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root/group/trunk/SHAPES/samples/cholesterol.pdb
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Comparing trunk/SHAPES/samples/cholesterol.pdb (file contents):
Revision 1302 by chrisfen, Thu Jun 24 21:48:08 2004 UTC vs.
Revision 1303 by chrisfen, Thu Jun 24 22:26:30 2004 UTC

# Line 1 | Line 1
1 < COMPND  cholesterol.pdb                                                        
2 < HETATM    1  O                  -7.876   2.722   2.070                
3 < HETATM    2  C                  -6.531   2.280   2.023                
4 < HETATM    6  C                  -5.722   3.377   1.327                
5 < HETATM    7  C                  -6.394   0.962   1.246                
6 < HETATM    9  C                  -4.261   2.973   1.266                
7 < HETATM   12  C                  -4.961   0.577   1.064                
8 < HETATM   18  C                  -4.573  -0.682   1.306                
9 < HETATM   20  C                  -4.018   1.638   0.538                
10 < HETATM   21  C                  -2.543   1.207   0.789                
11 < HETATM   22  C                  -3.193  -1.184   1.097                
12 < HETATM   23  C                  -4.258   1.780  -0.969                
13 < HETATM   27  C                  -1.556   2.204   0.169                
14 < HETATM   29  C                  -2.347  -0.228   0.260                
15 < HETATM   31  C                  -0.873  -0.594   0.337                
16 < HETATM   35  C                  -0.105   1.740   0.207                
17 < HETATM   38  C                  -0.443  -1.976  -0.137                
18 < HETATM   42  C                   0.020   0.374  -0.475                
19 < HETATM   44  C                   1.403  -0.340  -0.446                
20 < HETATM   45  C                  -0.394   0.516  -1.943                
21 < HETATM   49  C                   1.075  -1.843  -0.283                
22 < HETATM   50  C                   2.389   0.177   0.615                
23 < HETATM   56  C                   3.800  -0.365   0.360                
24 < HETATM   57  C                   1.940  -0.170   2.025                
25 < HETATM   63  C                   4.387   0.189  -0.927                
26 < HETATM   65  C                   5.709  -0.474  -1.279                
27 < HETATM   68  C                   6.185  -0.062  -2.673                
28 < HETATM   71  C                   7.591  -0.577  -2.928                
29 < HETATM   73  C                   5.228  -0.577  -3.737                
30 < HETATM    3  H                  -8.375   2.022   2.469                
31 < HETATM    8  H                  -6.161   2.142   3.069                
32 < HETATM   10  H                  -5.826   4.337   1.869                
33 < HETATM   11  H                  -6.121   3.563   0.309                
34 < HETATM   13  H                  -6.863   1.059   0.244                
35 < HETATM   14  H                  -6.955   0.157   1.763                
36 < HETATM   15  H                  -3.672   3.770   0.768                
37 < HETATM   17  H                  -3.859   2.902   2.298                
38 < HETATM   24  H                  -5.292  -1.419   1.686                
39 < HETATM   26  H                  -2.364   1.191   1.894                
40 < HETATM   28  H                  -2.728  -1.354   2.091                
41 < HETATM   30  H                  -3.228  -2.179   0.608                
42 < HETATM   25  H                  -4.034   0.827  -1.477                
43 < HETATM   32  H                  -3.586   2.540  -1.402                
44 < HETATM   34  H                  -5.292   2.063  -1.200                
45 < HETATM   36  H                  -1.651   3.181   0.686                
46 < HETATM   37  H                  -1.853   2.390  -0.893                
47 < HETATM   33  H                  -2.705  -0.267  -0.805                
48 < HETATM   39  H                  -0.554  -0.500   1.416                
49 < HETATM   41  H                   0.543   2.488  -0.289                
50 < HETATM   43  H                   0.249   1.665   1.261                
51 < HETATM   46  H                  -0.928  -2.246  -1.094                
52 < HETATM   47  H                  -0.728  -2.769   0.579                
53 < HETATM   48  H                   1.921  -0.184  -1.432                
54 < HETATM   53  H                   0.366   1.071  -2.511                
55 < HETATM   54  H                  -1.342   1.073  -2.047                
56 < HETATM   55  H                  -0.527  -0.460  -2.427                
57 < HETATM   51  H                   1.581  -2.249   0.620                
58 < HETATM   52  H                   1.452  -2.429  -1.138                
59 < HETATM   58  H                   2.436   1.292   0.522                
60 < HETATM   62  H                   4.457  -0.107   1.214                
61 < HETATM   64  H                   3.777  -1.473   0.325                
62 < HETATM   59  H                   2.615   0.238   2.786                
63 < HETATM   60  H                   1.889  -1.263   2.158                
64 < HETATM   61  H                   0.925   0.234   2.206                
65 < HETATM   66  H                   4.520   1.286  -0.846                
66 < HETATM   67  H                   3.661   0.039  -1.768                
67 < HETATM   69  H                   5.611  -1.577  -1.231                
68 < HETATM   70  H                   6.477  -0.209  -0.525                
69 < HETATM   72  H                   6.200   1.055  -2.722                
70 < HETATM   74  H                   7.940  -0.297  -3.930                
71 < HETATM   75  H                   7.639  -1.672  -2.858                
72 < HETATM   76  H                   8.306  -0.169  -2.202                
73 < HETATM   77  H                   5.456  -0.156  -4.724                
74 < HETATM   78  H                   4.189  -0.306  -3.481                
75 < HETATM   79  H                   5.269  -1.670  -3.825                
76 < CONECT    1    2    3                                        
77 < CONECT    2    1    6    7    8                              
78 < CONECT    6    2    9   10   11                              
79 < CONECT    7    2   12   13   14                              
80 < CONECT    9    6   20   15   17                              
81 < CONECT   12    7   18   20                                  
82 < CONECT   18   12   22   24                                  
83 < CONECT   20    9   12   21   23                              
84 < CONECT   21   20   27   29   26                              
85 < CONECT   22   18   29   28   30                              
86 < CONECT   23   20   25   32   34                              
87 < CONECT   27   21   35   36   37                              
88 < CONECT   29   21   22   31   33                              
89 < CONECT   31   29   38   42   39                              
90 < CONECT   35   27   42   41   43                              
91 < CONECT   38   31   49   46   47                              
92 < CONECT   42   31   35   44   45                              
93 < CONECT   44   42   49   50   48                              
94 < CONECT   45   42   53   54   55                              
95 < CONECT   49   38   44   51   52                              
96 < CONECT   50   44   56   57   58                              
97 < CONECT   56   50   63   62   64                              
98 < CONECT   57   50   59   60   61                              
99 < CONECT   63   56   65   66   67                              
100 < CONECT   65   63   68   69   70                              
101 < CONECT   68   65   71   73   72                              
102 < CONECT   71   68   74   75   76                              
103 < CONECT   73   68   77   78   79                              
104 < CONECT    3    1                                            
105 < CONECT    8    2                                            
106 < CONECT   10    6                                            
107 < CONECT   11    6                                            
108 < CONECT   13    7                                            
109 < CONECT   14    7                                            
110 < CONECT   15    9                                            
111 < CONECT   17    9                                            
112 < CONECT   24   18                                            
113 < CONECT   26   21                                            
114 < CONECT   28   22                                            
115 < CONECT   30   22                                            
116 < CONECT   25   23                                            
117 < CONECT   32   23                                            
118 < CONECT   34   23                                            
119 < CONECT   36   27                                            
120 < CONECT   37   27                                            
121 < CONECT   33   29                                            
122 < CONECT   39   31                                            
123 < CONECT   41   35                                            
124 < CONECT   43   35                                            
125 < CONECT   46   38                                            
126 < CONECT   47   38                                            
127 < CONECT   48   44                                            
128 < CONECT   53   45                                            
129 < CONECT   54   45                                            
130 < CONECT   55   45                                            
131 < CONECT   51   49                                            
132 < CONECT   52   49                                            
133 < CONECT   58   50                                            
134 < CONECT   62   56                                            
135 < CONECT   64   56                                            
136 < CONECT   59   57                                            
137 < CONECT   60   57                                            
138 < CONECT   61   57                                            
139 < CONECT   66   63                                            
140 < CONECT   67   63                                            
141 < CONECT   69   65                                            
142 < CONECT   70   65                                            
143 < CONECT   72   68                                            
144 < CONECT   74   71                                            
145 < CONECT   75   71                                            
146 < CONECT   76   71                                            
147 < CONECT   77   73                                            
148 < CONECT   78   73                                            
149 < CONECT   79   73                                            
150 < END  
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9 > AUTHOR    GENERATED BY BABEL 1.6 \
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26 > ATOM     17  C   UNK     1      -2.509   0.423   1.616  1.00  0.00 \
27 > ATOM     18  C   UNK     1      -3.158  -1.968   1.924  1.00  0.00 \
28 > ATOM     19  C   UNK     1      -4.223   0.996  -0.141  1.00  0.00 \
29 > ATOM     20  H   UNK     1      -5.257  -2.203   2.513  1.00  0.00 \
30 > ATOM     21  H   UNK     1      -3.999   0.043  -0.649  1.00  0.00 \
31 > ATOM     22  H   UNK     1      -2.329   0.407   2.721  1.00  0.00 \
32 > ATOM     23  C   UNK     1      -1.522   1.420   0.996  1.00  0.00 \
33 > ATOM     24  H   UNK     1      -2.693  -2.138   2.918  1.00  0.00 \
34 > ATOM     25  C   UNK     1      -2.312  -1.012   1.087  1.00  0.00 \
35 > ATOM     26  H   UNK     1      -3.193  -2.963   1.435  1.00  0.00 \
36 > ATOM     27  C   UNK     1      -0.838  -1.378   1.164  1.00  0.00 \
37 > ATOM     28  H   UNK     1      -3.551   1.756  -0.574  1.00  0.00 \
38 > ATOM     29  H   UNK     1      -2.670  -1.051   0.023  1.00  0.00 \
39 > ATOM     30  H   UNK     1      -5.257   1.279  -0.372  1.00  0.00 \
40 > ATOM     31  C   UNK     1      -0.070   0.956   1.034  1.00  0.00 \
41 > ATOM     32  H   UNK     1      -1.616   2.397   1.513  1.00  0.00 \
42 > ATOM     33  H   UNK     1      -1.818   1.606  -0.065  1.00  0.00 \
43 > ATOM     34  C   UNK     1      -0.408  -2.760   0.691  1.00  0.00 \
44 > ATOM     35  H   UNK     1      -0.519  -1.284   2.243  1.00  0.00 \
45 > ATOM     36  H   UNK     1       0.578   1.704   0.539  1.00  0.00 \
46 > ATOM     37  C   UNK     1       0.054  -0.410   0.353  1.00  0.00 \
47 > ATOM     38  H   UNK     1       0.283   0.881   2.088  1.00  0.00 \
48 > ATOM     39  C   UNK     1       1.438  -1.124   0.382  1.00  0.00 \
49 > ATOM     40  C   UNK     1      -0.359  -0.268  -1.115  1.00  0.00 \
50 > ATOM     41  H   UNK     1      -0.893  -3.030  -0.266  1.00  0.00 \
51 > ATOM     42  H   UNK     1      -0.693  -3.553   1.406  1.00  0.00 \
52 > ATOM     43  H   UNK     1       1.955  -0.968  -0.604  1.00  0.00 \
53 > ATOM     44  C   UNK     1       1.109  -2.627   0.545  1.00  0.00 \
54 > ATOM     45  C   UNK     1       2.423  -0.607   1.442  1.00  0.00 \
55 > ATOM     46  H   UNK     1       1.615  -3.033   1.447  1.00  0.00 \
56 > ATOM     47  H   UNK     1       1.486  -3.213  -0.310  1.00  0.00 \
57 > ATOM     48  H   UNK     1       0.400   0.287  -1.683  1.00  0.00 \
58 > ATOM     49  H   UNK     1      -1.307   0.289  -1.219  1.00  0.00 \
59 > ATOM     50  H   UNK     1      -0.492  -1.244  -1.599  1.00  0.00 \
60 > ATOM     51  C   UNK     1       3.834  -1.149   1.187  1.00  0.00 \
61 > ATOM     52  C   UNK     1       1.974  -0.954   2.852  1.00  0.00 \
62 > ATOM     53  H   UNK     1       2.470   0.508   1.349  1.00  0.00 \
63 > ATOM     54  H   UNK     1       2.649  -0.546   3.613  1.00  0.00 \
64 > ATOM     55  H   UNK     1       1.923  -2.047   2.985  1.00  0.00 \
65 > ATOM     56  H   UNK     1       0.959  -0.550   3.033  1.00  0.00 \
66 > ATOM     57  H   UNK     1       4.491  -0.891   2.041  1.00  0.00 \
67 > ATOM     58  C   UNK     1       4.421  -0.595  -0.099  1.00  0.00 \
68 > ATOM     59  H   UNK     1       3.811  -2.257   1.152  1.00  0.00 \
69 > ATOM     60  C   UNK     1       5.744  -1.258  -0.451  1.00  0.00 \
70 > ATOM     61  H   UNK     1       4.554   0.502  -0.018  1.00  0.00 \
71 > ATOM     62  H   UNK     1       3.695  -0.745  -0.940  1.00  0.00 \
72 > ATOM     63  C   UNK     1       6.219  -0.846  -1.845  1.00  0.00 \
73 > ATOM     64  H   UNK     1       5.645  -2.361  -0.403  1.00  0.00 \
74 > ATOM     65  H   UNK     1       6.511  -0.993   0.303  1.00  0.00 \
75 > ATOM     66  C   UNK     1       7.625  -1.361  -2.100  1.00  0.00 \
76 > ATOM     67  H   UNK     1       6.234   0.271  -1.894  1.00  0.00 \
77 > ATOM     68  C   UNK     1       5.262  -1.361  -2.909  1.00  0.00 \
78 > ATOM     69  H   UNK     1       7.974  -1.081  -3.102  1.00  0.00 \
79 > ATOM     70  H   UNK     1       7.673  -2.456  -2.030  1.00  0.00 \
80 > ATOM     71  H   UNK     1       8.341  -0.953  -1.374  1.00  0.00 \
81 > ATOM     72  H   UNK     1       5.490  -0.940  -3.897  1.00  0.00 \
82 > ATOM     73  H   UNK     1       4.223  -1.090  -2.653  1.00  0.00 \
83 > ATOM     74  H   UNK     1       5.303  -2.454  -2.997  1.00  0.00 \
84 > CONECT    1    2    3\
85 > CONECT    2    1    4    5    6\
86 > CONECT    3    1\
87 > CONECT    4    2    7    8    9\
88 > CONECT    5    2   10   11   12\
89 > CONECT    6    2\
90 > CONECT    7    4   13   14   16\
91 > CONECT    8    4\
92 > CONECT    9    4\
93 > CONECT   10    5   15   16\
94 > CONECT   11    5\
95 > CONECT   12    5\
96 > CONECT   13    7\
97 > CONECT   14    7\
98 > CONECT   15   10   18   20\
99 > CONECT   16    7   10   17   19\
100 > CONECT   17   16   22   23   25\
101 > CONECT   18   15   24   25   26\
102 > CONECT   19   16   21   28   30\
103 > CONECT   20   15\
104 > CONECT   21   19\
105 > CONECT   22   17\
106 > CONECT   23   17   31   32   33\
107 > CONECT   24   18\
108 > CONECT   25   17   18   27   29\
109 > CONECT   26   18\
110 > CONECT   27   25   34   35   37\
111 > CONECT   28   19\
112 > CONECT   29   25\
113 > CONECT   30   19\
114 > CONECT   31   23   36   37   38\
115 > CONECT   32   23\
116 > CONECT   33   23\
117 > CONECT   34   27   41   42   44\
118 > CONECT   35   27\
119 > CONECT   36   31\
120 > CONECT   37   27   31   39   40\
121 > CONECT   38   31\
122 > CONECT   39   37   43   44   45\
123 > CONECT   40   37   48   49   50\
124 > CONECT   41   34\
125 > CONECT   42   34\
126 > CONECT   43   39\
127 > CONECT   44   34   39   46   47\
128 > CONECT   45   39   51   52   53\
129 > CONECT   46   44\
130 > CONECT   47   44\
131 > CONECT   48   40\
132 > CONECT   49   40\
133 > CONECT   50   40\
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135 > CONECT   52   45   54   55   56\
136 > CONECT   53   45\
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138 > CONECT   55   52\
139 > CONECT   56   52\
140 > CONECT   57   51\
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150 > CONECT   67   63\
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158 > MASTER        0    0    0    0    0    0    0    0   74    0   74    0\
159 > END}

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