ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/group/trunk/SHAPES/samples/cholesterol.pdb
(Generate patch)

Comparing trunk/SHAPES/samples/cholesterol.pdb (file contents):
Revision 1303 by chrisfen, Thu Jun 24 22:26:30 2004 UTC vs.
Revision 1304 by chrisfen, Thu Jun 24 23:07:12 2004 UTC

# Line 1 | Line 1
1 < {\rtf1\mac\ansicpg10000\cocoartf102
2 < {\fonttbl\f0\fmodern\fcharset77 Courier;}
3 < {\colortbl;\red255\green255\blue255;}
4 < \margl1440\margr1440\vieww9000\viewh9000\viewkind0
5 < \pard\tx560\tx1120\tx1680\tx2240\tx2800\tx3360\tx3920\tx4480\tx5040\tx5600\tx6160\tx6720\ql\qnatural
6 <
7 < \f0\fs26 \cf0 HEADER    PROTEIN\
8 < COMPND    CON \
9 < AUTHOR    GENERATED BY BABEL 1.6 \
10 < ATOM      1  O   UNK     1      -7.841   1.938   2.897  1.00  0.00 \
11 < ATOM      2  C   UNK     1      -6.496   1.496   2.850  1.00  0.00 \
12 < ATOM      3  H   UNK     1      -8.341   1.238   3.296  1.00  0.00 \
13 < ATOM      4  C   UNK     1      -5.687   2.593   2.154  1.00  0.00 \
14 < ATOM      5  C   UNK     1      -6.359   0.178   2.073  1.00  0.00 \
15 < ATOM      6  H   UNK     1      -6.126   1.358   3.896  1.00  0.00 \
16 < ATOM      7  C   UNK     1      -4.226   2.189   2.093  1.00  0.00 \
17 < ATOM      8  H   UNK     1      -5.791   3.553   2.696  1.00  0.00 \
18 < ATOM      9  H   UNK     1      -6.086   2.779   1.136  1.00  0.00 \
19 < ATOM     10  C   UNK     1      -4.926  -0.207   1.891  1.00  0.00 \
20 < ATOM     11  H   UNK     1      -6.828   0.275   1.071  1.00  0.00 \
21 < ATOM     12  H   UNK     1      -6.920  -0.627   2.590  1.00  0.00 \
22 < ATOM     13  H   UNK     1      -3.637   2.986   1.595  1.00  0.00 \
23 < ATOM     14  H   UNK     1      -3.824   2.118   3.125  1.00  0.00 \
24 < ATOM     15  C   UNK     1      -4.538  -1.466   2.134  1.00  0.00 \
25 < ATOM     16  C   UNK     1      -3.983   0.854   1.365  1.00  0.00 \
26 < ATOM     17  C   UNK     1      -2.509   0.423   1.616  1.00  0.00 \
27 < ATOM     18  C   UNK     1      -3.158  -1.968   1.924  1.00  0.00 \
28 < ATOM     19  C   UNK     1      -4.223   0.996  -0.141  1.00  0.00 \
29 < ATOM     20  H   UNK     1      -5.257  -2.203   2.513  1.00  0.00 \
30 < ATOM     21  H   UNK     1      -3.999   0.043  -0.649  1.00  0.00 \
31 < ATOM     22  H   UNK     1      -2.329   0.407   2.721  1.00  0.00 \
32 < ATOM     23  C   UNK     1      -1.522   1.420   0.996  1.00  0.00 \
33 < ATOM     24  H   UNK     1      -2.693  -2.138   2.918  1.00  0.00 \
34 < ATOM     25  C   UNK     1      -2.312  -1.012   1.087  1.00  0.00 \
35 < ATOM     26  H   UNK     1      -3.193  -2.963   1.435  1.00  0.00 \
36 < ATOM     27  C   UNK     1      -0.838  -1.378   1.164  1.00  0.00 \
37 < ATOM     28  H   UNK     1      -3.551   1.756  -0.574  1.00  0.00 \
38 < ATOM     29  H   UNK     1      -2.670  -1.051   0.023  1.00  0.00 \
39 < ATOM     30  H   UNK     1      -5.257   1.279  -0.372  1.00  0.00 \
40 < ATOM     31  C   UNK     1      -0.070   0.956   1.034  1.00  0.00 \
41 < ATOM     32  H   UNK     1      -1.616   2.397   1.513  1.00  0.00 \
42 < ATOM     33  H   UNK     1      -1.818   1.606  -0.065  1.00  0.00 \
43 < ATOM     34  C   UNK     1      -0.408  -2.760   0.691  1.00  0.00 \
44 < ATOM     35  H   UNK     1      -0.519  -1.284   2.243  1.00  0.00 \
45 < ATOM     36  H   UNK     1       0.578   1.704   0.539  1.00  0.00 \
46 < ATOM     37  C   UNK     1       0.054  -0.410   0.353  1.00  0.00 \
47 < ATOM     38  H   UNK     1       0.283   0.881   2.088  1.00  0.00 \
48 < ATOM     39  C   UNK     1       1.438  -1.124   0.382  1.00  0.00 \
49 < ATOM     40  C   UNK     1      -0.359  -0.268  -1.115  1.00  0.00 \
50 < ATOM     41  H   UNK     1      -0.893  -3.030  -0.266  1.00  0.00 \
51 < ATOM     42  H   UNK     1      -0.693  -3.553   1.406  1.00  0.00 \
52 < ATOM     43  H   UNK     1       1.955  -0.968  -0.604  1.00  0.00 \
53 < ATOM     44  C   UNK     1       1.109  -2.627   0.545  1.00  0.00 \
54 < ATOM     45  C   UNK     1       2.423  -0.607   1.442  1.00  0.00 \
55 < ATOM     46  H   UNK     1       1.615  -3.033   1.447  1.00  0.00 \
56 < ATOM     47  H   UNK     1       1.486  -3.213  -0.310  1.00  0.00 \
57 < ATOM     48  H   UNK     1       0.400   0.287  -1.683  1.00  0.00 \
58 < ATOM     49  H   UNK     1      -1.307   0.289  -1.219  1.00  0.00 \
59 < ATOM     50  H   UNK     1      -0.492  -1.244  -1.599  1.00  0.00 \
60 < ATOM     51  C   UNK     1       3.834  -1.149   1.187  1.00  0.00 \
61 < ATOM     52  C   UNK     1       1.974  -0.954   2.852  1.00  0.00 \
62 < ATOM     53  H   UNK     1       2.470   0.508   1.349  1.00  0.00 \
63 < ATOM     54  H   UNK     1       2.649  -0.546   3.613  1.00  0.00 \
64 < ATOM     55  H   UNK     1       1.923  -2.047   2.985  1.00  0.00 \
65 < ATOM     56  H   UNK     1       0.959  -0.550   3.033  1.00  0.00 \
66 < ATOM     57  H   UNK     1       4.491  -0.891   2.041  1.00  0.00 \
67 < ATOM     58  C   UNK     1       4.421  -0.595  -0.099  1.00  0.00 \
68 < ATOM     59  H   UNK     1       3.811  -2.257   1.152  1.00  0.00 \
69 < ATOM     60  C   UNK     1       5.744  -1.258  -0.451  1.00  0.00 \
70 < ATOM     61  H   UNK     1       4.554   0.502  -0.018  1.00  0.00 \
71 < ATOM     62  H   UNK     1       3.695  -0.745  -0.940  1.00  0.00 \
72 < ATOM     63  C   UNK     1       6.219  -0.846  -1.845  1.00  0.00 \
73 < ATOM     64  H   UNK     1       5.645  -2.361  -0.403  1.00  0.00 \
74 < ATOM     65  H   UNK     1       6.511  -0.993   0.303  1.00  0.00 \
75 < ATOM     66  C   UNK     1       7.625  -1.361  -2.100  1.00  0.00 \
76 < ATOM     67  H   UNK     1       6.234   0.271  -1.894  1.00  0.00 \
77 < ATOM     68  C   UNK     1       5.262  -1.361  -2.909  1.00  0.00 \
78 < ATOM     69  H   UNK     1       7.974  -1.081  -3.102  1.00  0.00 \
79 < ATOM     70  H   UNK     1       7.673  -2.456  -2.030  1.00  0.00 \
80 < ATOM     71  H   UNK     1       8.341  -0.953  -1.374  1.00  0.00 \
81 < ATOM     72  H   UNK     1       5.490  -0.940  -3.897  1.00  0.00 \
82 < ATOM     73  H   UNK     1       4.223  -1.090  -2.653  1.00  0.00 \
83 < ATOM     74  H   UNK     1       5.303  -2.454  -2.997  1.00  0.00 \
84 < CONECT    1    2    3\
85 < CONECT    2    1    4    5    6\
86 < CONECT    3    1\
87 < CONECT    4    2    7    8    9\
88 < CONECT    5    2   10   11   12\
89 < CONECT    6    2\
90 < CONECT    7    4   13   14   16\
91 < CONECT    8    4\
92 < CONECT    9    4\
93 < CONECT   10    5   15   16\
94 < CONECT   11    5\
95 < CONECT   12    5\
96 < CONECT   13    7\
97 < CONECT   14    7\
98 < CONECT   15   10   18   20\
99 < CONECT   16    7   10   17   19\
100 < CONECT   17   16   22   23   25\
101 < CONECT   18   15   24   25   26\
102 < CONECT   19   16   21   28   30\
103 < CONECT   20   15\
104 < CONECT   21   19\
105 < CONECT   22   17\
106 < CONECT   23   17   31   32   33\
107 < CONECT   24   18\
108 < CONECT   25   17   18   27   29\
109 < CONECT   26   18\
110 < CONECT   27   25   34   35   37\
111 < CONECT   28   19\
112 < CONECT   29   25\
113 < CONECT   30   19\
114 < CONECT   31   23   36   37   38\
115 < CONECT   32   23\
116 < CONECT   33   23\
117 < CONECT   34   27   41   42   44\
118 < CONECT   35   27\
119 < CONECT   36   31\
120 < CONECT   37   27   31   39   40\
121 < CONECT   38   31\
122 < CONECT   39   37   43   44   45\
123 < CONECT   40   37   48   49   50\
124 < CONECT   41   34\
125 < CONECT   42   34\
126 < CONECT   43   39\
127 < CONECT   44   34   39   46   47\
128 < CONECT   45   39   51   52   53\
129 < CONECT   46   44\
130 < CONECT   47   44\
131 < CONECT   48   40\
132 < CONECT   49   40\
133 < CONECT   50   40\
134 < CONECT   51   45   57   58   59\
135 < CONECT   52   45   54   55   56\
136 < CONECT   53   45\
137 < CONECT   54   52\
138 < CONECT   55   52\
139 < CONECT   56   52\
140 < CONECT   57   51\
141 < CONECT   58   51   60   61   62\
142 < CONECT   59   51\
143 < CONECT   60   58   63   64   65\
144 < CONECT   61   58\
145 < CONECT   62   58\
146 < CONECT   63   60   66   67   68\
147 < CONECT   64   60\
148 < CONECT   65   60\
149 < CONECT   66   63   69   70   71\
150 < CONECT   67   63\
151 < CONECT   68   63   72   73   74\
152 < CONECT   69   66\
153 < CONECT   70   66\
154 < CONECT   71   66\
155 < CONECT   72   68\
156 < CONECT   73   68\
157 < CONECT   74   68\
158 < MASTER        0    0    0    0    0    0    0    0   74    0   74    0\
159 < END}
1 > HEADER    PROTEIN
2 > COMPND    cholesterol.pdb
3 > AUTHOR    GENERATED BY BABEL 1.6
4 > ATOM      1  O   UNK     1      -7.841   1.938   2.897  1.00  0.00
5 > ATOM      2  C   UNK     1      -6.496   1.496   2.850  1.00  0.00
6 > ATOM      3  H   UNK     1      -8.341   1.238   3.296  1.00  0.00
7 > ATOM      4  C   UNK     1      -5.687   2.593   2.154  1.00  0.00
8 > ATOM      5  C   UNK     1      -6.359   0.178   2.073  1.00  0.00
9 > ATOM      6  H   UNK     1      -6.126   1.358   3.896  1.00  0.00
10 > ATOM      7  C   UNK     1      -4.226   2.189   2.093  1.00  0.00
11 > ATOM      8  H   UNK     1      -5.791   3.553   2.696  1.00  0.00
12 > ATOM      9  H   UNK     1      -6.086   2.779   1.136  1.00  0.00
13 > ATOM     10  C   UNK     1      -4.926  -0.207   1.891  1.00  0.00
14 > ATOM     11  H   UNK     1      -6.828   0.275   1.071  1.00  0.00
15 > ATOM     12  H   UNK     1      -6.920  -0.627   2.590  1.00  0.00
16 > ATOM     13  H   UNK     1      -3.637   2.986   1.595  1.00  0.00
17 > ATOM     14  H   UNK     1      -3.824   2.118   3.125  1.00  0.00
18 > ATOM     15  C   UNK     1      -4.538  -1.466   2.134  1.00  0.00
19 > ATOM     16  C   UNK     1      -3.983   0.854   1.365  1.00  0.00
20 > ATOM     17  C   UNK     1      -2.509   0.423   1.616  1.00  0.00
21 > ATOM     18  C   UNK     1      -3.158  -1.968   1.924  1.00  0.00
22 > ATOM     19  C   UNK     1      -4.223   0.996  -0.141  1.00  0.00
23 > ATOM     20  H   UNK     1      -5.257  -2.203   2.513  1.00  0.00
24 > ATOM     21  H   UNK     1      -3.999   0.043  -0.649  1.00  0.00
25 > ATOM     22  H   UNK     1      -2.329   0.407   2.721  1.00  0.00
26 > ATOM     23  C   UNK     1      -1.522   1.420   0.996  1.00  0.00
27 > ATOM     24  H   UNK     1      -2.693  -2.138   2.918  1.00  0.00
28 > ATOM     25  C   UNK     1      -2.312  -1.012   1.087  1.00  0.00
29 > ATOM     26  H   UNK     1      -3.193  -2.963   1.435  1.00  0.00
30 > ATOM     27  C   UNK     1      -0.838  -1.378   1.164  1.00  0.00
31 > ATOM     28  H   UNK     1      -3.551   1.756  -0.574  1.00  0.00
32 > ATOM     29  H   UNK     1      -2.670  -1.051   0.023  1.00  0.00
33 > ATOM     30  H   UNK     1      -5.257   1.279  -0.372  1.00  0.00
34 > ATOM     31  C   UNK     1      -0.070   0.956   1.034  1.00  0.00
35 > ATOM     32  H   UNK     1      -1.616   2.397   1.513  1.00  0.00
36 > ATOM     33  H   UNK     1      -1.818   1.606  -0.065  1.00  0.00
37 > ATOM     34  C   UNK     1      -0.408  -2.760   0.691  1.00  0.00
38 > ATOM     35  H   UNK     1      -0.519  -1.284   2.243  1.00  0.00
39 > ATOM     36  H   UNK     1       0.578   1.704   0.539  1.00  0.00
40 > ATOM     37  C   UNK     1       0.054  -0.410   0.353  1.00  0.00
41 > ATOM     38  H   UNK     1       0.283   0.881   2.088  1.00  0.00
42 > ATOM     39  C   UNK     1       1.438  -1.124   0.382  1.00  0.00
43 > ATOM     40  C   UNK     1      -0.359  -0.268  -1.115  1.00  0.00
44 > ATOM     41  H   UNK     1      -0.893  -3.030  -0.266  1.00  0.00
45 > ATOM     42  H   UNK     1      -0.693  -3.553   1.406  1.00  0.00
46 > ATOM     43  H   UNK     1       1.955  -0.968  -0.604  1.00  0.00
47 > ATOM     44  C   UNK     1       1.109  -2.627   0.545  1.00  0.00
48 > ATOM     45  C   UNK     1       2.423  -0.607   1.442  1.00  0.00
49 > ATOM     46  H   UNK     1       1.615  -3.033   1.447  1.00  0.00
50 > ATOM     47  H   UNK     1       1.486  -3.213  -0.310  1.00  0.00
51 > ATOM     48  H   UNK     1       0.400   0.287  -1.683  1.00  0.00
52 > ATOM     49  H   UNK     1      -1.307   0.289  -1.219  1.00  0.00
53 > ATOM     50  H   UNK     1      -0.492  -1.244  -1.599  1.00  0.00
54 > ATOM     51  C   UNK     1       3.834  -1.149   1.187  1.00  0.00
55 > ATOM     52  C   UNK     1       1.974  -0.954   2.852  1.00  0.00
56 > ATOM     53  H   UNK     1       2.470   0.508   1.349  1.00  0.00
57 > ATOM     54  H   UNK     1       2.649  -0.546   3.613  1.00  0.00
58 > ATOM     55  H   UNK     1       1.923  -2.047   2.985  1.00  0.00
59 > ATOM     56  H   UNK     1       0.959  -0.550   3.033  1.00  0.00
60 > ATOM     57  H   UNK     1       4.491  -0.891   2.041  1.00  0.00
61 > ATOM     58  C   UNK     1       4.421  -0.595  -0.099  1.00  0.00
62 > ATOM     59  H   UNK     1       3.811  -2.257   1.152  1.00  0.00
63 > ATOM     60  C   UNK     1       5.744  -1.258  -0.451  1.00  0.00
64 > ATOM     61  H   UNK     1       4.554   0.502  -0.018  1.00  0.00
65 > ATOM     62  H   UNK     1       3.695  -0.745  -0.940  1.00  0.00
66 > ATOM     63  C   UNK     1       6.219  -0.846  -1.845  1.00  0.00
67 > ATOM     64  H   UNK     1       5.645  -2.361  -0.403  1.00  0.00
68 > ATOM     65  H   UNK     1       6.511  -0.993   0.303  1.00  0.00
69 > ATOM     66  C   UNK     1       7.625  -1.361  -2.100  1.00  0.00
70 > ATOM     67  H   UNK     1       6.234   0.271  -1.894  1.00  0.00
71 > ATOM     68  C   UNK     1       5.262  -1.361  -2.909  1.00  0.00
72 > ATOM     69  H   UNK     1       7.974  -1.081  -3.102  1.00  0.00
73 > ATOM     70  H   UNK     1       7.673  -2.456  -2.030  1.00  0.00
74 > ATOM     71  H   UNK     1       8.341  -0.953  -1.374  1.00  0.00
75 > ATOM     72  H   UNK     1       5.490  -0.940  -3.897  1.00  0.00
76 > ATOM     73  H   UNK     1       4.223  -1.090  -2.653  1.00  0.00
77 > ATOM     74  H   UNK     1       5.303  -2.454  -2.997  1.00  0.00
78 > CONECT    1    2    3
79 > CONECT    2    1    4    5    6
80 > CONECT    3    1
81 > CONECT    4    2    7    8    9
82 > CONECT    5    2   10   11   12
83 > CONECT    6    2
84 > CONECT    7    4   13   14   16
85 > CONECT    8    4
86 > CONECT    9    4
87 > CONECT   10    5   15   16
88 > CONECT   11    5
89 > CONECT   12    5
90 > CONECT   13    7
91 > CONECT   14    7
92 > CONECT   15   10   18   20
93 > CONECT   16    7   10   17   19
94 > CONECT   17   16   22   23   25
95 > CONECT   18   15   24   25   26
96 > CONECT   19   16   21   28   30
97 > CONECT   20   15
98 > CONECT   21   19
99 > CONECT   22   17
100 > CONECT   23   17   31   32   33
101 > CONECT   24   18
102 > CONECT   25   17   18   27   29
103 > CONECT   26   18
104 > CONECT   27   25   34   35   37
105 > CONECT   28   19
106 > CONECT   29   25
107 > CONECT   30   19
108 > CONECT   31   23   36   37   38
109 > CONECT   32   23
110 > CONECT   33   23
111 > CONECT   34   27   41   42   44
112 > CONECT   35   27
113 > CONECT   36   31
114 > CONECT   37   27   31   39   40
115 > CONECT   38   31
116 > CONECT   39   37   43   44   45
117 > CONECT   40   37   48   49   50
118 > CONECT   41   34
119 > CONECT   42   34
120 > CONECT   43   39
121 > CONECT   44   34   39   46   47
122 > CONECT   45   39   51   52   53
123 > CONECT   46   44
124 > CONECT   47   44
125 > CONECT   48   40
126 > CONECT   49   40
127 > CONECT   50   40
128 > CONECT   51   45   57   58   59
129 > CONECT   52   45   54   55   56
130 > CONECT   53   45
131 > CONECT   54   52
132 > CONECT   55   52
133 > CONECT   56   52
134 > CONECT   57   51
135 > CONECT   58   51   60   61   62
136 > CONECT   59   51
137 > CONECT   60   58   63   64   65
138 > CONECT   61   58
139 > CONECT   62   58
140 > CONECT   63   60   66   67   68
141 > CONECT   64   60
142 > CONECT   65   60
143 > CONECT   66   63   69   70   71
144 > CONECT   67   63
145 > CONECT   68   63   72   73   74
146 > CONECT   69   66
147 > CONECT   70   66
148 > CONECT   71   66
149 > CONECT   72   68
150 > CONECT   73   68
151 > CONECT   74   68
152 > MASTER        0    0    0    0    0    0    0    0   74    0   74    0
153 > END

Diff Legend

– Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines