ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/group/trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile
(Generate patch)

Comparing:
branches/mmeineke/OOPSE/libmdtools/Makefile (file contents), Revision 377 by mmeineke, Fri Mar 21 17:42:12 2003 UTC vs.
trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile (file contents), Revision 631 by chuckv, Thu Jul 17 19:25:51 2003 UTC

# Line 12 | Line 12 | DECLARES= -DFRC_PATH="$(OOPSE_HOME)/forcefields"
12  
13   # First do compile-time flags:
14  
15 < DECLARES= -DFRC_PATH="$(OOPSE_HOME)/forcefields"
15 > DECLARES= -DFRC_PATH="$(FORCE_PARAM_DIR)"
16   MPI_DECLARES= -DIS_MPI
17  
18   # include paths starting with "." are all relative to the SUBDIRS!!!
19  
20   INCLUDES= -I.. -I../../libBASS -I$(SPRNG_INC)
21 < MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPICH_INC)/mpi2c++ -I$(MPI_F90_MODS)
21 > MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPI_F90_MODS)
22  
23   CFLAGS=$(CFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES) $(MPI_INCLUDES)
24   CXXFLAGS=$(CXXFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES)
25 < FFLAGS=$(FFLAGS_C) $(DECLARES)
25 > FFLAGS=$(FFLAGS_C)
26   DEPFLAGS=$(CFLAGS_C) -I. -I../libBASS -I$(SPRNG_INC) $(MPI_INCLUDES)
27  
28   MPI_CFLAGS=$(CFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
29   MPI_CXXFLAGS=$(CXXFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
30   MPI_FFLAGS=$(FFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
31  
32 + SRC_DIR := $(PWD)
33 +
34   # Then do the compile rules:
35  
36   obj/%.o: %.F90
37 <        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  ../$<
37 >        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  $(SRC_DIR)/$<
38  
39   MPIobj/%.o: %.F90
40 <        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c ../$<
40 >        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
41  
42   obj/%.o: %.cpp
43 <        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c ../$<
43 >        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
44  
45   MPIobj/%.o: %.cpp
46 <        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c ../$<
46 >        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
47  
48   obj/%.o: %.c
49 <        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c ../$<
49 >        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
50  
51   MPIobj/%.o: %.c
52 <        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c ../$<
52 >        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
53  
54   # Then list what we have to compile
55  
56 < C_FILES = $(DIR)/mpiForceField.c
56 > C_FILES = \
57 >        $(DIR)/mpiForceField.c \
58 >        $(DIR)/fInfo.c
59  
60   CXX_FILES = \
61 +        $(DIR)/Atom.cpp \
62          $(DIR)/Bend.cpp \
63          $(DIR)/BendExtensions.cpp \
64          $(DIR)/Bond.cpp \
65          $(DIR)/BondExtensions.cpp \
61 –        $(DIR)/DipoleTestFF.cpp \
66          $(DIR)/DirectionalAtom.cpp \
67          $(DIR)/DumpWriter.cpp \
68 +        $(DIR)/Exclude.cpp \
69          $(DIR)/InitializeFromFile.cpp \
70 <        $(DIR)/LJ_FF.cpp \
70 >        $(DIR)/LJFF.cpp \
71 >        $(DIR)/EAM_FF.cpp \
72          $(DIR)/SimInfo.cpp \
73          $(DIR)/SimSetup.cpp \
74          $(DIR)/StatWriter.cpp \
75 <        $(DIR)/Symplectic.cpp \
75 >        $(DIR)/Integrator.cpp \
76          $(DIR)/Thermo.cpp \
77          $(DIR)/GhostBend.cpp \
78          $(DIR)/Torsion.cpp \
79          $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
80 <        $(DIR)/TraPPE_ExFF.cpp \
75 <        $(DIR)/TraPPEFF.cpp \
76 <        $(DIR)/Verlet.cpp \
80 >        $(DIR)/DUFF.cpp \
81          $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
82          $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
83          $(DIR)/ForceFields.cpp \
84 <        $(DIR)/mpiSimulation.cpp
84 >        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
85 >        $(DIR)/Molecule.cpp \
86 >        $(DIR)/NVT.cpp \
87 >        $(DIR)/NPTi.cpp \
88 >        $(DIR)/NPTf.cpp \
89 >        $(DIR)/NPTim.cpp \
90 >        $(DIR)/NPTfm.cpp
91  
92  
93   F90_FILES= \
94          $(DIR)/Linux_ifc_machdep.F90 \
95 +        $(DIR)/status_module.F90 \
96          $(DIR)/atype_module.F90 \
86 –        $(DIR)/f_verlet_constrained.F90 \
97          $(DIR)/calc_dipole_dipole.F90 \
98          $(DIR)/calc_reaction_field.F90 \
99          $(DIR)/calc_LJ_FF.F90 \
100 +        $(DIR)/calc_eam.F90 \
101          $(DIR)/calc_sticky_pair.F90 \
102          $(DIR)/do_Forces.F90 \
103          $(DIR)/vector_class.F90 \
# Line 95 | Line 106 | F90_FILES= \
106          $(DIR)/neighborLists.F90 \
107          $(DIR)/calc_gb.F90 \
108          $(DIR)/force_globals.F90 \
109 <        $(DIR)/mpiSimulation_module.F90
109 >        $(DIR)/mpiSimulation_module.F90 \
110 >        $(DIR)/notifyCutoffs.F90
111  
112   DIR:=.
113   C_SRCS   :=     $(C_FILES)
114   CXX_SRCS :=     $(CXX_FILES)
115   F90_SRCS :=     $(F90_FILES)
116 + SRCS     :=     $(C_SRCS) $(CXX_SRCS) $(F90_SRCS)
117  
118   DIR:=obj
119   C_OBJS   :=     $(C_FILES:.c=.o)
# Line 120 | Line 133 | all: libmdtools.a libmdtools_MPI.a
133  
134   # Possible make targets:
135  
136 < all: libmdtools.a libmdtools_MPI.a
136 > all: Make.dep libmdtools.a libmdtools_MPI.a
137  
138   libmdtools.a: $(OBJS)
139          $(RM) $@
# Line 144 | Line 157 | distclean : dummy
157          for i in $(LIBSUBDIRS); do \
158            (cd $$i; $(RM) *.o *.mod) || exit 1; \
159          done
160 <        $(RM) libmdtools.a libmdtools_MPI.a *.o *.mod *~ Make.temp Make.ftemp
160 >        $(RM) libmdtools.a libmdtools_MPI.a *.o *.mod *~ Make.temp Make.ftemp Make.dep
161  
162 < depend :
162 > depend : Make.dep
163 >
164 > Make.dep : $(SRCS)
165          echo "Only C dependencies are made automagically!"
166          echo "# DO NOT DELETE THIS LINE - used by make depend" > Make.dep
167          $(CC) $(DEPFLAGS) -MM $(C_SRCS) $(CXX_SRCS) \
168                  | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' > Make.temp
169 <        cat Make.temp | sed 's/^/obj\//' >> Make.dep
170 <        cat Make.temp | sed 's/^/MPIobj\//' >> Make.dep
171 < #       ../utils/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d obj -f ./Make.ftemp -h *.F90
172 < #       ../utils/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d MPIobj -f ./Make.ftemp -h *.F90
169 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/obj\/&/g' >> Make.dep
170 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/MPIobj\/&/g' >> Make.dep
171 > #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d obj -f ./Make.ftemp -h *.F90
172 > #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d MPIobj -f ./Make.ftemp -h *.F90
173   #       cat Make.ftemp | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' >> Make.dep
174          $(RM) Make.ftemp Make.temp
175  
# Line 168 | Line 183 | include Make.dep
183  
184   include Make.dep
185  
186 < # known dependencies
186 > obj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
187  
188 < obj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
188 > obj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
189  
190 < obj/vector_class$(O): vector_class.F90
190 > obj/status_module$(O): ./status_module.F90
191  
192 < obj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
192 > obj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
193          obj/$(F_MACH_DEFS)
194  
195 < obj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
195 > obj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
196          obj/$(F_MACH_DEFS)
197  
198 < obj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
198 > obj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
199          obj/$(F_MACH_DEFS) \
200 +        obj/simulation_module$(O) \
201          obj/force_globals$(O)
202  
203 < obj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
203 > obj/calc_eam$(O): ./calc_eam.F90 \
204          obj/$(F_MACH_DEFS) \
205 +        obj/atype_module$(O) \
206 +        obj/simulation_module$(O) \
207 +        obj/vector_class$(O) \
208 +        obj/force_globals$(O) \
209 +        obj/status_module$(O)
210 +
211 + obj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
212 +        obj/$(F_MACH_DEFS) \
213 +        obj/simulation_module$(O) \
214          obj/force_globals$(O)
215  
216 < obj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
216 > obj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
217          obj/$(F_MACH_DEFS) \
218 <        obj/vector_class$(O) \
194 <        obj/calc_sticky_pair$(O) \
195 <        obj/calc_gb$(O)
218 >        obj/vector_class$(O)
219  
220 < obj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
220 > obj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
221          obj/$(F_MACH_DEFS) \
222 +        obj/vector_class$(O) \
223 +        obj/force_globals$(O) \
224          obj/atype_module$(O) \
225          obj/neighborLists$(O)
226  
227 < obj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
227 > obj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
228          obj/$(F_MACH_DEFS) \
229          obj/atype_module$(O) \
230 +        obj/simulation_module$(O) \
231          obj/vector_class$(O) \
232          obj/force_globals$(O)
233  
234 < obj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
234 > obj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
235          obj/$(F_MACH_DEFS) \
236          obj/vector_class$(O) \
237          obj/atype_module$(O) \
238 +        obj/simulation_module$(O) \
239          obj/force_globals$(O)
240  
241 < obj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
241 > obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
242          obj/$(F_MACH_DEFS) \
243          obj/atype_module$(O) \
244 +        obj/simulation_module$(O) \
245          obj/force_globals$(O) \
246          obj/vector_class$(O)
247  
248 < obj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
248 > obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
249          obj/$(F_MACH_DEFS) \
222 –        obj/simulation_module$(O) \
250          obj/atype_module$(O) \
251 +        obj/simulation_module$(O) \
252          obj/neighborLists$(O) \
253          obj/calc_LJ_FF$(O) \
254          obj/calc_sticky_pair$(O) \
255          obj/calc_dipole_dipole$(O) \
256          obj/calc_reaction_field$(O) \
257          obj/calc_gb$(O) \
258 <        obj/force_globals$(O)
258 >        obj/force_globals$(O) \
259 >        obj/vector_class$(O)
260  
261 < obj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
261 > obj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
262          obj/$(F_MACH_DEFS) \
234 –        obj/simulation_module$(O) \
263          obj/atype_module$(O) \
264 +        obj/calc_LJ_FF$(O) \
265 +        obj/calc_dipole_dipole$(O) \
266 +        obj/calc_reaction_field$(O) \
267          obj/do_Forces$(O)
268  
269 + obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
270 +        obj/$(F_MACH_DEFS) \
271 +        obj/atype_module$(O) \
272 +        obj/simulation_module$(O) \
273 +        obj/calc_sticky_pair$(O) \
274 +        obj/calc_gb$(O) \
275 +        obj/do_Forces$(O) \
276 +        obj/notifyCutoffs$(O)
277 +
278 +
279 +
280 +
281 +
282 +
283   #MPI dependencies:
284  
285 < MPIobj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
285 > MPIobj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
286  
287 < MPIobj/vector_class$(O): vector_class.F90
287 > MPIobj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
288  
289 < MPIobj/mpiSimulation_module$(O): mpiSimulation_module.F90
289 > MPIobj/status_module$(O): ./status_module.F90
290  
291 < MPIobj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
291 > MPIobj/mpiSimulation_module$(O): ./mpiSimulation_module.F90
292 >
293 > MPIobj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
294          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
295          MPIobj/$(F_MACH_DEFS)
296  
297 < MPIobj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
297 > MPIobj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
298          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
299          MPIobj/mpiSimulation_module$(O)
300  
301 < MPIobj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
301 > MPIobj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
302          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
303 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
304          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
305          MPIobj/force_globals$(O)
306  
307 < MPIobj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
307 > MPIobj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
308          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
309 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
310          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
311          MPIobj/force_globals$(O)
312  
313 < MPIobj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
313 > MPIobj/calc_eam$(O): ./calc_eam.F90 \
314          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
315 +        MPIobj/atype_module$(O) \
316 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
317          MPIobj/vector_class$(O) \
318 <        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
319 <        MPIobj/calc_gb$(O)
318 >        MPIobj/force_globals$(O) \
319 >        MPIobj/status_module$(O)
320  
321 < MPIobj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
321 >
322 > MPIobj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
323          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
324 +        MPIobj/vector_class$(O)
325 +
326 + MPIobj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
327 +        MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
328 +        MPIobj/atype_module$(O) \
329 +        MPIobj/vector_class$(O) \
330 +        MPIobj/force_globals$(O) \
331          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
332          MPIobj/atype_module$(O) \
333          MPIobj/neighborLists$(O)
334  
335 < MPIobj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
335 > MPIobj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
336          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
337 +        MPIobj/atype_module$(O) \
338 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
339          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
340          MPIobj/atype_module$(O) \
341          MPIobj/vector_class$(O) \
342          MPIobj/force_globals$(O)
343  
344 < MPIobj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
344 > MPIobj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
345          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
346 +        MPIobj/atype_module$(O) \
347 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
348          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
349          MPIobj/vector_class$(O) \
350          MPIobj/atype_module$(O) \
351          MPIobj/force_globals$(O)
352  
353 < MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
353 > MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
354          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
292 –        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
355          MPIobj/atype_module$(O) \
356 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
357 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
358          MPIobj/force_globals$(O) \
359          MPIobj/vector_class$(O)
360  
361 < MPIobj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
361 > MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
362          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
363          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
300 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
364          MPIobj/atype_module$(O) \
365 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
366          MPIobj/neighborLists$(O) \
367          MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
368          MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
369          MPIobj/calc_dipole_dipole$(O) \
370          MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
371          MPIobj/calc_gb$(O) \
372 <        MPIobj/force_globals$(O)
372 >        MPIobj/force_globals$(O) \
373 >        MPIobj/vector_class$(O)
374  
375 < MPIobj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
375 > MPIobj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
376          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
312 –        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
313 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
377          MPIobj/atype_module$(O) \
378 +        MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
379 +        MPIobj/calc_dipole_dipole$(O) \
380 +        MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
381          MPIobj/do_Forces$(O)
382  
383 <
383 > MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
384 >        MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
385 >        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
386 >        MPIobj/atype_module$(O) \
387 >        MPIobj/simulation_module$(O) \
388 >        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
389 >        MPIobj/calc_gb$(O) \
390 >        MPIobj/do_Forces$(O) \
391 >        MPIobj/notifyCutoffs$(O)  

Diff Legend

– Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines