<div dir="ltr">Dear Professor <span style="color:rgb(0,0,0);white-space:pre-wrap">Gezelter,</span><div><span style="color:rgb(0,0,0);white-space:pre-wrap"><br></span></div><div><font color="#000000"><span style="white-space:pre-wrap">I am quite naive about molecular dynamics but I need to simulate binding of streptavidin molecules to a 20 nm sized biotinylated gold nano-particle for my work. I have built the gold nano-particle using the instructions in the website. Now I need to add biotin ligands into gold nano-particle and then determine the binding sites of streptavidin on the surface of biotinylated particle. I was wondering if it is possible to do all of these simulations using OpenMD? </span></font></div><div><font color="#000000"><span style="white-space:pre-wrap"><br></span></font></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">I would greatly appreciate any help and suggestions you could provide.</span><font color="#000000"><span style="white-space:pre-wrap"><br></span></font></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br></span></div><div><font face="arial, sans-serif">Best,</font></div><div><font face="arial, sans-serif">Mohammad</font></div></div>