ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/group/trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile (file contents):
Revision 385 by gezelter, Fri Mar 21 20:37:58 2003 UTC vs.
Revision 616 by mmeineke, Tue Jul 15 18:52:16 2003 UTC

# Line 18 | Line 18 | MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPICH_INC)/mpi2c++ -I
18   # include paths starting with "." are all relative to the SUBDIRS!!!
19  
20   INCLUDES= -I.. -I../../libBASS -I$(SPRNG_INC)
21 < MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPICH_INC)/mpi2c++ -I$(MPI_F90_MODS)
21 > MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPI_F90_MODS)
22  
23   CFLAGS=$(CFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES) $(MPI_INCLUDES)
24   CXXFLAGS=$(CXXFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES)
# Line 29 | Line 29 | MPI_FFLAGS=$(FFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
29   MPI_CXXFLAGS=$(CXXFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
30   MPI_FFLAGS=$(FFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
31  
32 + SRC_DIR := $(PWD)
33 +
34   # Then do the compile rules:
35  
36   obj/%.o: %.F90
37 <        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  ../$<
37 >        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  $(SRC_DIR)/$<
38  
39   MPIobj/%.o: %.F90
40 <        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c ../$<
40 >        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
41  
42   obj/%.o: %.cpp
43 <        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c ../$<
43 >        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
44  
45   MPIobj/%.o: %.cpp
46 <        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c ../$<
46 >        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
47  
48   obj/%.o: %.c
49 <        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c ../$<
49 >        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
50  
51   MPIobj/%.o: %.c
52 <        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c ../$<
52 >        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
53  
54   # Then list what we have to compile
55  
56   C_FILES = $(DIR)/mpiForceField.c
57  
58   CXX_FILES = \
59 +        $(DIR)/Atom.cpp \
60          $(DIR)/Bend.cpp \
61          $(DIR)/BendExtensions.cpp \
62          $(DIR)/Bond.cpp \
63          $(DIR)/BondExtensions.cpp \
61 –        $(DIR)/DipoleTestFF.cpp \
64          $(DIR)/DirectionalAtom.cpp \
65          $(DIR)/DumpWriter.cpp \
66 +        $(DIR)/Exclude.cpp \
67          $(DIR)/InitializeFromFile.cpp \
68 <        $(DIR)/LJ_FF.cpp \
68 >        $(DIR)/LJFF.cpp \
69          $(DIR)/SimInfo.cpp \
70          $(DIR)/SimSetup.cpp \
71          $(DIR)/StatWriter.cpp \
72 <        $(DIR)/Symplectic.cpp \
72 >        $(DIR)/Integrator.cpp \
73          $(DIR)/Thermo.cpp \
74          $(DIR)/GhostBend.cpp \
75          $(DIR)/Torsion.cpp \
76          $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
77 <        $(DIR)/TraPPE_ExFF.cpp \
75 <        $(DIR)/TraPPEFF.cpp \
76 <        $(DIR)/Verlet.cpp \
77 >        $(DIR)/DUFF.cpp \
78          $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
79          $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
80          $(DIR)/ForceFields.cpp \
81 <        $(DIR)/mpiSimulation.cpp
81 >        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
82 >        $(DIR)/Molecule.cpp \
83 >        $(DIR)/NVT.cpp \
84 >        $(DIR)/NPTi.cpp \
85 >        $(DIR)/NPTf.cpp \
86 >        $(DIR)/NPTim.cpp \
87 >        $(DIR)/NPTfm.cpp
88  
89  
90   F90_FILES= \
91          $(DIR)/Linux_ifc_machdep.F90 \
92          $(DIR)/atype_module.F90 \
86 –        $(DIR)/f_verlet_constrained.F90 \
93          $(DIR)/calc_dipole_dipole.F90 \
94          $(DIR)/calc_reaction_field.F90 \
95          $(DIR)/calc_LJ_FF.F90 \
# Line 154 | Line 160 | Make.dep : $(SRCS)
160          echo "# DO NOT DELETE THIS LINE - used by make depend" > Make.dep
161          $(CC) $(DEPFLAGS) -MM $(C_SRCS) $(CXX_SRCS) \
162                  | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' > Make.temp
163 <        cat Make.temp | sed 's/^/obj\//' >> Make.dep
164 <        cat Make.temp | sed 's/^/MPIobj\//' >> Make.dep
163 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/obj\/&/g' >> Make.dep
164 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/MPIobj\/&/g' >> Make.dep
165   #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d obj -f ./Make.ftemp -h *.F90
166   #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d MPIobj -f ./Make.ftemp -h *.F90
167   #       cat Make.ftemp | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' >> Make.dep
# Line 171 | Line 177 | include Make.dep
177  
178   include Make.dep
179  
180 < # known dependencies
180 > obj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
181  
182 < obj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
182 > obj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
183  
184 < obj/vector_class$(O): vector_class.F90
179 <
180 < obj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
184 > obj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
185          obj/$(F_MACH_DEFS)
186  
187 < obj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
187 > obj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
188          obj/$(F_MACH_DEFS)
189  
190 < obj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
190 > obj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
191          obj/$(F_MACH_DEFS) \
192 +        obj/simulation_module$(O) \
193          obj/force_globals$(O)
194  
195 < obj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
195 > obj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
196          obj/$(F_MACH_DEFS) \
197 +        obj/simulation_module$(O) \
198          obj/force_globals$(O)
199  
200 < obj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
200 > obj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
201          obj/$(F_MACH_DEFS) \
202 <        obj/vector_class$(O) \
197 <        obj/calc_sticky_pair$(O) \
198 <        obj/calc_gb$(O)
202 >        obj/vector_class$(O)
203  
204 < obj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
204 > obj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
205          obj/$(F_MACH_DEFS) \
206 +        obj/vector_class$(O) \
207 +        obj/force_globals$(O) \
208          obj/atype_module$(O) \
209          obj/neighborLists$(O)
210  
211 < obj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
211 > obj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
212          obj/$(F_MACH_DEFS) \
213          obj/atype_module$(O) \
214 +        obj/simulation_module$(O) \
215          obj/vector_class$(O) \
216          obj/force_globals$(O)
217  
218 < obj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
218 > obj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
219          obj/$(F_MACH_DEFS) \
220          obj/vector_class$(O) \
221          obj/atype_module$(O) \
222 +        obj/simulation_module$(O) \
223          obj/force_globals$(O)
224  
225 < obj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
225 > obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
226          obj/$(F_MACH_DEFS) \
227          obj/atype_module$(O) \
228 +        obj/simulation_module$(O) \
229          obj/force_globals$(O) \
230          obj/vector_class$(O)
231  
232 < obj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
232 > obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
233          obj/$(F_MACH_DEFS) \
225 –        obj/simulation_module$(O) \
234          obj/atype_module$(O) \
235 +        obj/simulation_module$(O) \
236          obj/neighborLists$(O) \
237          obj/calc_LJ_FF$(O) \
238          obj/calc_sticky_pair$(O) \
# Line 232 | Line 241 | obj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
241          obj/calc_gb$(O) \
242          obj/force_globals$(O)
243  
244 < obj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
244 > obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
245          obj/$(F_MACH_DEFS) \
237 –        obj/simulation_module$(O) \
246          obj/atype_module$(O) \
247 +        obj/simulation_module$(O) \
248 +        obj/calc_sticky_pair$(O) \
249 +        obj/calc_gb$(O) \
250          obj/do_Forces$(O)
251  
252   #MPI dependencies:
253  
254 < MPIobj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
254 > MPIobj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
255  
256 < MPIobj/vector_class$(O): vector_class.F90
256 > MPIobj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
257  
258 < MPIobj/mpiSimulation_module$(O): mpiSimulation_module.F90
258 > MPIobj/mpiSimulation_module$(O): ./mpiSimulation_module.F90
259  
260 < MPIobj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
260 > MPIobj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
261          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
262          MPIobj/$(F_MACH_DEFS)
263  
264 < MPIobj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
264 > MPIobj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
265          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
266          MPIobj/mpiSimulation_module$(O)
267  
268 < MPIobj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
268 > MPIobj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
269          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
270 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
271          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
272          MPIobj/force_globals$(O)
273  
274 < MPIobj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
274 > MPIobj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
275          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
276 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
277          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
278          MPIobj/force_globals$(O)
279  
280 < MPIobj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
280 > MPIobj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
281          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
282 <        MPIobj/vector_class$(O) \
270 <        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
271 <        MPIobj/calc_gb$(O)
282 >        MPIobj/vector_class$(O)
283  
284 < MPIobj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
284 > MPIobj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
285          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
286 +        MPIobj/atype_module$(O) \
287 +        MPIobj/vector_class$(O) \
288 +        MPIobj/force_globals$(O) \
289          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
290          MPIobj/atype_module$(O) \
291          MPIobj/neighborLists$(O)
292  
293 < MPIobj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
293 > MPIobj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
294          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
295 +        MPIobj/atype_module$(O) \
296 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
297          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
298          MPIobj/atype_module$(O) \
299          MPIobj/vector_class$(O) \
300          MPIobj/force_globals$(O)
301  
302 < MPIobj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
302 > MPIobj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
303          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
304 +        MPIobj/atype_module$(O) \
305 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
306          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
307          MPIobj/vector_class$(O) \
308          MPIobj/atype_module$(O) \
309          MPIobj/force_globals$(O)
310  
311 < MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
311 > MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
312          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
295 –        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
313          MPIobj/atype_module$(O) \
314 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
315 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
316          MPIobj/force_globals$(O) \
317          MPIobj/vector_class$(O)
318  
319 < MPIobj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
319 > MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
320          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
321          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
303 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
322          MPIobj/atype_module$(O) \
323 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
324          MPIobj/neighborLists$(O) \
325          MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
326          MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
# Line 310 | Line 329 | MPIobj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
329          MPIobj/calc_gb$(O) \
330          MPIobj/force_globals$(O)
331  
332 < MPIobj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
332 > MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
333          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
334          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
316 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
335          MPIobj/atype_module$(O) \
336 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
337 +        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
338 +        MPIobj/calc_gb$(O) \
339          MPIobj/do_Forces$(O)

Diff Legend

– Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines