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Comparing trunk/SHAPES/samples/DOBAMBC.pdb (file contents):
Revision 1301 by chrisfen, Thu Jun 24 21:21:04 2004 UTC vs.
Revision 1304 by chrisfen, Thu Jun 24 23:07:12 2004 UTC

# Line 1 | Line 1
1 < COMPND  DOBAMBC.pdb                                                            
2 < HETATM   19  O                  -8.117  -6.027   3.695                
3 < HETATM   21  C                  -8.042  -4.822   3.527                
4 < HETATM   23  C                  -6.969  -4.058   2.860                
5 < HETATM   24  O                  -9.042  -4.015   3.988                
6 < HETATM   25  C                  -5.882  -4.661   2.357                
7 < HETATM   26  C                 -10.148  -4.623   4.657                
8 < HETATM   28  C                  -4.813  -3.922   1.695                
9 < HETATM   30  C                  -4.876  -2.531   1.550                
10 < HETATM   31  C                  -3.703  -4.613   1.196                
11 < HETATM   32  C                 -11.126  -3.494   5.016                
12 < HETATM   33  C                  -3.850  -1.846   0.918                
13 < HETATM   36  C                  -2.677  -3.926   0.563                
14 < HETATM   39  C                  -2.740  -2.535   0.418                
15 < HETATM   41  C                  -1.654  -1.830  -0.247                
16 < HETATM   43  C                  -1.646  -0.500  -0.425                
17 < HETATM   45  C                  -0.561   0.207  -1.090                
18 < HETATM   47  C                  -0.628   1.600  -1.240                
19 < HETATM   48  C                   0.551  -0.479  -1.585                
20 < HETATM   49  C                 -12.022  -3.916   6.183                
21 < HETATM   50  C                   0.394   2.291  -1.869                
22 < HETATM   51  C                 -11.968  -3.095   3.814                
23 < HETATM   53  C                   1.586   0.196  -2.219                
24 < HETATM   56  C                   1.507   1.586  -2.361                
25 < HETATM   58  O                   2.447   2.389  -2.964                
26 < HETATM   59  C                   3.613   1.752  -3.475                
27 < HETATM   60  C                   4.481   2.860  -4.067                
28 < HETATM   63  C                   5.757   2.273  -4.648                
29 < HETATM   66  C                   6.639   3.359  -5.243                
30 < HETATM   69  C                   7.915   2.774  -5.828                
31 < HETATM   72  C                   8.800   3.859  -6.421                
32 < HETATM   75  C                  10.072   3.274  -7.009                
33 < HETATM   78  C                  10.957   4.359  -7.600                
34 < HETATM   81  C                  12.230   3.775  -8.193                
35 < HETATM   84  C                  13.113   4.852  -8.780                
36 < HETATM   93  C                 -12.896  -5.120   5.863                
37 < HETATM   97  C                 -13.935  -5.356   6.934                
38 < HETATM   27  H                  -7.084  -2.963   2.784                
39 < HETATM   29  H                  -5.757  -5.751   2.427                
40 < HETATM   34  H                  -9.784  -5.143   5.564                
41 < HETATM   42  H                 -10.622  -5.378   4.000                
42 < HETATM   35  H                  -5.753  -1.998   1.947                
43 < HETATM   37  H                  -3.645  -5.703   1.304                
44 < HETATM   90  H                 -10.540  -2.600   5.348                
45 < HETATM   38  H                  -3.890  -0.752   0.800                
46 < HETATM   40  H                  -1.811  -4.476   0.175                
47 < HETATM   44  H                  -0.808  -2.435  -0.616                
48 < HETATM   46  H                  -2.492   0.106  -0.057                
49 < HETATM   52  H                  -1.497   2.147  -0.855                
50 < HETATM   54  H                   0.590  -1.573  -1.461                
51 < HETATM   91  H                 -12.664  -3.058   6.465                
52 < HETATM   92  H                 -11.400  -4.130   7.076                
53 < HETATM   55  H                   0.335   3.380  -1.982                
54 < HETATM   94  H                 -12.534  -2.176   4.014                
55 < HETATM   95  H                 -12.700  -3.884   3.572                
56 < HETATM   96  H                 -11.352  -2.919   2.925                
57 < HETATM   57  H                   2.443  -0.373  -2.595                
58 < HETATM   61  H                   3.335   1.006  -4.246                
59 < HETATM   62  H                   4.145   1.216  -2.664                
60 < HETATM   64  H                   4.727   3.613  -3.292                
61 < HETATM   65  H                   3.923   3.411  -4.851                
62 < HETATM   67  H                   5.510   1.520  -5.424                
63 < HETATM   68  H                   6.313   1.721  -3.864                
64 < HETATM   70  H                   6.889   4.111  -4.467                
65 < HETATM   71  H                   6.083   3.913  -6.026                
66 < HETATM   73  H                   7.666   2.022  -6.604                
67 < HETATM   74  H                   8.471   2.219  -5.045                
68 < HETATM   76  H                   9.050   4.609  -5.644                
69 < HETATM   77  H                   8.242   4.416  -7.202                
70 < HETATM   79  H                   9.821   2.524  -7.786                
71 < HETATM   80  H                  10.628   2.716  -6.228                
72 < HETATM   82  H                  11.212   5.107  -6.823                
73 < HETATM   83  H                  10.400   4.918  -8.380                
74 < HETATM   85  H                  11.976   3.027  -8.971                
75 < HETATM   86  H                  12.785   3.214  -7.414                
76 < HETATM   87  H                  14.029   4.427  -9.209                
77 < HETATM   88  H                  13.416   5.586  -8.022                
78 < HETATM   89  H                  12.600   5.403  -9.581                
79 < HETATM   98  H                 -12.265  -6.024   5.741                
80 < HETATM   99  H                 -13.381  -4.962   4.873                
81 < HETATM  100  H                 -14.546  -6.238   6.708                
82 < HETATM  101  H                 -14.617  -4.500   7.035                
83 < HETATM  102  H                 -13.472  -5.520   7.916                
84 < CONECT   19   21                                            
85 < CONECT   21   19   23   24                                  
86 < CONECT   23   21   25   27                                  
87 < CONECT   24   21   26                                        
88 < CONECT   25   23   28   29                                  
89 < CONECT   26   24   32   34   42                              
90 < CONECT   28   25   30   31                                  
91 < CONECT   30   28   33   35                                  
92 < CONECT   31   28   36   37                                  
93 < CONECT   32   26   49   51   90                              
94 < CONECT   33   30   39   38                                  
95 < CONECT   36   31   39   40                                  
96 < CONECT   39   33   36   41                                  
97 < CONECT   41   39   43   44                                  
98 < CONECT   43   41   45   46                                  
99 < CONECT   45   43   47   48                                  
100 < CONECT   47   45   50   52                                  
101 < CONECT   48   45   53   54                                  
102 < CONECT   49   32   93   91   92                              
103 < CONECT   50   47   56   55                                  
104 < CONECT   51   32   94   95   96                              
105 < CONECT   53   48   56   57                                  
106 < CONECT   56   50   53   58                                  
107 < CONECT   58   56   59                                        
108 < CONECT   59   58   60   61   62                              
109 < CONECT   60   59   63   64   65                              
110 < CONECT   63   60   66   67   68                              
111 < CONECT   66   63   69   70   71                              
112 < CONECT   69   66   72   73   74                              
113 < CONECT   72   69   75   76   77                              
114 < CONECT   75   72   78   79   80                              
115 < CONECT   78   75   81   82   83                              
116 < CONECT   81   78   84   85   86                              
117 < CONECT   84   81   87   88   89                              
118 < CONECT   93   49   97   98   99                              
119 < CONECT   97   93  100  101  102                              
120 < CONECT   27   23                                            
121 < CONECT   29   25                                            
122 < CONECT   34   26                                            
123 < CONECT   42   26                                            
124 < CONECT   35   30                                            
125 < CONECT   37   31                                            
126 < CONECT   90   32                                            
127 < CONECT   38   33                                            
128 < CONECT   40   36                                            
129 < CONECT   44   41                                            
130 < CONECT   46   43                                            
131 < CONECT   52   47                                            
132 < CONECT   54   48                                            
133 < CONECT   91   49                                            
134 < CONECT   92   49                                            
135 < CONECT   55   50                                            
136 < CONECT   94   51                                            
137 < CONECT   95   51                                            
138 < CONECT   96   51                                            
139 < CONECT   57   53                                            
140 < CONECT   61   59                                            
141 < CONECT   62   59                                            
142 < CONECT   64   60                                            
143 < CONECT   65   60                                            
144 < CONECT   67   63                                            
145 < CONECT   68   63                                            
146 < CONECT   70   66                                            
147 < CONECT   71   66                                            
148 < CONECT   73   69                                            
149 < CONECT   74   69                                            
150 < CONECT   76   72                                            
151 < CONECT   77   72                                            
152 < CONECT   79   75                                            
153 < CONECT   80   75                                            
154 < CONECT   82   78                                            
155 < CONECT   83   78                                            
156 < CONECT   85   81                                            
157 < CONECT   86   81                                            
158 < CONECT   87   84                                            
159 < CONECT   88   84                                            
160 < CONECT   89   84                                            
161 < CONECT   98   93                                            
162 < CONECT   99   93                                            
163 < CONECT  100   97                                            
164 < CONECT  101   97                                            
165 < CONECT  102   97                                            
166 < END  
1 > HEADER    PROTEIN
2 > COMPND    DOBAMBC.pdb
3 > AUTHOR    GENERATED BY BABEL 1.6
4 > ATOM      1  O   UNK     1      -7.823  -5.701   4.527  1.00  0.00
5 > ATOM      2  C   UNK     1      -7.748  -4.496   4.359  1.00  0.00
6 > ATOM      3  C   UNK     1      -6.675  -3.732   3.692  1.00  0.00
7 > ATOM      4  O   UNK     1      -8.748  -3.689   4.820  1.00  0.00
8 > ATOM      5  C   UNK     1      -5.588  -4.335   3.189  1.00  0.00
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10 > ATOM      7  H   UNK     1      -6.790  -2.637   3.616  1.00  0.00
11 > ATOM      8  C   UNK     1      -4.519  -3.596   2.527  1.00  0.00
12 > ATOM      9  H   UNK     1      -5.463  -5.425   3.259  1.00  0.00
13 > ATOM     10  C   UNK     1      -4.582  -2.205   2.382  1.00  0.00
14 > ATOM     11  C   UNK     1      -3.409  -4.287   2.029  1.00  0.00
15 > ATOM     12  C   UNK     1     -10.832  -3.168   5.848  1.00  0.00
16 > ATOM     13  C   UNK     1      -3.556  -1.520   1.751  1.00  0.00
17 > ATOM     14  H   UNK     1      -9.490  -4.817   6.396  1.00  0.00
18 > ATOM     15  H   UNK     1      -5.459  -1.672   2.779  1.00  0.00
19 > ATOM     16  C   UNK     1      -2.383  -3.600   1.395  1.00  0.00
20 > ATOM     17  H   UNK     1      -3.351  -5.377   2.136  1.00  0.00
21 > ATOM     18  H   UNK     1      -3.596  -0.426   1.632  1.00  0.00
22 > ATOM     19  C   UNK     1      -2.446  -2.209   1.251  1.00  0.00
23 > ATOM     20  H   UNK     1      -1.517  -4.150   1.007  1.00  0.00
24 > ATOM     21  C   UNK     1      -1.360  -1.504   0.586  1.00  0.00
25 > ATOM     22  H   UNK     1     -10.328  -5.052   4.833  1.00  0.00
26 > ATOM     23  C   UNK     1      -1.352  -0.174   0.408  1.00  0.00
27 > ATOM     24  H   UNK     1      -0.514  -2.109   0.217  1.00  0.00
28 > ATOM     25  C   UNK     1      -0.267   0.533  -0.257  1.00  0.00
29 > ATOM     26  H   UNK     1      -2.198   0.432   0.776  1.00  0.00
30 > ATOM     27  C   UNK     1      -0.334   1.926  -0.407  1.00  0.00
31 > ATOM     28  C   UNK     1       0.845  -0.153  -0.752  1.00  0.00
32 > ATOM     29  C   UNK     1     -11.728  -3.590   7.016  1.00  0.00
33 > ATOM     30  C   UNK     1       0.688   2.617  -1.036  1.00  0.00
34 > ATOM     31  C   UNK     1     -11.674  -2.769   4.646  1.00  0.00
35 > ATOM     32  H   UNK     1      -1.203   2.473  -0.022  1.00  0.00
36 > ATOM     33  C   UNK     1       1.880   0.522  -1.386  1.00  0.00
37 > ATOM     34  H   UNK     1       0.884  -1.247  -0.628  1.00  0.00
38 > ATOM     35  H   UNK     1       0.629   3.706  -1.149  1.00  0.00
39 > ATOM     36  C   UNK     1       1.801   1.912  -1.528  1.00  0.00
40 > ATOM     37  H   UNK     1       2.737  -0.047  -1.762  1.00  0.00
41 > ATOM     38  O   UNK     1       2.741   2.715  -2.131  1.00  0.00
42 > ATOM     39  C   UNK     1       3.907   2.078  -2.642  1.00  0.00
43 > ATOM     40  C   UNK     1       4.775   3.186  -3.234  1.00  0.00
44 > ATOM     41  H   UNK     1       3.629   1.332  -3.413  1.00  0.00
45 > ATOM     42  H   UNK     1       4.439   1.542  -1.831  1.00  0.00
46 > ATOM     43  C   UNK     1       6.051   2.599  -3.815  1.00  0.00
47 > ATOM     44  H   UNK     1       5.021   3.939  -2.459  1.00  0.00
48 > ATOM     45  H   UNK     1       4.217   3.737  -4.018  1.00  0.00
49 > ATOM     46  C   UNK     1       6.933   3.685  -4.410  1.00  0.00
50 > ATOM     47  H   UNK     1       5.804   1.846  -4.591  1.00  0.00
51 > ATOM     48  H   UNK     1       6.607   2.047  -3.031  1.00  0.00
52 > ATOM     49  C   UNK     1       8.209   3.100  -4.995  1.00  0.00
53 > ATOM     50  H   UNK     1       7.183   4.437  -3.634  1.00  0.00
54 > ATOM     51  H   UNK     1       6.377   4.239  -5.193  1.00  0.00
55 > ATOM     52  C   UNK     1       9.094   4.185  -5.588  1.00  0.00
56 > ATOM     53  H   UNK     1       7.960   2.348  -5.771  1.00  0.00
57 > ATOM     54  H   UNK     1       8.765   2.545  -4.212  1.00  0.00
58 > ATOM     55  C   UNK     1      10.366   3.600  -6.176  1.00  0.00
59 > ATOM     56  H   UNK     1       9.344   4.935  -4.811  1.00  0.00
60 > ATOM     57  H   UNK     1       8.536   4.742  -6.369  1.00  0.00
61 > ATOM     58  C   UNK     1      11.251   4.685  -6.767  1.00  0.00
62 > ATOM     59  H   UNK     1      10.115   2.850  -6.953  1.00  0.00
63 > ATOM     60  H   UNK     1      10.922   3.042  -5.395  1.00  0.00
64 > ATOM     61  C   UNK     1      12.524   4.101  -7.360  1.00  0.00
65 > ATOM     62  H   UNK     1      11.506   5.433  -5.990  1.00  0.00
66 > ATOM     63  H   UNK     1      10.694   5.244  -7.547  1.00  0.00
67 > ATOM     64  C   UNK     1      13.407   5.178  -7.947  1.00  0.00
68 > ATOM     65  H   UNK     1      12.270   3.353  -8.138  1.00  0.00
69 > ATOM     66  H   UNK     1      13.079   3.540  -6.581  1.00  0.00
70 > ATOM     67  H   UNK     1      14.323   4.753  -8.376  1.00  0.00
71 > ATOM     68  H   UNK     1      13.710   5.912  -7.189  1.00  0.00
72 > ATOM     69  H   UNK     1      12.894   5.729  -8.748  1.00  0.00
73 > ATOM     70  H   UNK     1     -10.246  -2.274   6.180  1.00  0.00
74 > ATOM     71  H   UNK     1     -12.370  -2.732   7.298  1.00  0.00
75 > ATOM     72  H   UNK     1     -11.106  -3.804   7.908  1.00  0.00
76 > ATOM     73  C   UNK     1     -12.602  -4.794   6.695  1.00  0.00
77 > ATOM     74  H   UNK     1     -12.240  -1.850   4.846  1.00  0.00
78 > ATOM     75  H   UNK     1     -12.406  -3.558   4.404  1.00  0.00
79 > ATOM     76  H   UNK     1     -11.058  -2.593   3.757  1.00  0.00
80 > ATOM     77  C   UNK     1     -13.641  -5.030   7.766  1.00  0.00
81 > ATOM     78  H   UNK     1     -11.971  -5.698   6.574  1.00  0.00
82 > ATOM     79  H   UNK     1     -13.087  -4.636   5.705  1.00  0.00
83 > ATOM     80  H   UNK     1     -14.252  -5.912   7.540  1.00  0.00
84 > ATOM     81  H   UNK     1     -14.323  -4.174   7.867  1.00  0.00
85 > ATOM     82  H   UNK     1     -13.178  -5.194   8.748  1.00  0.00
86 > CONECT    1    2
87 > CONECT    2    1    3    4
88 > CONECT    3    2    5    7
89 > CONECT    4    2    6
90 > CONECT    5    3    8    9
91 > CONECT    6    4   12   14   22
92 > CONECT    7    3
93 > CONECT    8    5   10   11
94 > CONECT    9    5
95 > CONECT   10    8   13   15
96 > CONECT   11    8   16   17
97 > CONECT   12    6   29   31   70
98 > CONECT   13   10   18   19
99 > CONECT   14    6
100 > CONECT   15   10
101 > CONECT   16   11   19   20
102 > CONECT   17   11
103 > CONECT   18   13
104 > CONECT   19   13   16   21
105 > CONECT   20   16
106 > CONECT   21   19   23   24
107 > CONECT   22    6
108 > CONECT   23   21   25   26
109 > CONECT   24   21
110 > CONECT   25   23   27   28
111 > CONECT   26   23
112 > CONECT   27   25   30   32
113 > CONECT   28   25   33   34
114 > CONECT   29   12   71   72   73
115 > CONECT   30   27   35   36
116 > CONECT   31   12   74   75   76
117 > CONECT   32   27
118 > CONECT   33   28   36   37
119 > CONECT   34   28
120 > CONECT   35   30
121 > CONECT   36   30   33   38
122 > CONECT   37   33
123 > CONECT   38   36   39
124 > CONECT   39   38   40   41   42
125 > CONECT   40   39   43   44   45
126 > CONECT   41   39
127 > CONECT   42   39
128 > CONECT   43   40   46   47   48
129 > CONECT   44   40
130 > CONECT   45   40
131 > CONECT   46   43   49   50   51
132 > CONECT   47   43
133 > CONECT   48   43
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148 > CONECT   63   58
149 > CONECT   64   61   67   68   69
150 > CONECT   65   61
151 > CONECT   66   61
152 > CONECT   67   64
153 > CONECT   68   64
154 > CONECT   69   64
155 > CONECT   70   12
156 > CONECT   71   29
157 > CONECT   72   29
158 > CONECT   73   29   77   78   79
159 > CONECT   74   31
160 > CONECT   75   31
161 > CONECT   76   31
162 > CONECT   77   73   80   81   82
163 > CONECT   78   73
164 > CONECT   79   73
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168 > MASTER        0    0    0    0    0    0    0    0   82    0   82    0
169 > END

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