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root/group/trunk/mdtools/interface_implementation/bassDiag.cpp
(Generate patch)

Comparing trunk/mdtools/interface_implementation/bassDiag.cpp (file contents):
Revision 128 by chuckv, Thu Oct 3 21:52:46 2002 UTC vs.
Revision 131 by chuckv, Wed Oct 9 22:29:40 2002 UTC

# Line 2 | Line 2
2   #include <cstdio>
3   #include <cstring>
4   #include <cstdlib>
5 +
6   #include "bassDiag.hpp"
7  
8   void bassDiag::dumpStamps(void){
# Line 108 | Line 109 | void bassDiag::dumpStamps(void){
109    }
110  
111    if (globals->haveTempSet()){
112 <    sprintf(msg,"TempSet = %lf\n",globals->getTempSet());
112 >    sprintf(msg,"TempSet = %d\n",globals->getTempSet());
113      dumpFormater(msg);
114  
115    }
# Line 116 | Line 117 | void bassDiag::dumpStamps(void){
117    n_components = globals->getNComponents();
118    sprintf(msg,"\nWriting out %d components\n",n_components);
119    dumpFormater(msg);
120 <  components = globals-getComponents();
120 >  components = globals->getComponents();
121  
122    for(int i=0; i < n_components ; i++){
123  
# Line 126 | Line 127 | void bassDiag::dumpStamps(void){
127      sprintf(msg,"  Type = %s\n",components[i]->getType());
128      dumpFormater(msg);
129  
130 <    if (components[i]->haveNmol){
130 >    if (components[i]->haveNMol()){
131  
132        sprintf(msg,"  Nmol = %d\n",components[i]->getNMol());
133        dumpFormater(msg);
# Line 137 | Line 138 | void bassDiag::dumpStamps(void){
138    }
139  
140    testMolecule = stamps->getMolecule("tester");
140 –  sprintf(msg,"\nWriting out tester..... \n\n");
141 –  dumpFormater(msg);
141    
142 <  sprintf(msg,"Molecule{\n");
144 <  dumpFormater(msg);
145 <
146 <  sprintf(msg,"  ID = %s\n",testMolecule->getID());
147 <  dumpFormater(msg);
148 <
149 <  sprintf(msg,"  NAtoms = %d\n",testMolecule->getNAtoms());
150 <  dumpFormater(msg);
151 <  
152 <  int nAtoms = testMolecule->getNAtoms();
153 <  AtomStamp* aStamp;
154 <  for(int i=0; i<nAtoms;i++){
142 >  if(testMolecule != NULL ){
143      
144 <    aStamp = testMolecule->getAtom(i);
144 >    sprintf(msg,"\nWriting out tester..... \n\n");
145 >    dumpFormater(msg);
146      
147 <    sprintf(msg,"  Atom[%d]{\n",i);
147 >    sprintf(msg,"Molecule{\n");
148      dumpFormater(msg);
149 <
150 <    sprintf(msg,"    type = %s\n",aStamp->getType);
149 >    
150 >    sprintf(msg,"  ID = %s\n",testMolecule->getID());
151      dumpFormater(msg);
152      
153 <    if(aStamp->havePosition()){
154 <      sprintf(msg,"    position = < %lf, %lf, %lf>\n",
155 <              aStamp->getPosX(),
156 <              aStamp->getPosY(),
157 <              aStamp->getPosZ());
153 >    sprintf(msg,"  NAtoms = %d\n",testMolecule->getNAtoms());
154 >    dumpFormater(msg);
155 >    
156 >    int nAtoms = testMolecule->getNAtoms();
157 >    AtomStamp* aStamp;
158 >    for(int i=0; i<nAtoms;i++){
159 >      
160 >      aStamp = testMolecule->getAtom(i);
161 >      
162 >      sprintf(msg,"  Atom[%d]{\n",i);
163        dumpFormater(msg);
164 <    }
165 <
172 <    if(aStamp->haveOrientation()){
173 <      sprintf(msg,"   orientation = < %lf, %lf, %lf>\n",
174 <              aStamp->getOrntX(),
175 <              aStamp->getOrntY(),
176 <              aStamp->getOrntZ());
164 >      
165 >      sprintf(msg,"    type = %s\n",aStamp->getType());
166        dumpFormater(msg);
167 +      
168 +      if(aStamp->havePosition()){
169 +        sprintf(msg,"    position = < %lf, %lf, %lf>\n",
170 +                aStamp->getPosX(),
171 +                aStamp->getPosY(),
172 +                aStamp->getPosZ());
173 +        dumpFormater(msg);
174 +      }
175 +      
176 +      if(aStamp->haveOrientation()){
177 +        sprintf(msg,"   orientation = < %lf, %lf, %lf>\n",
178 +                aStamp->getOrntX(),
179 +                aStamp->getOrntY(),
180 +                aStamp->getOrntZ());
181 +        dumpFormater(msg);
182 +      }
183 +      sprintf(msg,"  }\n\n");
184 +      dumpFormater(msg);
185      }
179 –    sprintf(msg,"  }\n\n");
180 –    dumpFormater(msg);
181 –  }
182 –
183 –  sprintf(msg,"  NBonds = %d\n",testMolecule->getNBonds());
184 –  dumpFormater(msg);
185 –  
186 –  int nBonds = testMolecule->getNBonds();
187 –  BondStamp* boStamp;
188 –  for(int i=0; i<nBonds;i++){
186      
187 <    boStamp = testMolecule->getBond(i);
191 <    
192 <    sprintf(msg,"  Bond[%d]{\n",i);
187 >    sprintf(msg,"  NBonds = %d\n",testMolecule->getNBonds());
188      dumpFormater(msg);
194 –
195 –    sprintf(msg,"    members = %d, %d\n",
196 –            boStamp->getA(),
197 –            boStamp->getB());
198 –    dumpFormater(msg);
189      
190 <    sprintf(msg,"  }\n\n");
191 <    dumpFormater(msg);
192 <  }
193 <
194 <  sprintf(msg,"  NBends = %d\n",testMolecule->getNBends());
195 <  dumpFormater(msg);
196 <  
197 <  int nBends = testMolecule->getNBends();
198 <  BendStamp* beStamp;
199 <  for(int i=0; i<nBends;i++){
200 <    
201 <    beStamp = testMolecule->getBend(i);
190 >    int nBonds = testMolecule->getNBonds();
191 >    BondStamp* boStamp;
192 >    for(int i=0; i<nBonds;i++){
193 >      
194 >      boStamp = testMolecule->getBond(i);
195 >      
196 >      sprintf(msg,"  Bond[%d]{\n",i);
197 >      dumpFormater(msg);
198 >      
199 >      sprintf(msg,"    members = %d, %d\n",
200 >              boStamp->getA(),
201 >              boStamp->getB());
202 >      dumpFormater(msg);
203 >      
204 >      sprintf(msg,"  }\n\n");
205 >      dumpFormater(msg);
206 >    }
207      
208 <    sprintf(msg,"  Bend[%d]{\n",i);
208 >    sprintf(msg,"  NBends = %d\n",testMolecule->getNBends());
209      dumpFormater(msg);
215 –
216 –    sprintf(msg,"    members = %d, %d, %d\n",
217 –            beStamp->getA(),
218 –            beStamp->getB(),
219 –            beStamp->getC());
220 –    dumpFormater(msg);
210      
211 <    sprintf(msg,"  }\n\n");
211 >    int nBends = testMolecule->getNBends();
212 >    BendStamp* beStamp;
213 >    for(int i=0; i<nBends;i++){
214 >      
215 >      beStamp = testMolecule->getBend(i);
216 >      
217 >      sprintf(msg,"  Bend[%d]{\n",i);
218 >      dumpFormater(msg);
219 >      
220 >      sprintf(msg,"    members = %d, %d, %d\n",
221 >              beStamp->getA(),
222 >              beStamp->getB(),
223 >              beStamp->getC());
224 >      dumpFormater(msg);
225 >      
226 >      sprintf(msg,"  }\n\n");
227 >      dumpFormater(msg);
228 >    }
229 >    
230 >    sprintf(msg,"  NTorsions = %d\n",testMolecule->getNTorsions());
231      dumpFormater(msg);
224 –  }
225 –
226 –  sprintf(msg,"  NTorsions = %d\n",testMolecule->getNTorsions());
227 –  dumpFormater(msg);
228 –  
229 –  int nTorsions = testMolecule->getNTorsions();
230 –  TorsionStamp* tStamp;
231 –  for(int i=0; i<nTorsions;i++){
232      
233 <    tStamp = testMolecule->getTorsion(i);
233 >    int nTorsions = testMolecule->getNTorsions();
234 >    TorsionStamp* tStamp;
235 >    for(int i=0; i<nTorsions;i++){
236 >      
237 >      tStamp = testMolecule->getTorsion(i);
238 >      
239 >      sprintf(msg,"  Torsion[%d]{\n",i);
240 >      dumpFormater(msg);
241 >      
242 >      sprintf(msg,"    members = %d, %d, %d, %d\n",
243 >              tStamp->getA(),
244 >              tStamp->getB(),
245 >              tStamp->getC(),
246 >              tStamp->getD());
247 >      dumpFormater(msg);
248 >      
249 >      sprintf(msg,"  }\n\n");
250 >      dumpFormater(msg);
251 >    }
252      
253 <    sprintf(msg,"  Torsion[%d]{\n",i);
253 >    sprintf(msg,"}\n\n");
254      dumpFormater(msg);
237 –
238 –    sprintf(msg,"    members = %d, %d, %d, %d\n",
239 –            tStamp->getA(),
240 –            tStamp->getB(),
241 –            tStamp->getC(),
242 –            tStamp->getD());
243 –    dumpFormater(msg);
255      
245 –    sprintf(msg,"  }\n\n");
246 –    dumpFormater(msg);
256    }
257 <
258 <  sprintf(msg,"}\n\n");
259 <  dumpFormater(msg);
257 >  else{
258 >    sprintf(msg, "\n**************** Tester.mdl not included *************\n");
259 >    dumpFormater( msg );
260    
261 +  }
262   }
263 <
263 >  
264   void bassDiag::dumpFormater(char * theString){
265  
266    std::cout << theString;

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