +        MPIobj/status_module$(O) \
553          MPIobj/vector_class$(O)
554  
555   MPIobj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
# Line 486 | Line 559 | MPIobj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
559          MPIobj/calc_eam$(O) \
560          MPIobj/calc_dipole_dipole$(O) \
561          MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
562 +        MPIobj/switch_module$(O) \
563          MPIobj/do_Forces$(O)
564  
565   MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
# Line 498 | Line 572 | MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
572          MPIobj/do_Forces$(O) \
573          MPIobj/notifyCutoffs$(O)  
574  
575 + MPIobj/timing$(O): ./timing.F90 \
576 +        MPIobj/do_Forces$(O) \
577 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O)

Diff Legend

– Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines