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root/group/trunk/mdtools/interface_implementation/bassDiag.cpp
Revision: 131
Committed: Wed Oct 9 22:29:40 2002 UTC (21 years, 9 months ago) by chuckv
File size: 6089 byte(s)
Log Message: 
*** empty log message ***

File Contents

# User Rev Content
1 chuckv 128 #include <iostream>
2     #include <cstdio>
3     #include <cstring>
4     #include <cstdlib>
5 chuckv 131
6 chuckv 128 #include "bassDiag.hpp"
7    
8     void bassDiag::dumpStamps(void){
9     char msg[1000];
10     Component** components;
11     int n_components;
12     MoleculeStamp* testMolecule;
13    
14     dumpFormater("First comes the globals..... \n");
15     sprintf(msg,"ForceField = %s\n",globals->getForceField());
16     dumpFormater(msg);
17    
18     sprintf(msg,"NComponents = %d\n",globals->getNComponents());
19     dumpFormater(msg);
20    
21     sprintf(msg,"TargatTemp = %lf\n",globals->getTargetTemp());
22     dumpFormater(msg);
23    
24     sprintf(msg,"Ensemble = %s\n",globals->getEnsemble());
25     dumpFormater(msg);
26    
27     sprintf(msg,"Dt = %lf\n",globals->getDt());
28     dumpFormater(msg);
29    
30     sprintf(msg,"RunTime = %lf\n\n",globals->getRunTime());
31     dumpFormater(msg);
32    
33     sprintf(msg,"Dumping Optional Globals....\n");
34     dumpFormater(msg);
35    
36     if (globals->haveInitialConfig()){
37    
38     sprintf(msg,"InitialConfig = %s\n",globals->getInitialConfig());
39     dumpFormater(msg);
40     }
41     if (globals->haveFinalConfig()){
42    
43     sprintf(msg,"FinalConfig = %s\n",globals->getFinalConfig());
44     dumpFormater(msg);
45     }
46    
47     if (globals->haveNMol()){
48    
49     sprintf(msg,"NMol = %d\n",globals->getNMol());
50     dumpFormater(msg);
51     }
52    
53     if (globals->haveDensity()){
54    
55     sprintf(msg,"Density = %lf\n",globals->getDensity());
56     dumpFormater(msg);
57     }
58    
59     if (globals->haveBox()){
60    
61     sprintf(msg,"Box = %lf\n",globals->getBox());
62     dumpFormater(msg);
63     }
64    
65     if (globals->haveBoxX()){
66    
67     sprintf(msg,"BoxX = %lf\n",globals->getBoxX());
68     dumpFormater(msg);
69     }
70     if (globals->haveBoxY()){
71    
72     sprintf(msg,"BoxY = %lf\n",globals->getBoxY());
73     dumpFormater(msg);
74     }
75     if (globals->haveBoxZ()){
76    
77     sprintf(msg,"BoxZ = %lf\n",globals->getBoxZ());
78     dumpFormater(msg);
79     }
80    
81     if (globals->haveSampleTime()){
82    
83     sprintf(msg,"SampleTime = %lf\n",globals->getSampleTime());
84     dumpFormater(msg);
85     }
86    
87     if (globals->haveStatusTime()){
88    
89     sprintf(msg,"StatusTime = %lf\n",globals->getStatusTime());
90     dumpFormater(msg);
91     }
92    
93     if (globals->haveThermalTime()){
94    
95     sprintf(msg,"ThermalTime = %lf\n",globals->getThermalTime());
96     dumpFormater(msg);
97     }
98    
99     if (globals->haveDielectric()){
100    
101     sprintf(msg,"Dielectric = %lf\n",globals->getDielectric());
102     dumpFormater(msg);
103     }
104    
105     if (globals->haveRRF()){
106    
107     sprintf(msg,"RRF = %lf\n",globals->getRRF());
108     dumpFormater(msg);
109     }
110    
111     if (globals->haveTempSet()){
112 chuckv 131 sprintf(msg,"TempSet = %d\n",globals->getTempSet());
113 chuckv 128 dumpFormater(msg);
114    
115     }
116    
117     n_components = globals->getNComponents();
118     sprintf(msg,"\nWriting out %d components\n",n_components);
119     dumpFormater(msg);
120 chuckv 131 components = globals->getComponents();
121 chuckv 128
122     for(int i=0; i < n_components ; i++){
123    
124     sprintf(msg,"Component[%d]{\n",i);
125     dumpFormater(msg);
126    
127     sprintf(msg," Type = %s\n",components[i]->getType());
128     dumpFormater(msg);
129    
130 chuckv 131 if (components[i]->haveNMol()){
131 chuckv 128
132     sprintf(msg," Nmol = %d\n",components[i]->getNMol());
133     dumpFormater(msg);
134     }
135    
136     sprintf(msg,"{\n\n");
137     dumpFormater(msg);
138     }
139    
140     testMolecule = stamps->getMolecule("tester");
141    
142 chuckv 129 if(testMolecule != NULL ){
143 chuckv 128
144 chuckv 129 sprintf(msg,"\nWriting out tester..... \n\n");
145     dumpFormater(msg);
146 chuckv 128
147 chuckv 129 sprintf(msg,"Molecule{\n");
148 chuckv 128 dumpFormater(msg);
149 chuckv 129
150     sprintf(msg," ID = %s\n",testMolecule->getID());
151 chuckv 128 dumpFormater(msg);
152    
153 chuckv 129 sprintf(msg," NAtoms = %d\n",testMolecule->getNAtoms());
154     dumpFormater(msg);
155    
156     int nAtoms = testMolecule->getNAtoms();
157     AtomStamp* aStamp;
158     for(int i=0; i<nAtoms;i++){
159    
160     aStamp = testMolecule->getAtom(i);
161    
162     sprintf(msg," Atom[%d]{\n",i);
163 chuckv 128 dumpFormater(msg);
164 chuckv 129
165 chuckv 131 sprintf(msg," type = %s\n",aStamp->getType());
166 chuckv 128 dumpFormater(msg);
167 chuckv 129
168     if(aStamp->havePosition()){
169     sprintf(msg," position = < %lf, %lf, %lf>\n",
170     aStamp->getPosX(),
171     aStamp->getPosY(),
172     aStamp->getPosZ());
173     dumpFormater(msg);
174     }
175    
176     if(aStamp->haveOrientation()){
177     sprintf(msg," orientation = < %lf, %lf, %lf>\n",
178     aStamp->getOrntX(),
179     aStamp->getOrntY(),
180     aStamp->getOrntZ());
181     dumpFormater(msg);
182     }
183     sprintf(msg," }\n\n");
184     dumpFormater(msg);
185 chuckv 128 }
186 chuckv 129
187     sprintf(msg," NBonds = %d\n",testMolecule->getNBonds());
188 chuckv 128 dumpFormater(msg);
189    
190 chuckv 129 int nBonds = testMolecule->getNBonds();
191     BondStamp* boStamp;
192     for(int i=0; i<nBonds;i++){
193    
194     boStamp = testMolecule->getBond(i);
195    
196     sprintf(msg," Bond[%d]{\n",i);
197     dumpFormater(msg);
198    
199     sprintf(msg," members = %d, %d\n",
200     boStamp->getA(),
201     boStamp->getB());
202     dumpFormater(msg);
203    
204     sprintf(msg," }\n\n");
205     dumpFormater(msg);
206     }
207 chuckv 128
208 chuckv 129 sprintf(msg," NBends = %d\n",testMolecule->getNBends());
209 chuckv 128 dumpFormater(msg);
210    
211 chuckv 129 int nBends = testMolecule->getNBends();
212     BendStamp* beStamp;
213     for(int i=0; i<nBends;i++){
214    
215     beStamp = testMolecule->getBend(i);
216    
217     sprintf(msg," Bend[%d]{\n",i);
218     dumpFormater(msg);
219    
220     sprintf(msg," members = %d, %d, %d\n",
221     beStamp->getA(),
222     beStamp->getB(),
223     beStamp->getC());
224     dumpFormater(msg);
225    
226     sprintf(msg," }\n\n");
227     dumpFormater(msg);
228     }
229    
230     sprintf(msg," NTorsions = %d\n",testMolecule->getNTorsions());
231 chuckv 128 dumpFormater(msg);
232    
233 chuckv 129 int nTorsions = testMolecule->getNTorsions();
234     TorsionStamp* tStamp;
235     for(int i=0; i<nTorsions;i++){
236    
237     tStamp = testMolecule->getTorsion(i);
238    
239     sprintf(msg," Torsion[%d]{\n",i);
240     dumpFormater(msg);
241    
242     sprintf(msg," members = %d, %d, %d, %d\n",
243     tStamp->getA(),
244     tStamp->getB(),
245     tStamp->getC(),
246     tStamp->getD());
247     dumpFormater(msg);
248    
249     sprintf(msg," }\n\n");
250     dumpFormater(msg);
251     }
252 chuckv 128
253 chuckv 129 sprintf(msg,"}\n\n");
254 chuckv 128 dumpFormater(msg);
255    
256     }
257 chuckv 129 else{
258     sprintf(msg, "\n**************** Tester.mdl not included *************\n");
259 chuckv 131 dumpFormater( msg );
260 chuckv 128
261     }
262 chuckv 129 }
263 chuckv 128
264     void bassDiag::dumpFormater(char * theString){
265    
266     std::cout << theString;
267     std::cout.flush();
268     }
269    
270    
271    
272