ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/group/trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile (file contents):
Revision 379 by mmeineke, Fri Mar 21 17:52:35 2003 UTC vs.
Revision 670 by mmeineke, Thu Aug 7 21:47:18 2003 UTC

# Line 12 | Line 12 | DECLARES= -DFRC_PATH="$(OOPSE_HOME)/forcefields"
12  
13   # First do compile-time flags:
14  
15 < DECLARES= -DFRC_PATH="$(OOPSE_HOME)/forcefields"
15 > DECLARES= -DFRC_PATH="$(FORCE_PARAM_DIR)"
16   MPI_DECLARES= -DIS_MPI
17  
18   # include paths starting with "." are all relative to the SUBDIRS!!!
19  
20   INCLUDES= -I.. -I../../libBASS -I$(SPRNG_INC)
21 < MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPICH_INC)/mpi2c++ -I$(MPI_F90_MODS)
21 > MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPI_F90_MODS)
22  
23   CFLAGS=$(CFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES) $(MPI_INCLUDES)
24   CXXFLAGS=$(CXXFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES)
25 < FFLAGS=$(FFLAGS_C) $(DECLARES)
25 > FFLAGS=$(FFLAGS_C)
26   DEPFLAGS=$(CFLAGS_C) -I. -I../libBASS -I$(SPRNG_INC) $(MPI_INCLUDES)
27  
28   MPI_CFLAGS=$(CFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
29   MPI_CXXFLAGS=$(CXXFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
30   MPI_FFLAGS=$(FFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
31  
32 + SRC_DIR := $(PWD)
33 +
34   # Then do the compile rules:
35  
36   obj/%.o: %.F90
37 <        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  ../$<
37 >        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  $(SRC_DIR)/$<
38  
39   MPIobj/%.o: %.F90
40 <        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c ../$<
40 >        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
41  
42   obj/%.o: %.cpp
43 <        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c ../$<
43 >        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
44  
45   MPIobj/%.o: %.cpp
46 <        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c ../$<
46 >        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
47  
48   obj/%.o: %.c
49 <        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c ../$<
49 >        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
50  
51   MPIobj/%.o: %.c
52 <        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c ../$<
52 >        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
53  
54   # Then list what we have to compile
55  
56 < C_FILES = $(DIR)/mpiForceField.c
56 > C_FILES = \
57 >        $(DIR)/mpiForceField.c \
58 >        $(DIR)/fInfo.c
59  
60   CXX_FILES = \
61 +        $(DIR)/Atom.cpp \
62          $(DIR)/Bend.cpp \
63          $(DIR)/BendExtensions.cpp \
64          $(DIR)/Bond.cpp \
65          $(DIR)/BondExtensions.cpp \
61 –        $(DIR)/DipoleTestFF.cpp \
66          $(DIR)/DirectionalAtom.cpp \
67          $(DIR)/DumpWriter.cpp \
68 +        $(DIR)/Exclude.cpp \
69          $(DIR)/InitializeFromFile.cpp \
70 <        $(DIR)/LJ_FF.cpp \
70 >        $(DIR)/LJFF.cpp \
71 >        $(DIR)/EAM_FF.cpp \
72          $(DIR)/SimInfo.cpp \
73          $(DIR)/SimSetup.cpp \
74          $(DIR)/StatWriter.cpp \
75 <        $(DIR)/Symplectic.cpp \
75 >        $(DIR)/Integrator.cpp \
76          $(DIR)/Thermo.cpp \
77          $(DIR)/GhostBend.cpp \
78          $(DIR)/Torsion.cpp \
79          $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
80 <        $(DIR)/TraPPE_ExFF.cpp \
75 <        $(DIR)/TraPPEFF.cpp \
76 <        $(DIR)/Verlet.cpp \
80 >        $(DIR)/DUFF.cpp \
81          $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
82          $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
83          $(DIR)/ForceFields.cpp \
84 <        $(DIR)/mpiSimulation.cpp
84 >        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
85 >        $(DIR)/Molecule.cpp \
86 >        $(DIR)/SimState.cpp
87 >        $(DIR)/ZConstraint.cpp \
88 >        $(DIR)/ZConsWriter.cpp \
89 >        $(DIR)/GenericData.cpp
90  
82 –
91   F90_FILES= \
92          $(DIR)/Linux_ifc_machdep.F90 \
93 +        $(DIR)/status_module.F90 \
94          $(DIR)/atype_module.F90 \
86 –        $(DIR)/f_verlet_constrained.F90 \
95          $(DIR)/calc_dipole_dipole.F90 \
96          $(DIR)/calc_reaction_field.F90 \
97          $(DIR)/calc_LJ_FF.F90 \
98 +        $(DIR)/calc_eam.F90 \
99          $(DIR)/calc_sticky_pair.F90 \
100          $(DIR)/do_Forces.F90 \
101          $(DIR)/vector_class.F90 \
# Line 95 | Line 104 | F90_FILES= \
104          $(DIR)/neighborLists.F90 \
105          $(DIR)/calc_gb.F90 \
106          $(DIR)/force_globals.F90 \
107 <        $(DIR)/mpiSimulation_module.F90
107 >        $(DIR)/mpiSimulation_module.F90 \
108 >        $(DIR)/notifyCutoffs.F90
109  
110   DIR:=.
111   C_SRCS   :=     $(C_FILES)
112   CXX_SRCS :=     $(CXX_FILES)
113   F90_SRCS :=     $(F90_FILES)
114 + SRCS     :=     $(C_SRCS) $(CXX_SRCS) $(F90_SRCS)
115  
116   DIR:=obj
117   C_OBJS   :=     $(C_FILES:.c=.o)
# Line 144 | Line 155 | distclean : dummy
155          for i in $(LIBSUBDIRS); do \
156            (cd $$i; $(RM) *.o *.mod) || exit 1; \
157          done
158 <        $(RM) libmdtools.a libmdtools_MPI.a *.o *.mod *~ Make.temp Make.ftemp
158 >        $(RM) libmdtools.a libmdtools_MPI.a *.o *.mod *~ Make.temp Make.ftemp Make.dep
159  
160 < Make.dep: depend
160 > depend : Make.dep
161  
162 < depend :
162 > Make.dep : $(SRCS)
163          echo "Only C dependencies are made automagically!"
164          echo "# DO NOT DELETE THIS LINE - used by make depend" > Make.dep
165          $(CC) $(DEPFLAGS) -MM $(C_SRCS) $(CXX_SRCS) \
166                  | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' > Make.temp
167 <        cat Make.temp | sed 's/^/obj\//' >> Make.dep
168 <        cat Make.temp | sed 's/^/MPIobj\//' >> Make.dep
169 < #       ../utils/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d obj -f ./Make.ftemp -h *.F90
170 < #       ../utils/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d MPIobj -f ./Make.ftemp -h *.F90
167 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/obj\/&/g' >> Make.dep
168 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/MPIobj\/&/g' >> Make.dep
169 > #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d obj -f ./Make.ftemp -h *.F90
170 > #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d MPIobj -f ./Make.ftemp -h *.F90
171   #       cat Make.ftemp | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' >> Make.dep
172          $(RM) Make.ftemp Make.temp
173  
# Line 170 | Line 181 | include Make.dep
181  
182   include Make.dep
183  
184 < # known dependencies
184 > obj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
185  
186 < obj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
186 > obj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
187  
188 < obj/vector_class$(O): vector_class.F90
188 > obj/status_module$(O): ./status_module.F90
189  
190 < obj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
190 > obj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
191          obj/$(F_MACH_DEFS)
192  
193 < obj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
193 > obj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
194          obj/$(F_MACH_DEFS)
195  
196 < obj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
196 > obj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
197          obj/$(F_MACH_DEFS) \
198 +        obj/simulation_module$(O) \
199          obj/force_globals$(O)
200  
201 < obj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
201 > obj/calc_eam$(O): ./calc_eam.F90 \
202          obj/$(F_MACH_DEFS) \
203 +        obj/atype_module$(O) \
204 +        obj/simulation_module$(O) \
205 +        obj/vector_class$(O) \
206 +        obj/force_globals$(O) \
207 +        obj/status_module$(O)
208 +
209 + obj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
210 +        obj/$(F_MACH_DEFS) \
211 +        obj/simulation_module$(O) \
212          obj/force_globals$(O)
213  
214 < obj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
214 > obj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
215          obj/$(F_MACH_DEFS) \
216 <        obj/vector_class$(O) \
196 <        obj/calc_sticky_pair$(O) \
197 <        obj/calc_gb$(O)
216 >        obj/vector_class$(O)
217  
218 < obj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
218 > obj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
219          obj/$(F_MACH_DEFS) \
220 +        obj/vector_class$(O) \
221 +        obj/force_globals$(O) \
222          obj/atype_module$(O) \
223          obj/neighborLists$(O)
224  
225 < obj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
225 > obj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
226          obj/$(F_MACH_DEFS) \
227          obj/atype_module$(O) \
228 +        obj/simulation_module$(O) \
229          obj/vector_class$(O) \
230          obj/force_globals$(O)
231  
232 < obj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
232 > obj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
233          obj/$(F_MACH_DEFS) \
234          obj/vector_class$(O) \
235          obj/atype_module$(O) \
236 +        obj/simulation_module$(O) \
237          obj/force_globals$(O)
238  
239 < obj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
239 > obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
240          obj/$(F_MACH_DEFS) \
241          obj/atype_module$(O) \
242 +        obj/simulation_module$(O) \
243          obj/force_globals$(O) \
244          obj/vector_class$(O)
245  
246 < obj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
246 > obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
247          obj/$(F_MACH_DEFS) \
224 –        obj/simulation_module$(O) \
248          obj/atype_module$(O) \
249 +        obj/simulation_module$(O) \
250          obj/neighborLists$(O) \
251          obj/calc_LJ_FF$(O) \
252          obj/calc_sticky_pair$(O) \
253          obj/calc_dipole_dipole$(O) \
254          obj/calc_reaction_field$(O) \
255          obj/calc_gb$(O) \
256 <        obj/force_globals$(O)
256 >        obj/force_globals$(O) \
257 >        obj/vector_class$(O)
258  
259 < obj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
259 > obj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
260          obj/$(F_MACH_DEFS) \
236 –        obj/simulation_module$(O) \
261          obj/atype_module$(O) \
262 +        obj/calc_LJ_FF$(O) \
263 +        obj/calc_eam$(O) \
264 +        obj/calc_dipole_dipole$(O) \
265 +        obj/calc_reaction_field$(O) \
266          obj/do_Forces$(O)
267  
268 + obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
269 +        obj/$(F_MACH_DEFS) \
270 +        obj/atype_module$(O) \
271 +        obj/simulation_module$(O) \
272 +        obj/calc_sticky_pair$(O) \
273 +        obj/calc_gb$(O) \
274 +        obj/do_Forces$(O) \
275 +        obj/notifyCutoffs$(O)
276 +
277 +
278 +
279 +
280 +
281 +
282   #MPI dependencies:
283  
284 < MPIobj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
284 > MPIobj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
285  
286 < MPIobj/vector_class$(O): vector_class.F90
286 > MPIobj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
287  
288 < MPIobj/mpiSimulation_module$(O): mpiSimulation_module.F90
288 > MPIobj/status_module$(O): ./status_module.F90
289  
290 < MPIobj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
290 > MPIobj/mpiSimulation_module$(O): ./mpiSimulation_module.F90
291 >
292 > MPIobj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
293          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
294          MPIobj/$(F_MACH_DEFS)
295  
296 < MPIobj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
296 > MPIobj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
297          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
298          MPIobj/mpiSimulation_module$(O)
299  
300 < MPIobj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
300 > MPIobj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
301          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
302 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
303          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
304          MPIobj/force_globals$(O)
305  
306 < MPIobj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
306 > MPIobj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
307          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
308 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
309          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
310          MPIobj/force_globals$(O)
311  
312 < MPIobj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
312 > MPIobj/calc_eam$(O): ./calc_eam.F90 \
313          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
314 +        MPIobj/atype_module$(O) \
315 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
316 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
317          MPIobj/vector_class$(O) \
318 <        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
319 <        MPIobj/calc_gb$(O)
318 >        MPIobj/force_globals$(O) \
319 >        MPIobj/status_module$(O)
320  
321 < MPIobj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
321 >
322 > MPIobj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
323          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
324 +        MPIobj/vector_class$(O)
325 +
326 + MPIobj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
327 +        MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
328 +        MPIobj/atype_module$(O) \
329 +        MPIobj/vector_class$(O) \
330 +        MPIobj/force_globals$(O) \
331          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
332          MPIobj/atype_module$(O) \
333          MPIobj/neighborLists$(O)
334  
335 < MPIobj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
335 > MPIobj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
336          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
337 +        MPIobj/atype_module$(O) \
338 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
339          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
340          MPIobj/atype_module$(O) \
341          MPIobj/vector_class$(O) \
342          MPIobj/force_globals$(O)
343  
344 < MPIobj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
344 > MPIobj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
345          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
346 +        MPIobj/atype_module$(O) \
347 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
348          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
349          MPIobj/vector_class$(O) \
350          MPIobj/atype_module$(O) \
351          MPIobj/force_globals$(O)
352  
353 < MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
353 > MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
354          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
294 –        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
355          MPIobj/atype_module$(O) \
356 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
357 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
358          MPIobj/force_globals$(O) \
359          MPIobj/vector_class$(O)
360  
361 < MPIobj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
361 > MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
362          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
363          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
302 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
364          MPIobj/atype_module$(O) \
365 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
366          MPIobj/neighborLists$(O) \
367          MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
368          MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
369          MPIobj/calc_dipole_dipole$(O) \
370          MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
371          MPIobj/calc_gb$(O) \
372 <        MPIobj/force_globals$(O)
372 >        MPIobj/force_globals$(O) \
373 >        MPIobj/vector_class$(O)
374  
375 < MPIobj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
375 > MPIobj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
376          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
314 –        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
315 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
377          MPIobj/atype_module$(O) \
378 +        MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
379 +        MPIobj/calc_eam$(O) \
380 +        MPIobj/calc_dipole_dipole$(O) \
381 +        MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
382          MPIobj/do_Forces$(O)
383  
384 <
384 > MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
385 >        MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
386 >        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
387 >        MPIobj/atype_module$(O) \
388 >        MPIobj/simulation_module$(O) \
389 >        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
390 >        MPIobj/calc_gb$(O) \
391 >        MPIobj/do_Forces$(O) \
392 >        MPIobj/notifyCutoffs$(O)  

Diff Legend

– Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines