ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/group/trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile (file contents):
Revision 385 by gezelter, Fri Mar 21 20:37:58 2003 UTC vs.
Revision 653 by chuckv, Fri Jul 25 20:00:17 2003 UTC

# Line 18 | Line 18 | MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPICH_INC)/mpi2c++ -I
18   # include paths starting with "." are all relative to the SUBDIRS!!!
19  
20   INCLUDES= -I.. -I../../libBASS -I$(SPRNG_INC)
21 < MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPICH_INC)/mpi2c++ -I$(MPI_F90_MODS)
21 > MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPI_F90_MODS)
22  
23   CFLAGS=$(CFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES) $(MPI_INCLUDES)
24   CXXFLAGS=$(CXXFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES)
25 < FFLAGS=$(FFLAGS_C) $(DECLARES)
25 > FFLAGS=$(FFLAGS_C)
26   DEPFLAGS=$(CFLAGS_C) -I. -I../libBASS -I$(SPRNG_INC) $(MPI_INCLUDES)
27  
28   MPI_CFLAGS=$(CFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
29   MPI_CXXFLAGS=$(CXXFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
30   MPI_FFLAGS=$(FFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
31  
32 + SRC_DIR := $(PWD)
33 +
34   # Then do the compile rules:
35  
36   obj/%.o: %.F90
37 <        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  ../$<
37 >        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  $(SRC_DIR)/$<
38  
39   MPIobj/%.o: %.F90
40 <        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c ../$<
40 >        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
41  
42   obj/%.o: %.cpp
43 <        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c ../$<
43 >        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
44  
45   MPIobj/%.o: %.cpp
46 <        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c ../$<
46 >        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
47  
48   obj/%.o: %.c
49 <        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c ../$<
49 >        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
50  
51   MPIobj/%.o: %.c
52 <        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c ../$<
52 >        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
53  
54   # Then list what we have to compile
55  
56 < C_FILES = $(DIR)/mpiForceField.c
56 > C_FILES = \
57 >        $(DIR)/mpiForceField.c \
58 >        $(DIR)/fInfo.c
59  
60   CXX_FILES = \
61 +        $(DIR)/Atom.cpp \
62          $(DIR)/Bend.cpp \
63          $(DIR)/BendExtensions.cpp \
64          $(DIR)/Bond.cpp \
65          $(DIR)/BondExtensions.cpp \
61 –        $(DIR)/DipoleTestFF.cpp \
66          $(DIR)/DirectionalAtom.cpp \
67          $(DIR)/DumpWriter.cpp \
68 +        $(DIR)/Exclude.cpp \
69          $(DIR)/InitializeFromFile.cpp \
70 <        $(DIR)/LJ_FF.cpp \
70 >        $(DIR)/LJFF.cpp \
71 >        $(DIR)/EAM_FF.cpp \
72          $(DIR)/SimInfo.cpp \
73          $(DIR)/SimSetup.cpp \
74          $(DIR)/StatWriter.cpp \
75 <        $(DIR)/Symplectic.cpp \
75 >        $(DIR)/Integrator.cpp \
76          $(DIR)/Thermo.cpp \
77          $(DIR)/GhostBend.cpp \
78          $(DIR)/Torsion.cpp \
79          $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
80 <        $(DIR)/TraPPE_ExFF.cpp \
75 <        $(DIR)/TraPPEFF.cpp \
76 <        $(DIR)/Verlet.cpp \
80 >        $(DIR)/DUFF.cpp \
81          $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
82          $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
83          $(DIR)/ForceFields.cpp \
84 <        $(DIR)/mpiSimulation.cpp
84 >        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
85 >        $(DIR)/Molecule.cpp
86  
87  
88   F90_FILES= \
89          $(DIR)/Linux_ifc_machdep.F90 \
90 +        $(DIR)/status_module.F90 \
91          $(DIR)/atype_module.F90 \
86 –        $(DIR)/f_verlet_constrained.F90 \
92          $(DIR)/calc_dipole_dipole.F90 \
93          $(DIR)/calc_reaction_field.F90 \
94          $(DIR)/calc_LJ_FF.F90 \
95 +        $(DIR)/calc_eam.F90 \
96          $(DIR)/calc_sticky_pair.F90 \
97          $(DIR)/do_Forces.F90 \
98          $(DIR)/vector_class.F90 \
# Line 95 | Line 101 | F90_FILES= \
101          $(DIR)/neighborLists.F90 \
102          $(DIR)/calc_gb.F90 \
103          $(DIR)/force_globals.F90 \
104 <        $(DIR)/mpiSimulation_module.F90
104 >        $(DIR)/mpiSimulation_module.F90 \
105 >        $(DIR)/notifyCutoffs.F90
106  
107   DIR:=.
108   C_SRCS   :=     $(C_FILES)
# Line 154 | Line 161 | Make.dep : $(SRCS)
161          echo "# DO NOT DELETE THIS LINE - used by make depend" > Make.dep
162          $(CC) $(DEPFLAGS) -MM $(C_SRCS) $(CXX_SRCS) \
163                  | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' > Make.temp
164 <        cat Make.temp | sed 's/^/obj\//' >> Make.dep
165 <        cat Make.temp | sed 's/^/MPIobj\//' >> Make.dep
164 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/obj\/&/g' >> Make.dep
165 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/MPIobj\/&/g' >> Make.dep
166   #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d obj -f ./Make.ftemp -h *.F90
167   #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d MPIobj -f ./Make.ftemp -h *.F90
168   #       cat Make.ftemp | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' >> Make.dep
# Line 171 | Line 178 | include Make.dep
178  
179   include Make.dep
180  
181 < # known dependencies
181 > obj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
182  
183 < obj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
183 > obj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
184  
185 < obj/vector_class$(O): vector_class.F90
185 > obj/status_module$(O): ./status_module.F90
186  
187 < obj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
187 > obj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
188          obj/$(F_MACH_DEFS)
189  
190 < obj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
190 > obj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
191          obj/$(F_MACH_DEFS)
192  
193 < obj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
193 > obj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
194          obj/$(F_MACH_DEFS) \
195 +        obj/simulation_module$(O) \
196          obj/force_globals$(O)
197  
198 < obj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
198 > obj/calc_eam$(O): ./calc_eam.F90 \
199 >        obj/$(F_MACH_DEFS) \
200 >        obj/atype_module$(O) \
201 >        obj/simulation_module$(O) \
202 >        obj/vector_class$(O) \
203 >        obj/force_globals$(O) \
204 >        obj/status_module$(O)
205 >
206 > obj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
207          obj/$(F_MACH_DEFS) \
208 +        obj/simulation_module$(O) \
209          obj/force_globals$(O)
210  
211 < obj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
211 > obj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
212          obj/$(F_MACH_DEFS) \
213 <        obj/vector_class$(O) \
197 <        obj/calc_sticky_pair$(O) \
198 <        obj/calc_gb$(O)
213 >        obj/vector_class$(O)
214  
215 < obj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
215 > obj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
216          obj/$(F_MACH_DEFS) \
217 +        obj/vector_class$(O) \
218 +        obj/force_globals$(O) \
219          obj/atype_module$(O) \
220          obj/neighborLists$(O)
221  
222 < obj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
222 > obj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
223          obj/$(F_MACH_DEFS) \
224          obj/atype_module$(O) \
225 +        obj/simulation_module$(O) \
226          obj/vector_class$(O) \
227          obj/force_globals$(O)
228  
229 < obj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
229 > obj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
230          obj/$(F_MACH_DEFS) \
231          obj/vector_class$(O) \
232          obj/atype_module$(O) \
233 +        obj/simulation_module$(O) \
234          obj/force_globals$(O)
235  
236 < obj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
236 > obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
237          obj/$(F_MACH_DEFS) \
238          obj/atype_module$(O) \
239 +        obj/simulation_module$(O) \
240          obj/force_globals$(O) \
241          obj/vector_class$(O)
242  
243 < obj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
243 > obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
244          obj/$(F_MACH_DEFS) \
225 –        obj/simulation_module$(O) \
245          obj/atype_module$(O) \
246 +        obj/simulation_module$(O) \
247          obj/neighborLists$(O) \
248          obj/calc_LJ_FF$(O) \
249          obj/calc_sticky_pair$(O) \
250          obj/calc_dipole_dipole$(O) \
251          obj/calc_reaction_field$(O) \
252          obj/calc_gb$(O) \
253 <        obj/force_globals$(O)
253 >        obj/force_globals$(O) \
254 >        obj/vector_class$(O)
255  
256 < obj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
256 > obj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
257          obj/$(F_MACH_DEFS) \
237 –        obj/simulation_module$(O) \
258          obj/atype_module$(O) \
259 +        obj/calc_LJ_FF$(O) \
260 +        obj/calc_eam$(O) \
261 +        obj/calc_dipole_dipole$(O) \
262 +        obj/calc_reaction_field$(O) \
263          obj/do_Forces$(O)
264  
265 < #MPI dependencies:
265 > obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
266 >        obj/$(F_MACH_DEFS) \
267 >        obj/atype_module$(O) \
268 >        obj/simulation_module$(O) \
269 >        obj/calc_sticky_pair$(O) \
270 >        obj/calc_gb$(O) \
271 >        obj/do_Forces$(O) \
272 >        obj/notifyCutoffs$(O)
273  
243 – MPIobj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
274  
245 – MPIobj/vector_class$(O): vector_class.F90
275  
247 – MPIobj/mpiSimulation_module$(O): mpiSimulation_module.F90
276  
277 < MPIobj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
277 >
278 >
279 > #MPI dependencies:
280 >
281 > MPIobj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
282 >
283 > MPIobj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
284 >
285 > MPIobj/status_module$(O): ./status_module.F90
286 >
287 > MPIobj/mpiSimulation_module$(O): ./mpiSimulation_module.F90
288 >
289 > MPIobj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
290          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
291          MPIobj/$(F_MACH_DEFS)
292  
293 < MPIobj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
293 > MPIobj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
294          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
295          MPIobj/mpiSimulation_module$(O)
296  
297 < MPIobj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
297 > MPIobj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
298          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
299 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
300          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
301          MPIobj/force_globals$(O)
302  
303 < MPIobj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
303 > MPIobj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
304          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
305 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
306          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
307          MPIobj/force_globals$(O)
308  
309 < MPIobj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
309 > MPIobj/calc_eam$(O): ./calc_eam.F90 \
310          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
311 +        MPIobj/atype_module$(O) \
312 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
313 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
314          MPIobj/vector_class$(O) \
315 <        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
316 <        MPIobj/calc_gb$(O)
315 >        MPIobj/force_globals$(O) \
316 >        MPIobj/status_module$(O)
317  
318 < MPIobj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
318 >
319 > MPIobj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
320          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
321 +        MPIobj/vector_class$(O)
322 +
323 + MPIobj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
324 +        MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
325 +        MPIobj/atype_module$(O) \
326 +        MPIobj/vector_class$(O) \
327 +        MPIobj/force_globals$(O) \
328          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
329          MPIobj/atype_module$(O) \
330          MPIobj/neighborLists$(O)
331  
332 < MPIobj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
332 > MPIobj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
333          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
334 +        MPIobj/atype_module$(O) \
335 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
336          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
337          MPIobj/atype_module$(O) \
338          MPIobj/vector_class$(O) \
339          MPIobj/force_globals$(O)
340  
341 < MPIobj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
341 > MPIobj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
342          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
343 +        MPIobj/atype_module$(O) \
344 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
345          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
346          MPIobj/vector_class$(O) \
347          MPIobj/atype_module$(O) \
348          MPIobj/force_globals$(O)
349  
350 < MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
350 > MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
351          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
295 –        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
352          MPIobj/atype_module$(O) \
353 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
354 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
355          MPIobj/force_globals$(O) \
356          MPIobj/vector_class$(O)
357  
358 < MPIobj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
358 > MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
359          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
360          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
303 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
361          MPIobj/atype_module$(O) \
362 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
363          MPIobj/neighborLists$(O) \
364          MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
365          MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
366          MPIobj/calc_dipole_dipole$(O) \
367          MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
368          MPIobj/calc_gb$(O) \
369 <        MPIobj/force_globals$(O)
369 >        MPIobj/force_globals$(O) \
370 >        MPIobj/vector_class$(O)
371  
372 < MPIobj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
372 > MPIobj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
373          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
315 –        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
316 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
374          MPIobj/atype_module$(O) \
375 +        MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
376 +        MPIobj/calc_eam$(O) \
377 +        MPIobj/calc_dipole_dipole$(O) \
378 +        MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
379          MPIobj/do_Forces$(O)
380 +
381 + MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
382 +        MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
383 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
384 +        MPIobj/atype_module$(O) \
385 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
386 +        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
387 +        MPIobj/calc_gb$(O) \
388 +        MPIobj/do_Forces$(O) \
389 +        MPIobj/notifyCutoffs$(O)  

Diff Legend

– Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines