ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/group/trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE/libmdtools/Makefile (file contents):
Revision 385 by gezelter, Fri Mar 21 20:37:58 2003 UTC vs.
Revision 718 by gezelter, Mon Aug 25 21:51:30 2003 UTC

# Line 18 | Line 18 | MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPICH_INC)/mpi2c++ -I
18   # include paths starting with "." are all relative to the SUBDIRS!!!
19  
20   INCLUDES= -I.. -I../../libBASS -I$(SPRNG_INC)
21 < MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPICH_INC)/mpi2c++ -I$(MPI_F90_MODS)
21 > MPI_INCLUDES= -I$(MPICH_INC) -I$(MPI_F90_MODS)
22  
23   CFLAGS=$(CFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES) $(MPI_INCLUDES)
24   CXXFLAGS=$(CXXFLAGS_C) $(INCLUDES) $(DECLARES)
25 < FFLAGS=$(FFLAGS_C) $(DECLARES)
25 > FFLAGS=$(FFLAGS_C)
26   DEPFLAGS=$(CFLAGS_C) -I. -I../libBASS -I$(SPRNG_INC) $(MPI_INCLUDES)
27  
28   MPI_CFLAGS=$(CFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
29   MPI_CXXFLAGS=$(CXXFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
30   MPI_FFLAGS=$(FFLAGS) $(MPI_INCLUDES) $(MPI_DECLARES)
31  
32 + SRC_DIR := $(PWD)
33 +
34   # Then do the compile rules:
35  
36   obj/%.o: %.F90
37 <        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  ../$<
37 >        cd obj; $(FC) $(FFLAGS) -c  $(SRC_DIR)/$<
38  
39   MPIobj/%.o: %.F90
40 <        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c ../$<
40 >        cd MPIobj; $(FC) $(MPI_FFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
41  
42   obj/%.o: %.cpp
43 <        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c ../$<
43 >        cd obj; $(CXX) $(CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
44  
45   MPIobj/%.o: %.cpp
46 <        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c ../$<
46 >        cd MPIobj; $(CXX) $(MPI_CXXFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
47  
48   obj/%.o: %.c
49 <        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c ../$<
49 >        cd obj; $(CC) $(CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
50  
51   MPIobj/%.o: %.c
52 <        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c ../$<
52 >        cd MPIobj; $(CC) $(MPI_CFLAGS) -c $(SRC_DIR)/$<
53  
54   # Then list what we have to compile
55  
56 < C_FILES = $(DIR)/mpiForceField.c
56 > C_FILES = \
57 >        $(DIR)/mpiForceField.c \
58 >        $(DIR)/fInfo.c
59  
60   CXX_FILES = \
61 +        $(DIR)/Atom.cpp \
62          $(DIR)/Bend.cpp \
63          $(DIR)/BendExtensions.cpp \
64          $(DIR)/Bond.cpp \
65          $(DIR)/BondExtensions.cpp \
61 –        $(DIR)/DipoleTestFF.cpp \
66          $(DIR)/DirectionalAtom.cpp \
67          $(DIR)/DumpWriter.cpp \
68 +        $(DIR)/Exclude.cpp \
69          $(DIR)/InitializeFromFile.cpp \
70 <        $(DIR)/LJ_FF.cpp \
70 >        $(DIR)/LJFF.cpp \
71 >        $(DIR)/EAM_FF.cpp \
72          $(DIR)/SimInfo.cpp \
73          $(DIR)/SimSetup.cpp \
74          $(DIR)/StatWriter.cpp \
75 <        $(DIR)/Symplectic.cpp \
75 >        $(DIR)/Integrator.cpp \
76          $(DIR)/Thermo.cpp \
77          $(DIR)/GhostBend.cpp \
78          $(DIR)/Torsion.cpp \
79          $(DIR)/TorsionExtensions.cpp \
80 <        $(DIR)/TraPPE_ExFF.cpp \
75 <        $(DIR)/TraPPEFF.cpp \
76 <        $(DIR)/Verlet.cpp \
80 >        $(DIR)/DUFF.cpp \
81          $(DIR)/randomSPRNG.cpp \
82          $(DIR)/fortranWrappers.cpp \
83          $(DIR)/ForceFields.cpp \
84 <        $(DIR)/mpiSimulation.cpp
84 >        $(DIR)/mpiSimulation.cpp \
85 >        $(DIR)/Molecule.cpp \
86 >        $(DIR)/SimState.cpp \
87 >        $(DIR)/ZConstraint.cpp \
88 >        $(DIR)/ZConsWriter.cpp \
89 >        $(DIR)/GenericData.cpp
90  
82 –
91   F90_FILES= \
92          $(DIR)/Linux_ifc_machdep.F90 \
93 +        $(DIR)/status_module.F90 \
94          $(DIR)/atype_module.F90 \
86 –        $(DIR)/f_verlet_constrained.F90 \
95          $(DIR)/calc_dipole_dipole.F90 \
96          $(DIR)/calc_reaction_field.F90 \
97          $(DIR)/calc_LJ_FF.F90 \
98 +        $(DIR)/calc_eam.F90 \
99          $(DIR)/calc_sticky_pair.F90 \
100          $(DIR)/do_Forces.F90 \
101          $(DIR)/vector_class.F90 \
# Line 95 | Line 104 | F90_FILES= \
104          $(DIR)/neighborLists.F90 \
105          $(DIR)/calc_gb.F90 \
106          $(DIR)/force_globals.F90 \
107 <        $(DIR)/mpiSimulation_module.F90
107 >        $(DIR)/mpiSimulation_module.F90 \
108 >        $(DIR)/notifyCutoffs.F90
109  
110   DIR:=.
111   C_SRCS   :=     $(C_FILES)
# Line 152 | Line 162 | Make.dep : $(SRCS)
162   Make.dep : $(SRCS)
163          echo "Only C dependencies are made automagically!"
164          echo "# DO NOT DELETE THIS LINE - used by make depend" > Make.dep
165 <        $(CC) $(DEPFLAGS) -MM $(C_SRCS) $(CXX_SRCS) \
165 >        $(CC) $(DEPFLAGS) -MM $(C_SRCS) \
166                  | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' > Make.temp
167 <        cat Make.temp | sed 's/^/obj\//' >> Make.dep
168 <        cat Make.temp | sed 's/^/MPIobj\//' >> Make.dep
167 >        $(CXX) $(DEPFLAGS) -MM $(CXX_SRCS) \
168 >                | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' >> Make.temp
169 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/obj\/&/g' >> Make.dep
170 >        cat Make.temp | sed 's/^[a-zA-Z0-9]/MPIobj\/&/g' >> Make.dep
171   #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d obj -f ./Make.ftemp -h *.F90
172   #       ../scripts/sfmakedepend -I $(MPI_F90_MODS) -d MPIobj -f ./Make.ftemp -h *.F90
173   #       cat Make.ftemp | sed 's/\.o:/\$$(O)\ :/g' >> Make.dep
# Line 171 | Line 183 | include Make.dep
183  
184   include Make.dep
185  
186 < # known dependencies
186 > obj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
187  
188 < obj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
188 > obj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
189  
190 < obj/vector_class$(O): vector_class.F90
190 > obj/status_module$(O): ./status_module.F90
191  
192 < obj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
192 > obj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
193          obj/$(F_MACH_DEFS)
194  
195 < obj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
195 > obj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
196          obj/$(F_MACH_DEFS)
197  
198 < obj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
198 > obj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
199          obj/$(F_MACH_DEFS) \
200 +        obj/simulation_module$(O) \
201          obj/force_globals$(O)
202  
203 < obj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
203 > obj/calc_eam$(O): ./calc_eam.F90 \
204          obj/$(F_MACH_DEFS) \
205 +        obj/atype_module$(O) \
206 +        obj/simulation_module$(O) \
207 +        obj/vector_class$(O) \
208 +        obj/force_globals$(O) \
209 +        obj/status_module$(O)
210 +
211 + obj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
212 +        obj/$(F_MACH_DEFS) \
213 +        obj/simulation_module$(O) \
214          obj/force_globals$(O)
215  
216 < obj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
216 > obj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
217          obj/$(F_MACH_DEFS) \
218 <        obj/vector_class$(O) \
197 <        obj/calc_sticky_pair$(O) \
198 <        obj/calc_gb$(O)
218 >        obj/vector_class$(O)
219  
220 < obj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
220 > obj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
221          obj/$(F_MACH_DEFS) \
222 +        obj/vector_class$(O) \
223 +        obj/force_globals$(O) \
224          obj/atype_module$(O) \
225          obj/neighborLists$(O)
226  
227 < obj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
227 > obj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
228          obj/$(F_MACH_DEFS) \
229          obj/atype_module$(O) \
230 +        obj/simulation_module$(O) \
231          obj/vector_class$(O) \
232          obj/force_globals$(O)
233  
234 < obj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
234 > obj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
235          obj/$(F_MACH_DEFS) \
236          obj/vector_class$(O) \
237          obj/atype_module$(O) \
238 +        obj/simulation_module$(O) \
239          obj/force_globals$(O)
240  
241 < obj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
241 > obj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
242          obj/$(F_MACH_DEFS) \
243          obj/atype_module$(O) \
244 +        obj/simulation_module$(O) \
245          obj/force_globals$(O) \
246          obj/vector_class$(O)
247  
248 < obj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
248 > obj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
249          obj/$(F_MACH_DEFS) \
225 –        obj/simulation_module$(O) \
250          obj/atype_module$(O) \
251 +        obj/simulation_module$(O) \
252          obj/neighborLists$(O) \
253          obj/calc_LJ_FF$(O) \
254          obj/calc_sticky_pair$(O) \
255          obj/calc_dipole_dipole$(O) \
256          obj/calc_reaction_field$(O) \
257          obj/calc_gb$(O) \
258 <        obj/force_globals$(O)
258 >        obj/force_globals$(O) \
259 >        obj/vector_class$(O)
260  
261 < obj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
261 > obj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
262          obj/$(F_MACH_DEFS) \
237 –        obj/simulation_module$(O) \
263          obj/atype_module$(O) \
264 +        obj/calc_LJ_FF$(O) \
265 +        obj/calc_eam$(O) \
266 +        obj/calc_dipole_dipole$(O) \
267 +        obj/calc_reaction_field$(O) \
268          obj/do_Forces$(O)
269 +
270 + obj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
271 +        obj/$(F_MACH_DEFS) \
272 +        obj/atype_module$(O) \
273 +        obj/simulation_module$(O) \
274 +        obj/calc_sticky_pair$(O) \
275 +        obj/calc_gb$(O) \
276 +        obj/do_Forces$(O) \
277 +        obj/notifyCutoffs$(O)
278  
279 +
280 +
281 +
282 +
283 +
284   #MPI dependencies:
285  
286 < MPIobj/$(F_MACH_DEFS): Linux_ifc_machdep.F90
286 > MPIobj/$(F_MACH_DEFS): ./Linux_ifc_machdep.F90
287  
288 < MPIobj/vector_class$(O): vector_class.F90
288 > MPIobj/vector_class$(O): ./vector_class.F90
289  
290 < MPIobj/mpiSimulation_module$(O): mpiSimulation_module.F90
290 > MPIobj/status_module$(O): ./status_module.F90
291  
292 < MPIobj/force_globals$(O): force_globals.F90 \
292 > MPIobj/mpiSimulation_module$(O): ./mpiSimulation_module.F90
293 >
294 > MPIobj/force_globals$(O): ./force_globals.F90 \
295          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
296          MPIobj/$(F_MACH_DEFS)
297  
298 < MPIobj/neighborLists$(O): neighborLists.F90 \
298 > MPIobj/neighborLists$(O): ./neighborLists.F90 \
299          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
300          MPIobj/mpiSimulation_module$(O)
301  
302 < MPIobj/calc_sticky_pair$(O): calc_sticky_pair.F90 \
302 > MPIobj/calc_sticky_pair$(O): ./calc_sticky_pair.F90 \
303          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
304 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
305          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
306          MPIobj/force_globals$(O)
307  
308 < MPIobj/calc_gb$(O): calc_gb.F90 \
308 > MPIobj/calc_gb$(O): ./calc_gb.F90 \
309          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
310 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
311          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
312          MPIobj/force_globals$(O)
313  
314 < MPIobj/atype_module$(O): atype_module.F90 \
314 > MPIobj/calc_eam$(O): ./calc_eam.F90 \
315          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
316 +        MPIobj/atype_module$(O) \
317 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
318 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
319          MPIobj/vector_class$(O) \
320 <        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
321 <        MPIobj/calc_gb$(O)
320 >        MPIobj/force_globals$(O) \
321 >        MPIobj/status_module$(O)
322  
323 < MPIobj/simulation_module$(O): simulation_module.F90 \
323 >
324 > MPIobj/atype_module$(O): ./atype_module.F90 \
325          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
326 +        MPIobj/vector_class$(O)
327 +
328 + MPIobj/simulation_module$(O): ./simulation_module.F90 \
329 +        MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
330 +        MPIobj/atype_module$(O) \
331 +        MPIobj/vector_class$(O) \
332 +        MPIobj/force_globals$(O) \
333          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
334          MPIobj/atype_module$(O) \
335          MPIobj/neighborLists$(O)
336  
337 < MPIobj/calc_LJ_FF$(O): calc_LJ_FF.F90 \
337 > MPIobj/calc_LJ_FF$(O): ./calc_LJ_FF.F90 \
338          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
339 +        MPIobj/atype_module$(O) \
340 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
341          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
342          MPIobj/atype_module$(O) \
343          MPIobj/vector_class$(O) \
344          MPIobj/force_globals$(O)
345  
346 < MPIobj/calc_reaction_field$(O): calc_reaction_field.F90 \
346 > MPIobj/calc_reaction_field$(O): ./calc_reaction_field.F90 \
347          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
348 +        MPIobj/atype_module$(O) \
349 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
350          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
351          MPIobj/vector_class$(O) \
352          MPIobj/atype_module$(O) \
353          MPIobj/force_globals$(O)
354  
355 < MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): calc_dipole_dipole.F90 \
355 > MPIobj/calc_dipole_dipole$(O): ./calc_dipole_dipole.F90 \
356          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
295 –        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
357          MPIobj/atype_module$(O) \
358 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
359 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
360          MPIobj/force_globals$(O) \
361          MPIobj/vector_class$(O)
362  
363 < MPIobj/do_Forces$(O): do_Forces.F90 \
363 > MPIobj/do_Forces$(O): ./do_Forces.F90 \
364          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
365          MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
303 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
366          MPIobj/atype_module$(O) \
367 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
368          MPIobj/neighborLists$(O) \
369          MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
370          MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
371          MPIobj/calc_dipole_dipole$(O) \
372          MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
373          MPIobj/calc_gb$(O) \
374 <        MPIobj/force_globals$(O)
374 >        MPIobj/force_globals$(O) \
375 >        MPIobj/vector_class$(O)
376  
377 < MPIobj/wrappers$(O): wrappers.F90 \
377 > MPIobj/notifyCutoffs$(O): ./notifyCutoffs.F90 \
378          MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
315 –        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
316 –        MPIobj/simulation_module$(O) \
379          MPIobj/atype_module$(O) \
380 +        MPIobj/calc_LJ_FF$(O) \
381 +        MPIobj/calc_eam$(O) \
382 +        MPIobj/calc_dipole_dipole$(O) \
383 +        MPIobj/calc_reaction_field$(O) \
384          MPIobj/do_Forces$(O)
385 +
386 + MPIobj/wrappers$(O): ./wrappers.F90 \
387 +        MPIobj/$(F_MACH_DEFS) \
388 +        MPIobj/mpiSimulation_module$(O) \
389 +        MPIobj/atype_module$(O) \
390 +        MPIobj/simulation_module$(O) \
391 +        MPIobj/calc_sticky_pair$(O) \
392 +        MPIobj/calc_gb$(O) \
393 +        MPIobj/do_Forces$(O) \
394 +        MPIobj/notifyCutoffs$(O)  

Diff Legend

– Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines