Here is a list of all documented functions with links to the class documentation for each member:

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~

- g -

• GaussianTriangleQuadratureRule() : OpenMD::GaussianTriangleQuadratureRule
• GBheadVisitor() : OpenMD::GBheadVisitor
• GBtailVisitor() : OpenMD::GBtailVisitor
• get() : OpenMD::OpenMDBitSet, OpenMD::SelectionSet
• get95percentConfidenceInterval() : OpenMD::Accumulator, OpenMD::MatrixAccumulator, OpenMD::PotVecAccumulator, OpenMD::VectorAccumulator
• get_rotation_angle() : OpenMD::Quaternion< Real >
• getA() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• GetAllredRochowElectroNeg() : OpenMD::Element, OpenMD::ElementsTable
• getAllTokens() : OpenMD::StringTokenizer
• getAngularMomentum() : OpenMD::Thermo
• getAngularVelocity() : OpenMD::VelocityField
• getArray() : DynamicRectMatrix< Real >, OpenMD::DynamicRectMatrix< Real >, OpenMD::RectMatrix< Real, Row, Col >, OpenMD::Vector< Real, Dim >
• getArrayPointer() : DynamicRectMatrix< Real >, OpenMD::DataStorage, OpenMD::DynamicRectMatrix< Real >, OpenMD::RectMatrix< Real, Row, Col >, OpenMD::Vector< Real, Dim >
• GetAtomicNum() : OpenMD::Element, OpenMD::ElementsTable
• getAtomPos() : OpenMD::RigidBody
• getAtomRefCoor() : OpenMD::RigidBody
• getAtoms() : OpenMD::RigidBody
• getAtomsInGroupRow() : OpenMD::ForceMatrixDecomposition
• getAtomStorageLayout() : OpenMD::SimInfo
• getAtomType() : OpenMD::Atom, OpenMD::ForceField
• getAtomVel() : OpenMD::RigidBody
• getAverage() : OpenMD::Accumulator, OpenMD::MatrixAccumulator, OpenMD::PotVecAccumulator, OpenMD::VectorAccumulator
• getAverageLength() : OpenMD::PotVecAccumulator, OpenMD::VectorAccumulator
• getBackgroundVelocity() : OpenMD::VelocityField
• GetBlue() : OpenMD::Element
• getBoundingBox() : OpenMD::Snapshot, OpenMD::Thermo
• getBytesPerStuntDouble() : OpenMD::DataStorage
• getChebyshevPolynomial() : OpenMD::ChebyshevT, OpenMD::ChebyshevU
• getCoefficient() : OpenMD::Polynomial< Real >
• getColumn() : DynamicRectMatrix< Real >, OpenMD::DynamicRectMatrix< Real >, OpenMD::RectMatrix< Real, Row, Col >
• getCOM() : OpenMD::StuntDouble
• getCom() : OpenMD::Molecule, OpenMD::Thermo
• getComAll() : OpenMD::Thermo
• getCOMvel() : OpenMD::StuntDouble
• getComVel() : OpenMD::Molecule, OpenMD::Thermo
• getCOMw() : OpenMD::StuntDouble
• getConsElem1() : OpenMD::ConstraintPair
• getConsElem2() : OpenMD::ConstraintPair
• getContactValueAt() : OpenMD::ShapeAtomType
• GetCovalentRad() : OpenMD::Element, OpenMD::ElementsTable
• getCurrentSnapshot() : OpenMD::SnapshotManager
• getD() : JAMA::Eigenvalue< Real >
• getData() : OpenMD::SimpleTypeData< ElemDataType >
• getDelimiters() : OpenMD::StringTokenizer
• getDensity() : OpenMD::StuntDouble
• getDerivative() : OpenMD::Polynomial< Real >
• getDescriptors() : OpenMD::NEP
• getDipole() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::NEP, OpenMD::StuntDouble
• getDipoleGradient() : OpenMD::NEP
• getEigenvalues() : OpenMD::RealSymmetricTridiagonal< Real >
• getEigenvectors() : OpenMD::RealSymmetricTridiagonal< Real >
• getElectricField() : OpenMD::StuntDouble
• GetElectronAffinity() : OpenMD::Element, OpenMD::ElementsTable
• GetElectroNeg() : OpenMD::Element, OpenMD::ElementsTable
• getEuler() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getFixedCharge() : OpenMD::Molecule
• getFlucQFrc() : OpenMD::StuntDouble
• getFlucQPos() : OpenMD::StuntDouble
• getFlucQVel() : OpenMD::StuntDouble
• getForceField() : OpenMD::SimInfo
• getFrameDataSize() : OpenMD::Snapshot
• getFrc() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getGlobalAtomIndices() : OpenMD::SimInfo
• getGlobalCountOfType() : OpenMD::SimInfo
• getGlobalGroupIndices() : OpenMD::SimInfo
• getGlobalIndex() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::Molecule, OpenMD::ShortRangeInteraction, OpenMD::StuntDouble
• getGrad() : OpenMD::Atom, OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::DirectionalAtom, OpenMD::RigidBody, OpenMD::StuntDouble
• GetGreen() : OpenMD::Element
• getGyrationalVolume() : OpenMD::Thermo
• getHmat() : OpenMD::Snapshot
• getHouseholder() : JAMA::QR< Real >
• getI() : OpenMD::Atom, OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::DirectionalAtom, OpenMD::RigidBody, OpenMD::StuntDouble
• getID() : OpenMD::GenericData, OpenMD::Snapshot
• getIdents() : OpenMD::GenericFactory< Object, IdentType, Creator >, OpenMD::HydrodynamicsModelFactory, OpenMD::IntegratorFactory, OpenMD::LatticeFactory, OpenMD::OptimizationFactory
• getImagEigenvalues() : JAMA::Eigenvalue< Real >
• getInertiaTensor() : OpenMD::Thermo
• getInstance() : OpenMD::GenericFactory< Object, IdentType, Creator >, OpenMD::HydrodynamicsModelFactory, OpenMD::IntegratorFactory, OpenMD::LatticeFactory, OpenMD::OptimizationFactory
• getInvBoundingBox() : OpenMD::Snapshot
• getInvHmat() : OpenMD::Snapshot
• getIOIndexToIntegrableObject() : OpenMD::SimInfo
• GetIonization() : OpenMD::Element, OpenMD::ElementsTable
• getJ() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getLastValue() : OpenMD::Accumulator, OpenMD::MatrixAccumulator, OpenMD::PotVecAccumulator, OpenMD::VectorAccumulator
• getLatentSpace() : OpenMD::NEP
• getLegendrePolynomial() : OpenMD::LegendrePolynomial
• getLength95percentConfidenceInterval() : OpenMD::PotVecAccumulator, OpenMD::VectorAccumulator
• getLengthStdDev() : OpenMD::PotVecAccumulator, OpenMD::VectorAccumulator
• getLengthVariance() : OpenMD::PotVecAccumulator, OpenMD::VectorAccumulator
• getLocalIndex() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::CutoffGroup, OpenMD::ShortRangeInteraction, OpenMD::StuntDouble
• getLocalIndexManager() : OpenMD::SimInfo
• GetMass() : OpenMD::Element, OpenMD::ElementsTable
• getMass() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::Molecule, OpenMD::StuntDouble
• getMax() : OpenMD::Accumulator
• GetMaxBonds() : OpenMD::Element, OpenMD::ElementsTable
• getMaxLength() : OpenMD::PotVecAccumulator, OpenMD::VectorAccumulator
• getMin() : OpenMD::Accumulator
• getMinLength() : OpenMD::PotVecAccumulator, OpenMD::VectorAccumulator
• getMoleculeByGlobalIndex() : OpenMD::SimInfo
• getMoleculeStamp() : OpenMD::SimInfo
• getMolToProc() : OpenMD::SimInfo
• GetName() : OpenMD::Element, OpenMD::ElementsTable
• getName() : OpenMD::Bend, OpenMD::Bond, OpenMD::Inversion, OpenMD::ShortRangeInteraction, OpenMD::Torsion
• getNAtoms() : OpenMD::Molecule, OpenMD::SimInfo
• getNBends() : OpenMD::Molecule, OpenMD::SimInfo
• getNBlocks() : OpenMD::BlockSnapshotManager
• getNBonds() : OpenMD::Molecule, OpenMD::SimInfo
• getNConstraintPairs() : OpenMD::Molecule
• getNConstraints() : OpenMD::SimInfo
• getNCutoffGroups() : OpenMD::Molecule, OpenMD::SimInfo
• getNdf() : OpenMD::SimInfo
• getNdfLocal() : OpenMD::SimInfo
• getNdfRaw() : OpenMD::SimInfo
• getNdfTrans() : OpenMD::SimInfo
• getNFluctuatingCharges() : OpenMD::Molecule, OpenMD::SimInfo
• getNFrames() : OpenMD::DumpReader
• getNGlobalAtoms() : OpenMD::SimInfo
• getNGlobalBends() : OpenMD::SimInfo
• getNGlobalBonds() : OpenMD::SimInfo
• getNGlobalCutoffGroups() : OpenMD::SimInfo
• getNGlobalIntegrableObjects() : OpenMD::SimInfo
• getNGlobalInversions() : OpenMD::SimInfo
• getNGlobalMolecules() : OpenMD::SimInfo
• getNGlobalRigidBodies() : OpenMD::SimInfo
• getNGlobalTorsions() : OpenMD::SimInfo
• getNHBondAcceptors() : OpenMD::Molecule
• getNHBondDonors() : OpenMD::Molecule
• getNIntegrableObjects() : OpenMD::Molecule, OpenMD::SimInfo
• getNInversions() : OpenMD::Molecule, OpenMD::SimInfo
• getNLocalCutoffGroups() : OpenMD::SimInfo
• getNMolecules() : OpenMD::SimInfo
• getNMoleculeStamp() : OpenMD::SimInfo
• getNpoints() : OpenMD::Icosahedron
• getNRigidBodies() : OpenMD::Molecule, OpenMD::SimInfo
• getNTorsions() : OpenMD::Molecule, OpenMD::SimInfo
• getNumAtoms() : OpenMD::RigidBody
• getNumberOfAtoms() : OpenMD::Snapshot
• getNumberOfCutoffGroups() : OpenMD::Snapshot
• GetNumberOfElements() : OpenMD::ElementsTable
• getNumberOfRigidBodies() : OpenMD::Snapshot
• getNZconstraint() : OpenMD::SimInfo
• getOriginal() : OpenMD::StringTokenizer
• getPairList() : OpenMD::PairList
• getParticlePot() : OpenMD::StuntDouble
• getPoints() : OpenMD::Cuboctahedron, OpenMD::CurlingStoneDecahedron, OpenMD::Decahedron, OpenMD::Icosahedron
• getPolarizability() : OpenMD::NEP
• getPolarizabilityGradient() : OpenMD::NEP
• getPos() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getPotential() : OpenMD::Molecule
• getPotentialForcesAndVirials() : OpenMD::NEP
• getPressureTensor() : OpenMD::Thermo
• getPrevA() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getPrevCom() : OpenMD::Molecule
• getPrevDensity() : OpenMD::StuntDouble
• getPrevDipole() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getPrevElectricField() : OpenMD::StuntDouble
• getPrevEuler() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getPrevFlucQFrc() : OpenMD::StuntDouble
• getPrevFlucQPos() : OpenMD::StuntDouble
• getPrevFlucQVel() : OpenMD::StuntDouble
• getPrevFrc() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getPrevJ() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getPrevParticlePot() : OpenMD::StuntDouble
• getPrevPos() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getPrevQ() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getPrevQuadrupole() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getPrevSitePotential() : OpenMD::StuntDouble
• getPrevSnapshot() : OpenMD::SnapshotManager
• getPrevTrq() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getPrevValue() : OpenMD::Bend, OpenMD::Bond, OpenMD::Inversion, OpenMD::ShortRangeInteraction, OpenMD::Torsion
• getPrevVel() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getProperties() : OpenMD::AtomType, OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::Molecule, OpenMD::NonBondedInteractionType, OpenMD::PropertyMap, OpenMD::ShortRangeInteraction, OpenMD::SimInfo, OpenMD::StuntDouble
• getPropertyByName() : OpenMD::AtomType, OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::Molecule, OpenMD::NonBondedInteractionType, OpenMD::PropertyMap, OpenMD::ShortRangeInteraction, OpenMD::SimInfo, OpenMD::StuntDouble
• getPropertyNames() : OpenMD::AtomType, OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::Molecule, OpenMD::NonBondedInteractionType, OpenMD::PropertyMap, OpenMD::ShortRangeInteraction, OpenMD::SimInfo, OpenMD::StuntDouble
• getQ() : JAMA::QR< Real >, OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getQuadrupole() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getR() : JAMA::QR< Real >
• getRangeValueAt() : OpenMD::ShapeAtomType
• getRateOfStrain() : OpenMD::VelocityField
• getRealEigenvalues() : JAMA::Eigenvalue< Real >
• GetRed() : OpenMD::Element
• getRemainingString() : OpenMD::StringTokenizer
• getRestraintType() : OpenMD::Restraint
• GetRGB() : OpenMD::ElementsTable
• getRow() : DynamicRectMatrix< Real >, OpenMD::DynamicRectMatrix< Real >, OpenMD::RectMatrix< Real, Row, Col >
• getS() : JAMA::SVD< Real >
• getSelectedAtomTypes() : OpenMD::SelectionManager
• getSimulatedAtomTypes() : OpenMD::SimInfo
• getSingularValues() : JAMA::SVD< Real >
• getSitePotential() : OpenMD::StuntDouble
• getSize() : OpenMD::DataStorage, OpenMD::PairList
• getSizeOfPairList() : OpenMD::PairList
• getSnapshotManager() : OpenMD::SimInfo
• getSpin() : OpenMD::VelocityField
• getStampId() : OpenMD::Molecule
• getStdDev() : OpenMD::Accumulator, OpenMD::MatrixAccumulator, OpenMD::PotVecAccumulator, OpenMD::VectorAccumulator
• getStorageLayout() : OpenMD::DataStorage
• getStrengthValueAt() : OpenMD::ShapeAtomType
• GetSymbol() : OpenMD::Element, OpenMD::ElementsTable
• getSystemDipole() : OpenMD::Thermo
• getSystemQuadrupole() : OpenMD::Thermo
• getTotal() : OpenMD::Accumulator, OpenMD::MatrixAccumulator, OpenMD::PotVecAccumulator, OpenMD::VectorAccumulator
• getTrq() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getType() : OpenMD::Atom, OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::Molecule, OpenMD::RigidBody, OpenMD::StuntDouble
• getUpdatedDirection() : QuantLib::LineSearchBasedMethod
• getV() : JAMA::Eigenvalue< Real >
• getValue() : OpenMD::Bend, OpenMD::Bond, OpenMD::Inversion, OpenMD::ShortRangeInteraction, OpenMD::Torsion
• getVariance() : OpenMD::Accumulator, OpenMD::MatrixAccumulator, OpenMD::PotVecAccumulator, OpenMD::VectorAccumulator
• GetVdwRad() : OpenMD::Element, OpenMD::ElementsTable
• getVel() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• getVelocity() : OpenMD::VelocityField
• getVelocityGradient() : OpenMD::VelocityField
• getVorticity() : OpenMD::VelocityField
• gradient() : OpenMD::BoxObjectiveFunction, OpenMD::FluctuatingChargeObjectiveFunction, OpenMD::PotentialEnergyObjectiveFunction, QuantLib::ObjectiveFunction, QuantLib::Problem
• gradientEvaluation() : QuantLib::Problem
• gradientNormValue() : QuantLib::Problem