ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/group/trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile (file contents):
Revision 379 by mmeineke, Fri Mar 21 17:52:35 2003 UTC vs.
Revision 738 by tim, Tue Sep 2 14:30:12 2003 UTC

# Line 12 | Line 12 | DECLARES= -DFRC_PATH="$(OOPSE_HOME)/forcefields"
12  
13   # First do compile-time flags:
14  
15 < DECLARES= -DFRC_PATH="$(OOPSE_HOME)/forcefields"
15 > DECLARES= -DFRC_PATH="$(FORCE_PARAM_DIR)"
16   MPI_DECLARES= -DIS_MPI
17  
18   # include paths starting with "." are all relative to the SUBDIRS!!!
19  
20   INCLUDES= -I.. -I../../libBASS -I$(SPRNG_INC)
21 < MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPICH_INC)/mpi2c++ -I$(MPI_F90_MODS)
21 > MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPI_F90_MODS)
22  
23   CFLAGS=$(CFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES) $(MPI_INCLUDES)
24   CXXFLAGS=$(CXXFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES)
25 < FFLAGS=$(FFLAGS_C) $(DECLARES)
25 > FFLAGS=$(FFLAGS_C)
26   DEPFLAGS=$(CFLAGS_C) -I. -I../libBASS -I$(SPRNG_INC) $(MPI_INCLUDES)
27  
28   MPI_CFLAGS=$(CFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
29   MPI_CXXFLAGS=$(CXXFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
30   MPI_FFLAGS=$(FFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
31  
32 + SRC_DIR := $(PWD)
33 +
34   # Then do the compile rules:
35  
36   obj/%.o: %.F90
37 <        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  ../$<
37 >        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  $(SRC_DIR)/$<
38  
39   MPIobj/%.o: %.F90
40 <        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c ../$<
40 >        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
41  
42   obj/%.o: %.cpp
43 <        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c ../$<
43 >        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
44  
45   MPIobj/%.o: %.cpp
46 <        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c ../$<
46 >        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
47  
48   obj/%.o: %.c
49 <        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c ../$<
49 >        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
50  
51   MPIobj/%.o: %.c
52 <        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c ../$<
52 >        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
53  
54   # Then list what we have to compile
55  
56 < C_FILES = $(DIR)/mpiForceField.c
56 > C_FILES = \
57 >        $(DIR)/mpiForceField.c \
58 >        $(DIR)/fInfo.c
59  
60   CXX_FILES = \
61 +        $(DIR)/Atom.cpp \
62          $(DIR)/Bend.cpp \
63          $(DIR)/BendExtensions.cpp \
64          $(DIR)/Bond.cpp \
65          $(DIR)/BondExtensions.cpp \
61 –        $(DIR)/DipoleTestFF.cpp \
66          $(DIR)/DirectionalAtom.cpp \
67          $(DIR)/DumpWriter.cpp \
68 +        $(DIR)/Exclude.cpp \
69          $(DIR)/InitializeFromFile.cpp \
70 <        $(DIR)/LJ_FF.cpp \
70 >        $(DIR)/LJFF.cpp \
71 >        $(DIR)/EAM_FF.cpp \
72          $(DIR)/SimInfo.cpp \
73          $(DIR)/SimSetup.cpp \
74          $(DIR)/StatWriter.cpp \
75 <        $(DIR)/Symplectic.cpp \
75 >        $(DIR)/Integrator.cpp \
76          $(DIR)/Thermo.cpp \
77          $(DIR)/GhostBend.cpp \
78          $(DIR)/Torsion.cpp \
79          $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
80 <        $(DIR)/TraPPE_ExFF.cpp \
75 <        $(DIR)/TraPPEFF.cpp \
76 <        $(DIR)/Verlet.cpp \
80 >        $(DIR)/DUFF.cpp \
81          $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
82          $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
83          $(DIR)/ForceFields.cpp \
84 <        $(DIR)/mpiSimulation.cpp
84 >        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
85 >        $(DIR)/Molecule.cpp \
86 >        $(DIR)/SimState.cpp \
87 >        $(DIR)/ZConstraint.cpp \
88 >        $(DIR)/ZConsWriter.cpp \
89 >        $(DIR)/GenericData.cpp \
90 >        $(DIR)/ZConsReader.cpp
91  
82 –
92   F90_FILES= \
93          $(DIR)/Linux_ifc_machdep.F90 \
94 +        $(DIR)/status_module.F90 \
95          $(DIR)/atype_module.F90 \
86 –        $(DIR)/f_verlet_constrained.F90 \
96          $(DIR)/calc_dipole_dipole.F90 \
97          $(DIR)/calc_reaction_field.F90 \
98          $(DIR)/calc_LJ_FF.F90 \
99 +        $(DIR)/calc_eam.F90 \
100          $(DIR)/calc_sticky_pair.F90 \
101          $(DIR)/do_Forces.F90 \
102          $(DIR)/vector_class.F90 \
# Line 95 | Line 105 | F90_FILES= \
105          $(DIR)/neighborLists.F90 \
106          $(DIR)/calc_gb.F90 \
107          $(DIR)/force_globals.F90 \
108 <        $(DIR)/mpiSimulation_module.F90
108 >        $(DIR)/mpiSimulation_module.F90 \
109 >        $(DIR)/notifyCutoffs.F90
110  
111   DIR:=.
112   C_SRCS   :=     $(C_FILES)
113   CXX_SRCS :=     $(CXX_FILES)
114   F90_SRCS :=     $(F90_FILES)
115 + SRCS     :=     $(C_SRCS) $(CXX_SRCS) $(F90_SRCS)
116  
117   DIR:=obj
118   C_OBJS   :=     $(C_FILES:.c=.o)
# Line 144 | Line 156 | distclean : dummy
156          for i in $(LIBSUBDIRS); do \
157            (cd $$i; $(RM) *.o *.mod) || exit 1; \
158          done
159 <        $(RM) libmdtools.a libmdtools_MPI.a *.o *.mod *~ Make.temp Make.ftemp
159 >        $(RM) libmdtools.a libmdtools_MPI.a *.o *.mod *~ Make.temp Make.ftemp Make.dep
160  
161 < Make.dep: depend
161 > depend : Make.dep
162  
163 < depend :
163 > Make.dep : $(SRCS)
164          echo "Only C dependencies are made automagically!"
165          echo "# DO NOT DELETE THIS LINE - used by make depend" > Make.dep
166 <        $(CC) $(DEPFLAGS) -MM $(C_SRCS) $(CXX_SRCS) \
166 >        $(CC) $(DEPFLAGS) -MM $(C_SRCS) \
167                  | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' > Make.temp
168 <        cat Make.temp | sed 's/^/obj\//' >> Make.dep
169 <        cat Make.temp | sed 's/^/MPIobj\//' >> Make.dep
170 < #       ../utils/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d obj -f ./Make.ftemp -h *.F90
171 < #       ../utils/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d MPIobj -f ./Make.ftemp -h *.F90
168 >        $(CXX) $(DEPFLAGS) -MM $(CXX_SRCS) \
169 >                | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' >> Make.temp
170 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/obj\/&/g' >> Make.dep
171 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/MPIobj\/&/g' >> Make.dep
172 > #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d obj -f ./Make.ftemp -h *.F90
173 > #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d MPIobj -f ./Make.ftemp -h *.F90
174   #       cat Make.ftemp | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' >> Make.dep
175          $(RM) Make.ftemp Make.temp
176  
# Line 170 | Line 184 | include Make.dep
184  
185   include Make.dep
186  
187 < # known dependencies
187 > obj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
188  
189 < obj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
189 > obj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
190  
191 < obj/vector_class$(O): vector_class.F90
191 > obj/status_module$(O): ./status_module.F90
192  
193 < obj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
193 > obj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
194          obj/$(F_MACH_DEFS)
195  
196 < obj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
196 > obj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
197          obj/$(F_MACH_DEFS)
198  
199 < obj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
199 > obj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
200          obj/$(F_MACH_DEFS) \
201 +        obj/simulation_module$(O) \
202          obj/force_globals$(O)
203  
204 < obj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
204 > obj/calc_eam$(O): ./calc_eam.F90 \
205          obj/$(F_MACH_DEFS) \
206 +        obj/atype_module$(O) \
207 +        obj/simulation_module$(O) \
208 +        obj/vector_class$(O) \
209 +        obj/force_globals$(O) \
210 +        obj/status_module$(O)
211 +
212 + obj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
213 +        obj/$(F_MACH_DEFS) \
214 +        obj/simulation_module$(O) \
215          obj/force_globals$(O)
216  
217 < obj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
217 > obj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
218          obj/$(F_MACH_DEFS) \
219 <        obj/vector_class$(O) \
196 <        obj/calc_sticky_pair$(O) \
197 <        obj/calc_gb$(O)
219 >        obj/vector_class$(O)
220  
221 < obj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
221 > obj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
222          obj/$(F_MACH_DEFS) \
223 +        obj/vector_class$(O) \
224 +        obj/force_globals$(O) \
225          obj/atype_module$(O) \
226          obj/neighborLists$(O)
227  
228 < obj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
228 > obj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
229          obj/$(F_MACH_DEFS) \
230          obj/atype_module$(O) \
231 +        obj/simulation_module$(O) \
232          obj/vector_class$(O) \
233          obj/force_globals$(O)
234  
235 < obj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
235 > obj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
236          obj/$(F_MACH_DEFS) \
237          obj/vector_class$(O) \
238          obj/atype_module$(O) \
239 +        obj/simulation_module$(O) \
240          obj/force_globals$(O)
241  
242 < obj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
242 > obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
243          obj/$(F_MACH_DEFS) \
244          obj/atype_module$(O) \
245 +        obj/simulation_module$(O) \
246          obj/force_globals$(O) \
247          obj/vector_class$(O)
248  
249 < obj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
249 > obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
250          obj/$(F_MACH_DEFS) \
224 –        obj/simulation_module$(O) \
251          obj/atype_module$(O) \
252 +        obj/simulation_module$(O) \
253          obj/neighborLists$(O) \
254          obj/calc_LJ_FF$(O) \
255          obj/calc_sticky_pair$(O) \
256          obj/calc_dipole_dipole$(O) \
257          obj/calc_reaction_field$(O) \
258          obj/calc_gb$(O) \
259 <        obj/force_globals$(O)
259 >        obj/force_globals$(O) \
260 >        obj/vector_class$(O)
261  
262 < obj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
262 > obj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
263          obj/$(F_MACH_DEFS) \
236 –        obj/simulation_module$(O) \
264          obj/atype_module$(O) \
265 +        obj/calc_LJ_FF$(O) \
266 +        obj/calc_eam$(O) \
267 +        obj/calc_dipole_dipole$(O) \
268 +        obj/calc_reaction_field$(O) \
269          obj/do_Forces$(O)
270  
271 + obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
272 +        obj/$(F_MACH_DEFS) \
273 +        obj/atype_module$(O) \
274 +        obj/simulation_module$(O) \
275 +        obj/calc_sticky_pair$(O) \
276 +        obj/calc_gb$(O) \
277 +        obj/do_Forces$(O) \
278 +        obj/notifyCutoffs$(O)
279 +
280 +
281 +
282 +
283 +
284 +
285   #MPI dependencies:
286  
287 < MPIobj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
287 > MPIobj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
288  
289 < MPIobj/vector_class$(O): vector_class.F90
289 > MPIobj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
290  
291 < MPIobj/mpiSimulation_module$(O): mpiSimulation_module.F90
291 > MPIobj/status_module$(O): ./status_module.F90
292  
293 < MPIobj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
293 > MPIobj/mpiSimulation_module$(O): ./mpiSimulation_module.F90
294 >
295 > MPIobj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
296          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
297          MPIobj/$(F_MACH_DEFS)
298  
299 < MPIobj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
299 > MPIobj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
300          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
301          MPIobj/mpiSimulation_module$(O)
302  
303 < MPIobj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
303 > MPIobj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
304          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
305 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
306          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
307          MPIobj/force_globals$(O)
308  
309 < MPIobj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
309 > MPIobj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
310          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
311 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
312          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
313          MPIobj/force_globals$(O)
314  
315 < MPIobj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
315 > MPIobj/calc_eam$(O): ./calc_eam.F90 \
316          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
317 +        MPIobj/atype_module$(O) \
318 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
319 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
320          MPIobj/vector_class$(O) \
321 <        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
322 <        MPIobj/calc_gb$(O)
321 >        MPIobj/force_globals$(O) \
322 >        MPIobj/status_module$(O)
323  
324 < MPIobj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
324 >
325 > MPIobj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
326          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
327 +        MPIobj/vector_class$(O)
328 +
329 + MPIobj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
330 +        MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
331 +        MPIobj/atype_module$(O) \
332 +        MPIobj/vector_class$(O) \
333 +        MPIobj/force_globals$(O) \
334          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
335          MPIobj/atype_module$(O) \
336          MPIobj/neighborLists$(O)
337  
338 < MPIobj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
338 > MPIobj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
339          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
340 +        MPIobj/atype_module$(O) \
341 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
342          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
343          MPIobj/atype_module$(O) \
344          MPIobj/vector_class$(O) \
345          MPIobj/force_globals$(O)
346  
347 < MPIobj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
347 > MPIobj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
348          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
349 +        MPIobj/atype_module$(O) \
350 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
351          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
352          MPIobj/vector_class$(O) \
353          MPIobj/atype_module$(O) \
354          MPIobj/force_globals$(O)
355  
356 < MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
356 > MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
357          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
294 –        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
358          MPIobj/atype_module$(O) \
359 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
360 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
361          MPIobj/force_globals$(O) \
362          MPIobj/vector_class$(O)
363  
364 < MPIobj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
364 > MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
365          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
366          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
302 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
367          MPIobj/atype_module$(O) \
368 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
369          MPIobj/neighborLists$(O) \
370          MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
371          MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
372          MPIobj/calc_dipole_dipole$(O) \
373          MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
374          MPIobj/calc_gb$(O) \
375 <        MPIobj/force_globals$(O)
375 >        MPIobj/force_globals$(O) \
376 >        MPIobj/vector_class$(O)
377  
378 < MPIobj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
378 > MPIobj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
379          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
314 –        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
315 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
380          MPIobj/atype_module$(O) \
381 +        MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
382 +        MPIobj/calc_eam$(O) \
383 +        MPIobj/calc_dipole_dipole$(O) \
384 +        MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
385          MPIobj/do_Forces$(O)
386  
387 <
387 > MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
388 >        MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
389 >        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
390 >        MPIobj/atype_module$(O) \
391 >        MPIobj/simulation_module$(O) \
392 >        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
393 >        MPIobj/calc_gb$(O) \
394 >        MPIobj/do_Forces$(O) \
395 >        MPIobj/notifyCutoffs$(O)  

Diff Legend

– Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines