ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/group/trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile
(Generate patch)

Comparing:
branches/mmeineke/OOPSE/libmdtools/Makefile (file contents), Revision 377 by mmeineke, Fri Mar 21 17:42:12 2003 UTC vs.
trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile (file contents), Revision 626 by mmeineke, Wed Jul 16 21:30:56 2003 UTC

# Line 12 | Line 12 | DECLARES= -DFRC_PATH="$(OOPSE_HOME)/forcefields"
12  
13   # First do compile-time flags:
14  
15 < DECLARES= -DFRC_PATH="$(OOPSE_HOME)/forcefields"
15 > DECLARES= -DFRC_PATH="$(FORCE_PARAM_DIR)"
16   MPI_DECLARES= -DIS_MPI
17  
18   # include paths starting with "." are all relative to the SUBDIRS!!!
19  
20   INCLUDES= -I.. -I../../libBASS -I$(SPRNG_INC)
21 < MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPICH_INC)/mpi2c++ -I$(MPI_F90_MODS)
21 > MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPI_F90_MODS)
22  
23   CFLAGS=$(CFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES) $(MPI_INCLUDES)
24   CXXFLAGS=$(CXXFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES)
# Line 29 | Line 29 | MPI_FFLAGS=$(FFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
29   MPI_CXXFLAGS=$(CXXFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
30   MPI_FFLAGS=$(FFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
31  
32 + SRC_DIR := $(PWD)
33 +
34   # Then do the compile rules:
35  
36   obj/%.o: %.F90
37 <        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  ../$<
37 >        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  $(SRC_DIR)/$<
38  
39   MPIobj/%.o: %.F90
40 <        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c ../$<
40 >        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
41  
42   obj/%.o: %.cpp
43 <        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c ../$<
43 >        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
44  
45   MPIobj/%.o: %.cpp
46 <        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c ../$<
46 >        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
47  
48   obj/%.o: %.c
49 <        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c ../$<
49 >        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
50  
51   MPIobj/%.o: %.c
52 <        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c ../$<
52 >        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
53  
54   # Then list what we have to compile
55  
56   C_FILES = $(DIR)/mpiForceField.c
57  
58   CXX_FILES = \
59 +        $(DIR)/Atom.cpp \
60          $(DIR)/Bend.cpp \
61          $(DIR)/BendExtensions.cpp \
62          $(DIR)/Bond.cpp \
63          $(DIR)/BondExtensions.cpp \
61 –        $(DIR)/DipoleTestFF.cpp \
64          $(DIR)/DirectionalAtom.cpp \
65          $(DIR)/DumpWriter.cpp \
66 +        $(DIR)/Exclude.cpp \
67          $(DIR)/InitializeFromFile.cpp \
68 <        $(DIR)/LJ_FF.cpp \
68 >        $(DIR)/LJFF.cpp \
69          $(DIR)/SimInfo.cpp \
70          $(DIR)/SimSetup.cpp \
71          $(DIR)/StatWriter.cpp \
72 <        $(DIR)/Symplectic.cpp \
72 >        $(DIR)/Integrator.cpp \
73          $(DIR)/Thermo.cpp \
74          $(DIR)/GhostBend.cpp \
75          $(DIR)/Torsion.cpp \
76          $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
77 <        $(DIR)/TraPPE_ExFF.cpp \
75 <        $(DIR)/TraPPEFF.cpp \
76 <        $(DIR)/Verlet.cpp \
77 >        $(DIR)/DUFF.cpp \
78          $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
79          $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
80          $(DIR)/ForceFields.cpp \
81 <        $(DIR)/mpiSimulation.cpp
81 >        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
82 >        $(DIR)/Molecule.cpp \
83 >        $(DIR)/NVT.cpp \
84 >        $(DIR)/NPTi.cpp \
85 >        $(DIR)/NPTf.cpp \
86 >        $(DIR)/NPTim.cpp \
87 >        $(DIR)/NPTfm.cpp
88  
89  
90   F90_FILES= \
91          $(DIR)/Linux_ifc_machdep.F90 \
92          $(DIR)/atype_module.F90 \
86 –        $(DIR)/f_verlet_constrained.F90 \
93          $(DIR)/calc_dipole_dipole.F90 \
94          $(DIR)/calc_reaction_field.F90 \
95          $(DIR)/calc_LJ_FF.F90 \
# Line 95 | Line 101 | F90_FILES= \
101          $(DIR)/neighborLists.F90 \
102          $(DIR)/calc_gb.F90 \
103          $(DIR)/force_globals.F90 \
104 <        $(DIR)/mpiSimulation_module.F90
104 >        $(DIR)/mpiSimulation_module.F90 \
105 >        $(DIR)/notifyCutoffs.F90
106  
107   DIR:=.
108   C_SRCS   :=     $(C_FILES)
109   CXX_SRCS :=     $(CXX_FILES)
110   F90_SRCS :=     $(F90_FILES)
111 + SRCS     :=     $(C_SRCS) $(CXX_SRCS) $(F90_SRCS)
112  
113   DIR:=obj
114   C_OBJS   :=     $(C_FILES:.c=.o)
# Line 120 | Line 128 | all: libmdtools.a libmdtools_MPI.a
128  
129   # Possible make targets:
130  
131 < all: libmdtools.a libmdtools_MPI.a
131 > all: Make.dep libmdtools.a libmdtools_MPI.a
132  
133   libmdtools.a: $(OBJS)
134          $(RM) $@
# Line 144 | Line 152 | distclean : dummy
152          for i in $(LIBSUBDIRS); do \
153            (cd $$i; $(RM) *.o *.mod) || exit 1; \
154          done
155 <        $(RM) libmdtools.a libmdtools_MPI.a *.o *.mod *~ Make.temp Make.ftemp
155 >        $(RM) libmdtools.a libmdtools_MPI.a *.o *.mod *~ Make.temp Make.ftemp Make.dep
156  
157 < depend :
157 > depend : Make.dep
158 >
159 > Make.dep : $(SRCS)
160          echo "Only C dependencies are made automagically!"
161          echo "# DO NOT DELETE THIS LINE - used by make depend" > Make.dep
162          $(CC) $(DEPFLAGS) -MM $(C_SRCS) $(CXX_SRCS) \
163                  | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' > Make.temp
164 <        cat Make.temp | sed 's/^/obj\//' >> Make.dep
165 <        cat Make.temp | sed 's/^/MPIobj\//' >> Make.dep
166 < #       ../utils/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d obj -f ./Make.ftemp -h *.F90
167 < #       ../utils/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d MPIobj -f ./Make.ftemp -h *.F90
164 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/obj\/&/g' >> Make.dep
165 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/MPIobj\/&/g' >> Make.dep
166 > #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d obj -f ./Make.ftemp -h *.F90
167 > #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d MPIobj -f ./Make.ftemp -h *.F90
168   #       cat Make.ftemp | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' >> Make.dep
169          $(RM) Make.ftemp Make.temp
170  
# Line 168 | Line 178 | include Make.dep
178  
179   include Make.dep
180  
181 < # known dependencies
181 > obj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
182  
183 < obj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
183 > obj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
184  
185 < obj/vector_class$(O): vector_class.F90
176 <
177 < obj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
185 > obj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
186          obj/$(F_MACH_DEFS)
187  
188 < obj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
188 > obj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
189          obj/$(F_MACH_DEFS)
190  
191 < obj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
191 > obj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
192          obj/$(F_MACH_DEFS) \
193 +        obj/simulation_module$(O) \
194          obj/force_globals$(O)
195  
196 < obj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
196 > obj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
197          obj/$(F_MACH_DEFS) \
198 +        obj/simulation_module$(O) \
199          obj/force_globals$(O)
200  
201 < obj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
201 > obj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
202          obj/$(F_MACH_DEFS) \
203 <        obj/vector_class$(O) \
194 <        obj/calc_sticky_pair$(O) \
195 <        obj/calc_gb$(O)
203 >        obj/vector_class$(O)
204  
205 < obj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
205 > obj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
206          obj/$(F_MACH_DEFS) \
207 +        obj/vector_class$(O) \
208 +        obj/force_globals$(O) \
209          obj/atype_module$(O) \
210          obj/neighborLists$(O)
211  
212 < obj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
212 > obj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
213          obj/$(F_MACH_DEFS) \
214          obj/atype_module$(O) \
215 +        obj/simulation_module$(O) \
216          obj/vector_class$(O) \
217          obj/force_globals$(O)
218  
219 < obj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
219 > obj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
220          obj/$(F_MACH_DEFS) \
221          obj/vector_class$(O) \
222          obj/atype_module$(O) \
223 +        obj/simulation_module$(O) \
224          obj/force_globals$(O)
225  
226 < obj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
226 > obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
227          obj/$(F_MACH_DEFS) \
228          obj/atype_module$(O) \
229 +        obj/simulation_module$(O) \
230          obj/force_globals$(O) \
231          obj/vector_class$(O)
232  
233 < obj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
233 > obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
234          obj/$(F_MACH_DEFS) \
222 –        obj/simulation_module$(O) \
235          obj/atype_module$(O) \
236 +        obj/simulation_module$(O) \
237          obj/neighborLists$(O) \
238          obj/calc_LJ_FF$(O) \
239          obj/calc_sticky_pair$(O) \
240          obj/calc_dipole_dipole$(O) \
241          obj/calc_reaction_field$(O) \
242          obj/calc_gb$(O) \
243 <        obj/force_globals$(O)
243 >        obj/force_globals$(O) \
244 >        obj/vector_class$(O)
245  
246 < obj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
246 > obj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
247          obj/$(F_MACH_DEFS) \
234 –        obj/simulation_module$(O) \
248          obj/atype_module$(O) \
249 +        obj/calc_LJ_FF$(O) \
250 +        obj/calc_dipole_dipole$(O) \
251 +        obj/calc_reaction_field$(O) \
252          obj/do_Forces$(O)
253  
254 + obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
255 +        obj/$(F_MACH_DEFS) \
256 +        obj/atype_module$(O) \
257 +        obj/simulation_module$(O) \
258 +        obj/calc_sticky_pair$(O) \
259 +        obj/calc_gb$(O) \
260 +        obj/do_Forces$(O) \
261 +        obj/notifyCutoffs$(O)
262 +
263 +
264 +
265 +
266 +
267 +
268   #MPI dependencies:
269  
270 < MPIobj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
270 > MPIobj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
271  
272 < MPIobj/vector_class$(O): vector_class.F90
272 > MPIobj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
273  
274 < MPIobj/mpiSimulation_module$(O): mpiSimulation_module.F90
274 > MPIobj/mpiSimulation_module$(O): ./mpiSimulation_module.F90
275  
276 < MPIobj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
276 > MPIobj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
277          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
278          MPIobj/$(F_MACH_DEFS)
279  
280 < MPIobj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
280 > MPIobj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
281          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
282          MPIobj/mpiSimulation_module$(O)
283  
284 < MPIobj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
284 > MPIobj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
285          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
286 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
287          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
288          MPIobj/force_globals$(O)
289  
290 < MPIobj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
290 > MPIobj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
291          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
292 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
293          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
294          MPIobj/force_globals$(O)
295  
296 < MPIobj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
296 > MPIobj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
297          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
298 <        MPIobj/vector_class$(O) \
267 <        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
268 <        MPIobj/calc_gb$(O)
298 >        MPIobj/vector_class$(O)
299  
300 < MPIobj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
300 > MPIobj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
301          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
302 +        MPIobj/atype_module$(O) \
303 +        MPIobj/vector_class$(O) \
304 +        MPIobj/force_globals$(O) \
305          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
306          MPIobj/atype_module$(O) \
307          MPIobj/neighborLists$(O)
308  
309 < MPIobj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
309 > MPIobj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
310          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
311 +        MPIobj/atype_module$(O) \
312 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
313          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
314          MPIobj/atype_module$(O) \
315          MPIobj/vector_class$(O) \
316          MPIobj/force_globals$(O)
317  
318 < MPIobj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
318 > MPIobj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
319          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
320 +        MPIobj/atype_module$(O) \
321 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
322          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
323          MPIobj/vector_class$(O) \
324          MPIobj/atype_module$(O) \
325          MPIobj/force_globals$(O)
326  
327 < MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
327 > MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
328          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
292 –        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
329          MPIobj/atype_module$(O) \
330 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
331 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
332          MPIobj/force_globals$(O) \
333          MPIobj/vector_class$(O)
334  
335 < MPIobj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
335 > MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
336          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
337          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
300 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
338          MPIobj/atype_module$(O) \
339 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
340          MPIobj/neighborLists$(O) \
341          MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
342          MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
343          MPIobj/calc_dipole_dipole$(O) \
344          MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
345          MPIobj/calc_gb$(O) \
346 <        MPIobj/force_globals$(O)
346 >        MPIobj/force_globals$(O) \
347 >        MPIobj/vector_class$(O)
348  
349 < MPIobj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
349 > MPIobj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
350          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
312 –        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
313 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
351          MPIobj/atype_module$(O) \
352 +        MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
353 +        MPIobj/calc_dipole_dipole$(O) \
354 +        MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
355          MPIobj/do_Forces$(O)
356  
357 <
357 > MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
358 >        MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
359 >        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
360 >        MPIobj/atype_module$(O) \
361 >        MPIobj/simulation_module$(O) \
362 >        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
363 >        MPIobj/calc_gb$(O) \
364 >        MPIobj/do_Forces$(O) \
365 >        MPIobj/notifyCutoffs$(O)  

Diff Legend

– Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines