ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/group/trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile (file contents):
Revision 385 by gezelter, Fri Mar 21 20:37:58 2003 UTC vs.
Revision 597 by mmeineke, Mon Jul 14 21:28:54 2003 UTC

# Line 18 | Line 18 | MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPICH_INC)/mpi2c++ -I
18   # include paths starting with "." are all relative to the SUBDIRS!!!
19  
20   INCLUDES= -I.. -I../../libBASS -I$(SPRNG_INC)
21 < MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPICH_INC)/mpi2c++ -I$(MPI_F90_MODS)
21 > MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPI_F90_MODS)
22  
23   CFLAGS=$(CFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES) $(MPI_INCLUDES)
24   CXXFLAGS=$(CXXFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES)
# Line 29 | Line 29 | MPI_FFLAGS=$(FFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
29   MPI_CXXFLAGS=$(CXXFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
30   MPI_FFLAGS=$(FFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
31  
32 + SRC_DIR := $(PWD)
33 +
34   # Then do the compile rules:
35  
36   obj/%.o: %.F90
37 <        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  ../$<
37 >        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  $(SRC_DIR)/$<
38  
39   MPIobj/%.o: %.F90
40 <        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c ../$<
40 >        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
41  
42   obj/%.o: %.cpp
43 <        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c ../$<
43 >        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
44  
45   MPIobj/%.o: %.cpp
46 <        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c ../$<
46 >        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
47  
48   obj/%.o: %.c
49 <        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c ../$<
49 >        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
50  
51   MPIobj/%.o: %.c
52 <        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c ../$<
52 >        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
53  
54   # Then list what we have to compile
55  
56   C_FILES = $(DIR)/mpiForceField.c
57  
58   CXX_FILES = \
59 +        $(DIR)/Atom.cpp \
60          $(DIR)/Bend.cpp \
61          $(DIR)/BendExtensions.cpp \
62          $(DIR)/Bond.cpp \
63          $(DIR)/BondExtensions.cpp \
61 –        $(DIR)/DipoleTestFF.cpp \
64          $(DIR)/DirectionalAtom.cpp \
65          $(DIR)/DumpWriter.cpp \
66 +        $(DIR)/Exclude.cpp \
67          $(DIR)/InitializeFromFile.cpp \
68 <        $(DIR)/LJ_FF.cpp \
68 >        $(DIR)/LJFF.cpp \
69          $(DIR)/SimInfo.cpp \
70          $(DIR)/SimSetup.cpp \
71          $(DIR)/StatWriter.cpp \
72 <        $(DIR)/Symplectic.cpp \
72 >        $(DIR)/Integrator.cpp \
73          $(DIR)/Thermo.cpp \
74          $(DIR)/GhostBend.cpp \
75          $(DIR)/Torsion.cpp \
76          $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
77 <        $(DIR)/TraPPE_ExFF.cpp \
75 <        $(DIR)/TraPPEFF.cpp \
76 <        $(DIR)/Verlet.cpp \
77 >        $(DIR)/DUFF.cpp \
78          $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
79          $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
80          $(DIR)/ForceFields.cpp \
81 <        $(DIR)/mpiSimulation.cpp
81 >        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
82 >        $(DIR)/Molecule.cpp \
83 >        $(DIR)/NVT.cpp \
84 >        $(DIR)/NPTi.cpp \
85 >        $(DIR)/NPTf.cpp
86  
87  
88   F90_FILES= \
# Line 154 | Line 159 | Make.dep : $(SRCS)
159          echo "# DO NOT DELETE THIS LINE - used by make depend" > Make.dep
160          $(CC) $(DEPFLAGS) -MM $(C_SRCS) $(CXX_SRCS) \
161                  | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' > Make.temp
162 <        cat Make.temp | sed 's/^/obj\//' >> Make.dep
163 <        cat Make.temp | sed 's/^/MPIobj\//' >> Make.dep
162 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/obj\/&/g' >> Make.dep
163 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/MPIobj\/&/g' >> Make.dep
164   #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d obj -f ./Make.ftemp -h *.F90
165   #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d MPIobj -f ./Make.ftemp -h *.F90
166   #       cat Make.ftemp | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' >> Make.dep
# Line 171 | Line 176 | include Make.dep
176  
177   include Make.dep
178  
179 < # known dependencies
179 > obj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
180  
181 < obj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
181 > obj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
182  
183 < obj/vector_class$(O): vector_class.F90
179 <
180 < obj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
183 > obj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
184          obj/$(F_MACH_DEFS)
185  
186 < obj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
186 > obj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
187          obj/$(F_MACH_DEFS)
188  
189 < obj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
189 > obj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
190          obj/$(F_MACH_DEFS) \
191 +        obj/simulation_module$(O) \
192          obj/force_globals$(O)
193  
194 < obj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
194 > obj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
195          obj/$(F_MACH_DEFS) \
196 +        obj/simulation_module$(O) \
197          obj/force_globals$(O)
198  
199 < obj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
199 > obj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
200          obj/$(F_MACH_DEFS) \
201 <        obj/vector_class$(O) \
197 <        obj/calc_sticky_pair$(O) \
198 <        obj/calc_gb$(O)
201 >        obj/vector_class$(O)
202  
203 < obj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
203 > obj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
204          obj/$(F_MACH_DEFS) \
205 +        obj/vector_class$(O) \
206 +        obj/force_globals$(O) \
207          obj/atype_module$(O) \
208          obj/neighborLists$(O)
209  
210 < obj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
210 > obj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
211          obj/$(F_MACH_DEFS) \
212          obj/atype_module$(O) \
213 +        obj/simulation_module$(O) \
214          obj/vector_class$(O) \
215          obj/force_globals$(O)
216  
217 < obj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
217 > obj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
218          obj/$(F_MACH_DEFS) \
219          obj/vector_class$(O) \
