ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/group/trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile (file contents):
Revision 385 by gezelter, Fri Mar 21 20:37:58 2003 UTC vs.
Revision 573 by mmeineke, Thu Jul 3 19:41:26 2003 UTC

# Line 18 | Line 18 | MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPICH_INC)/mpi2c++ -I
18   # include paths starting with "." are all relative to the SUBDIRS!!!
19  
20   INCLUDES= -I.. -I../../libBASS -I$(SPRNG_INC)
21 < MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPICH_INC)/mpi2c++ -I$(MPI_F90_MODS)
21 > MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPI_F90_MODS)
22  
23   CFLAGS=$(CFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES) $(MPI_INCLUDES)
24   CXXFLAGS=$(CXXFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES)
# Line 29 | Line 29 | MPI_FFLAGS=$(FFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
29   MPI_CXXFLAGS=$(CXXFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
30   MPI_FFLAGS=$(FFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
31  
32 + SRC_DIR := $(PWD)
33 +
34   # Then do the compile rules:
35  
36   obj/%.o: %.F90
37 <        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  ../$<
37 >        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  $(SRC_DIR)/$<
38  
39   MPIobj/%.o: %.F90
40 <        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c ../$<
40 >        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
41  
42   obj/%.o: %.cpp
43 <        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c ../$<
43 >        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
44  
45   MPIobj/%.o: %.cpp
46 <        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c ../$<
46 >        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
47  
48   obj/%.o: %.c
49 <        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c ../$<
49 >        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
50  
51   MPIobj/%.o: %.c
52 <        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c ../$<
52 >        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
53  
54   # Then list what we have to compile
55  
56   C_FILES = $(DIR)/mpiForceField.c
57  
58   CXX_FILES = \
59 +        $(DIR)/Atom.cpp \
60          $(DIR)/Bend.cpp \
61          $(DIR)/BendExtensions.cpp \
62          $(DIR)/Bond.cpp \
63          $(DIR)/BondExtensions.cpp \
61 –        $(DIR)/DipoleTestFF.cpp \
64          $(DIR)/DirectionalAtom.cpp \
65          $(DIR)/DumpWriter.cpp \
66 +        $(DIR)/Exclude.cpp \
67          $(DIR)/InitializeFromFile.cpp \
68 <        $(DIR)/LJ_FF.cpp \
68 >        $(DIR)/LJFF.cpp \
69          $(DIR)/SimInfo.cpp \
70          $(DIR)/SimSetup.cpp \
71          $(DIR)/StatWriter.cpp \
72 <        $(DIR)/Symplectic.cpp \
72 >        $(DIR)/Integrator.cpp \
73          $(DIR)/Thermo.cpp \
74          $(DIR)/GhostBend.cpp \
75          $(DIR)/Torsion.cpp \
76          $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
77 <        $(DIR)/TraPPE_ExFF.cpp \
75 <        $(DIR)/TraPPEFF.cpp \
76 <        $(DIR)/Verlet.cpp \
77 >        $(DIR)/DUFF.cpp \
78          $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
79          $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
80          $(DIR)/ForceFields.cpp \
81 <        $(DIR)/mpiSimulation.cpp
81 >        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
82 >        $(DIR)/Molecule.cpp \
83 >        $(DIR)/NVT.cpp
84  
85  
86   F90_FILES= \
# Line 154 | Line 157 | Make.dep : $(SRCS)
157          echo "# DO NOT DELETE THIS LINE - used by make depend" > Make.dep
158          $(CC) $(DEPFLAGS) -MM $(C_SRCS) $(CXX_SRCS) \
159                  | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' > Make.temp
160 <        cat Make.temp | sed 's/^/obj\//' >> Make.dep
161 <        cat Make.temp | sed 's/^/MPIobj\//' >> Make.dep
160 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/obj\/&/g' >> Make.dep
161 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/MPIobj\/&/g' >> Make.dep
162   #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d obj -f ./Make.ftemp -h *.F90
163   #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d MPIobj -f ./Make.ftemp -h *.F90
164   #       cat Make.ftemp | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' >> Make.dep
# Line 171 | Line 174 | include Make.dep
174  
175   include Make.dep
176  
177 < # known dependencies
177 > obj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
178  
179 < obj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
179 > obj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
180  
181 < obj/vector_class$(O): vector_class.F90
179 <
180 < obj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
181 > obj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
182          obj/$(F_MACH_DEFS)
183  
184 < obj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
184 > obj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
185          obj/$(F_MACH_DEFS)
186  
187 < obj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
187 > obj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
188          obj/$(F_MACH_DEFS) \
189 +        obj/simulation_module$(O) \
190          obj/force_globals$(O)
191  
192 < obj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
192 > obj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
193          obj/$(F_MACH_DEFS) \
194 +        obj/simulation_module$(O) \
195          obj/force_globals$(O)
196  
197 < obj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
197 > obj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
198          obj/$(F_MACH_DEFS) \
199 <        obj/vector_class$(O) \
197 <        obj/calc_sticky_pair$(O) \
198 <        obj/calc_gb$(O)
199 >        obj/vector_class$(O)
200  
201 < obj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
201 > obj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
202          obj/$(F_MACH_DEFS) \
203 +        obj/vector_class$(O) \
204 +        obj/force_globals$(O) \
205          obj/atype_module$(O) \
206          obj/neighborLists$(O)
207  
208 < obj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
208 > obj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
209          obj/$(F_MACH_DEFS) \
210          obj/atype_module$(O) \
211 +        obj/simulation_module$(O) \
212          obj/vector_class$(O) \
213          obj/force_globals$(O)
214  
215 < obj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
215 > obj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
216          obj/$(F_MACH_DEFS) \
217          obj/vector_class$(O) \
218          obj/atype_module$(O) \
219 +        obj/simulation_module$(O) \
220          obj/force_globals$(O)
221  
222 < obj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
222 > obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
223          obj/$(F_MACH_DEFS) \
224          obj/atype_module$(O) \
225 +        obj/simulation_module$(O) \
226          obj/force_globals$(O) \
227          obj/vector_class$(O)
228  
229 < obj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
229 > obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
230          obj/$(F_MACH_DEFS) \
225 –        obj/simulation_module$(O) \
231          obj/atype_module$(O) \
232 +        obj/simulation_module$(O) \
233          obj/neighborLists$(O) \
234          obj/calc_LJ_FF$(O) \
235          obj/calc_sticky_pair$(O) \
# Line 232 | Line 238 | obj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
238          obj/calc_gb$(O) \
239          obj/force_globals$(O)
240  
241 < obj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
241 > obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
242          obj/$(F_MACH_DEFS) \
237 –        obj/simulation_module$(O) \
243          obj/atype_module$(O) \
244 +        obj/simulation_module$(O) \
245 +        obj/calc_sticky_pair$(O) \
246 +        obj/calc_gb$(O) \
247          obj/do_Forces$(O)
248  
249   #MPI dependencies:
250  
251 < MPIobj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
251 > MPIobj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
252  
253 < MPIobj/vector_class$(O): vector_class.F90
253 > MPIobj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
254  
255 < MPIobj/mpiSimulation_module$(O): mpiSimulation_module.F90
255 > MPIobj/mpiSimulation_module$(O): ./mpiSimulation_module.F90
256  
257 < MPIobj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
257 > MPIobj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
258          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
259          MPIobj/$(F_MACH_DEFS)
260  
261 < MPIobj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
261 > MPIobj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
262          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
263          MPIobj/mpiSimulation_module$(O)
264  
265 < MPIobj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
265 > MPIobj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
266          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
267 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
268          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
269          MPIobj/force_globals$(O)
270  
271 < MPIobj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
271 > MPIobj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
272          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
273 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
274          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
275          MPIobj/force_globals$(O)
276  
277 < MPIobj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
277 > MPIobj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
278          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
279 <        MPIobj/vector_class$(O) \
270 <        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
271 <        MPIobj/calc_gb$(O)
279 >        MPIobj/vector_class$(O)
280  
281 < MPIobj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
281 > MPIobj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
282          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
283 +        MPIobj/atype_module$(O) \
284 +        MPIobj/vector_class$(O) \
285 +        MPIobj/force_globals$(O) \
286          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
287          MPIobj/atype_module$(O) \
288          MPIobj/neighborLists$(O)
289  
290 < MPIobj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
290 > MPIobj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
291          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
292 +        MPIobj/atype_module$(O) \
293 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
294          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
295          MPIobj/atype_module$(O) \
296          MPIobj/vector_class$(O) \
297          MPIobj/force_globals$(O)
298  
299 < MPIobj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
299 > MPIobj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
300          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
301 +        MPIobj/atype_module$(O) \
302 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
303          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
304          MPIobj/vector_class$(O) \
305          MPIobj/atype_module$(O) \
306          MPIobj/force_globals$(O)
307  
308 < MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
308 > MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
309          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
295 –        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
310          MPIobj/atype_module$(O) \
311 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
312 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
313          MPIobj/force_globals$(O) \
314          MPIobj/vector_class$(O)
315  
316 < MPIobj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
316 > MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
317          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
318          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
303 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
319          MPIobj/atype_module$(O) \
320 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
321          MPIobj/neighborLists$(O) \
322          MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
323          MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
# Line 310 | Line 326 | MPIobj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
326          MPIobj/calc_gb$(O) \
327          MPIobj/force_globals$(O)
328  
329 < MPIobj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
329 > MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
330          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
331          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
316 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
332          MPIobj/atype_module$(O) \
333 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
334 +        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
335 +        MPIobj/calc_gb$(O) \
336          MPIobj/do_Forces$(O)

Diff Legend

– Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines