ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/group/trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile
(Generate patch)

Comparing:
branches/mmeineke/OOPSE/libmdtools/Makefile (file contents), Revision 377 by mmeineke, Fri Mar 21 17:42:12 2003 UTC vs.
trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile (file contents), Revision 574 by gezelter, Tue Jul 8 20:56:10 2003 UTC

# Line 12 | Line 12 | DECLARES= -DFRC_PATH="$(OOPSE_HOME)/forcefields"
12  
13   # First do compile-time flags:
14  
15 < DECLARES= -DFRC_PATH="$(OOPSE_HOME)/forcefields"
15 > DECLARES= -DFRC_PATH="$(FORCE_PARAM_DIR)"
16   MPI_DECLARES= -DIS_MPI
17  
18   # include paths starting with "." are all relative to the SUBDIRS!!!
19  
20   INCLUDES= -I.. -I../../libBASS -I$(SPRNG_INC)
21 < MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPICH_INC)/mpi2c++ -I$(MPI_F90_MODS)
21 > MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPI_F90_MODS)
22  
23   CFLAGS=$(CFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES) $(MPI_INCLUDES)
24   CXXFLAGS=$(CXXFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES)
# Line 29 | Line 29 | MPI_FFLAGS=$(FFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
29   MPI_CXXFLAGS=$(CXXFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
30   MPI_FFLAGS=$(FFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
31  
32 + SRC_DIR := $(PWD)
33 +
34   # Then do the compile rules:
35  
36   obj/%.o: %.F90
37 <        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  ../$<
37 >        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  $(SRC_DIR)/$<
38  
39   MPIobj/%.o: %.F90
40 <        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c ../$<
40 >        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
41  
42   obj/%.o: %.cpp
43 <        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c ../$<
43 >        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
44  
45   MPIobj/%.o: %.cpp
46 <        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c ../$<
46 >        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
47  
48   obj/%.o: %.c
49 <        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c ../$<
49 >        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
50  
51   MPIobj/%.o: %.c
52 <        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c ../$<
52 >        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
53  
54   # Then list what we have to compile
55  
56   C_FILES = $(DIR)/mpiForceField.c
57  
58   CXX_FILES = \
59 +        $(DIR)/Atom.cpp \
60          $(DIR)/Bend.cpp \
61          $(DIR)/BendExtensions.cpp \
62          $(DIR)/Bond.cpp \
63          $(DIR)/BondExtensions.cpp \
61 –        $(DIR)/DipoleTestFF.cpp \
64          $(DIR)/DirectionalAtom.cpp \
65          $(DIR)/DumpWriter.cpp \
66 +        $(DIR)/Exclude.cpp \
67          $(DIR)/InitializeFromFile.cpp \
68 <        $(DIR)/LJ_FF.cpp \
68 >        $(DIR)/LJFF.cpp \
69          $(DIR)/SimInfo.cpp \
70          $(DIR)/SimSetup.cpp \
71          $(DIR)/StatWriter.cpp \
72 <        $(DIR)/Symplectic.cpp \
72 >        $(DIR)/Integrator.cpp \
73          $(DIR)/Thermo.cpp \
74          $(DIR)/GhostBend.cpp \
75          $(DIR)/Torsion.cpp \
76          $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
77 <        $(DIR)/TraPPE_ExFF.cpp \
75 <        $(DIR)/TraPPEFF.cpp \
76 <        $(DIR)/Verlet.cpp \
77 >        $(DIR)/DUFF.cpp \
78          $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
79          $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
80          $(DIR)/ForceFields.cpp \
81 <        $(DIR)/mpiSimulation.cpp
81 >        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
82 >        $(DIR)/Molecule.cpp \
83 >        $(DIR)/NVT.cpp \
84 >        $(DIR)/NPTi.cpp
85  
86  
87   F90_FILES= \
# Line 101 | Line 105 | F90_SRCS :=    $(F90_FILES)
105   C_SRCS   :=     $(C_FILES)
106   CXX_SRCS :=     $(CXX_FILES)
107   F90_SRCS :=     $(F90_FILES)
108 + SRCS     :=     $(C_SRCS) $(CXX_SRCS) $(F90_SRCS)
109  
110   DIR:=obj
111   C_OBJS   :=     $(C_FILES:.c=.o)
# Line 120 | Line 125 | all: libmdtools.a libmdtools_MPI.a
125  
126   # Possible make targets:
127  
128 < all: libmdtools.a libmdtools_MPI.a
128 > all: Make.dep libmdtools.a libmdtools_MPI.a
129  
130   libmdtools.a: $(OBJS)
131          $(RM) $@
# Line 144 | Line 149 | distclean : dummy
149          for i in $(LIBSUBDIRS); do \
150            (cd $$i; $(RM) *.o *.mod) || exit 1; \
151          done
152 <        $(RM) libmdtools.a libmdtools_MPI.a *.o *.mod *~ Make.temp Make.ftemp
152 >        $(RM) libmdtools.a libmdtools_MPI.a *.o *.mod *~ Make.temp Make.ftemp Make.dep
153  
154 < depend :
154 > depend : Make.dep
155 >
156 > Make.dep : $(SRCS)
157          echo "Only C dependencies are made automagically!"
158          echo "# DO NOT DELETE THIS LINE - used by make depend" > Make.dep
159          $(CC) $(DEPFLAGS) -MM $(C_SRCS) $(CXX_SRCS) \
160                  | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' > Make.temp
161 <        cat Make.temp | sed 's/^/obj\//' >> Make.dep
162 <        cat Make.temp | sed 's/^/MPIobj\//' >> Make.dep
163 < #       ../utils/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d obj -f ./Make.ftemp -h *.F90
164 < #       ../utils/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d MPIobj -f ./Make.ftemp -h *.F90
161 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/obj\/&/g' >> Make.dep
162 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/MPIobj\/&/g' >> Make.dep
163 > #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d obj -f ./Make.ftemp -h *.F90
164 > #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d MPIobj -f ./Make.ftemp -h *.F90
165   #       cat Make.ftemp | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' >> Make.dep
166          $(RM) Make.ftemp Make.temp
167  
# Line 168 | Line 175 | include Make.dep
175  
176   include Make.dep
177  
178 < # known dependencies
178 > obj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
179  
180 < obj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
180 > obj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
181  
182 < obj/vector_class$(O): vector_class.F90
176 <
177 < obj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
182 > obj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
183          obj/$(F_MACH_DEFS)
184  
185 < obj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
185 > obj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
186          obj/$(F_MACH_DEFS)
187  
188 < obj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
188 > obj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
189          obj/$(F_MACH_DEFS) \
190 +        obj/simulation_module$(O) \
191          obj/force_globals$(O)
192  
193 < obj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
193 > obj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
194          obj/$(F_MACH_DEFS) \
195 +        obj/simulation_module$(O) \
196          obj/force_globals$(O)
197  
198 < obj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
198 > obj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
199          obj/$(F_MACH_DEFS) \
200 <        obj/vector_class$(O) \
194 <        obj/calc_sticky_pair$(O) \
195 <        obj/calc_gb$(O)
200 >        obj/vector_class$(O)
201  
202 < obj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
202 > obj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
203          obj/$(F_MACH_DEFS) \
204 +        obj/vector_class$(O) \
205 +        obj/force_globals$(O) \
206          obj/atype_module$(O) \
207          obj/neighborLists$(O)
208  
209 < obj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
209 > obj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
210          obj/$(F_MACH_DEFS) \
211          obj/atype_module$(O) \
212 +        obj/simulation_module$(O) \
213          obj/vector_class$(O) \
214          obj/force_globals$(O)
215  
216 < obj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
216 > obj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
217          obj/$(F_MACH_DEFS) \
218          obj/vector_class$(O) \
219          obj/atype_module$(O) \
220 +        obj/simulation_module$(O) \
221          obj/force_globals$(O)
222  
223 < obj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
223 > obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
224          obj/$(F_MACH_DEFS) \
225          obj/atype_module$(O) \
226 +        obj/simulation_module$(O) \
227          obj/force_globals$(O) \
228          obj/vector_class$(O)
229  
230 < obj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
230 > obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
231          obj/$(F_MACH_DEFS) \
222 –        obj/simulation_module$(O) \
232          obj/atype_module$(O) \
233 +        obj/simulation_module$(O) \
234          obj/neighborLists$(O) \
235          obj/calc_LJ_FF$(O) \
236          obj/calc_sticky_pair$(O) \
# Line 229 | Line 239 | obj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
239          obj/calc_gb$(O) \
240          obj/force_globals$(O)
241  
242 < obj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
242 > obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
243          obj/$(F_MACH_DEFS) \
234 –        obj/simulation_module$(O) \
244          obj/atype_module$(O) \
245 +        obj/simulation_module$(O) \
246 +        obj/calc_sticky_pair$(O) \
247 +        obj/calc_gb$(O) \
248          obj/do_Forces$(O)
249  
250   #MPI dependencies:
251  
252 < MPIobj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
252 > MPIobj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
253  
254 < MPIobj/vector_class$(O): vector_class.F90
254 > MPIobj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
255  
256 < MPIobj/mpiSimulation_module$(O): mpiSimulation_module.F90
256 > MPIobj/mpiSimulation_module$(O): ./mpiSimulation_module.F90
257  
258 < MPIobj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
258 > MPIobj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
259          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
260          MPIobj/$(F_MACH_DEFS)
261  
262 < MPIobj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
262 > MPIobj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
263          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
264          MPIobj/mpiSimulation_module$(O)
265  
266 < MPIobj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
266 > MPIobj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
267          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
268 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
269          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
270          MPIobj/force_globals$(O)
271  
272 < MPIobj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
272 > MPIobj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
273          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
274 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
275          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
276          MPIobj/force_globals$(O)
277  
278 < MPIobj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
278 > MPIobj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
279          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
280 <        MPIobj/vector_class$(O) \
267 <        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
268 <        MPIobj/calc_gb$(O)
280 >        MPIobj/vector_class$(O)
281  
282 < MPIobj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
282 > MPIobj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
283          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
284 +        MPIobj/atype_module$(O) \
285 +        MPIobj/vector_class$(O) \
286 +        MPIobj/force_globals$(O) \
287          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
288          MPIobj/atype_module$(O) \
289          MPIobj/neighborLists$(O)
290  
291 < MPIobj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
291 > MPIobj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
292          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
293 +        MPIobj/atype_module$(O) \
294 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
295          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
296          MPIobj/atype_module$(O) \
297          MPIobj/vector_class$(O) \
298          MPIobj/force_globals$(O)
299  
300 < MPIobj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
300 > MPIobj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
301          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
302 +        MPIobj/atype_module$(O) \
303 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
304          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
305          MPIobj/vector_class$(O) \
306          MPIobj/atype_module$(O) \
307          MPIobj/force_globals$(O)
308  
309 < MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
309 > MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
310          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
292 –        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
311          MPIobj/atype_module$(O) \
312 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
313 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
314          MPIobj/force_globals$(O) \
315          MPIobj/vector_class$(O)
316  
317 < MPIobj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
317 > MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
318          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
319          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
300 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
320          MPIobj/atype_module$(O) \
321 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
322          MPIobj/neighborLists$(O) \
323          MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
324          MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
# Line 307 | Line 327 | MPIobj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
327          MPIobj/calc_gb$(O) \
328          MPIobj/force_globals$(O)
329  
330 < MPIobj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
330 > MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
331          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
332          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
313 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
333          MPIobj/atype_module$(O) \
334 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
335 +        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
336 +        MPIobj/calc_gb$(O) \
337          MPIobj/do_Forces$(O)
316 –
317 –

Diff Legend

– Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines