Here is a list of all documented functions with links to the class documentation for each member:

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~

- s -

• scale() : OpenMD::Velocitizer
• scaleVector() : OpenMD::Snapshot
• searchDirection() : QuantLib::LineSearch
• setA() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::DirectionalAtom, OpenMD::RigidBody, OpenMD::StuntDouble
• setAtomStorageLayout() : OpenMD::SimInfo
• setBoundingBox() : OpenMD::Snapshot
• setCell() : OpenMD::NEP
• setCoefficient() : OpenMD::Polynomial< Real >
• setColumn() : DynamicRectMatrix< Real >, OpenMD::DynamicRectMatrix< Real >, OpenMD::RectMatrix< Real, Row, Col >
• setCom() : OpenMD::Molecule
• setData() : OpenMD::SimpleTypeData< ElemDataType >
• setDensity() : OpenMD::StuntDouble
• setElectricField() : OpenMD::StuntDouble
• SetEnvironmentVariable() : OpenMD::ElementsTable
• setEuler() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• setFdf() : OpenMD::SimInfo
• setFlucQFrc() : OpenMD::StuntDouble
• setFlucQPos() : OpenMD::StuntDouble
• setFlucQVel() : OpenMD::StuntDouble
• setFrc() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• setGlobalGroupMembership() : OpenMD::SimInfo
• setGlobalIndex() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::Molecule, OpenMD::ShortRangeInteraction, OpenMD::StuntDouble
• setGlobalMolMembership() : OpenMD::SimInfo
• setGridDimension() : OpenMD::shapedLattice
• setHmat() : OpenMD::Snapshot
• setID() : OpenMD::GenericData, OpenMD::Snapshot
• setJ() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• setLocalIndex() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::CutoffGroup, OpenMD::ShortRangeInteraction, OpenMD::StuntDouble
• setMass() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• setMasses() : OpenMD::NEP
• setMolToProcMap() : OpenMD::SimInfo
• setName() : OpenMD::Bend, OpenMD::Bond, OpenMD::Inversion, OpenMD::ShortRangeInteraction, OpenMD::Torsion
• setNZconstraint() : OpenMD::SimInfo
• setParticlePot() : OpenMD::StuntDouble
• setPos() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• setPositions() : OpenMD::NEP
• setPrevA() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::DirectionalAtom, OpenMD::RigidBody, OpenMD::StuntDouble
• setPrevDensity() : OpenMD::StuntDouble
• setPrevElectricField() : OpenMD::StuntDouble
• setPrevEuler() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• setPrevFlucQFrc() : OpenMD::StuntDouble
• setPrevFlucQPos() : OpenMD::StuntDouble
• setPrevFlucQVel() : OpenMD::StuntDouble
• setPrevFrc() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• setPrevJ() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• setPrevParticlePot() : OpenMD::StuntDouble
• setPrevPos() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• setPrevQ() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• setPrevSitePotential() : OpenMD::StuntDouble
• setPrevTrq() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• setPrevVel() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• setQ() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• SetReadDirectory() : OpenMD::ElementsTable
• setRestraintType() : OpenMD::Restraint
• setRow() : DynamicRectMatrix< Real >, OpenMD::DynamicRectMatrix< Real >, OpenMD::RectMatrix< Real, Row, Col >
• setSitePotential() : OpenMD::StuntDouble
• setSnapshotManager() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::CutoffGroup, OpenMD::ShortRangeInteraction, OpenMD::SimInfo, OpenMD::StuntDouble
• setStorageLayout() : OpenMD::DataStorage
• setSymbols() : OpenMD::NEP
• setTrq() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• setType() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::RigidBody, OpenMD::StuntDouble
• setupCutoffs() : OpenMD::ForceManager
• setupRotMat() : OpenMD::SquareMatrix3< Real >
• setupUpperTriangularVoigtTensor() : OpenMD::SquareMatrix3< Real >
• setupVoigtTensor() : OpenMD::SquareMatrix3< Real >
• setVel() : OpenMD::ConstraintElem, OpenMD::StuntDouble
• setZero() : DynamicVector< Real, Alloc >, OpenMD::DynamicVector< Real, Alloc >
• SimInfo() : OpenMD::SimInfo
• size() : OpenMD::OpenMDBitSet, OpenMD::SelectionSet
• skipAtomPair() : OpenMD::ForceMatrixDecomposition
• skipToken() : OpenMD::StringTokenizer
• solve() : JAMA::QR< Real >
• SquareMatrix() : OpenMD::SquareMatrix< Real, Dim >
• SquareMatrix3() : OpenMD::SquareMatrix3< Real >
• SSDAtomVisitor() : OpenMD::SSDAtomVisitor
• step() : OpenMD::Integrator, OpenMD::NPT, OpenMD::VelocityVerletIntegrator
• StrangFixCowperTriangleQuadratureRule() : OpenMD::StrangFixCowperTriangleQuadratureRule
• StringTokenizer() : OpenMD::StringTokenizer
• sub() : DynamicRectMatrix< Real >, DynamicVector< Real, Alloc >, OpenMD::DynamicRectMatrix< Real >, OpenMD::DynamicVector< Real, Alloc >, OpenMD::RectMatrix< Real, Row, Col >, OpenMD::Vector< Real, Dim >
• sum() : OpenMD::Vector< Real, Dim >
• swapColumn() : DynamicRectMatrix< Real >, OpenMD::DynamicRectMatrix< Real >, OpenMD::RectMatrix< Real, Row, Col >
• swapRow() : DynamicRectMatrix< Real >, OpenMD::DynamicRectMatrix< Real >, OpenMD::RectMatrix< Real, Row, Col >