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root/group/trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile.in
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile.in (file contents):
Revision 884 by mmeineke, Thu Dec 18 21:47:51 2003 UTC vs.
Revision 1254 by tim, Wed Jun 9 16:16:33 2004 UTC

# Line 36 | Line 36 | SPRNG_INC=@SPRNG_INC@
36  
37   # SPRNG include path
38   SPRNG_INC=@SPRNG_INC@
39 +
40 + # Compile MPI code?
41 + USE_MPI=@USE_MPI@
42 +  
43 + # MPI include path
44 + MPI_INC_DIR=@MPI_INC_DIR@
45  
46 < # MPICH library path
47 < MPI_LIBDIR=@MPI_LIBDIR@
46 > # MPI include path
47 > MPI_F90_INC=@MPI_F90_INC@
48  
43 – # MPICH library
44 – MPI_LIB=@MPI_LIB@
45 –
46 – # MPICH include path
47 – MPI_INC=@MPI_INC@
48 –
49 – # MODDIRFLAG
50 – MODDIRFLAG=@MODDIRFLAG@
51 –
52 – # MPI F90 Module path
53 – MPI_F90_MODS=@MPI_F90_MODS@
54 –
49   # Compiler dependent Fortran module
50   FLIBS_EXTRA = @F90LIBS@
51  
# Line 127 | Line 121 | MPI_INCLUDES= -I$(MPI_INC) $(MODDIRFLAG)$(MPI_F90_MODS
121   # include paths starting with "." are all relative to the SUBDIRS!!!
122  
123   INCLUDES= -I.. -I../../libBASS $(SPRNG_INC)
124 < MPI_INCLUDES= -I$(MPI_INC) $(MODDIRFLAG)$(MPI_F90_MODS)
125 < F90_INCLUDES= -I/usr/local/include
124 > MPI_INCLUDES= -I$(MPI_INC_DIR)
125 > MPI_F90_INCLUDES= -I$(MPI_F90_INC)
126  
127 < CFLAGS=$(CFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARE) $(MPI_INCLUDES) $(FUNCWRAP)
128 < CXXFLAGS=$(CXXFLAGS_C) $(OOPSE_TEMPLATE_FLAGS) $(EXTRA_CC_FLAG) $(INCLUDES) $(DECLARE) $(FUNCWRAP)
127 > CFLAGS=$(CFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARE)
128 > CXXFLAGS=$(CXXFLAGS_C) $(OOPSE_TEMPLATE_FLAGS) $(EXTRA_CC_FLAG) $(INCLUDES) $(DECLARE)
129   FFLAGS=$(PREPFLAG) $(FFLAGS_C)
130 < F90FLAGS=$(PREPFLAG) $(F90FLAGS_C) $(F90_INCLUDES)
130 > F90FLAGS=$(PREPFLAG) $(F90FLAGS_C) -I../../libBASS
131   DEPFLAGS=$(CFLAGS_C) -I. -I../libBASS $(SPRNG_INC) $(MPI_INCLUDES)
132  
133   MPI_CFLAGS=$(CFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARE)
134   MPI_CXXFLAGS=$(CXXFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARE)
135 < MPI_F90FLAGS=$(F90FLAGS) $(PREPDEFFLAG)$(MPI_DECLARE) $(MPI_INCLUDES)
135 > MPI_F90FLAGS=$(F90FLAGS) $(MPI_F90_INCLUDES) $(PREPDEFFLAG)$(MPI_DECLARE)
136  
137   SRC_DIR := ..
138  
# Line 166 | Line 160 | C_FILES = \
160  
161   C_FILES = \
162          $(DIR)/mpiForceField.c \
163 <        $(DIR)/fInfo.c
163 >        $(DIR)/MatVec3.c
164  
165   CXX_FILES = \
166 <        $(DIR)/Atom.cpp \
166 >        $(DIR)/Atom.cpp \
167 >        $(DIR)/AtomVisitor.cpp \
168          $(DIR)/Bend.cpp \
169          $(DIR)/BendExtensions.cpp \
170          $(DIR)/Bond.cpp \
171          $(DIR)/BondExtensions.cpp \
172 +        $(DIR)/CGFamilyMinimizer.cpp \
173 +        $(DIR)/CompositeVisitor.cpp \
174          $(DIR)/DirectionalAtom.cpp \
175 <        $(DIR)/DumpWriter.cpp \
175 >        $(DIR)/DUFF.cpp \
176          $(DIR)/DumpReader.cpp \
177 +        $(DIR)/DumpWriter.cpp \
178 +        $(DIR)/EAM_FF.cpp \
179          $(DIR)/Exclude.cpp \
180 +        $(DIR)/ForceFields.cpp \
181 +        $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
182 +        $(DIR)/GenericData.cpp \
183 +        $(DIR)/GhostBend.cpp \
184          $(DIR)/InitializeFromFile.cpp \
182 –        $(DIR)/LJFF.cpp \
183 –        $(DIR)/EAM_FF.cpp \
184 –        $(DIR)/SimInfo.cpp \
185 –        $(DIR)/SimSetup.cpp \
186 –        $(DIR)/StatWriter.cpp \
185          $(DIR)/Integrator.cpp \
186 <        $(DIR)/Thermo.cpp \
187 <        $(DIR)/GhostBend.cpp \
190 <        $(DIR)/Torsion.cpp \
191 <        $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
192 <        $(DIR)/DUFF.cpp \
193 <        $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
194 <        $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
195 <        $(DIR)/ForceFields.cpp \
196 <        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
186 >        $(DIR)/LJFF.cpp \
187 >        $(DIR)/mdProfile.cpp \
188          $(DIR)/Molecule.cpp \
189 +        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
190 +        $(DIR)/NPT.cpp \
191          $(DIR)/NPTf.cpp \
192          $(DIR)/NPTi.cpp \
193          $(DIR)/NPTxyz.cpp \
194          $(DIR)/NVT.cpp \
195 +        $(DIR)/OOPSEMinimizer.cpp \
196 +        $(DIR)/OtherVisitor.cpp \
197 +        $(DIR)/PRCG.cpp \
198 +        $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
199 +        $(DIR)/Restraints.cpp \
200 +        $(DIR)/RigidBody.cpp \
201 +        $(DIR)/RigidBodyVisitor.cpp \
202 +        $(DIR)/SDMinimizer.cpp \
203 +        $(DIR)/SimInfo.cpp \
204 +        $(DIR)/SimSetup.cpp \
205          $(DIR)/SimState.cpp \
206 +        $(DIR)/SkipList.cpp \
207 +        $(DIR)/StatWriter.cpp \
208 +        $(DIR)/StreamTokenizer.cpp \
209 +        $(DIR)/StuntDouble.cpp \
210 +        $(DIR)/Thermo.cpp \
211 +        $(DIR)/Torsion.cpp \
212 +        $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
213 +        $(DIR)/Utility.cpp \
214 +        $(DIR)/WATER.cpp \
215 +        $(DIR)/ZConsReader.cpp \
216          $(DIR)/ZConstraint.cpp \
217 +        $(DIR)/ZconsVisitor.cpp \
218 +        $(DIR)/Restraints.cpp   \
219 +        $(DIR)/ConstraintManager.cpp \
220 +        $(DIR)/ConstraintAlgorithm.cpp \
221 +        $(DIR)/Shake.cpp \
222 +        $(DIR)/Rattle.cpp \
223 +        $(DIR)/ShakeMin.cpp \
224 +        $(DIR)/CallbackFunctor.cpp \
225 +        $(DIR)/ConstraintElement.cpp \
226          $(DIR)/ZConsWriter.cpp \
227 <        $(DIR)/Profile.cpp \
228 <        $(DIR)/GenericData.cpp
227 >        $(DIR)/Vector3d.cpp \
228 >        $(DIR)/Quaternion.cpp \
229 >        $(DIR)/Mat3x3d.cpp \
230 >        $(DIR)/Euler3.cpp \
231 >        $(DIR)/Roll.cpp
232  
233   F90_FILES= \
234 <        $(DIR)/definitions_module.F90 \
235 <        $(DIR)/status_module.F90 \
211 <        $(DIR)/atype_module.F90 \
234 >        $(DIR)/atype_module.F90 \
235 >        $(DIR)/calc_charge_charge.F90 \
236          $(DIR)/calc_dipole_dipole.F90 \
213 –        $(DIR)/calc_reaction_field.F90 \
214 –        $(DIR)/calc_LJ_FF.F90 \
237          $(DIR)/calc_eam.F90 \
238 +        $(DIR)/calc_gb.F90 \
239 +        $(DIR)/calc_LJ_FF.F90 \
240 +        $(DIR)/calc_reaction_field.F90 \
241          $(DIR)/calc_sticky_pair.F90 \
242 +        $(DIR)/definitions_module.F90 \
243          $(DIR)/do_Forces.F90 \
218 –        $(DIR)/vector_class.F90 \
219 –        $(DIR)/simulation_module.F90 \
220 –        $(DIR)/wrappers.F90 \
221 –        $(DIR)/neighborLists.F90 \
222 –        $(DIR)/calc_gb.F90 \
244          $(DIR)/force_globals.F90 \
245          $(DIR)/mpiSimulation_module.F90 \
246 +        $(DIR)/neighborLists.F90 \
247          $(DIR)/notifyCutoffs.F90 \
248 <        $(DIR)/oopseMPI_module.F90
248 >        $(DIR)/oopseMPI_module.F90 \
249 >        $(DIR)/simulation_module.F90 \
250 >        $(DIR)/status_module.F90 \
251 >        $(DIR)/switch_module.F90 \
252 >        $(DIR)/timing.F90 \
253 >        $(DIR)/vector_class.F90 \
254 >        $(DIR)/wrappers.F90
255  
256   DIR:=.
257   C_SRCS   :=     $(C_FILES)
# Line 249 | Line 277 | all: libmdtools.a libmdtools_MPI.a
277  
278   # Possible make targets:
279  
280 + ifeq ($(USE_MPI),yes)
281   all: libmdtools.a libmdtools_MPI.a
282 + else
283 + all: libmdtools.a
284 + endif
285  
286 +
287   libmdtools.a: $(OBJS)
288          $(RM) $@
289          $(AR) cr $@ $(OBJS)
# Line 340 | Line 373 | obj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
373          obj/vector_class$(O) \
374          obj/force_globals$(O) \
375          obj/atype_module$(O) \
376 +        obj/switch_module$(O) \
377          obj/neighborLists$(O)
378  
379   obj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
380          obj/definitions_module$(O) \
381          obj/atype_module$(O) \
382 +        obj/switch_module$(O) \
383          obj/simulation_module$(O) \
384          obj/vector_class$(O) \
385          obj/force_globals$(O)
# Line 354 | Line 389 | obj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90
389          obj/vector_class$(O) \
390          obj/atype_module$(O) \
391          obj/simulation_module$(O) \
392 +        obj/status_module$(O) \
393          obj/force_globals$(O)
394  
395   obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
# Line 361 | Line 397 | obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
397          obj/atype_module$(O) \
398          obj/simulation_module$(O) \
399          obj/force_globals$(O) \
400 +        obj/status_module$(O) \
401          obj/vector_class$(O)
402  
403 + obj/calc_charge_charge$(O): ./calc_charge_charge.F90 \
404 +        obj/definitions_module$(O) \
405 +        obj/atype_module$(O) \
406 +        obj/simulation_module$(O) \
407 +        obj/force_globals$(O) \
408 +        obj/status_module$(O) \
409 +        obj/vector_class$(O)
410 +
411   obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
412          obj/definitions_module$(O) \
413          obj/atype_module$(O) \
414 +        obj/switch_module$(O) \
415          obj/simulation_module$(O) \
416          obj/neighborLists$(O) \
417          obj/calc_LJ_FF$(O) \
# Line 374 | Line 420 | obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
420          obj/calc_reaction_field$(O) \
421          obj/calc_gb$(O) \
422          obj/force_globals$(O) \
423 +        obj/status_module$(O) \
424          obj/vector_class$(O)
425  
426   obj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
# Line 383 | Line 430 | obj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
430          obj/calc_eam$(O) \
431          obj/calc_dipole_dipole$(O) \
432          obj/calc_reaction_field$(O) \
433 +        obj/switch_module$(O) \
434          obj/do_Forces$(O)
435  
436   obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
# Line 393 | Line 441 | obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
441          obj/calc_gb$(O) \
442          obj/do_Forces$(O) \
443          obj/notifyCutoffs$(O)
396 –
397 –
444  
445 + obj/timing$(O): ./timing.F90 \
446 +        obj/do_Forces$(O)
447  
448  
449  
# Line 452 | Line 500 | MPIobj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90
500          MPIobj/force_globals$(O) \
501          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
502          MPIobj/atype_module$(O) \
503 +        MPIobj/switch_module$(O) \
504          MPIobj/neighborLists$(O)
505  
506   MPIobj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
507          MPIobj/definitions_module$(O) \
508          MPIobj/atype_module$(O) \
509 +        MPIobj/switch_module$(O) \
510          MPIobj/simulation_module$(O) \
511          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
512          MPIobj/atype_module$(O) \
# Line 470 | Line 520 | MPIobj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.
520          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
521          MPIobj/vector_class$(O) \
522          MPIobj/atype_module$(O) \
523 +        MPIobj/status_module$(O) \
524          MPIobj/force_globals$(O)
525  
526   MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
# Line 478 | Line 529 | MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F9
529          MPIobj/simulation_module$(O) \
530          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
531          MPIobj/force_globals$(O) \
532 +        MPIobj/status_module$(O) \
533          MPIobj/vector_class$(O)
534  
535 + MPIobj/calc_charge_charge$(O): ./calc_charge_charge.F90 \
536 +        MPIobj/definitions_module$(O) \
537 +        MPIobj/atype_module$(O) \
538 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
539 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
540 +        MPIobj/force_globals$(O) \
541 +        MPIobj/status_module$(O) \
542 +        MPIobj/vector_class$(O)
543 +
544   MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
545          MPIobj/definitions_module$(O) \
546          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
547          MPIobj/atype_module$(O) \
548 +        MPIobj/switch_module$(O) \
549          MPIobj/simulation_module$(O) \
550          MPIobj/neighborLists$(O) \
551          MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
# Line 492 | Line 554 | MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
554          MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
555          MPIobj/calc_gb$(O) \
556          MPIobj/force_globals$(O) \
557 +        MPIobj/status_module$(O) \
558          MPIobj/vector_class$(O)
559  
560   MPIobj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
# Line 501 | Line 564 | MPIobj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
564          MPIobj/calc_eam$(O) \
565          MPIobj/calc_dipole_dipole$(O) \
566          MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
567 +        MPIobj/switch_module$(O) \
568          MPIobj/do_Forces$(O)
569  
570   MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
# Line 513 | Line 577 | MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
577          MPIobj/do_Forces$(O) \
578          MPIobj/notifyCutoffs$(O)  
579  
580 + MPIobj/timing$(O): ./timing.F90 \
581 +        MPIobj/do_Forces$(O) \
582 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O)

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