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root/group/trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile.in
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile.in (file contents):
Revision 1180 by chrisfen, Thu May 20 20:24:07 2004 UTC vs.
Revision 1224 by gezelter, Wed Jun 2 18:27:52 2004 UTC

# Line 167 | Line 167 | CXX_FILES = \
167          $(DIR)/fInfo.c
168  
169   CXX_FILES = \
170 <        $(DIR)/Atom.cpp \
170 >        $(DIR)/Atom.cpp \
171 >        $(DIR)/AtomVisitor.cpp \
172          $(DIR)/Bend.cpp \
173          $(DIR)/BendExtensions.cpp \
174          $(DIR)/Bond.cpp \
175          $(DIR)/BondExtensions.cpp \
176 +        $(DIR)/CGFamilyMinimizer.cpp \
177 +        $(DIR)/CompositeVisitor.cpp \
178          $(DIR)/DirectionalAtom.cpp \
179 <        $(DIR)/DumpWriter.cpp \
179 >        $(DIR)/DUFF.cpp \
180          $(DIR)/DumpReader.cpp \
181 +        $(DIR)/DumpWriter.cpp \
182 +        $(DIR)/EAM_FF.cpp \
183          $(DIR)/Exclude.cpp \
184 +        $(DIR)/ForceFields.cpp \
185 +        $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
186 +        $(DIR)/GenericData.cpp \
187 +        $(DIR)/GhostBend.cpp \
188          $(DIR)/InitializeFromFile.cpp \
180 –        $(DIR)/LJFF.cpp \
181 –        $(DIR)/EAM_FF.cpp \
182 –        $(DIR)/WATER.cpp \
183 –        $(DIR)/RigidBody.cpp \
184 –        $(DIR)/SimInfo.cpp \
185 –        $(DIR)/SimSetup.cpp \
186 –        $(DIR)/StatWriter.cpp \
187 –        $(DIR)/StuntDouble.cpp \
189          $(DIR)/Integrator.cpp \
190 <        $(DIR)/Thermo.cpp \
191 <        $(DIR)/GhostBend.cpp \
191 <        $(DIR)/Torsion.cpp \
192 <        $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
193 <        $(DIR)/DUFF.cpp \
194 <        $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
195 <        $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
196 <        $(DIR)/ForceFields.cpp \
190 >        $(DIR)/LJFF.cpp \
191 >        $(DIR)/mdProfile.cpp \
192          $(DIR)/Molecule.cpp \
193 +        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
194 +        $(DIR)/NPT.cpp \
195          $(DIR)/NPTf.cpp \
196          $(DIR)/NPTi.cpp \
197          $(DIR)/NPTxyz.cpp \
198          $(DIR)/NVT.cpp \
202 –        $(DIR)/SimState.cpp \
203 –        $(DIR)/ZConstraint.cpp \
204 –        $(DIR)/ZConsWriter.cpp \
205 –        $(DIR)/mdProfile.cpp \
206 –        $(DIR)/GenericData.cpp \
207 –        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
208 –        $(DIR)/Utility.cpp \
199          $(DIR)/OOPSEMinimizer.cpp \
210 –        $(DIR)/CGFamilyMinimizer.cpp \
211 –        $(DIR)/PRCG.cpp \
212 –        $(DIR)/SDMinimizer.cpp \
213 –        $(DIR)/ZConsReader.cpp  \
214 –        $(DIR)/AtomVisitor.cpp \
215 –        $(DIR)/CompositeVisitor.cpp \
200          $(DIR)/OtherVisitor.cpp \
201 +        $(DIR)/PRCG.cpp \
202 +        $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
203 +        $(DIR)/Restraints.cpp \
204 +        $(DIR)/RigidBody.cpp \
205          $(DIR)/RigidBodyVisitor.cpp \
206 +        $(DIR)/SDMinimizer.cpp \
207 +        $(DIR)/SimInfo.cpp \
208 +        $(DIR)/SimSetup.cpp \
209 +        $(DIR)/SimState.cpp \
210 +        $(DIR)/SkipList.cpp \
211 +        $(DIR)/StatWriter.cpp \
212 +        $(DIR)/StreamTokenizer.cpp \
213 +        $(DIR)/StuntDouble.cpp \
214 +        $(DIR)/Thermo.cpp \
215 +        $(DIR)/Torsion.cpp \
216 +        $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
217 +        $(DIR)/Utility.cpp \
218 +        $(DIR)/WATER.cpp \
219 +        $(DIR)/ZConsReader.cpp \
220 +        $(DIR)/ZConstraint.cpp \
221          $(DIR)/ZconsVisitor.cpp \
222 <        $(DIR)/Restraints.cpp
222 >        $(DIR)/ZConsWriter.cpp
223  
224   F90_FILES= \
225 <        $(DIR)/definitions_module.F90 \
223 <        $(DIR)/status_module.F90 \
224 <        $(DIR)/atype_module.F90 \
225 <        $(DIR)/switch_module.F90 \
226 <        $(DIR)/calc_dipole_dipole.F90 \
225 >        $(DIR)/atype_module.F90 \
226          $(DIR)/calc_charge_charge.F90 \
227 <        $(DIR)/calc_reaction_field.F90 \
229 <        $(DIR)/calc_LJ_FF.F90 \
227 >        $(DIR)/calc_dipole_dipole.F90 \
228          $(DIR)/calc_eam.F90 \
231 –        $(DIR)/calc_sticky_pair.F90 \
232 –        $(DIR)/do_Forces.F90 \
233 –        $(DIR)/vector_class.F90 \
234 –        $(DIR)/simulation_module.F90 \
235 –        $(DIR)/wrappers.F90 \
236 –        $(DIR)/neighborLists.F90 \
229          $(DIR)/calc_gb.F90 \
230 +        $(DIR)/calc_LJ_FF.F90 \
231 +        $(DIR)/calc_reaction_field.F90 \
232 +        $(DIR)/calc_sticky_pair.F90 \
233 +        $(DIR)/definitions_module.F90 \
234 +        $(DIR)/do_Forces.F90 \
235          $(DIR)/force_globals.F90 \
236          $(DIR)/mpiSimulation_module.F90 \
237 +        $(DIR)/neighborLists.F90 \
238          $(DIR)/notifyCutoffs.F90 \
239 +        $(DIR)/oopseMPI_module.F90 \
240 +        $(DIR)/simulation_module.F90 \
241 +        $(DIR)/status_module.F90 \
242 +        $(DIR)/switch_module.F90 \
243          $(DIR)/timing.F90 \
244 <        $(DIR)/oopseMPI_module.F90
244 >        $(DIR)/vector_class.F90 \
245 >        $(DIR)/wrappers.F90
246  
247   DIR:=.
248   C_SRCS   :=     $(C_FILES)
# Line 356 | Line 359 | obj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
359          obj/vector_class$(O) \
360          obj/force_globals$(O) \
361          obj/atype_module$(O) \
362 +        obj/switch_module$(O) \
363          obj/neighborLists$(O)
364  
365   obj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
366          obj/definitions_module$(O) \
367          obj/atype_module$(O) \
368 +        obj/switch_module$(O) \
369          obj/simulation_module$(O) \
370          obj/vector_class$(O) \
371          obj/force_globals$(O)
# Line 370 | Line 375 | obj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90
375          obj/vector_class$(O) \
376          obj/atype_module$(O) \
377          obj/simulation_module$(O) \
378 +        obj/status_module$(O) \
379          obj/force_globals$(O)
380  
381   obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
# Line 377 | Line 383 | obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
383          obj/atype_module$(O) \
384          obj/simulation_module$(O) \
385          obj/force_globals$(O) \
386 +        obj/status_module$(O) \
387          obj/vector_class$(O)
388  
389   obj/calc_charge_charge$(O): ./calc_charge_charge.F90 \
# Line 384 | Line 391 | obj/calc_charge_charge$(O): ./calc_charge_charge.F90 \
391          obj/atype_module$(O) \
392          obj/simulation_module$(O) \
393          obj/force_globals$(O) \
394 +        obj/status_module$(O) \
395          obj/vector_class$(O)
396  
397   obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
# Line 398 | Line 406 | obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
406          obj/calc_reaction_field$(O) \
407          obj/calc_gb$(O) \
408          obj/force_globals$(O) \
409 +        obj/status_module$(O) \
410          obj/vector_class$(O)
411  
412   obj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
# Line 407 | Line 416 | obj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
416          obj/calc_eam$(O) \
417          obj/calc_dipole_dipole$(O) \
418          obj/calc_reaction_field$(O) \
419 +        obj/switch_module$(O) \
420          obj/do_Forces$(O)
421  
422   obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
# Line 476 | Line 486 | MPIobj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90
486          MPIobj/force_globals$(O) \
487          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
488          MPIobj/atype_module$(O) \
489 +        MPIobj/switch_module$(O) \
490          MPIobj/neighborLists$(O)
491  
492   MPIobj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
493          MPIobj/definitions_module$(O) \
494          MPIobj/atype_module$(O) \
495 +        MPIobj/switch_module$(O) \
496          MPIobj/simulation_module$(O) \
497          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
498          MPIobj/atype_module$(O) \
# Line 494 | Line 506 | MPIobj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.
506          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
507          MPIobj/vector_class$(O) \
508          MPIobj/atype_module$(O) \
509 +        MPIobj/status_module$(O) \
510          MPIobj/force_globals$(O)
511  
512   MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
# Line 502 | Line 515 | MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F9
515          MPIobj/simulation_module$(O) \
516          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
517          MPIobj/force_globals$(O) \
518 +        MPIobj/status_module$(O) \
519          MPIobj/vector_class$(O)
520  
521   MPIobj/calc_charge_charge$(O): ./calc_charge_charge.F90 \
# Line 510 | Line 524 | MPIobj/calc_charge_charge$(O): ./calc_charge_charge.F9
524          MPIobj/simulation_module$(O) \
525          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
526          MPIobj/force_globals$(O) \
527 +        MPIobj/status_module$(O) \
528          MPIobj/vector_class$(O)
529  
530   MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
# Line 525 | Line 540 | MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
540          MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
541          MPIobj/calc_gb$(O) \
542          MPIobj/force_globals$(O) \
543 +        MPIobj/status_module$(O) \
544          MPIobj/vector_class$(O)
545  
546   MPIobj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
# Line 534 | Line 550 | MPIobj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
550          MPIobj/calc_eam$(O) \
551          MPIobj/calc_dipole_dipole$(O) \
552          MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
553 +        MPIobj/switch_module$(O) \
554          MPIobj/do_Forces$(O)
555  
556   MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \

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