220          obj/atype_module$(O) \
221 +        obj/simulation_module$(O) \
222          obj/force_globals$(O)
223  
224 < obj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
224 > obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
225          obj/$(F_MACH_DEFS) \
226          obj/atype_module$(O) \
227 +        obj/simulation_module$(O) \
228          obj/force_globals$(O) \
229          obj/vector_class$(O)
230  
231 < obj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
231 > obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
232          obj/$(F_MACH_DEFS) \
225 –        obj/simulation_module$(O) \
233          obj/atype_module$(O) \
234 +        obj/simulation_module$(O) \
235          obj/neighborLists$(O) \
236          obj/calc_LJ_FF$(O) \
237          obj/calc_sticky_pair$(O) \
# Line 232 | Line 240 | obj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
240          obj/calc_gb$(O) \
241          obj/force_globals$(O)
242  
243 < obj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
243 > obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
244          obj/$(F_MACH_DEFS) \
237 –        obj/simulation_module$(O) \
245          obj/atype_module$(O) \
246 +        obj/simulation_module$(O) \
247 +        obj/calc_sticky_pair$(O) \
248 +        obj/calc_gb$(O) \
249          obj/do_Forces$(O)
250  
251   #MPI dependencies:
252  
253 < MPIobj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
253 > MPIobj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
254  
255 < MPIobj/vector_class$(O): vector_class.F90
255 > MPIobj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
256  
257 < MPIobj/mpiSimulation_module$(O): mpiSimulation_module.F90
257 > MPIobj/mpiSimulation_module$(O): ./mpiSimulation_module.F90
258  
259 < MPIobj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
259 > MPIobj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
260          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
261          MPIobj/$(F_MACH_DEFS)
262  
263 < MPIobj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
263 > MPIobj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
264          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
265          MPIobj/mpiSimulation_module$(O)
266  
267 < MPIobj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
267 > MPIobj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
268          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
269 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
270          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
271          MPIobj/force_globals$(O)
272  
273 < MPIobj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
273 > MPIobj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
274          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
275 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
276          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
277          MPIobj/force_globals$(O)
278  
279 < MPIobj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
279 > MPIobj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
280          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
281 <        MPIobj/vector_class$(O) \
270 <        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
271 <        MPIobj/calc_gb$(O)
281 >        MPIobj/vector_class$(O)
282  
283 < MPIobj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
283 > MPIobj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
284          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
285 +        MPIobj/atype_module$(O) \
286 +        MPIobj/vector_class$(O) \
287 +        MPIobj/force_globals$(O) \
288          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
289          MPIobj/atype_module$(O) \
290          MPIobj/neighborLists$(O)
291  
292 < MPIobj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
292 > MPIobj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
293          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
294 +        MPIobj/atype_module$(O) \
295 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
296          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
297          MPIobj/atype_module$(O) \
298          MPIobj/vector_class$(O) \
299          MPIobj/force_globals$(O)
300  
301 < MPIobj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
301 > MPIobj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
302          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
303 +        MPIobj/atype_module$(O) \
304 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
305          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
306          MPIobj/vector_class$(O) \
307          MPIobj/atype_module$(O) \
308          MPIobj/force_globals$(O)
309  
310 < MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
310 > MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
311          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
295 –        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
312          MPIobj/atype_module$(O) \
313 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
314 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
315          MPIobj/force_globals$(O) \
316          MPIobj/vector_class$(O)
317  
318 < MPIobj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
318 > MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
319          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
320          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
303 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
321          MPIobj/atype_module$(O) \
322 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
323          MPIobj/neighborLists$(O) \
324          MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
325          MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
# Line 310 | Line 328 | MPIobj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
328          MPIobj/calc_gb$(O) \
329          MPIobj/force_globals$(O)
330  
331 < MPIobj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
331 > MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
332          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
333          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
316 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
334          MPIobj/atype_module$(O) \
335 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
336 +        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
337 +        MPIobj/calc_gb$(O) \
338          MPIobj/do_Forces$(O)

Diff Legend

– Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines